KEGG   Viruses: 9887728
Entry
9887728           CDS       T40000                                 
Symbol
crov325
Name
(RefSeq) Cafeteria roenbergensis virus BV-PW1; DNA topoisomerase II
Virus
693272  Cafeteria roenbergensis virus BV-PW1
SSDB
Motif
Pfam: DNA_topoisoIV TOPRIM_C DNA_gyraseB Hom_end_hint Toprim Hom_end PlyCA_N DUF3955
Other DBs
NCBI-GeneID: 9887728
NCBI-ProteinID: YP_003969958
RS: NC_014637
UniProt: E3T596
LinkDB
Position
NC_014637:361386..365852
AA seq 1488 aa
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NT seq 4467 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
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DBGET integrated database retrieval system