Viruses: 9887889
Help
Entry
9887889 CDS
T40000
Symbol
crov486
Name
(RefSeq) Cafeteria roenbergensis virus BV-PW1; putative DNA mismatch repair protein MutS
Virus
693272
Cafeteria roenbergensis virus BV-PW1
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
MutS_V
MutS_III
MutS_I
HNH
HNH_2
AI2M-like_HNH
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
9887889
NCBI-ProteinID:
YP_003970119
RS:
NC_014637
UniProt:
E3T5Q7
LinkDB
All DBs
Position
NC_014637:complement(535942..538713)
AA seq
923 aa
AA seq
DB search
MIDYNNIKVTDYFQLHLDMKKKYGENTIILMQVGGFHEMYSTDKDGPNLEKIGEELDVLI
TKKNKNKTVSKNNPYMMGFPNHSLGKYVDLFINEGYLIVIVSQISTPPKPKRKITKIITP
STYQRDNSCSGNYLISVIIDESKSLQGESTIEIGLSAIELSIGQVFFHQGFSKKGDSNYS
LDDAARFIQSFKPTEIIYANISDKDVIGKYNISQICEYLRFPRNSLDLSSKISPLKKITF
QKRKFKEIFNTNLELIENMDIYPQARLSLFLIIYYIERINEVLLHKFQIPQIFYQPSKLY
LGNRTLKQLNFSKEDKLYNVINKCKTPMGKRFFEMNINNPESDITELNKRYSDIKQFSEN
TVDNKLFMGIYDTDRIIRKIQLKTIVPVDIYKLHSSLHTGLELYTKVNIDDKQIKKIINF
IEESVDLEKIRHLNSLDVKESFFLIDNKEFEKITLVNNKITQIMENLELNKTKFENLIDE
GKFIKKSILKVEANLIDGLYISGTKKRGLEIEKKFIKSDLYKQFNNITFNYQKTTVKIKG
DFLEKSFIDKSKLEGKLNELTSELFYSFIDKLEKYINELEHFSNNIAYYDFINSAVDLLN
KNHYTLPKIRKDSNQNSFIRAKNLRHPLVELLLDEEYIPQNISLDDKIRGVMLFGVNSAG
KSTLMKSVGISVLLAQIGYPVPAAKFEFYPYQSIFTRIVGNDDILKGLSSFMVEMIELNS
ILKRNNKNTLVIADELCRGTEVESAMYIVTTMIEALSKNNCSFITASHLHGLKNFNVINN
LQNVKPFHLKVEYKNNNLIYDRKLCEGYGSNCYGIEVAKYILEDQNIVNRIYEISNQFEE
MKMSKYNSEIVLEKCQICESKQQLETHHIIFQKDFNDGKHKKKLHLIKNNKSNLVVLCSK
CHDEVDRNNIKIEGWKNSKLVIK
NT seq
2772 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattgattataataatataaaagtaactgattatttccaattacatttagatatgaaa
aaaaaatatggagaaaatacaattattttgatgcaggttggaggatttcatgagatgtat
tcaacagataaagatggaccaaatttagaaaaaattggtgaagaattagatgtattaatt
acgaaaaaaaataaaaataaaactgtaagtaaaaataatccttatatgatgggatttccg
aatcatagtttaggtaaatatgtagatttatttattaatgagggatatttaatagtaata
gtatctcaaatttcaactcctcctaaacctaaaagaaaaataacaaaaattattacacct
tctacttatcaacgtgataattcttgttcgggtaattatttaatatctgtaataattgat
gaatctaaatctttacagggagaatcaacaattgaaattggtttatctgccatagaatta
tcaattggtcaagtattctttcatcagggattttcaaaaaaaggtgattcaaattattca
ttagatgatgctgctagattcattcaaagttttaaaccaacagaaattatttatgctaat
atatcagataaagatgttattggaaaatacaatatttctcaaatttgtgagtatttaaga
tttcctagaaatagtttagatctatctagtaaaattagtcctttaaaaaaaataacattt
caaaaaagaaaatttaaggaaatttttaatactaatttagaattaattgaaaatatggat
atatatccacaagctagattaagtttatttcttattatttattatattgaaagaattaat
gaagttttattacataaatttcaaattcctcaaatattttatcaaccatccaaattatat
ttaggtaatagaacattaaaacaattaaatttttcaaaagaagataaattatataatgtt
ataaataagtgtaaaactcctatgggtaaaagattctttgaaatgaatataaataatcct
gaaagtgatattactgaattaaacaaacgatattcagatatcaaacaattttcagaaaat
actgtagataataaattatttatgggtatttatgatacggatagaattattagaaaaatt
caattaaaaacaattgttcctgttgatatatataaattacactcatctttacatactggt
ctagaattatatactaaggttaatattgatgacaaacaaattaaaaaaattattaatttt
attgaagaatcagtagatttagaaaaaattagacatttaaattctttagatgtaaaggaa
tcatttttccttatagataataaagaatttgaaaaaattactttagtaaataataaaatt
actcaaattatggaaaatcttgaattaaataaaactaaatttgaaaatttaatagatgag
ggaaaatttattaaaaaatcaattttaaaagtggaagcaaatttaattgatggtttatat
attagtggtactaaaaaaagaggtcttgaaattgaaaaaaaatttattaagagtgattta
tataaacaatttaataatataacttttaattatcaaaaaactacagttaaaattaaagga
gattttttagaaaaatcttttattgataaatcaaaattagaaggtaaacttaatgagctt
acaagtgaattattttattcttttattgataaattagaaaaatatataaatgaattagaa
catttttctaataatattgcttattatgattttattaattctgcagttgatttattaaat
aaaaatcattatactcttcctaaaattagaaaagattctaatcaaaatagttttattaga
gctaaaaatttacgtcatcctttagttgaattattattagatgaagaatatattccacaa
aatataagtttagatgataaaattagaggagttatgttatttggtgttaatagtgctggt
aaatctactttaatgaaaagtgtgggaattagtgttcttttagcacaaataggatatcca
gttccagcagctaaatttgagttttatccttatcaaagtatatttacaagaattgttgga
aatgatgatattttaaaaggtcttagtagttttatggttgaaatgattgaattaaattct
attttaaaacgtaataataaaaatactttggtaattgcagatgaattatgcaggggtaca
gaagttgaatcagcaatgtatatagtaactactatgatagaagcattatctaaaaataat
tgttcatttattactgcaagtcatctacatggattaaaaaattttaatgttattaataat
ttacaaaatgtaaaaccttttcatctaaaagttgaatataaaaataataatttaatttat
gatagaaaattatgtgaaggatatggttctaactgttatggtatagaagttgctaaatat
atattagaagatcaaaatatagttaatagaatttatgaaatttctaaccaatttgaagaa
atgaaaatgagtaaatataatagtgaaattgttttagaaaaatgtcaaatttgtgaaagt
aaacaacaattagaaacacatcatatcatatttcaaaaagattttaatgatggaaaacat
aaaaaaaaattacatttaattaaaaataataaaagtaatttagttgtattatgtagtaaa
tgtcatgatgaagttgatagaaataatattaaaattgagggatggaaaaatagtaaactt
gtaattaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
