Viruses: 9887541
Help
Entry
9887541 CDS
T40000
Symbol
crov139
Name
(RefSeq) Cafeteria roenbergensis virus BV-PW1; putative 5'-3' exoribonuclease
Virus
693272
Cafeteria roenbergensis virus BV-PW1
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
XRN_N
DUF3642
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
9887541
NCBI-ProteinID:
YP_003969771
RS:
NC_014637
UniProt:
E3T4Q9
LinkDB
All DBs
Position
NC_014637:complement(142557..144740)
AA seq
727 aa
AA seq
DB search
MGLEKIYNTFYRLFGGNEDMEENDFDDNFNYIPAESIFIDGNFIVYHIFNLIEQDINDIL
KVILAVPHNSERDKLIKLIHKILENSPLKNYAGYFEDIFYQESLEKMVEMLRNKTLNLEH
KDNQMKHIISEYYLEYVKNKIINLHYTEFIKNIYLIFDGVPSGFKIIEQRRRRFKNYLES
NIRKSLLENHMINFPDNLTINQVRDDSIIFDYGKFVENMITLNKSFGPSSNLFKIIGLKI
KYFLNTFYPKITYWYSGVNEKGEADFKILHLCRLCEDDNIVVHCSDFDFIILCSRLQNNS
FNKLYMMRHFDKSYLIINFSKLNKRIMDYLLNIFKIKLDKKIIDDFYFIINLFGNDYIPP
LKELNFDTNFMELIEIIGNNLWKNNKFILKNEKIDFNNLKQIFIKLNNFNNLNLKSYLKN
NYYCNSILKHIPPNITTFYQFDEEILTPYWLDKIFELESWDDLYQKDIRLDIIQLHFPLL
KEDLIKKKLDDLKNDLKQIISKINILPDNLKITLDKILKPYYTENKGLKKKVINYKFNEN
IYDNLYYFYCTEAKNKINELFPLLENRNEINNPLNSTEKEIVNDYLLTLELINYKFYNPM
SYTLFFYKNYNSPPISLILNCIDNYVNNSIESYLTDETIDTYLHLILISPNNRELYSNYD
TFFKENTDLILVSNSEKILNNSFLIKKFNLYRNINLDKIRISWDDFILNLNKNKILANTN
FDIKLLN
NT seq
2184 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggcttggaaaaaatatataatactttttataggttatttggaggtaatgaagatatg
gaagaaaatgattttgatgataattttaattacattccagcagaatcaatatttattgat
ggtaattttattgtttatcatatctttaatttaatagaacaagatataaatgatatttta
aaagttattttagcagttccccacaactcagaacgtgataaattaataaagttaatacat
aaaatattagaaaatagtcccttgaaaaattatgctggatatttcgaagatatattttat
caagaatcattagaaaaaatggttgaaatgttaagaaataaaactttaaacttggaacat
aaagataatcaaatgaaacatataatttctgaatattatcttgaatatgttaaaaataaa
attataaatttacattatactgaatttattaaaaatatatatttaatttttgatggggtt
ccttcagggtttaaaataattgaacaacgacggagacgttttaaaaattatttagaatca
aatattcgtaaaagcttattagaaaatcatatgataaattttcctgataacttaactata
aaccaggtaagagatgatagtataatttttgattatggtaaatttgtagaaaatatgatt
actttaaataaatcatttggtccatcatctaatttattcaaaataattggattaaaaatt
aaatattttttaaacacattttatccaaaaattacctattggtatagtggtgttaatgaa
aaaggagaggcagattttaaaatattacatttatgtagattgtgcgaggatgataatatt
gtagttcattgtagtgattttgattttataatattatgtagtagacttcaaaataatagt
tttaataaattatatatgatgcgccattttgataaatcttatttaattataaatttttca
aaattaaataaaagaataatggattacttactaaatatatttaaaattaaattagataaa
aaaattattgatgatttttattttattataaatttatttgggaatgattatattccacca
ttaaaagaattaaattttgatactaattttatggaattaatagaaataattggaaataat
ttatggaaaaataataaatttattttaaaaaatgaaaaaatagattttaataatttaaaa
caaatatttattaaattaaataattttaataatttaaatttaaaatcatatttaaaaaac
aattattattgtaattcaattttaaaacacattcctccaaatattaccactttttatcaa
tttgatgaagaaattttaacaccttactggttagataaaatttttgaattagaatcttgg
gatgatttatatcaaaaagatattagattagatataatccaactacattttcctttatta
aaggaagatttaattaaaaaaaaattagatgatttaaaaaatgatttaaaacaaataatt
tctaaaataaacattttaccagataatttaaaaataactcttgataaaatattaaaacct
tattatacagaaaataagggattaaaaaaaaaggttataaattataagtttaatgaaaat
atttatgataatctttattatttttattgtactgaagcaaaaaataaaattaatgaatta
tttcctttattagaaaatagaaatgaaataaataatcctttaaatagtacagaaaaagaa
atagtaaatgattatttattaactttagaactaattaattataaattttataatccaatg
agctatactttatttttttataaaaattataatagtcctcctatttctttaattttaaat
tgtatagataattatgtaaataattcaattgaatcatatttaactgatgaaacaattgat
acatacttacatttaattttaatttctccaaataatcgtgaattatatagtaattatgat
actttttttaaagaaaatactgatttaatattagtttcaaattcagaaaaaatattaaat
aattcttttcttattaaaaaatttaatttatatagaaatattaatttggataaaattaga
atttcatgggatgactttattttaaatttaaataaaaataaaatattagcaaatacaaat
tttgatattaaattattaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
