Viruses: 9887486
Help
Entry
9887486 CDS
T40000
Symbol
crov084
Name
(RefSeq) Cafeteria roenbergensis virus BV-PW1; putative DNA topoisomerase IA
Virus
693272
Cafeteria roenbergensis virus BV-PW1
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Topoisom_bac
Toprim
Toprim_C_rpt
Toprim_4
Toprim_2
SHOCT_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
9887486
NCBI-ProteinID:
YP_003969716
RS:
NC_014637
UniProt:
E3T4K4
LinkDB
All DBs
Position
NC_014637:complement(80107..82350)
AA seq
747 aa
AA seq
DB search
MKLVIVESPGKIKKIQSYLGDNYHVEASFGHIRDLDPNGLSVDLDNNFNPTYVISPDKSK
IVDKLESISNKAEETILAADQDREGEAIAYSLKEVLKLKNPPRIIFTEITKTAIEKAILN
PSHINQHEVYAQQARRILDRIVGYQLSPLLWKHLPGTKSAGRVQSVLVRIIVEQERKIRE
TQSEMRVKVYGEFLKGKKKINTTLYYKDKIKEFENLDIPEQLFKLLTNKDNFYVDKIITS
QVNKNPPPPFITSSLQQEASIRLKFPTKMTMSVAQKLYEKGLITYMRTDSTVLSSAALGM
LKKFIIENYGDNYYQGRNYTKNKKNAQEAHEAIRPTKLNVDTSKLKLEEKKLFNLILNRT
LASQMASAIITNQKIYIKTNNIKWNKYDFQTIVNHIKFEGYLKVYHNQEEDEKIIKLQEK
EQVDLNQLTTTEDYKEPPKRLNEASLVNYLEKKGIGRPSTYSSLISKVLDRKYVEIKSIP
GVKQKINFVQLNKNFVLDRGSKQIAVGSEKHKLIPTELGFKSNDFLMKYFNNILEENFTA
HLENSLDKISHNKLCWIDLLSDFYQNLKPIIQSLNNLKIERKDDIDELLGEINKIKIYYG
KSQYGFYVKKQENKKWKFSSVESKPTLEEAFKKLEFPKVLGKKGNTVVTLFIGKFGPYIK
YGSLNCSIPSDVNINKLTLEDSFKYLEGKGNKNILKSIMHNNKLILIKKGPYGNYLQTTF
KSKKINLKLGEKIPEDNEIIEMINKYK
NT seq
2244 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaactagtaatagtagaatctccaggtaaaataaaaaaaattcaatcatatttaggt
gataattatcatgtagaagcttcttttggacatattagagatttagacccaaatggatta
tctgttgatttagataataattttaatcctacttatgtaatttcacctgataaaagtaaa
attgttgataaattggagtcaatttctaataaagcagaagaaactattttagctgccgat
caagatagagagggtgaagctattgcatatagtttaaaagaagttttaaaattaaaaaat
ccaccccgtattatttttaccgaaataacaaaaacagcaatcgagaaagctattttaaat
ccttcccatataaatcaacatgaagtatatgcacaacaagctagaagaattttagataga
atagttggttatcaattaagtcccttattatggaaacatttaccaggtacaaaatcagct
ggaagagttcaatcagtattagtaagaattatagtagaacaagaacgtaaaattcgtgaa
actcaaagtgaaatgagagtaaaggtatatggtgaatttttaaaagggaaaaaaaagatt
aatacaactttatattataaagataaaattaaggaatttgaaaatttagatattcctgaa
caattatttaaattactcacaaataaagataatttttatgttgacaaaataataacatca
caagtaaataaaaatccaccacctccttttattacttcttctttacaacaagaagcttca
attagattaaaatttcctacaaaaatgacaatgtcagtagcacaaaaattatatgaaaaa
ggtttaattacttatatgagaacagattcaacagtattatcaagtgcagctttaggaatg
ttaaaaaaatttataatagaaaattatggagataattattaccagggaagaaactacact
aaaaataaaaaaaatgcacaagaagcacatgaagcaattagacctacaaaattaaatgta
gatactagtaagctaaaattagaagaaaaaaaattatttaatctaattttaaatagaaca
ttagcaagccagatggcatcagctattattacaaatcaaaaaatatatataaaaacaaat
aatataaaatggaataaatatgattttcaaactattgttaatcatattaaatttgaggga
tatcttaaagtatatcataatcaagaagaagatgagaagattattaaactccaagaaaaa
gaacaagttgatttaaatcaactgactacaactgaagattataaagaacctcctaaaaga
ttaaatgaagctagtttagttaattatttagagaaaaaagggataggtagaccttcaacc
tattcctccttaatttcaaaagtgttagatcgcaaatatgtagaaattaaaagtattcct
ggagtaaaacaaaaaattaattttgttcaattaaataaaaattttgtattagatagaggt
tctaaacaaatagcagtaggaagtgaaaaacataaattaattccaacagagttaggattt
aaatcaaatgattttttaatgaaatattttaataatattttagaagaaaattttacagct
catttagaaaattctttagataaaatatcacataataaattatgttggatagatctgctt
tctgacttttatcaaaatttaaaaccaattattcaaagtttaaataatttaaaaattgaa
agaaaagatgatattgatgaattattaggagaaattaataagataaaaatatattatggt
aaatcacaatatgggttttatgttaaaaaacaagaaaataaaaaatggaaatttagctca
gttgaatctaaaccaactttagaagaagcttttaaaaaattagaatttccaaaagtttta
ggaaaaaaaggaaatactgttgttactctttttataggtaaatttggtccctacattaaa
tatggatctcttaattgttctattcctagtgatgtaaatataaataaattaactcttgaa
gactcttttaaatatttagaaggtaaaggaaataaaaatattcttaaaagtataatgcat
aataataaattaattttaataaaaaaaggaccatatggaaattatctacaaactactttt
aaaagtaaaaaaataaatttaaaattaggggaaaaaatacctgaagataacgaaataatt
gaaatgataaataaatataaataa
DBGET
integrated database retrieval system
