Viruses: 9887929
Help
Entry
9887929 CDS
T40000
Symbol
crov526
Name
(RefSeq) Cafeteria roenbergensis virus BV-PW1; putative superfamily II helicase/restriction enzyme
Virus
693272
Cafeteria roenbergensis virus BV-PW1
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
ResIII
T5orf172
DEAD
Helicase_C
MUG113
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
9887929
NCBI-ProteinID:
YP_003970159
RS:
NC_014637
UniProt:
E3T5U7
LinkDB
All DBs
Position
NC_014637:complement(592181..594349)
AA seq
722 aa
AA seq
DB search
MQGYIYFLNYAKISNNPTVKIGSTKFPHSRLRTYQTGMFYDLHYYYLYQIINSTLDCYQI
DDLIQETFNQDKWKVKTGQGGTEWYDSTKITNKVIEDFFQKNNIIFKYINLEDCPKDENI
QDYTNELIQKQIKQNYCPFQLYLKPYDYQQIVLNNLDNFKKTKRGKLLWACGLGKTYMSL
FICHKLKFKNILICVPSLYLLKQFYDSVKKIFNFNPLCLYGTNKNLDQTINKIKCHDKNI
IISTYHSSWKLLQYNINFDIKIGDEAHHLVSKINPNNKKTFDKFHQISSNYTLFMTATEK
KFESSLNFVEDEVYTMSDEEDFGCIIDKKPIKWAIENKKITDLRIFCLQNSSSDIKEIMK
KIKLNIIIKKLNNIKNTTNKEELFFSAYTALKMIEDNYSNHMLIYTNNCYSAKIIEIIID
KLLDNNIFPKLDKSDFYNKTLTSKTEFTSEENINDTIISKNSIQFQNEVVKFTNKKYGII
PCVYIFGEGFDLPKLDSVVIAEKMTTEIRIVQSCLRPNRLDKNNPNKISKIIIPLNKNQI
DDKLKMVIKKLSVEDDTIEQKIKLFELVDVKKDKKESNYNHQVKFKKNLDKLNQLKIEMY
RGGYLAGFNLQKEYELYHERVLSYNFKSIKDYQNSKMEIIKPNIYFNGVWTNWFDFLGIN
TTGWIDNIIEWKLYCQEKRVIDANDYYIKIDDKMPPEPEYFYPNFKGINKELGKNKYRFV
RN
NT seq
2169 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaggttacatttattttttaaattatgctaagattagtaataatccaacagtaaaa
ataggttcaactaaatttcctcattcacgtttgagaacctatcaaacaggaatgttttat
gatttacattattattatttatatcaaattattaattcaaccttagattgttatcaaatt
gatgatttaattcaagaaacttttaatcaagataaatggaaagtaaaaacaggtcaaggt
ggtacagaatggtatgattctacaaaaattactaataaggttattgaagattttttccaa
aaaaataatattattttcaaatacattaatttagaagattgtcctaaagatgaaaatatt
caagattatacaaatgaattaattcaaaaacaaattaaacaaaattattgtccttttcaa
ttatatttaaaaccatatgattatcaacaaatagttttaaataatttggataactttaaa
aaaacaaaaagaggaaaattattatgggcttgtggtttaggtaaaacttatatgtcacta
tttatttgccataaattaaaatttaaaaatattttaatttgtgtgccttctttatactta
ttaaaacaattttatgattctgttaaaaaaatttttaattttaaccctttgtgcttatat
ggaactaataaaaatttagatcaaactataaataaaataaaatgtcatgataaaaatata
attatttctacttatcattcttcttggaaactattacaatataatattaattttgatatt
aaaataggagatgaagcacaccatttagtatcaaaaattaatcctaataataaaaaaact
tttgataaatttcatcaaatttcaagcaattacaccttatttatgacagcaaccgaaaag
aaatttgagagctctttaaactttgttgaagacgaagtttacaccatgtcagatgaagaa
gattttggttgtattattgataaaaaacctatcaaatgggcaattgaaaataaaaaaatt
actgatttaagaattttttgtcttcaaaattcatcaagtgatataaaagaaattatgaaa
aaaattaaattaaatattattattaaaaaacttaataatattaaaaatacaactaacaaa
gaagaactatttttttcagcttatacagctttaaaaatgattgaagataactattctaat
catatgttaatctatactaataattgttattcggcaaagattattgaaattattattgat
aaattattagataataatatttttcctaaattagataaatcagacttttataataaaact
ttaaccagtaaaactgaatttactagtgaagaaaatattaatgatacaattataagtaaa
aatagtattcaatttcaaaacgaagtagttaaatttactaataaaaaatatggtattatt
ccatgtgtttatatttttggtgaggggtttgatcttcctaaattagacagtgtggttatt
gctgaaaagatgacaactgaaattagaatagttcaatcatgtttaagacctaatcgctta
gataaaaataatcctaataaaatttctaaaatcattattccattaaataaaaatcaaatt
gatgataaattaaaaatggttattaaaaaactttcagtagaagatgatactattgaacaa
aaaattaaattgtttgaacttgttgatgttaaaaaagacaaaaaagaaagtaattataat
catcaagttaaatttaagaaaaatcttgataaactaaatcaacttaagattgaaatgtat
cgtggaggatatttagcaggtttcaatttacaaaaagaatatgaattatatcatgaaaga
gtattaagttataattttaaatcaatcaaagattaccaaaatagtaaaatggaaattatt
aaaccaaatatatattttaatggagtttggacaaattggtttgactttttaggtattaat
acaacaggatggattgataatattatagaatggaaattatattgtcaagaaaaaagagta
atagatgcgaatgattattatataaaaatagatgataaaatgccaccagaacctgagtat
ttttatcctaattttaaaggaataaataaagaattaggtaaaaataaatatagatttgtt
agaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
