KEGG   Viruses: 956505
Entry
956505            CDS       T40000                                 
Symbol
RDVs1gp1
Name
(RefSeq) Rice dwarf virus; RNA-dependent RNA polymerase
Virus
10991  Rice dwarf virus
SSDB
Motif
Pfam: Rad33
Other DBs
NCBI-GeneID: 956505
NCBI-ProteinID: NP_620544
RS: NC_003773
UniProt: Q98631
LinkDB
Position
NC_003773:36..4370
AA seq 1444 aa
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DEQM
NT seq 4335 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
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DBGET integrated database retrieval system