Viruses: 944635
Help
Entry
944635 CDS
T40000
Symbol
SPPV_67
Name
(RefSeq) Sheeppox virus; RNA polymerase subunit RPO147
KO
K25273
Poxviridae DNA-directed RNA polymerase 147 kDa subunit [EC:
2.7.7.6
]
Virus
10266
Sheeppox virus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_4
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_1
RsgA_N
CSTF2_hinge
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
944635
NCBI-ProteinID:
NP_659643
UniProt:
A0A3F2YKM8
LinkDB
All DBs
Position
NC_004002:59559..63416
Genome browser
AA seq
1285 aa
AA seq
DB search
MAVISKVTYSLYNQEEINATDIFINHVKNDDDVGTVKDGRLGAMDGALCKTCGKTELQCF
GHWGKVRLYETHIIKPEYIGEVIRILNHICIRCGFLRSREPYIEDVTKMSSYALRKLKDK
ILSKKKSCWNSKCMQQYQKITFSKKKVCFVNKSDDITIPNALIYQKITSIYKRFWPLLEI
YQKPENLFYKNFFPVPPLIIRPAISFWIDSIPKETNELTYLLGMIVKYCNMNADEQVIQK
AIIEYDDIKIISNNTTSINLSYITSGKNNMIRSYIVARRKDQTARSVIGPDITLTINEVG
VPFYIRNTLTEKIFVNPFTTNEVQRLFTNNEIKFYFNKRLNQLTRIKQGKFIKNKIHMLP
GDWVEVPLKENTSIIFGRQPSLHRYNVIASTVKYIEGDTIKIPPGIANSQNADFDGDEEW
MILEQNPKAVIEQSILMYPTTLLKHDVNGSPVYGSIQDEIVAAYSLFRMENLTLDEVMNI
LGKYGINFSSNGKIVFSGKDIFEFLINDKVNYPGILSNGRIVANDIISDFIVAMRGMSLA
GFISDYKSNVEGIEFIIKSSYVFKRYLSIYGFGVTFKELRPNSDFTNKLEAINSEKIELI
KNSYKKYLTDVKDGKILPLSKSMESDAVESMLSNLTNLNIKEIEEYMKTTLINNPDNNLL
KMAKAGYKVNPTELMYILGTYGQQRIDGEPTETRVMGRVLPYYLPDSKDPEGRGYILNSL
TQGLTGSQYYFSMLVARSQSTDIVCETSRTGTLARKIIKKMEDMVVDGYGQVIYSNILIK
YAANYTKISASVCKPIDLIFPRESMVWYFEIRSIWEKIKDGFIYSQKQKISKKTLSPFNF
LVFLEPSDEKHAISSKDLYNMIQNVIDDVSEKYFFTISNIDFIKYVFLTHLNPSIIRITK
ETATTIFKKFYEKLNYSLGGGTPIGIIAAQVLSEKFTQQALSSFHTTEKSGAIKHKLGFN
EFSNLTNLSKNKTEIITLISEDIEKLQSVKINFEFVCLGELNPDIVLNNDNEKYIIDITI
NRIYIKRADITELVVEHMIERFVSFSVLVKEWGLETHIEDNNNIKFTILVKFIEPVELSL
NKFMMVLPGAANKGKISKFKIPISNYNYYDDHNKSRKMNKMTVELMNLKELGTFNLENVI
VYPGIWNTYDIFGIESARSYLCEALLNTYGEGFDYLYQPCDLLASLICMSYEPESVNKFK
FGVTSSLKKATFGDNKALLNAALHKKTEPVNDNSSCHFFSKVPKIGTGYYRYFVNLELLT
RLEKKLSVTISDRKVEELIEKSDEF
NT seq
3858 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcagtaatatctaaagtaacatatagtttatataatcaggaagaaattaatgctact
gatatatttattaatcatgtcaaaaacgatgatgatgttggaacagttaaagatggtagg
ttaggtgctatggatggagcattatgtaaaacttgtggtaaaacagaattgcaatgtttt
ggacattggggaaaagtaagactttatgagacacatataataaaaccagaatacataggt
gaagtaataagaattcttaaccatatatgtataagatgtggatttttaagatctagagaa
ccatacatagaagacgtaaccaaaatgtcatcgtatgcacttagaaagttaaaggataag
atcctttctaaaaaaaaatcttgttggaatagtaaatgcatgcaacaatatcaaaaaata
acattctcaaaaaaaaaagtatgttttgttaacaaatcagacgatatcacaatccctaat
gcgttgatatatcaaaaaataacgtcaatttataaacgtttttggccattgttagaaatt
tatcaaaaaccggaaaatttattttataaaaacttttttcctgtgccaccgttgataatt
agaccagctattagtttttggatagatagtataccaaaagaaacaaatgaactaacttac
ttattaggtatgattgtaaagtactgtaatatgaatgcagacgaacaggtaatacaaaaa
gcaataatagaatatgatgatattaaaattatatcaaataatactactagtataaactta
tcatatataacatctggaaagaataatatgataagaagctatattgttgcaagacgaaaa
gatcaaactgctagatctgttattggacctgatatcacattaacaattaatgaagtaggt
gttccattttatataaggaatactctaactgaaaaaatatttgtaaatccattcacaacg
aatgaggtacaaagattatttacaaataacgagattaagttttactttaataaacgacta
aatcaattaactagaataaagcaaggaaaatttattaaaaacaaaatacatatgcttcct
ggggattgggtagaagtaccattaaaagaaaacacaagcataatttttggaaggcaacct
tctttacatagatacaatgttattgcttctacagttaaatatattgaaggtgatacaata
aaaataccacccggtatagcaaactcacaaaatgctgattttgacggtgacgaagaatgg
atgatacttgaacaaaaccccaaagctgttatagagcaaagtattttaatgtatccaact
acactgttaaaacatgacgttaatggatctcctgtatatggttctatacaagatgaaata
gtggcagcgtattccctttttaggatggaaaatttaacacttgatgaggttatgaatata
ttaggaaagtatggtattaatttttcatccaatggaaaaatagtattctcaggaaaggat
atatttgaatttcttataaatgataaagttaactatcctggcattttaagtaatggtagg
atagtcgcaaatgatattataagcgattttatagttgcaatgcgtggtatgtcacttgcc
gggtttatatctgactataaatctaacgtagaaggtattgaatttataataaaatcatct
tacgtctttaagaggtatttaagtatttatggatttggggtcacatttaaagaattacga
cccaattctgattttacaaacaaattagaagcaataaactcagaaaaaattgagttaatt
aaaaattcatataaaaaatatttaacagatgtaaaagatggtaaaatattacctctttca
aaatctatggaatctgacgctgtagaatcaatgctttcaaacttaacaaaccttaatata
aaagaaattgaagaatatatgaagacaacattaatcaataatccagataataatttacta
aagatggcaaaggctggttataaagtaaacccaactgagttaatgtatatattaggaact
tacggacaacaaaggattgatggtgagcctacagaaacaagggtgatgggaagggtgtta
ccgtattatttacctgattcaaaagatccagaggggagaggatatatattaaattcatta
acgcaagggttaaccggatcacaatattatttttccatgttagtagcacgatcacaatcg
acagatattgtttgtgaaacatctagaacaggaacgttggcacgtaaaattataaaaaag
atggaagatatggttgtagacggatacgggcaagttatttacagtaacattttgataaag
tatgctgctaattatacaaaaatttcagcatccgtttgtaaaccaattgatttaatattt
ccacgagagtcgatggtttggtattttgaaataaggtccatttgggaaaaaatcaaagat
ggttttatatattctcaaaaacaaaaaatatcaaaaaaaacattatcaccatttaatttt
ttagtgtttttagaaccatctgatgaaaaacatgcaataagttctaaagatttatacaac
atgatacaaaatgtaattgatgacgttagtgaaaaatatttcttcactatatcgaatata
gattttataaagtatgtgtttctaactcacttaaatccttcaataatcagaataacaaaa
gaaacagctacaacaatttttaaaaaattttatgaaaagttaaattattcattaggtggt
gggacccctataggtattattgctgctcaggtattatctgaaaagtttactcaacaagcg
ttatctagttttcacaccactgaaaagagtggagctataaaacataaacttggttttaat
gaatttagtaacttaacaaatttaagcaaaaataaaacagaaattattacattaatatca
gaagatatcgaaaaacttcaaagtgttaaaataaactttgagtttgtatgtttaggagaa
ttgaatccagatattgtattaaataatgataatgaaaaatacataatcgatatcactatc
aatcgtatttatataaaacgagcagatataactgaattagtcgttgaacatatgatagaa
agatttgtatcattcagtgtgttagttaaggaatggggattagaaacacatatagaggat
aataataatataaagtttacaatacttgtaaaatttatcgaacctgtagaattatcacta
aataagtttatgatggtattgccaggagctgcaaataaagggaaaattagtaaatttaag
atccctataagtaattacaattactacgatgatcataataaaagtaggaaaatgaataaa
atgacagttgaactgatgaatttgaaagaattgggaacctttaatttagaaaatgtaata
gtatatcctggtatatggaacacatatgatatatttggtatagaatcagccagatcatac
ttatgtgaagctttattaaatacatacggtgaaggatttgattatttgtatcaaccatgt
gacttattggctagcttaatttgtatgagttacgaacctgaatcagttaataagtttaag
tttggtgttacaagttcccttaaaaaggctacgtttggagataacaaagctctattaaat
gctgcattacataaaaagactgaacctgttaatgataacagcagttgtcatttctttagc
aaggttccaaaaataggaacagggtactaccgttattttgttaacctagaattactaact
agattggaaaagaaactttctgttacaatatctgatagaaaggttgaagaattaatagaa
aaatccgacgagttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
