Viruses: 991082
Help
Entry
991082 CDS
T40000
Symbol
BNYVVs1gp1
Name
(RefSeq) Beet necrotic yellow vein virus; 237k protein
Virus
31721
Beet necrotic yellow vein virus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Peptidase_C36
Viral_helicase1
RdRP_2
AAA_30
AAA_19
AAA
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
991082
NCBI-ProteinID:
NP_612615
RS:
NC_003514
UniProt:
Q65667
LinkDB
All DBs
Position
NC_003514:154..6483
Genome browser
AA seq
2109 aa
AA seq
DB search
MADSFGFTPMEVLLFGGESVQLLTSDMPIDVQWGFVHSTRCYALWKDDLIHLNPLLKYSQ
RIAKRWERLVSGFVGPVPLDKLLSLLAKLMRYCVNMGVSVQEIYLSDAIVSSSYMLHVSR
SAGCVSFSWLYAKLSMFASCGKFWVGSSHHTAANMIEGSRAVNGPDVAISEMVEAFHLEV
KSSLVVTVSLTPREKKILERELGFVPLYKQKSRAPRNHPVLAALREVMRQEYSASCNILN
TKLKTLVVGAASREVNCYSSNPSVHYYFANKDSKDLVRTTLELLHSALATKYRNMESGER
ELMNNLKGCGYIVKRSVENAVYEVVSDKDVAEVLRYAQTVASTKKEAKKKPNTGKRKMVM
SEATRRTIELHELSRIVAEEKKIPNHFHFDESDFASVGNFTQLVCEDVGYNFSVDAWLHL
FEATGAQTAVGYMALPNELLFEHYPISDYYDYWEGVEKHGSLGGITISPLRNGQVVGMPT
GVFQPVHFDKTSAGLGIPGSKMGAAERVICHMSDGLGNGYNHVKSDWQTLLKHPILSSSK
YNFAVEVDLTGRYGCLATFRLTRVTGVKYVARTIKLRPEDRYVRVLDLLHIVRSIRLKGH
AGLKEPYQYFPVYKREVDTPVSYCFSIAEKSLTVQNIANFIRHHIGGVSLVNKELVSAWR
LNPQLVPSFAYAVYFYVVNLRGELDGMLQKLMKKGITWADRLKANVSAFLRDMVDPISFL
WTWLFERRLVDQIFQDGTDVFYQMDRACVDEKALRLNDHIKITRDFLPADTLLPEGWSLD
DWEKAPDSLKTLSAAASLPVECGAVNCVGKSFKSVRTLLPPSVVTSPVEQFFKSGGKFRD
DAEFAELLSAHYRWQMDNSFCACQVCAALTGKTGSQVVECRWKAESMYTFSMSQTEVDDF
RNEIKAQSIEKGNRFGEMLIGVHQKIPTQAFEVSVRLEYVKGGPGTGKSFLIRSLADPIR
DLVVAPFIKLRSDYQNQRVGDELLSWDFHTPHKALDVTGKQIIFVDEFTAYDWRLLAVLA
YRNHAHTIYLVGDEQQTGIQEGRGEGISILNKVDLSKVSTHVPIMNFRNPVRDVKVLNYL
FGSRMVPMSSVEKGFSFGDVKEFSSLSNIPDTKIIHYSDETGEHMMPDYVRGVSKTTVRA
NQGSTYDNVVLPVLPSDLNLINSAELNLVALSRHRNKLTILLDNDGMNIGAVLKGMLEGV
PEELERRDYIVGMYLGLHLPIKKEFFFPESEFAKSFRLMVAKYEAFVPYDSNLPTLVLQG
DVVVLDIARVENDINDAFNCPDFYNLVSRPNNCLVVAISECLGVTLEKLDNLMQANAVTL
DKYHAWLSKKSPSTWQDCRMFADALKVSMYVKVLSDKPYDLTYEVDGAGSSVTLHLVGKE
SDGHFIAAPLSPSLSTNERESGHDSKKPADDSDTFDAANLFADKGVSSADIEAFCAYLEK
TLMATIMEYDLRLQSWANVVDDTDDFYQINISEFRQSTCFGKLLSALEVLKVDVSRKRFI
SDWLCKNLENKQFRWRWSSSVASTSSAGSNVDDDFVNMAGGKTDANVDPADVLRQSFMDY
ASEFVPILIAESPILMPLVEPEPILSKCMVPEFDAFLLIKEFDLDNGADEYQCAYLNESV
ANRVGDKFVSGVLDTDIISPLNLRGHPIAENVKYHSMCVAPAQIYFKRNQWQELQVQQAR
YLFRKVRNSPSSTQDSVARMVAQLFVSDCLVPNVADTFSASNLWRIMDKAMHDMVTKNYQ
GQMEEEFTRNAKLYRFQLKDIEKPLKDPETDLAKAGQGILAWSKEAHVKFMVAFRVLNDL
LLKSLNSNVVYDNTMSETEFVGKINAAMNIVPDSAINGVIDAAACDSGQGVFTQLIERHI
YAALGISDFFLDWYFSFREKYVMQSRYVRAHMSYVKTSGEPGTLLGNTILMGAMLNAMLR
GTGPFCMAMKGDDGFKRQANLKINDQMLKLIKKETVLDFKLDLNVPITFCGYALSNGHLF
PSVSRKLTKIAAHRFREYKHFCEYQESLRDWIKNLPKDPAVYADFLECNASLSCRNVDDV
QRWLDAIISVSRIGREQFMMMFPIREVFMSLPPVEDSLGELSSTKVAVSIGDNVSNVVRK
VARVDMKKF
NT seq
6330 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcagattcgttcggttttactccaatggaggttttgctttttggtggtgaatcggtt
cagttgttaacttcagacatgcctattgatgtccagtggggctttgtacactccactcga
tgttatgctctctggaaagacgacttgattcatctcaatccgctgttgaaatattcacag
cgaattgcaaaacggtgggaaaggttagtttcgggctttgttggcccagtaccgcttgat
aagttgttgtctttgttggcaaaacttatgaggtattgtgttaacatgggggtgtctgta
caggagatatatttgtctgatgctattgtttcatcgtcttatatgttgcatgtgtctagg
agtgcaggttgtgtgtcttttagttggttgtatgccaagctgtccatgtttgcttcgtgt
ggcaagttctgggtagggtcttcacatcacacggctgccaacatgattgaaggttcccgt
gctgtgaatggtccggatgtggctatttctgagatggttgaagccttccatttagaggtg
aagtcttcactcgttgtaactgtgtctttgactcctagggagaaaaagattctggagcga
gagctaggttttgtgccgttgtacaaacagaaaagtagagctccacgcaatcacccagtg
ctggctgctcttcgcgaggttatgaggcaggagtattctgctagttgtaatattcttaat
acaaagttgaaaacactggtagttggtgctgccagtcgtgaagttaattgttattcgtct
aatccgtctgtacattactattttgctaataaagatagcaaggatttggtaaggaccact
ctggagttgttgcatagcgctttggctacaaagtaccgcaatatggaaagtggtgagcga
gaactcatgaataatttgaagggttgtggttatattgtcaaaaggtcggttgaaaatgct
gtctatgaggttgtttctgataaagatgttgccgaagtgttaaggtatgcgcaaactgtc
gcttcaacgaagaaagaggcgaaaaagaaacctaacactggaaagcgaaaaatggtcatg
tcggaagcaactcgtagaacaatcgaactgcatgagttgtcgcgtattgtagccgaagag
aagaagattcctaaccatttccactttgatgaaagtgattttgcttctgttggtaatttt
actcagttggtttgtgaagatgttggttacaatttttctgtggatgcttggttgcatttg
ttcgaggcgaccggtgcgcagactgccgttggttatatggcattgcctaacgaacttttg
tttgaacattatccaatatcagattattatgattattgggagggtgttgaaaagcatggt
tcattgggtggtattactatttcccctttgcggaatggacaggttgttggtatgccgact
ggggtttttcaacctgttcattttgacaagacgtctgctggtttaggtattcctggttca
aagatgggtgctgctgaacgtgttatatgtcacatgtcagatggacttggaaatggctac
aatcatgttaaaagtgattggcagacgttgttgaaacatcctattttgtcttcttcaaag
tataattttgctgttgaagtggatttaacgggacgttatggttgtcttgctacctttcgg
ttaactcgtgtgactggagtcaagtatgttgctagaactataaaattgcgtccagaagat
aggtatgttcgggtgttggatttgttacatattgtgcgtagtattaggttgaaagggcat
gccggtttgaaagaaccatatcagtattttcctgtgtataaacgtgaggtagatacgccg
gtgtcttactgtttttctattgctgaaaaatcgttgacagtacaaaacattgctaatttt
attagacatcatattggtggtgtttctttagttaacaaagaattagtatcggcgtggcgt
ctgaatccacaacttgttccttcgttcgcatatgccgtttacttttatgttgttaatttg
agaggtgagttggatgggatgttgcagaagttaatgaaaaagggtatcacatgggcagat
aggttgaaggctaatgtttcagcgtttttgcgagatatggtagatcctattagttttttg
tggacgtggttatttgagaggagattagtcgatcaaatttttcaggatgggactgatgtt
ttttaccagatggatcgtgcttgtgttgatgagaaggcattgcgtttgaacgatcacatt
aaaatcacacgagactttttgcctgctgacactttacttcctgaaggatggtctttagac
gattgggaaaaagctcccgatagtttgaagactctttcggcagctgcttcgttgccagta
gagtgcggggcggtaaattgtgttggtaagtcgtttaagagcgtgcgtactctattacca
ccatctgttgttacttcacctgttgagcagtttttcaaatctggtggtaaatttagagat
gatgccgagtttgcggaattgttgagtgcgcactatcgctggcagatggacaattctttt
tgtgcttgtcaggtttgtgctgctttgactggtaaaacgggttctcaagttgttgaatgc
agatggaaagctgagtctatgtatacattttctatgtcacaaactgaggttgatgatttt
agaaatgagattaaggctcaatctattgaaaagggaaatcgttttggtgaaatgttaata
ggtgtacatcagaaaattcctacacaagcctttgaggtttcagttcgactcgaatatgtt
aaaggtgggcctggtacgggtaaatcttttcttataagatcattggctgaccctatcagg
gatcttgtggttgctccgttcataaaattgcgttctgattatcagaatcaacgagttggt
gatgagcttctttcttgggactttcacacgcctcacaaagcattggatgttactggtaag
caaattatttttgttgatgagtttacagcctatgattggcgtttactagctgtgttggct
tatagaaatcatgcccatactatttacttagttggtgatgagcagcagactggtattcaa
gagggtcgtggagaaggaatatcgatacttaacaaagttgatctgtctaaggtttctaca
catgttccaatcatgaactttagaaatcctgtccgtgatgttaaggtattaaattatctg
tttgggtctcgtatggttcctatgtcttccgttgaaaagggatttagtttcggggatgtt
aaagaattttcgtctttgtcaaatatcccagacactaaaatcattcattattccgatgag
actggtgaacatatgatgcctgattacgttaggggagtgtcaaaaactactgtccgtgct
aatcagggtagtacctacgataatgttgttttgcctgttttaccatctgatttgaacctg
attaactcagctgagttgaatttggtagctttatctcgtcacaggaataagttaaccatt
ttattggacaatgatggtatgaatattggtgctgttttgaaaggcatgcttgagggtgtg
ccggaagaactcgaaagaagggattacattgttgggatgtaccttgggttacatttacct
attaagaaagagttcttctttcctgagtctgagtttgctaaatcgtttagattaatggtt
gctaagtatgaggcatttgtaccttacgatagtaatttgccaactttggttttacaagga
gatgtcgttgttttggacatagcacgtgtggaaaacgacattaatgatgcctttaattgt
ccagatttctataatcttgtgtctcgtcctaacaattgtttagtagtagctatttcagaa
tgtttaggtgtgacgctagaaaaattggacaatcttatgcaagctaacgctgtgacgctt
gataagtatcacgcgtggttgtctaagaagtctccatcaacttggcaagactgtagaatg
tttgccgatgctctgaaggtttccatgtacgttaaggttttatctgacaaaccttacgat
ctaacttatgaggttgatggtgctggttcctcagtgacattacatttagttggtaaggaa
agcgatgggcattttattgctgccccgcttagtccgtcgctttctaccaatgagagagag
tccggacatgatagtaagaaaccggctgatgattctgacacctttgatgctgctaatttg
tttgctgataagggtgtttcttccgctgatatagaggctttttgtgcctatttagaaaag
actttaatggcaacaattatggagtatgatttgagattgcaatcgtgggctaatgtggtt
gatgatactgacgatttttatcaaattaatatttctgagtttcgtcagtccacgtgtttt
ggtaaattgttgtcagcgcttgaagttttgaaggttgatgtttcgaggaagaggtttata
tctgattggttgtgtaaaaatcttgagaataaacaattccggtggcgttggtcttctagt
gtggcttcaactagttcggccgggtcgaatgtcgacgatgattttgtcaatatggcaggg
ggaaagactgatgctaatgttgatcctgctgatgttttgaggcagagttttatggattat
gcatcggaatttgttcctatccttatcgctgaatcaccaatacttatgccgttagttgag
cctgaaccgatattgtccaagtgtatggtgcctgagtttgacgcctttttattaataaag
gaatttgatttggacaatggtgctgatgagtatcaatgcgcttatcttaatgaatctgtt
gctaatcgtgttggtgacaaatttgtttcgggtgttttggacactgatattatatctcca
ttaaatctgaggggacatcctattgctgaaaatgttaaatatcacagtatgtgtgtggcc
ccggctcagatatattttaagcggaatcagtggcaagaattacaggttcaacaggctcgg
tacttatttcgaaaagtgaggaattctccatcatcgacacaagatagtgttgcacgtatg
gttgctcagctatttgtttctgattgtttggtgccaaacgtagctgatactttttctgct
tccaatttgtggcgaattatggacaaagctatgcatgacatggtcacaaaaaattatcaa
ggacaaatggaagaggagtttacgcgtaatgctaaattatatcgttttcagttgaaggat
attgaaaaacctttgaaggacccagagactgatttggcaaaggctggtcaagggatattg
gcatggtctaaggaggcacatgttaagtttatggttgcttttagagttttaaatgatttg
ttattgaagtcgttaaactctaatgttgtttacgataacacaatgtctgagaccgaattt
gttggaaaaataaatgccgccatgaatatagtaccggatagtgctataaacggggttatc
gatgctgctgcttgcgattctgggcaaggggtttttacccaattgatagaaagacatatt
tatgctgctttgggcatttctgacttctttttggattggtatttctcatttcgtgagaaa
tatgttatgcagtccagatatgtcagagcacatatgtcttatgttaagactagtggagaa
cccggcactttgcttggtaacaccattttaatgggtgctatgttaaatgctatgcttcgt
gggaccggaccattttgtatggccatgaagggcgatgatggttttaaaaggcaggctaat
ttgaaaattaacgatcaaatgttaaagttgattaaaaaggaaactgtcttggatttcaaa
ttggatttaaatgttcctatcactttttgtggttatgctttatctaatggacatttgttt
ccaagtgtttcacgtaaattgacgaagatagcagcacacaggttccgtgagtataagcat
ttttgtgaataccaggaatctttgcgtgattggattaaaaatcttcccaaagacccagct
gtttatgctgattttttggagtgtaatgctagcttatcttgtcgcaatgttgacgatgtt
caacgttggttggatgctattatctctgtgtcccgaattgggcgtgagcaatttatgatg
atgttcccgatacgggaagtttttatgtcattgccacccgttgaggatagtttgggtgag
ttatcttctacgaaagtggctgtgtctattggggacaatgtttctaatgttgttagaaag
gttgcccgtgtcgatatgaaaaagttttaa
DBGET
integrated database retrieval system