Viruses: 9887533
Help
Entry
9887533 CDS
T40000
Symbol
crov131
Name
(RefSeq) Cafeteria roenbergensis virus BV-PW1; putative superfamily II helicase/VV D11-like transcription factor
KO
K26906
Mimiviridae putative ATP-dependent RNA helicase
Virus
693272
Cafeteria roenbergensis virus BV-PW1
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
ResIII
DEAD
SNF2-rel_dom
NPHI_C
Helicase_C
AAA_19
KH_PARP14_1
NPHP3_N
Cnd2
SWI2_SNF2
Erf4
Radical_SAM_2
AAA
AAA_22
Aminotran_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
9887533
NCBI-ProteinID:
YP_003969763
RS:
NC_014637
UniProt:
E3T4Q1
LinkDB
All DBs
Position
NC_014637:131226..132938
Genome browser
AA seq
570 aa
AA seq
DB search
MKYPDIEDENFNNLITKKLQPYYIKKTKKTMKQLCQPKKFKLQNSQKLVADFMGPSTPYN
NLLVFHQIGSGKTCTAITVAEQWKHTKKILILTPASLVDNMRDELRSSCGQNNYITLTEL
KELEKYKVSDKRYQAIIKKSNERIAKFYNIMSYHKFVKLALDNKINLKNTLLIIDEIQNM
VSESGTFYRVLYQKIINAPSDLKILLLSATPMFDRPQEIGLTLNLLRPTVPFPIGTEFVD
TYLKKYKTKNGFNYRPINMRDFKDKITGLISYYRGANPISYPDTNFMIKRITMNEFQYKS
YLGSLSDNDGYIRGAFKSADILNLPTNFLIGPRVVSNIAFPNKCTGSDGIKCLRGECLEL
QNLKNYSIKFYHILKKLKQSEGPCFVYSNFKTYGGIDCFIRVLKKHGWKDFKKQGEGTRR
FAIWSGDETMEYKSLVKSTFNQPNNHNGSKLHLILGSPSIKEGVTLKRLEQMHILEPYWN
LSRMLQIIGRGVRYCSHADLPKRKRKVDIYLYLAKTPDNRESVDEYIWKLAKQKAKLINQ
FEKTMKEHAIDCEIFYNANYDSENPLKCFS
NT seq
1713 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagtatccagatattgaagatgaaaattttaataatctaattactaaaaaattacaa
ccttattatattaaaaaaactaaaaaaactatgaaacaattatgtcaacctaaaaaattt
aaattacaaaattcacaaaaacttgtagctgattttatgggtccaagtactccttataat
aatttattagtttttcatcaaattgggtctggtaaaacttgtacagctattactgttgcc
gagcaatggaaacatactaaaaaaattttaattttaactcctgcatctctagttgataat
atgagagatgaacttcgttcatcatgtggccaaaataactatattactttaacagaatta
aaagaacttgaaaaatataaagtttctgacaaaagatatcaagccattattaaaaaaagt
aatgaaagaattgctaaattttataatatcatgtcatatcataaatttgttaaattagca
ctagataataaaataaatttaaaaaataccctattaattattgatgaaattcaaaatatg
gtatcagaatcaggaacattttaccgtgtattatatcaaaaaattataaatgctccttca
gatttaaaaattttattattatctgctactcccatgtttgatagacctcaagaaatagga
ttaaccttaaatcttttaagaccaacagttccttttcctataggtacagaatttgtagat
acatacttaaaaaaatataaaactaaaaacggtttcaattatcgtcctattaatatgaga
gattttaaagataaaattacgggattaatttcatattatcgtggtgcaaatccaatatct
tatcctgatactaattttatgattaaacgtataacaatgaatgaattccaatacaaatca
tatttaggttcccttagtgataatgatggatatattagaggagcttttaaaagtgctgat
attttaaatttacctactaattttttaattggacccagagttgtaagtaatattgctttt
cctaataaatgtacaggaagtgatggaattaaatgtttaagaggtgaatgtttagaattg
caaaatttaaaaaattattctattaaattctatcatattttaaaaaaactaaaacaaagt
gagggaccttgtttcgtttattcaaattttaaaacatatggtggtattgattgttttatt
agagtattgaaaaaacatggatggaaagattttaaaaaacaaggtgaaggtactagaaga
tttgctatttggtcaggtgacgaaactatggaatataaaagccttgtaaaatccaccttt
aatcaacctaataatcataatggttctaaattacatttaattttaggttcaccttctata
aaagagggtgttacacttaagagattagaacaaatgcatattttagaaccttattggaat
ttatctagaatgttacaaattataggaagaggtgttagatattgttctcatgctgattta
cctaaaagaaaacgtaaagttgatatctatttatatcttgctaaaactcctgataataga
gaaagtgtagatgaatatatttggaaattagctaaacaaaaagctaaattaattaatcaa
tttgaaaaaactatgaaagaacatgctattgattgtgaaatcttttataatgctaattat
gatagtgaaaacccattgaaatgttttagttaa
DBGET
integrated database retrieval system