Viruses: 9887906
Help
Entry
9887906 CDS
T40000
Symbol
crov503
Name
(RefSeq) Cafeteria roenbergensis virus BV-PW1; DNA polymerase exonuclease subunit
Virus
693272
Cafeteria roenbergensis virus BV-PW1
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
RNase_T
UvrD-helicase
AAA_19
Viral_helicase1
UvrD_C_2
SLFN-g3_helicase
ResIII
AAA_22
AAA_30
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
9887906
NCBI-ProteinID:
YP_003970136
RS:
NC_014637
UniProt:
E3T5S4
LinkDB
All DBs
Position
NC_014637:560881..563493
AA seq
870 aa
AA seq
DB search
MIELSKEQHNIINLLKNNYNIIIDSVAGSGKTTTNLNIGKEFPNKNILLLTYNAKLKFET
RKKCIEQNIKNMEVHSYHSFCVKYFDRKCFTDSGIINFLKNKNNVNNNFDYDIILVDEAQ
DMSPLYFKIVLNIIKYNKNNYQIGIIGDQKQSIFDFNYADSRFIKYGDKIFNLNDKIWKK
ENLSISFRLTYENAHFINKCCFNKTIINTIKNGCKPTYFLTDSFGELGVNHIYNQLKDLL
KIYNPNDIFILAPSLKNEKSPCRQLENLLKKHLKIPIYVPVSDEEKIDDSIINNKLVFST
FHQVKGLERKVVVVYNFDKSYFDLFKKNKNPNVCPNELYVALTRATEKMVLVHHYKNDYL
PFINKKYIALCSTLIKTDTLHITNSFNKKHIEVSVTNLIKHLPQEIVDKAMTFLKVSIET
PKSDIISIPLKSKQGSGSESISEITGIAIPSYFELKKLNKLTILDNLNNNNDKNIINVDF
IDDDDTIDAELPFDLKDINISKITPAELLFISNLWNTKKTGYLFKKYQITNYNWLTQQNL
DLAVKRLDNLQIDATSKFEVKVSSKGKKELLNRELVGFIDCISNKRIFEFKCVNILTSEY
ILQLACYMYLFQTEFKKTYDNYLYNILTNELIKVSSSYNKLKEFVKFLITEKYFTNKTIT
DKEFLNNITNIKQSIMLNENENKNEINKIMILDTETTGLPKQRPFNPNNTSAYDNARMIE
LGYIIYNTKGDIIKKYNNLINHNIKINNSFIHGITSDICSKKGLIIDDVLDTFYQDLKEC
DVLVCHNVDFDKNILLNEIYRIKKMELYEHLNNKSTICTLKKTKELYGKRTKLSDWYKKN
FNDNTIQNHRALDDVIMTGKCFFKCKILTI
NT seq
2613 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatagaattatcaaaagagcaacacaatattataaatttattaaaaaataattataat
ataataatagattcagtagcaggtagtggtaaaacaacaactaatttaaatataggcaag
gagtttccaaataaaaatattcttttattaacttataatgctaaattaaaatttgaaacg
agaaaaaaatgtattgaacaaaatattaaaaatatggaggttcatagttatcattctttt
tgtgtaaaatattttgataggaaatgttttacagatagtggaattataaattttttaaaa
aataaaaataatgtaaataataattttgattatgatataattttagtagatgaagcacaa
gatatgtcacctttatattttaaaatagtattaaacattataaaatataataaaaataat
tatcaaattgggataataggtgaccagaaacaaagtatatttgattttaattatgctgat
tcacgatttataaaatatggtgataaaatatttaatttaaatgataaaatatggaaaaaa
gaaaatttaagtattagttttagattaacttatgaaaatgcacattttattaataaatgt
tgttttaataaaacaattataaatacaataaaaaatggatgtaaacctacatatttttta
acagattcatttggagagttaggagttaatcatatttataaccaattaaaagatttgtta
aaaatttataatccaaatgatatttttatattagctcctagtttaaaaaatgaaaaatca
ccatgtagacaattagaaaatctattgaaaaaacatttaaaaatacctatttatgttcct
gtatcagatgaggaaaaaatagatgatagtattattaataataagttagtattttctact
tttcatcaagtaaaaggattagaaagaaaagttgtagtagtatataattttgataaatct
tattttgatctatttaaaaaaaataagaatcctaatgtatgtcctaatgaattatatgtt
gccttaacacgagccactgaaaaaatggttctagttcatcattataaaaatgattattta
ccttttattaataaaaaatatatagctttatgttcaaccctaattaaaacagatacttta
catattacaaattcatttaataaaaaacatatagaggttagtgttactaatttaattaaa
catttacctcaagaaatagttgataaagcaatgacatttctaaaagtatctattgaaact
cctaaatctgatataatttcaattccccttaaaagcaaacaaggctcaggttcagaaagt
attagtgaaataacaggcattgcaattcctagttattttgaattaaaaaaacttaataaa
ttaactattttagataatttaaataataataatgataaaaatataataaatgttgatttt
attgatgatgatgatacaattgatgcagaattaccttttgatttaaaagatattaatatt
agtaaaataacaccagcagaattattatttattagtaatttatggaatactaaaaaaaca
ggatatttatttaaaaaatatcaaattactaattataactggttaactcaacaaaattta
gatttagctgtaaaaagattagataatttacaaatagatgcaacctctaaatttgaagtt
aaagtatcatcaaaaggaaaaaaagaattattaaatagagaattagtaggttttattgat
tgtatatctaataaaagaatttttgaattcaaatgtgtaaatattttaacatctgaatat
attttacaattagcatgttatatgtatttatttcaaacagaatttaagaaaacttatgat
aattatttatataatattttaacaaatgaattgattaaagtttcatcaagttataataaa
ttaaaggaatttgttaagtttctaattacagaaaaatattttactaataaaactattacg
gataaagaatttttaaataatattactaatattaaacagtctataatgttaaatgaaaat
gaaaataaaaatgaaattaataaaataatgattttagatactgaaacaacaggacttcct
aaacaaagaccttttaatcctaataatacatcagcttatgataatgccagaatgatagaa
ttaggatatataatatacaatactaaaggtgatataattaaaaaatataataatttaata
aatcataatataaaaattaataatagttttattcatggaataacttctgatatatgttca
aaaaaaggattaattatagatgatgtactagacacattttatcaggatttaaaagagtgt
gatgtattagtatgtcataatgttgattttgataaaaatattttattaaatgaaatttat
cgtattaaaaagatggagctatatgaacacttaaataataaatctacaatatgtacttta
aagaaaacaaaagaattatatggaaaacgtacaaaattaagtgattggtataaaaaaaat
tttaatgataatactatacaaaatcacagggcattggatgatgtaattatgacaggaaaa
tgtttttttaaatgtaagattttaacaatttaa
DBGET
integrated database retrieval system