Viruses: 9925064
Help
Entry
9925064 CDS
T40000
Symbol
R440, MIMI_gp0473
Name
(RefSeq) Acanthamoeba polyphaga mimivirus; probable capsid protein 3
Virus
212035
Acanthamoeba polyphaga mimivirus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Capsid_N
Capsid_NCLDV
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
9925064
NCBI-ProteinID:
YP_003986947
RS:
NC_014649
UniProt:
Q5UQN7
E3VY06
LinkDB
All DBs
Position
NC_014649:573994..580464
Genome browser
AA seq
2156 aa
AA seq
DB search
MAGGILQLVCNATAAENMWINNDPEITFFKKLFRRHTPFASEYIPLYFKSNLDFGQSSSA
TILSNGDLVHKIFFVCDIPSISAEFINSKNEDVIKTIKNLNSQYIDNDFMRKLNNCINGT
IIEYDNICNIIDENIQYYDYYKPIIISIINTLSKYQNKDVLINYQQKIFGKLLNKSNDNL
SQNESFQNDSFKLEILDSFFSTNVKYNLVFELIKLIDLEQQFYSQKIPIIPIQNTGKYLA
NNFVNSVLPAVNNLGNNFGKDFYHRLNTHNAIIGAIESLSISVPTVIIKPFVLNDCYDIY
RPNNQNVYFDSTYYSSIIDPNFKLNFMLKSNQVEKYIQSNEFIPIDIIGTNDFIYPEIDN
NYNLLFNTQANIMFDNIQSFTDLLFEHYRNLLFDSTENLFFNKSPTPSNIYSYILPTKAY
DTKSNNLSDEKINDGPNVFNLNIWFFYFFKYLDQFDVDKFIVYVKDNVHKNLSNACYSFL
RNMMVLLKINVDYYMHEISYYMNDMCSKSPSHDLSDTLKNYVPNISESTNQFNKQSGSNL
LMVTLIFHRNIIPSIEDMFNFIYEFIENINCNDIENYLEVEIGFVDRETLTELKSTAKQL
YQGFYNYFMNKYNKMHFEAEYHCEEINPLVQEYVNHFLTGTSIHDKFYQKRNLNDIIHQL
EFYFISETIHIRELQKFYYNIFSNNNLIKNYVDDYGCELIDYFNSVLKTDLEQKYYKVNN
IHRYNGESYKMTPYNTRFYGLNDNLPLVYPFDHPPVNPYGVNPDYYSHYRSVTDYVTIPT
SNNQILCTEIPINLNNTEPINNRYNDSEYQRFEIDYFRLKHEIFHGTIDNPISDLYKIFI
SEYDFNVLKLYHLLQQLLDQSNTKPMLSDDLLYKLYITTIYLMNYINEDAGNDTVMSKSI
MHQFLEMIEDYLNNQTENISENTINEMVELSDILLKNNQHNYTTDDLIKCNQYINLIKNT
DKYDNGIIDRLQIIKYNFLSQYFIYSLESQNISMLKNLDNKFFFKNTGQIINEILQLVDN
NPVLDDLSNMEYLYSGEFETEHNHLLCTDSSNLSRYFMNTFNIFTAHELNPIKKLSVRDI
YDIIDTTFMSVREIYNICMNNGSINNILVKLDKYQDKLLNKLVLTNKIGQYFYDFLQNKP
IEQQNKKDLIKIIDSFGIDLENYMCNKIIPLYNQLVLNNNKNSTIIILAIISKDLDSFFL
PNSSASSFKQVIIEDLTNGNKEDPLYLYLKLIGNEYYSYLKFFLDYCCENDLDYDSITNP
LESLDITVLKNDNNTNRILSVKDCLNYFMDYLWDHSYPSMKQFGFNEKISDVINKYSSNK
SNKSNKSNESDKSSESDKSSESSNHDDKISKIINLLSGSFDTNGFVLNRYLEEFTKNDEI
SEIQNLSEKSNIIYGLNLYLGKLLILLEQQYNSGLEIKNKISNILYRNKKACTAWIKKLA
HYLVDEISISTNSETIDSHKSDWFEIYSQTNLSESRIDGYYKMIGNIDELTIFSNNDKSS
RTIILPLCFYFNRNIALSLPLNASINLTYTINIKLKELSDVLFKEEFSEYIDNTGSIVKP
KLSNVHLMCEYIYLSNEERQAFVTKHLQYLVDEFQYSTTNITDNNLTPVYKIGTNKISCV
VKKNGKKTTETYFNKGIYVDQNNVNVDDNELILRKDLEVKPSKNKSGISSTMIQHTIIDT
DPKIHFKRVSIENHFSNPTKMMAILIRPDLHIITDKRDYSSDYFFGEKQWSNYGVHSWYD
FSQVRKIREDYYTKFRQKINNLEDPVYGFLNIINHTIENMKIPEIPDKLIKYCEQIKSMY
IKHSDEIFDQSNIQKIRDNLHILKINFDITDKQLLLQMIYDICYNMDVSLPTNSIIIDEF
RRLDSNFTLDDDNLYVNYEFFKDCICSILKLSILQGRSDELYQLIQQIYDKHNENQINLL
INKLSEIIPISNHTYSFTNIMYKAKNLCLLHKCDNHIVNLINQIQDKIDFMNSSELSCVN
NMKTVSSTYKDIINQIIVNTNYLDHIPSYIIDTISNKMLETLNIIIDKQYIKIIPYNKLI
KPNPKINPLISGHLTFNNISTMPENSDHTFWTACQTYQHFKHDTETGINLYSWAIKPFNE
QNSGSANLSRIDRFMSILNIHPIISSKNSASIITMTLSINIINYLSGLCGKAWEKY
NT seq
6471 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctggtggaattttacaattagtttgtaatgcaacagctgctgaaaatatgtggatt
aataatgatccagaaattactttttttaagaaattatttagaagacacactccatttgca
agtgaatatataccattatatttcaaatcaaatcttgattttggacaatcaagttctgcg
acaattttgtcaaatggtgatttagtacataaaatattttttgtgtgcgacataccatca
ataagtgccgaatttataaatagtaaaaatgaggacgttattaaaactatcaaaaatctt
aatagtcagtatattgataatgatttcatgagaaaactcaataattgtattaatggaaca
ataatcgaatacgataatatatgtaacatcatcgatgaaaatattcaatattatgactat
tataaacccattattatttccattattaatacattatccaaatatcaaaataaagatgtt
ctaattaattaccaacaaaaaatatttggaaaattattgaataaatccaatgataatttg
tcccaaaatgaatcgttccaaaatgattcattcaaattagaaattttagattcatttttt
tccacaaatgttaaatataatttagtttttgaactaattaaacttattgatttagaacaa
caattttacagtcaaaaaatacccatcataccaattcaaaatacaggcaaatatttggca
aataattttgtgaatagtgttcttccagctgtaaataatcttggaaataattttggaaaa
gatttttatcacagattaaatactcacaatgcaatcataggtgcaatagaaagtttatca
ataagtgtccctactgttattatcaaaccttttgtattaaatgattgttatgatatttat
cgaccaaataatcaaaacgtgtattttgattcaacttattattcatcaattatcgatcca
aatttcaaactaaattttatgttgaaatctaatcaagtagaaaaatatattcagtctaat
gaatttatacccattgatattattggaacaaatgattttatttatccagaaatagacaac
aattacaatttattgtttaatactcaagcaaatattatgtttgacaacatacaaagtttt
actgatttattgtttgaacattatagaaatttattgttcgattcaactgaaaatcttttc
ttcaataaaagtccaacaccatctaatatttacagttatattttacccactaaagcttat
gatacaaaatcaaataatttgtctgatgaaaaaataaacgatggtccgaatgtttttaat
ttgaatatttggtttttttatttttttaaatatttggatcaatttgatgttgataaattt
attgtatatgttaaggacaatgttcataaaaatttatcgaatgcttgttactcgttttta
cgaaacatgatggttttgttgaaaataaatgttgattattatatgcacgaaatatcttac
tacatgaacgatatgtgttccaaatcaccatcgcatgatttatcagatacattgaaaaat
tatgttccaaacatatcggaatcaacaaatcaattcaataaacaatctggatcaaattta
ttaatggttactttgatatttcatagaaatattattccgagtattgaggacatgtttaat
tttatttatgaattcatagaaaatattaattgtaatgatattgaaaattatttagaggta
gaaattggttttgttgatagagaaacactaacagaacttaaatcaacagccaaacaatta
tatcaaggtttttataattatttcatgaacaaatacaataaaatgcattttgaagctgaa
tatcattgcgaagaaattaatccattggtacaagaatatgttaatcatttcttgacagga
acttctattcatgataaattttatcaaaaaagaaatctaaacgatattatacatcaactc
gaattttatttcataagtgaaacaatccatattagagaattgcaaaaattttattacaat
atttttagtaacaataatctcattaaaaattatgttgatgattatggttgtgaactcatt
gactattttaattctgttttgaaaacagatttagaacaaaaatattacaaagtaaataat
attcatagatataatggagaatcttataaaatgactccatacaatacaagattttacggt
ttaaacgataatttacctcttgtttatccgtttgatcatcctccggttaatccgtatgga
gttaatccagattattattctcattatagatcggttactgattatgtaactataccaaca
tcaaacaatcaaattttgtgtacagaaatacctatcaatctaaataatacagaaccaata
aataatcgttataatgattcagaatatcaacgattcgaaatagattatttccgtctcaaa
cacgaaatatttcatggtactattgataatcctatttccgatttgtataaaatatttatt
tctgaatacgattttaatgttcttaaattgtatcatttacttcaacaactacttgatcag
tcaaatactaaaccaatgttatctgatgatttactctataaactatacataaccacaatt
tatctcatgaattatatcaatgaagatgctggtaatgatactgttatgtcaaaatcgatt
atgcatcaatttttagaaatgatagaagattatttaaataatcagacggaaaatatatct
gaaaatacaattaatgaaatggttgaattgtccgatattttattgaaaaataatcagcat
aattataccaccgatgatttaattaaatgtaatcaatatattaatttaataaaaaataca
gacaaatatgataacggtataatagacagactacaaattatcaaatacaattttttgtca
caatattttatctattcacttgagtcacaaaatatttcaatgttaaaaaatcttgataat
aaatttttttttaaaaataccggacaaattattaatgaaattttacaattagtagataat
aatccagtacttgatgatttatcaaacatggagtatttgtattcaggtgaatttgaaact
gaacacaatcatttattatgtacggattcaagtaatttaagtcgatatttcatgaatact
tttaatatttttaccgctcatgaattaaatcctattaagaaactttctgtgagagatatt
tacgatattattgatactacatttatgtccgtcagggaaatttataatatttgtatgaat
aatggttctataaataatatattagtcaaattagataaatatcaagacaaattattgaat
aaacttgttttgacaaataaaattggtcaatatttttatgattttttacaaaataaacct
atcgaacaacaaaataaaaaggatttaataaaaattattgattcattcggaattgatttg
gaaaattatatgtgtaacaaaatcatacctttgtataatcaattggttttaaacaataac
aaaaattctacaataataatacttgcaattattagtaaagatttagattcattcttttta
ccaaacagttctgctagtagttttaaacaagttattattgaagatttaacaaatggaaac
aaagaagatccactttatttatatttgaagcttattggtaatgaatactattcttattta
aaatttttcttggattattgttgtgaaaatgatttggattatgattctattactaatcct
ttagaatcgttggatattacagttctaaaaaatgataataatactaatcgaattttaagt
gtaaaagattgcctaaattattttatggattatttatgggatcattcttatccttcaatg
aaacaattcggttttaatgaaaaaatttctgatgttattaataaatattcgtctaataaa
tctaataaatctaataaatccaatgaatctgacaaatctagtgaatctgacaaatctagt
gaatcgagtaatcatgacgataaaattagtaaaataataaatttgttgtcaggatctttt
gatacaaatggatttgttttgaacagatatttggaagaattcacaaaaaatgatgaaatt
agtgaaatacaaaatctatccgaaaaatccaacattatttatggtctaaatttgtatttg
ggaaagttattgattttattggaacaacaatataatagtggattagaaataaaaaacaaa
atttcgaatattttgtacagaaacaaaaaagcatgtactgcttggataaaaaaattggcc
cattatttggtagatgaaataagtataagtacaaatagtgaaacaattgacagtcacaaa
tcagattggtttgaaatatattcccaaactaatttatccgaaagtagaattgatggttat
tataaaatgataggtaatattgacgaactaacaatattttcaaacaatgataaatcaagt
cgaacgataattttacccctgtgtttttattttaatcgtaatattgcgttatctttacca
cttaatgcgagtattaatttaacctatactattaatatcaaactcaaagaattatcggat
gttttgttcaaagaagagttttcagaatatattgacaatacaggatccatagtcaaacct
aaactatctaatgtccatttaatgtgcgaatatatttatttgtctaatgaagaaagacaa
gcatttgtgactaaacatttacaatatttagttgatgaatttcaatatagtacaactaat
attactgacaacaatttaacacctgtttataaaattggaacaaacaaaatatcatgtgtt
gtcaaaaaaaatggtaaaaaaacgaccgaaacttattttaacaaaggtatttatgttgac
caaaataatgttaatgttgatgataatgaacttattttacggaaagacttagaagtaaaa
ccatccaaaaataaatctggaatatcaagcacaatgatacaacatactattatcgatacc
gatccaaaaatccattttaaaagagtttcgattgaaaatcatttttctaatcccactaag
atgatggctatattgataagaccagatttacatattattacagacaaacgtgattattca
tctgattatttctttggggaaaaacaatggagtaattatggagttcactcatggtatgat
ttttctcaagtcaggaaaatccgggaagattattacactaaattcagacaaaaaataaat
aacctggaagatccagtatacggtttcttaaatataattaatcacaccattgaaaatatg
aaaattccagaaattcccgacaaattaataaaatattgtgaacaaattaaatccatgtac
attaaacattctgacgagatttttgaccagtccaatattcaaaaaatacgagataatctt
catatactcaaaataaattttgatattactgataaacagttgttattgcaaatgatatac
gatatttgttataacatggatgtaagtttacccacaaattctattattattgatgaattt
agacgtttagattcgaattttaccttggatgatgataatttatatgtaaattatgaattt
tttaaagattgtatttgtagtattttgaaattatcgattttacaaggcagaagtgatgaa
ttgtatcaattgatacaacaaatttatgacaaacataatgaaaaccaaataaatttattg
ataaataaattgtctgaaataattccaatttcaaatcatacatacagttttactaatata
atgtacaaagcaaaaaatttatgtctactacataaatgtgataatcatattgttaatctg
atcaatcaaattcaagataaaatagattttatgaattctagtgaattgtcttgtgtcaat
aatatgaaaactgtaagttcaacatacaaagatattattaatcaaattattgtgaataca
aattatctagaccatatacctagttatataatagatacaattagtaataaaatgcttgaa
actctcaatataattatagataaacagtacattaaaattattccgtacaataaattaatt
aaaccaaatccaaaaattaatccattgatatctggtcatttaacattcaacaacatttca
acaatgcctgaaaattcagatcatacattttggactgcttgtcaaacttatcaacatttc
aaacacgatactgaaactggaataaatttatactcatgggccattaaaccattcaatgaa
caaaattcaggttcagctaatttatctcgaatagatagattcatgtccattttaaatatc
catccaatcattagttcaaaaaattccgcaagtataataactatgacactcagtattaac
ataattaattatctatctggattatgtggaaaagcttgggaaaaatactaa
DBGET
integrated database retrieval system
