Viruses: 9887714
Help
Entry
9887714 CDS
T40000
Symbol
crov311
Name
(RefSeq) Cafeteria roenbergensis virus BV-PW1; hypothetical protein
Virus
693272
Cafeteria roenbergensis virus BV-PW1
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
PheRS_DBD1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
9887714
NCBI-ProteinID:
YP_003969944
RS:
NC_014637
UniProt:
E3T582
LinkDB
All DBs
Position
NC_014637:complement(341642..346282)
AA seq
1546 aa
AA seq
DB search
MSFNEIDEIVDNILDNFYQNIIKQNIYNQILKDANFVRYQNNILTFIEDFFNNNTITLSK
HLKKNHDIIINIIKSIVYYYFFLGLSYYYKNGRDAFITNIIELSKNQAKSKVKITGFFTS
NSNGLIIKNYDIVKNSLELTSHKTLEQIKNTITNSPIKYETTNKFIKDISIDFFINNIID
NPENFHILIKTIVIKNIYQLYERSNLLSIINEEQETEGEFRYITVVTAKLGKMVDYNVIE
KMLTPSQIREGLATDIYNYILYYKDKTKLHLKDRENIIDYLFSEKILVPITEEFLKFHKK
TEKYQKSDKSNKEDTKAKFIISKLKHIKKYYSEVVKSDPKKKLDVKNLFYTPLIDRLATL
FNQTEDVKIINKLQQANNVDLTEILNDMENLTKYSYLNFDNFSKDGIKIRTSKPVQGVRY
CNLSTKSNPNPTNKLLETRVGNDLLDMNVVGVMFLPEKDLPNLIERKKLVSVNDDSPYQD
FLKKVEKEVLGKSSDKKYFWLFDTNKDKLDTTLYNDVSGGDIDKTISVFLEDFYDNYYQM
ILQKAKNLIKEKKISSFEDFYLLIDSLSSKYTNLTREPEIYNNLIKYFRQTAIKDLQITQ
DEIDNMIPNKNKNLIKLPIIKVPLAKQNIIYVEDTETKKIINQDYSQSICIHHLIWKDIS
SMRKTDIDNFNQRIFDFVKKYVKVNDSGEYICKSCDELLPIKKYVYAGSYVDEIDTFLTT
SIAVNQNLERIPKYRIYNRTIKNVDRLIERIGLLGNFNILLGNTPIIKLRRRLIVKDTLD
MVLAHNVTLSKIMKSRSEVEQRGRNALKNYNIDPAYSKVFFFELKDDIFLTSSEDTDKYK
IVKYNNLLTYLILMIILEINSGQILGIKETKFYNFYFYEKFIPLFNKLKLRLSKTEIISI
GKIPLFAYTIYIISGMISKDGIWFGTDKTKGVNVEAQKEIIYSVVDLINSIMEESFKKEK
NFIYEIFTSRIINQIKSTYQDIRVFKMIEQEKKGNMIVNENKKLQYIEKKHTGIIVKNNK
IKDIDLVDIKFEDVDFNRCYTEIRILKNKKMVNYGDYITGEYYEEKLNTQILSFLKKICA
RDKLENWEKNLCDKYGPLFDKKLDKKDMDFFLNNIKNTQTQKFIKDKLIEDKLIKKNKET
LQRREEVTNRWKTLFSKETDLEAYQNKFIDNLIKVVGKKINTEILQINLDDNIFIIEHDY
LGNPRKNKLTILESENLFTQENNNNLFGYDIPVMYFYDSQSRVYMYYHLISHQYLGYSVD
KTKFQKLTPNNYLIVNYSVKNMIKLIGFKNKYERILDYVSKENLDKTDNNQIIQTILDRR
INNLKTIIFKTNSIINQVKNQQNTQTNTKENDIIKQFISRINNFKDKNNEGKKGVFKNIN
YILDIKPDKIKGEFIMDYPGYIDTKIFDRFENNDSLLIFYLLSELNKLIEYNSNNKTIQS
ELAYLIISAIKYIFESYYEQNYSTHVQKFYFLTKLIDDDTMVDERVSFVGMYSELLHQEE
LENKEINEDIYDAEQETTALDIDDYDEDDDFAFDNEYDREIPDAMI
NT seq
4641 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcgtttaatgaaattgatgaaatagtagataatatactagataatttttaccaaaat
attattaaacaaaatatttataatcaaattttaaaggatgcaaattttgttagatatcaa
aataacattttaacatttattgaagatttttttaataataatactattaccctatcaaaa
catctaaagaaaaatcatgatataattataaatattattaaaagtattgtatattattat
tttttcttaggattaagttattattataaaaatggtagagatgcatttataaccaatata
attgagttatctaaaaaccaggcaaaaagtaaagttaaaattacaggtttttttacttct
aattcaaatggattaattattaaaaattatgatattgtaaaaaattctcttgaattaaca
tcacataaaacattagaacaaattaaaaatactattacaaattcaccaattaaatatgaa
acaacaaataaatttattaaggatatatcaattgatttttttataaataatataatagac
aatcctgaaaactttcatattttaattaaaactattgttattaaaaatatttatcaatta
tatgaaaggagtaatttattatcaattattaatgaagaacaagaaacagaaggagaattt
agatatatcactgttgttacagctaaattaggcaaaatggttgattataatgttattgaa
aaaatgttaacaccgtcacaaattagagaagggttagccacagatatatataattatatt
ttatattataaagataaaacaaaacttcatttaaaagacagagagaatataatagattat
ttatttagtgaaaaaatattggttccaattactgaagaatttttaaaatttcataaaaaa
acagaaaaatatcaaaaatcagataaaagtaataaagaagatactaaagctaaatttata
atatccaaactcaaacatattaaaaaatattattcagaagttgttaaatcagatcctaaa
aaaaagctggatgttaaaaatttattttatactccattaattgatagattagctacttta
tttaatcaaacagaagatgttaaaattattaataaattacaacaagctaataatgtagat
ttaacagaaattttaaatgatatggaaaatttaactaaatattcatatttaaattttgat
aattttagtaaagatggtattaaaataagaacgtctaaacctgttcaaggggtaagatat
tgtaatctaagtactaagtctaatcctaatcctactaataaattattagaaacaagagta
ggtaatgacttattggatatgaatgtggtgggagtaatgtttttaccagaaaaagattta
ccaaatttaattgaaagaaaaaaactagtttctgtaaatgatgattctccttatcaagat
tttcttaaaaaagtagaaaaagaagttttaggaaaatcatctgataaaaaatatttttgg
ttatttgatacaaataaagataaactagacaccactttatacaatgatgtttcaggtggt
gatattgataaaacaataagtgtatttttagaagatttttatgataattattatcaaatg
attttacaaaaagctaaaaatttaataaaagaaaaaaaaatttcatcttttgaagatttt
tatttattaattgatagtttatcatctaaatatacaaatttaacaagagaaccagaaata
tataataatttaataaaatatttccgtcaaacagctattaaagatttacaaattactcaa
gatgaaattgataatatgattcctaataaaaataaaaatctcattaaattaccaattatt
aaagttcctcttgcaaaacaaaatataatttatgtggaagatacagaaactaaaaaaatt
attaatcaagattattcacaatcaatatgtatacatcatttaatctggaaagatatttca
tctatgagaaaaacagatattgataactttaatcaaagaatttttgattttgttaagaaa
tacgttaaagttaatgattcaggtgaatatatatgtaaaagttgtgatgaattgcttcct
attaaaaaatatgtatatgctggaagttatgttgatgaaattgatactttcttgactact
tctattgctgttaatcaaaatttagaaagaatacctaaatatagaatatataatagaact
attaaaaatgttgatagattaattgaaagaattggattattaggtaattttaatatttta
ttaggtaatacaccaattataaaattaagaagaagattaattgttaaagatactttagat
atggtgttagctcataatgtaactctaagtaaaataatgaaatcacgttctgaagtagaa
caaagaggtagaaatgctttaaaaaattataatattgatccagcatattctaaagttttc
ttttttgaattaaaggatgatattttcttaacttcttctgaagatacagataaatataaa
attgtaaaatataataatttactaacttatttaatattaatgattattttagaaattaat
tcaggacaaattttaggaataaaagaaactaaattttataacttttatttttatgaaaag
tttataccattatttaataaattaaaattaagattatcaaaaaccgaaataatttctatt
gggaaaataccattatttgcttatactatttatattattagtggaatgatttcaaaagat
ggcatatggtttggaactgataaaacaaaaggtgtaaatgtagaagcacaaaaagaaatt
atttattcagttgttgatttaattaattcaattatggaagaatcattcaaaaaagaaaaa
aactttatttatgaaatatttacttctagaattataaatcaaattaaatcaacctatcaa
gatattagagtatttaaaatgattgagcaagaaaagaaaggtaatatgattgtaaatgaa
aataaaaaattacaatatatagagaaaaaacatactggtataattgttaaaaataataaa
attaaagatattgatttagttgatattaaatttgaagatgttgattttaatagatgttac
accgaaattagaattttgaaaaataaaaaaatggtaaattatggagactatattacagga
gaatattatgaagaaaaattaaatacacaaattttaagcttcttaaaaaaaatttgtgca
agagataaattagaaaattgggaaaaaaacttatgtgataagtatggaccactttttgat
aaaaaattagataaaaaagatatggatttcttccttaataatattaaaaacacacaaaca
caaaagtttattaaggataaattaattgaagataaattaattaaaaaaaataaagaaaca
ttacaaagacgtgaagaagttactaatagatggaaaactttattttctaaagaaacagat
ttagaagcttaccaaaataaatttatagataatttaataaaagttgttggtaaaaaaatt
aatactgaaattttacaaattaatttagatgataacatatttattatagaacatgattat
ttaggcaacccacgtaaaaacaaattaacaatattagaatcagaaaatttattcacacaa
gaaaataataataatttatttggttatgacataccagtaatgtatttctatgattcacaa
tcacgtgtatatatgtattatcatttaattagccatcaatatttaggttattctgttgat
aaaactaaatttcaaaaattaactcctaataattatcttattgtgaattattctgttaaa
aatatgattaaattgattggttttaaaaataagtatgaaagaattttggattatgtctct
aaagaaaatttagataaaactgataataatcaaattatacaaactatattagatagaaga
attaataatcttaaaactattatatttaaaactaattctattataaatcaagttaaaaac
caacaaaatacacaaactaatactaaagaaaatgatattattaaacaatttatttctaga
attaataattttaaagataaaaataatgaaggtaaaaaaggagtgtttaaaaatattaat
tacattttagatattaaacctgacaaaattaaaggcgaatttataatggattatcctgga
tatattgatactaaaatatttgataggtttgaaaataatgatagtttgttaatattttat
ttattatctgaattaaataaactaatagaatataattctaataataaaactatacaatca
gaattagcttatttaattatatctgctattaaatatatttttgaaagctattatgagcaa
aattattcaactcatgttcaaaaattctactttttaactaaattaattgatgatgataca
atggttgatgaaagagtttcatttgttggtatgtattctgaattattacatcaagaagaa
ttagaaaataaagagataaatgaagatatatatgatgcagaacaagaaactactgcttta
gatattgacgattatgatgaagatgatgactttgcttttgataatgagtatgatcgtgaa
attcctgatgcaatgatctag
DBGET
integrated database retrieval system