Viruses: 9887544
Help
Entry
9887544 CDS
T40000
Symbol
crov142
Name
(RefSeq) Cafeteria roenbergensis virus BV-PW1; hypothetical protein
Virus
693272
Cafeteria roenbergensis virus BV-PW1
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Hint_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
9887544
NCBI-ProteinID:
YP_003969774
RS:
NC_014637
UniProt:
E3T4R2
LinkDB
All DBs
Position
NC_014637:147186..152738
AA seq
1850 aa
AA seq
DB search
MKNLILIENSLKDIDIFKNGINDNTILSNETEILNIDFTNINHIGFVYHYKGYPEFPFFK
DILKKNSGTPTSTHTLPQTNIFSDKFKQILKKITETNPKIIIDLLTCNVFNQKMIDEINL
LSNTLDITIRYSIDEKGSYPHGNWIQESHNIDIKDIYFNDLIINWNYNLNNGVGLENLTD
YFFTLPGAGSNYFYLKNNFSWPPAGFNSTDFIQLFPGQTLDGNGYILTFGSDYEGIVATN
HVNLTSESEMVDIPIIRNLGTTWDTMVNGSGGIVRKEQQFFSISKCYSDGIITDRSGGIS
GENCGHDGLIIISDCYSTGGKTMIASGNLGEEAGGIVGRYTCSSINTSANMTILNCYSTA
SPVARGSGGICGSLVCSSSSSNTQVQTNVHIQECFSLGHQIGDSNDLPNYSYCGGICGSE
CSYTSIISAKTELSISNCYTIGNIENRSGGIVGGMTCWGQGLSGCVIENCYALGNVSNES
GSIAGYNLSYKEFTPIHYAIIRFCVGKNPYYTLQFSDPTRYEITLTDSINDVSQLTIGTF
IFSPEALLNNRWEFPIGNYPYLTGYSHNWNNYTSYDSTPSLQITSVPEQDLEITPPGLYV
LYENIPSQSYIKPCYTSIYLYINDDLSKKYKVGLVMSPNPTDSTSFIIYSKEEFIHVFKS
YEPYDPNEINENINIYKYKVEIWEFVQNFIMGTYTFNGNVYIKTPGTGVNMGIRLPELNN
PLLIGIQFVDSNEPFTPLTSYQQIVQLPGGPEVKINLEFEIDHLLKSFNEKNYVFTIGSN
YFIKLLTNNYVSNNDTNIDPIEDTEKTLINYSHPVDSMKRLNEMFQKNIYSFYNINNNPV
NQLFSPGDFATFRHLGDDIIDRSVTIDPIPYYNSEKSFYFQYLQTENFQSTINIILPIPQ
ELLTNGDNPDCPYYLDTSNINSVVLFNYNNIKIGPMTWSSTHNYYYTTITEESPVGITDF
TPFKLSFVFQFVNKEGPIMINSPSLIMPPPVPETGDLSNSSNYSDIFENIVENSTYNLNE
ELSTNNNIILNFFNESLYSKINNEIAKLYDIYLKFTFKSKIYYIFVETLNLTEFYNSFSN
ENYIVEPHNLSGVKVSFYNLIKFLPNDVISQLNILLVPGEKYPYGSEITYPINLTSFGNN
FKNIRIDLYGKPLNIVNPASTPSIDVGDLDENDFIISKEVINYNDFSFNPQPSENIFSKL
FYYNIQISKNEQVIGSGNSFKTNHFIIRKTIQLRRGTQTNYYNLYNIYYTKDLIVNDTVS
NLDNNTNYLGNNLIKLTFKTDINTGSDTSISINQEIKSFETTVNSDNLTEFINNNVTTEN
NNTEPVPAVNDFTQALQQLIEQDSTIQLSVESIQLNDSSSISNLIGANLEEDGSVVINGD
AIGIYDLITNNITVASADTIKYTYQNKDGSTIFKIISKNTKQVFTIKAFNKNGVWQSQTI
GEGSLIVESKLLIKYLYVYDLDMGQLPGNEINEINYNNNGFRIYSENNITATAILLNDFE
KLENEDEDDQINLNIYEEVGNIKTYYFLDISEYVEDTFNVLQPGNIYRIFINQENKDEIY
FDILYQVMGKEYNVNEGLINEPLGINFNDTLKINSYLHYWYNLTGTMDNLLIFLQNNYRV
VSSENDIIYNDNSIGELQFIFTNNNSVTFTNELYSDITFSINELYDTTKVFTHNFYNIEI
KGLGKNGSGIVQLTLLSPSVIPCVTFDTLIKTPSGEKYICDLEEGELVKTSNGENVPIIK
KMVKKCINPKKMPFIIPKNYYGKNMPNRDLYISGNHAINIGNNTWRYPQMENFDRLNKKE
IIYYNLKLPDYHKHQFIANNLVIESWNDEDTNIQNYKWITKGNNIIKILL
NT seq
5553 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaacttaattttaatagaaaattccctaaaagatatagatatatttaaaaatgga
ataaatgataatactatattgtcaaatgaaacagaaatattaaatattgattttactaat
ataaatcatattggatttgtttatcattacaaaggatatcctgaatttcctttttttaaa
gatatcttgaaaaaaaatagtggtacacctacatcaacccacacactaccacaaacaaac
attttctcagataaatttaaacaaattttaaaaaaaattactgaaactaatcctaaaatt
attattgatttattaacttgtaatgtatttaaccaaaaaatgattgatgaaattaattta
ttaagtaatacacttgatattactattagatattcaatagatgaaaaaggttcttatcct
catggaaactggatacaagagagtcataatattgatattaaagatatatattttaatgat
ttaattattaattggaattacaacttaaataatggggttgggcttgaaaatttaactgat
tatttttttacgttacctggagcaggtagtaattatttttatttaaaaaataattttagt
tggcctcctgcaggttttaattctacagattttatacaattattcccaggtcaaacttta
gatggtaatgggtatatcttaacatttgggtctgactatgagggtattgttgcaacaaat
catgttaatttaacatcagaatctgaaatggttgatattccaattattcgtaatttaggt
actacttgggatactatggttaatgggtcaggaggaattgttagaaaggaacaacaattt
ttcagtatttctaaatgttattcagacggtattattactgatagatcaggaggtatttca
ggtgaaaattgtggtcatgatggattaattataatttcggattgttattctactggtggt
aaaactatgatagcaagtggcaatttgggtgaagaagcagggggtattgtaggtagatac
acatgtagttctataaatacttcagcaaatatgacaattttaaattgttattcaactgca
tctcctgttgcaagagggtcgggtggtatttgtggttctttagtatgttcaagtagttct
tctaatacacaagtacaaactaatgttcatatacaggaatgttttagtttaggtcatcaa
attggtgattctaatgatttaccaaactactcttattgtggaggaatatgtgggtctgaa
tgttcttacacatctattatttcagcaaaaacagaattaagtattagtaattgctatact
attggtaatattgaaaatcgttctggtggtattgtaggtggtatgacttgttggggacag
ggacttagtggatgtgttatagaaaattgttatgcattaggtaatgtatctaatgaatca
ggttcaattgcaggttataatttgtcttataaggagtttacaccaattcattatgccatt
attagattttgtgtaggtaaaaatccttattatacgttacaatttagtgatcctaccaga
tatgaaataaccttaactgattctataaatgatgtatcacaactaaccataggaactttt
atattttcaccagaagcattattaaataataggtgggagtttccaataggtaattatcct
tatttgactggttatagtcataattggaataattatacttcatatgacagtactcctagt
ttacaaataacaagtgttccagaacaagatttagaaataacaccaccaggtttatatgta
ttatatgaaaacatcccaagtcaaagctatattaaaccttgttacacctctatttattta
tatataaatgatgacttatctaaaaaatataaagtaggtttagttatgtctcccaatcca
acagattcaacctcatttattatttattcaaaagaagaatttattcatgtgtttaaaagt
tatgaaccctatgatcccaatgaaataaatgaaaatataaatatatataaatataaagta
gaaatatgggaatttgttcagaactttataatgggaacttatacatttaatggtaatgtt
tatattaaaacaccaggtacaggtgtaaatatgggcatacgtttgccagaacttaataat
ccattattaattggcatacaatttgttgattcaaatgaaccatttacccctctaacatct
tatcaacaaatagttcaactgccaggaggaccggaagttaaaattaatttagaatttgaa
atagatcatttgcttaaatcatttaatgaaaaaaattatgtgtttaccatagggtctaat
tattttattaaattacttactaataattatgttagtaataatgatactaatattgacccc
attgaagatactgaaaaaacattaattaattactctcatcctgttgattcaatgaaaaga
ttaaatgaaatgtttcaaaaaaatatttattcattctataacataaataataatcctgtt
aatcaattatttagtccaggagattttgcaacttttagacatttaggagatgatataatt
gaccgctcagtaactattgacccaatcccttattataattctgaaaaatcattttatttt
caatatttacaaactgaaaattttcaaagtactattaatattatattacctattccacaa
gagttattaacaaatggtgataatcctgattgtccatattatttagatacttcaaatatt
aactctgttgttctttttaattataataatattaaaattggtccaatgacttggtcatcc
acacataattattattatactacaataactgaagaatcaccagtaggaattacagatttt
acaccttttaaattaagttttgtatttcaatttgtaaataaagagggtccaattatgata
aattcacccagtttaattatgccaccaccagtacctgaaactggagatttatcaaatagc
agtaattatagtgacatctttgaaaatatagttgaaaattcaacatataatttgaacgaa
gaattatcaacaaataataatattattttaaatttttttaatgaaagtttgtattctaaa
attaataatgagattgccaagttgtatgatatttatcttaaatttacattcaaatcaaaa
atatattatatttttgtggaaacattaaatcttactgaattttacaatagcttttctaat
gagaattatatagtagaaccacataacttgtctggagtaaaagtgtctttttacaattta
attaaattcttaccaaatgatgttatttcacaattaaatattctactagttccaggagaa
aaatatccatatggaagtgaaataacttatccaatcaatttaactagttttggaaataat
tttaagaatatacgtattgatttatatggtaaacctttaaatattgtaaatcctgcgtct
actccttctattgatgttggagatttagatgaaaatgattttattatttcaaaagaagta
attaattataatgattttagttttaatcctcaaccttctgaaaatatattttccaaatta
ttttattataatattcaaattagtaaaaatgaacaagtaattggttcaggtaattccttt
aaaactaatcattttattattagaaaaacaattcaattaagaagaggaactcaaacaaat
tattataatttgtataatatatattatacaaaagatttaattgtaaatgatacagtttct
aatttagataataatacaaattatttaggaaataatttaattaaattaacttttaaaact
gatataaatactgggagtgatacctcaattagtattaatcaagaaataaaaagttttgaa
acaacagttaattctgataatctaacagaatttattaataataatgtaactactgaaaat
aataatacagaacctgtaccggcggtaaatgattttactcaagctttacaacaacttatt
gaacaagattcaactattcaacttagtgtagaaagtattcaattaaatgactcttcctca
atttctaatttaattggtgctaatttagaggaagacggaagtgttgtaataaatggtgat
gcaataggaatttatgacttgattacaaataatataacggttgcatctgctgatactata
aaatatacttaccaaaataaagatggttctaccatatttaaaattatatcaaaaaatact
aaacaagtatttaccataaaagctttcaataaaaatggagtttggcagagtcaaacaatt
ggtgaaggatcattaattgttgaaagtaaattattaattaagtatttgtatgtgtatgat
ttagatatgggtcagttaccaggaaatgaaataaatgaaataaattataataataatgga
tttagaatttattcagaaaataatataactgcaactgcaatattattaaatgattttgaa
aagttagaaaatgaagatgaagatgaccaaattaatttaaatatttatgaagaagttggt
aatataaaaacatattatttcttagatatttccgaatatgttgaagacacttttaatgta
ttacagcctggaaatatatatagaatttttataaatcaagaaaataaagatgaaatatat
tttgatatattatatcaagtaatgggaaaagaatataatgtaaacgaaggtttaatcaat
gaacctttaggaattaattttaatgatactttaaaaattaattcatatttacactattgg
tataatttaactggtactatggataatttattaatatttttacagaataattatagagtg
gtatcttctgaaaatgatataatatataatgataatagtataggtgaacttcaatttatt
tttactaataataattcagtcacttttactaatgaattatattctgatattactttttct
ataaacgaattatatgatactactaaggtatttactcacaatttttataatattgaaatt
aaaggattaggtaaaaatgggtcaggcattgtacaacttactttactttcaccatcagta
ataccttgtgtaacttttgataccttaattaaaacaccatctggtgagaaatatatatgt
gatttagaagagggagaacttgttaaaacatcaaatggtgaaaatgttcctattataaaa
aaaatggttaaaaaatgtattaatcctaaaaaaatgccttttataattccaaaaaattat
tatggtaaaaatatgcctaatagagatttatatatatctggaaatcatgcaataaatatt
ggtaataatacttggaggtatccacaaatggaaaactttgatagactaaacaaaaaagaa
ataatttattataaccttaaattacctgattatcataaacatcaatttattgctaataat
ttagttattgaatcatggaatgacgaagatacaaatatccaaaattataaatggattact
aaaggaaataatataattaaaatattattataa
DBGET
integrated database retrieval system
