Viruses: 9887600
Help
Entry
9887600 CDS
T40000
Symbol
crov198
Name
(RefSeq) Cafeteria roenbergensis virus BV-PW1; putative ubiquitin-conjugating enzyme E2
Virus
693272
Cafeteria roenbergensis virus BV-PW1
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
UQ_con
RWD
UEV
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
9887600
NCBI-ProteinID:
YP_003969830
RS:
NC_014637
UniProt:
E3T4W8
LinkDB
All DBs
Position
NC_014637:217440..219629
AA seq
729 aa
AA seq
DB search
MSKIPEIKHQLLFNKLFWESSNITLFKYDDATITIGNKHTRIEIKFFKLEDNYYPVVSAS
YQEASKINIELIGLKLNHPSNLSKFKTIIETYINQEHCNTKTENSKSLVDNLYLTNATKN
VKFFIDKDLVLINTIGNNIYNKSELIDTFNNNYNSKQIIYNELVEFNSNLDFPDYAEIRD
NNIYQVYLNIYKTLDEKCIIKFDFDSNFYPLVPPKIQWMAPKISKEDYSAIINCSVFGGG
WSQLITIPWLFTQIKNKLLERESTKNSKFFSKDITFVDYQETLIVGFAKTTGRFICPNPI
EISVNSIKKPLKTSSTHMKKGTGYGTGPTDKVNYLDIQKNIISEKTDYIDKIYRIKNITS
SNKSFLFNILIKEIMGITLLELIKYPILYYKYFKIIKNIATKELFNNLDCLEEIKLDFTN
LIENINISDDPALEFKIYNKIHPIVSDLIKLIDIDIDIDKTELTPKISTNTLDEYCTIMK
PLQFSYNDISKCKFAYHNITGPQRTPKQMTRIAQEISSLQKSLPLNKNSCVWIRWDKKQL
NKMQFMISGPQDTPYQDGLFLFDCYFPHNYPLVPPLINLQTTGNGTVRFNPNLYENGKVC
LSLLGTWTGSNSEKWNSKTSTMLQVIVSIQSLILNEEPYFNEPVYQHTMGTPTGIKHSLQ
YNQNIRSATSVWAINNMINNPPSGFEDIVKNHFKLKKNNLIKTLQHWENIADTIYREHIQ
KVLKNIMKL
NT seq
2190 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctaaaataccagaaattaaacaccaattattatttaataaactattttgggaatcc
agtaatattacactatttaaatatgatgatgcaacaatcactattggaaataaacatact
cgaatagaaattaaattttttaaactagaagacaactattatcctgtagtttcagctagt
tatcaagaagcttctaaaattaatatagaattaattggacttaaattaaatcatccttct
aatttatctaaatttaaaacaattatagaaacttatataaatcaagaacattgtaataca
aaaactgaaaatagtaaatcacttgttgataatttatatttaactaatgccactaaaaat
gtcaaattttttattgataaggatttagtgttaattaatacaataggtaataatatatat
aataaaagtgaactaatagatacatttaataataattataattcaaaacaaattatttat
aatgagttagtagaatttaattctaatttagattttccggattatgctgaaattagggat
aataatatttatcaagtatatttaaatatttataaaacacttgatgaaaaatgtattatt
aaatttgattttgatagtaatttttatccattagttcctcctaaaatacaatggatggca
cctaaaatttcaaaagaagattactctgctataattaattgttctgtatttggtggtggt
tggtcacaattaataacaattccatggttgtttactcaaattaaaaataaattgttagaa
agagaatccactaaaaatagtaaattttttagtaaagatataacttttgtagattatcaa
gaaactttaattgttggttttgctaaaactacaggaagatttatatgtccaaacccaatt
gaaattagtgttaattctattaaaaaaccacttaaaacatcatctacacatatgaaaaaa
ggcactggatatggaactggtccaactgataaagttaattatttagatatacaaaaaaat
attatttctgaaaaaacagattacatagataaaatttatagaattaaaaatattacttct
tcaaataaatcatttctatttaatatattaattaaagaaattatgggaattaccctatta
gaactaattaaatatcctatactttattataagtattttaaaattattaaaaatattgct
acaaaagaattatttaataatcttgattgtcttgaagaaattaaattagattttactaat
ttaattgaaaatattaatattagtgatgaccctgctcttgagtttaaaatttataataaa
attcatccaatagtttcagatttaattaaattaattgatattgatattgatattgataaa
actgaattaacacctaaaatatctacaaatactttagatgaatattgcactattatgaaa
cccttacaatttagttataatgatattagtaagtgtaaatttgcttatcataatattaca
ggtccacaacgaactcctaaacaaatgactagaattgctcaagaaatttcatctttacaa
aaaagtttaccacttaataaaaattcatgtgtatggattagatgggataaaaaacagctt
aataaaatgcagtttatgatatcaggaccacaagatacaccctatcaagatggattattc
ttatttgattgttatttccctcataattatccactagtaccaccattaattaacctacaa
actacaggaaatggtacagttagatttaatcccaatttatatgagaatggaaaagtatgt
cttagtctattaggaacatggactggttcaaatagtgaaaaatggaattctaaaacatct
actatgcttcaagtaatagtttctattcaaagtttaattttaaatgaagaaccatatttt
aatgaacctgtatatcaacacacaatgggaactccaacaggtattaaacatagtttacaa
tataatcaaaacattaggtcagctacatctgtatgggctataaataatatgataaacaat
cctccctcaggatttgaagatattgttaaaaatcattttaaacttaagaaaaataattta
attaaaacacttcagcattgggaaaatattgctgatactatatatagagaacatatacag
aaagttctaaaaaatattatgaaattataa
DBGET
integrated database retrieval system
