Viruses: 956617
Help
Entry
956617 CDS
T40000
Symbol
BPMVsRNA1gp1
Name
(RefSeq) Bean pod mottle virus; polyprotein
Virus
12260
Bean pod mottle virus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
RdRP_1
RNA_helicase
Peptidase_C3
Peptidase_C37
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
956617
NCBI-ProteinID:
NP_612349
RS:
NC_003496
UniProt:
Q9YJU5
LinkDB
All DBs
Position
NC_003496:368..5920
Genome browser
AA seq
1850 aa
AA seq
DB search
MKFYPGQNISEIVYHFQSNETANRLDAYFACGCEEDTEVLARLKQCNPRLLHLSYAAFCL
EMGSHSIEEMEYDDGELIFSYFQNFLLSIVSNSSKTTKLRAYIRSAFAYHFQHFVEFDQY
TNDSLNTVDTSVSAQGIADLALSMVRWIPTQIKKVVNFGVGSVIESFSEHFNKLLMQYCP
IVFQAFSWVNNIWTMVKEWIEEAAKEISWFLQGCKELHAWGMCILASSCALGLVEKCLIS
LGMISESFDLVGLFVRSAIVGAFCVSIKTGKFVTNSELITCATIAVSTIATVMSQAFKPS
EEIKGQFQALSVLEGLATQLTSFCDTSLVAMGKTCTAFNQICTAGKNVKVIAGRLLEVVS
NFVRKLLGLDSAFLRDAALIFSQDVDGWLRNISWCQEQFLLKAYMSQDDLIVLRSLVVKG
ERMREQMLEGEVKVSPSVCNLIVKGCEEANKLMRESRLHCSKTIRKIPFVIFAHGESRVG
KSLLVDRLITDFCDHLEIGEDAVYSRNPSDPFWSGYRRQPIVTIDDFAAVVSEPSAEAQL
IPLVSSAPYPINMAGLEEKGMHFDSQIMMCSSNFLEPSPEAKIRDDMAFRNRRHVLITVE
LKPGVEYDESDFTKNQRYLLKTWFHYHYVVDQTFESYADLLAHCFTKWERHVKEQESNLS
QIKGKKSESGHFYNFQQLMDLAVSWNLNADIMKNRIKAERNDMVYVFSAGRKDKILHCFL
NKEGECTVRPDSIDDPEAQALLKASETMLMKAYAFLKYNNATNLIVRTHLAELVNEDFYD
EKFNFIGTIGTPAFHRQIAAHLEKMPLWQKAILCGMGHCLSRKSKETWYTGMKEKFVQMM
KSIYETEVTDWPVPLKIISGTILATILGTTFWKLFSFLRDAGNGGVFVGNVASAFTTSSV
LEAQSRKPNRYEVSQYRYRNVPIKRRAWVEGQMSFDQSVVAIMSKCKASMRMGNTDAQIL
MVPGRRFIAHGHFFKNLTQKVRVQIVTSEKSYWHVYDPDKFQMFDNSEIGLYTNPTLEDI
PHSAWDLFCWDSEKTLPNNFSAELLSCKLDTVTGQYYPRMAPINCRVHRQPIHITEGNYV
RKQDVSIEYDACTIPNDCGSLVVAKVGNHKQIVGFHVAGSKGRLGYASLIPYVEPVVQAQ
SAEVYFDFFPVEVDSQEGVAHIGELKSGVYVPLPTKTNLVETPKEWQLDLPCDKIPSVLT
TTDERLVGTEHEDMTHSWWYSKYATPMMPLDEEILSKVAQDMVEEWFDCVDEEDTFEEVS
LSAALNGVEGLDYMERIPLATSEGFPHVLSRKNGEKGKRRFVTGDGEEMSLIPGTSVEEA
YNKLTVELEKCVPTLVGIECPKDEKLPRRKIFDKPKTRCFTILPMEFNLVVRQKFLNFVR
FIMKKRDKLSCQVGINPYSMEWTGLANRLLSKGNDILCCDYASFSGLITKQVMSKMAEMI
NSLCGGDEKLMRERTHLLLACCSRMAICKKDIWRVECGIPSGFPLTVICNSIFNEMLIRY
SYEKLLRQAKAPSMFLQSFRNFISLCVYGDDNLISVHEYVKPYFSGSKLKSFLASHNITI
TDGIDKTSATLQFRKLSECDFLKRNFKQMSNVLWVAPEDKASLWSQLHYVSCNNLEMQEA
YLVNLVNVLRELYLHSPEEARRLRRKALSCIEWLQKADVPTIAQIEEFHSMQRIMNAPDS
NDNIDLLLSIDLLGLQGAARPSQIRLWFDDKLVLANTQEFFDGNFPADSWLPIFVNCLYP
VSQLPAEAVIVNVVCGSGRGGLPTTAWISSAVNNRSSDINKKIRTALGKGKKIVFLTRVD
PFPVALLAVLFGVKNEILSSNATNPMLTRLLENCKSLKYLVDECPFAFVN
NT seq
5553 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagttctatcctggtcagaatatttctgaaattgtttaccactttcagagtaatgag
acagccaataggttagatgcatattttgcttgtggctgtgaggaggatactgaagtcctc
gctcgtttgaagcagtgtaatcctcgtctgcttcatctgtcatatgctgccttttgtttg
gaaatgggcagtcattcaatagaggaaatggaatatgatgatggggaattaattttttcc
tattttcaaaattttttgctttccatcgtttccaattcttctaaaacaaccaaattgaga
gcatacattcgttcagcatttgcatatcattttcagcattttgttgaatttgatcaatat
acaaatgattctctcaatactgtagatacaagtgtatcagcccaagggatagcagacttg
gctctctctatggttagatggatacccactcagattaaaaaagttgttaattttggtgtg
ggatctgttatagagtctttttcagagcattttaataagctcttgatgcaatattgtcca
atagtttttcaagctttcagctgggttaacaatatttggacaatggtcaaagagtggata
gaagaagctgcgaaagaaatttcatggtttttgcaaggatgtaaagagctgcatgcctgg
ggaatgtgtattttggctagctcctgtgctctaggattggttgaaaaatgccttatttct
ttgggcatgatttccgaatcttttgatttggttggcttgtttgtccgatctgccattgtg
ggagctttctgtgtttccataaaaactggcaagttcgtcacgaatagtgaattgatcact
tgtgctaccattgcagtttctacaatagcaactgtaatgtctcaggcttttaagccttct
gaagagattaagggacagttccaagccctttcagttctagaagggttggcaacacagctc
acttcattttgtgacacgtccttagttgctatgggaaaaacctgcacagcttttaatcaa
atttgcactgctggcaaaaatgttaaggtgatcgcaggtaggttgctggaagttgtttct
aattttgttagaaaattattaggattggatagtgcttttctcagagatgctgcactcatt
ttttctcaagatgtggatggatggttgcgtaacattagttggtgccaagaacagtttttg
ttgaaagcttacatgtcgcaagatgatcttattgtcttacgctctttagttgtcaaaggt
gaaagaatgagggaacagatgcttgaaggagaagttaaggtgtctccaagtgtttgcaac
cttattgtcaaaggctgtgaagaagcaaataaattgatgcgtgagagccgacttcattgt
tcaaaaacaattaggaaaattccttttgttatttttgctcacggtgaatcccgagttggg
aaatctctgctggttgataggctaatcacagatttctgtgatcatttggaaattggagaa
gatgctgtgtactcaaggaatccatcagatcctttttggagtggatatagaaggcagcca
attgttactattgatgattttgctgctgttgtttcggagccatctgctgaagctcaatta
attccattagtttcaagtgctccttatccaataaacatggctggtttggaggaaaaggga
atgcactttgattcccagatcatgatgtgttcttcgaatttcttagagccgtctcctgaa
gctaaaattagagatgatatggcttttagaaatcgaagacatgtgctgatcacagttgaa
ctcaaacctggggttgaatatgatgagagtgattttactaaaaatcagcgatatttgctg
aaaacttggtttcattatcattatgttgtagaccaaacttttgagtcttatgctgatctg
ctggcacattgttttaccaagtgggagagacatgttaaggagcaagagtcaaatctgtct
caaattaagggcaagaaaagtgaaagtggtcatttctataactttcaacaacttatggat
ttggctgtttcatggaatcttaatgcagatatcatgaaaaacaggatcaaggctgagaga
aatgacatggtttatgttttttctgcagggaggaaggataaaattttgcattgttttttg
aacaaggaaggcgagtgcacggttcgtcctgattcaatagatgatcctgaagcgcaagct
ttgctcaaagcttcagagacaatgctcatgaaagcctatgccttcctcaaatacaataat
gcaacaaatttgattgtcaggacccatttggcagaactggtgaatgaagatttttatgat
gaaaaattcaatttcattggaacaattggaacaccggcttttcatcgccaaatagctgca
catttggaaaagatgccattgtggcaaaaagcaattttgtgtggaatgggacattgtttg
tctcggaaaagcaaagaaacctggtatactggtatgaaggagaaatttgtgcagatgatg
aaaagcatttatgaaactgaagtcacagattggccagtgccattgaaaatcatttctggt
actattctagccaccattttgggaacaactttttggaagttattttcctttttaagggat
gctggtaatggaggtgtttttgttggtaatgttgcttcagcatttactacatcaagtgtg
ctcgaggcgcaaagccgaaaacccaacagatatgaggtctctcaatataggtatcgcaat
gtgccaataaagcgcagagcgtgggttgagggccaaatgtcttttgatcaatcagtggta
gcaattatgtcaaaatgtaaagccagtatgagaatgggaaacactgatgctcagattttg
atggttccagggcgtagattcattgcacatggtcattttttcaagaatctcacccaaaaa
gttagagtccaaattgttacttctgagaaaagctattggcatgtgtatgatcctgataaa
tttcaaatgtttgataacagtgaaattgggttgtatacaaatccaactttggaggacatc
ccacattctgcttgggaccttttctgctgggacagtgagaaaactttgccaaacaatttt
tctgctgaattgctttcctgtaaattggacactgttacgggacaatattatcccagaatg
gctccaataaattgtcgagtacatcggcaaccaattcacataactgaagggaattatgtt
aggaaacaagatgtaagcattgaatatgatgcctgcacaattcccaatgattgtggatct
ctggtggttgctaaggttggaaatcacaagcaaattgttggtttccatgttgctggaagc
aaaggaagattgggctatgcttcattaataccatatgttgagcctgtggtacaagcccaa
agtgctgaagtctattttgatttctttcctgtggaagttgatagtcaagagggagtagct
catattggtgaactcaaatctggagtttatgtaccactgcccacaaaaactaatcttgtg
gaaactcccaaagaatggcagttggatttgccttgtgataagattccaagtgtgttaacc
actactgatgagagattggttggcacagagcatgaagatatgacccattcttggtggtat
tcaaaatatgcaactcccatgatgcctcttgatgaggagattctttccaaagttgcacaa
gacatggttgaagagtggtttgattgtgttgatgaggaggatacatttgaagaagtttct
ttgagtgctgcactcaatggtgttgaaggtttggattacatggaacgcattcctcttgcc
acttcagagggttttcctcatgttctgtccaggaaaaatggtgaaaaaggcaagagaaga
tttgtcactggagatggtgaagaaatgtcactaattcctggtaccagtgttgaagaagcg
tacaataaattgactgttgaattagaaaagtgtgttccaacattggttggtatagaatgt
cctaaagatgaaaaacttcctcgtcgcaaaatttttgataaacccaagacgcgctgcttc
accatacttcctatggaatttaatttagtggtgcgtcaaaagttcttgaattttgtgcga
ttcattatgaagaaaagggacaaattgagttgccaagttggaatcaatccatattccatg
gagtggactggtttggcaaatagactgttgagcaagggaaatgacattttgtgttgtgac
tatgctagttttagtggtctgataactaagcaagtcatgagcaagatggcagaaatgata
aacagtctttgtggtggagatgagaaactgatgcgtgagagaactcatcttctgttagct
tgttgctccaggatggcaatctgtaaaaaagatatttggagagttgagtgtggtatcccc
tctggatttccactcactgttatctgcaatagcattttcaatgagatgcttatcagatat
agttatgaaaagttgttgcgtcaagctaaggctcctagtatgtttctccagtcttttaga
aattttatttctttgtgtgtttatggagatgataatttaattagtgttcatgagtatgtc
aagccatattttagtggttctaaattgaaaagtttcctagctagtcataacatcaccatc
actgatggaattgacaaaactagtgcaactttacagtttagaaagttgtctgagtgtgat
tttcttaaaagaaattttaagcaaatgtccaatgttttgtgggtagctcctgaagacaaa
gctagtttgtggtcacaattgcactatgtttcatgtaacaatttggaaatgcaagaagct
tatcttgttaacttggttaatgtgttgcgtgagttgtacctgcatagtccagaagaagct
cgtcgattgagaagaaaggctctctcttgtattgagtggttgcaaaaagctgatgtgccc
accatagcacaaattgaagaatttcattcaatgcagaggattatgaatgctcctgattca
aatgataatattgatcttttgttgagcattgacttgttgggtcttcagggtgcagcaagg
ccttcccaaataagattgtggtttgatgataaattggtattggcaaatacacaagaattt
tttgatggaaattttccagcagattcttggttaccaatatttgttaattgtctttaccct
gtgagtcaattgcccgcagaagctgtcattgttaatgttgtttgtgggagtgggcgtggt
ggtttgcctactactgcttggattagttctgcagttaacaatcgctcctcagatatcaat
aagaaaattcggacagcgcttggaaaaggtaagaaaattgtctttttgactagagttgat
ccttttcctgtggccttgttagctgttctctttggtgttaagaacgaaattctgagttct
aatgccacaaatccaatgttgacaaggcttcttgagaactgcaagagtcttaaatatttg
gttgatgagtgtccttttgcatttgttaactag
DBGET
integrated database retrieval system