Viruses: 993312
Help
Entry
993312 CDS
T40000
Symbol
CTFVs4gp1
Name
(RefSeq) Colorado tick fever virus; VP4
Virus
46839
Colorado tick fever virus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Other DBs
NCBI-GeneID:
993312
NCBI-ProteinID:
NP_690894
RS:
NC_004184
UniProt:
Q9ENL2
LinkDB
All DBs
Position
NC_004184:22..3105
Genome browser
AA seq
1027 aa
AA seq
DB search
MGNRVSTYSPQFITINGNNNALDTKTMERFDQTNSVDAAVKLPDGINPTRAEFSTVNDMR
AFLGLRDDLLCEDDDIFEDMFDQMVGSEGKIKGVVSGTLDGYEKIRKAANWLGGTYSRPW
RVETREMSEIQKRIDTALPAMTSIIGGTFGPGAARVGGDHMLVRPEQWVNVRGDFFLGHD
DGFESRHIAVGTDAFQCVRLGRLMPEFGDAVRGGGWANGVSYLMGQPLFQIAYGRVVNDV
DRPIQILWQAALRTAASSEGDVPVAEALKILGAMTKSTFSWMVSIVGTEYSMEATAERPM
FPMTHLTSADYELLHRLFVMWLKGDVMHSRFFDVVANLESFTSGMCFLNRVRLALQLFVT
KLDEETKSRQDYWCDMLNQLMEVHSCPLLYTAFLLSGGWNDEVSMKVEPIDGVVLERLEF
SGRYLWMSWRNAATYSEYVRMHAEGGDGDDDILGLLKRGAAQMKGMVAGHLRPVLNEAAG
AAERVMTGWAKQKAGTLKQAVTNAMAGVLLDTKREAQAEANVYGSMVGGRHVLALPPTDH
LQKLAPLVPPGAADTVIDDVKRVGHHVGLAIMERGEPVREPVVENHVVHEMVNRTKTGVG
QIGEVRRELAKCSEVMKDVSVEKMVARPDEVRGTSFPIHTRGYHVSLVDGCDKHAMKDPT
NNLAAGATFSCQGLVTGKLKTCFSVTLAKAHHNRETSPTTLHVISGGFFSYDPAAVHIGG
QDGGGPDHDMNINVVVTAAVKKSTSETACKVYVGAIAKSPNTTHHTTNNGVGFVPAIDDK
GQTYFTTSGVFVGRLSFNISALLRGGLTGVTSCPWDGTFAFVVACGCSNYGSSGCTHVEL
VQLGVEFGECIIVPRGLDRYYIFNRVRYYDKTIFDFIGRVDATVAVSESPLDVVSAWSEL
ISPLVVYLPLMVHELKSANTLALVKTRYRAWLKKVGLKMGENNPFRTDEDCDGWVCAAIL
AMPMWMRYAGGNPLIIMTQDDRKASAIMLLSTAKAMLPLSAFQLVDGSLSRAAAKGLKWA
ADREIMG
NT seq
3084 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggggaaccgagtgtcaacatacagccctcaattcatcacaatcaatggaaataataat
gcactggatacaaaaacgatggaacgctttgatcagactaattcggtagacgcagccgtt
aaattacccgatggaatcaatccaactagagctgaattctcaactgtgaatgacatgcgt
gcatttctcggactgcgagatgatttgctatgtgaggatgatgatatcttcgaagatatg
tttgatcagatggttggttcagaaggtaaaatcaaaggtgtggtgtctggtacattggat
ggctatgaaaagatccgaaaagcagcgaattggctcggtggaacgtatagccgaccgtgg
agagttgaaacaagggaaatgtctgagattcagaagcggattgatactgcgttacctgcc
atgacatcaatcattggagggacctttggacccggtgcagccagagtaggaggggatcat
atgctcgtgcgacctgagcagtgggttaatgtaaggggtgatttctttctggggcatgat
gatggatttgagtcgaggcatatcgcagtagggacggatgcgtttcagtgtgttcgccta
ggaagattgatgccagaatttggtgatgcagtgcgcggtggaggttgggcaaatggtgta
agttatttgatgggtcagcccttgtttcagattgcatatggtcgagtggtgaatgatgta
gatcgtccgattcaaatcttgtggcaggcagctttaaggacggcagcttcgagtgaggga
gatgtcccagtggcggaggctttaaaaattcttggggcgatgacaaagagcacgttttcc
tggatggtgtcgattgtagggacggagtactcaatggaggctacagcggagaggccaatg
tttccaatgacgcaccttacgtccgctgattatgagctcttgcatagactttttgttatg
tggttgaagggcgatgtcatgcattcgcgattttttgatgtcgttgcgaatctcgaatcg
tttacttctggaatgtgctttttaaaccgagttagattggccttgcaattgtttgttact
aagttggatgaggagacgaagtcgcgtcaagattattggtgtgatatgttaaatcagctt
atggaggtgcactcctgccctttgctatatacagcttttcttctaagtggtggatggaat
gatgaggtgtctatgaaagtggagcccattgacggtgtggtgctggaacgattggaattc
tccggccgctatttgtggatgtcttggaggaatgctgctacgtattctgagtatgtgcga
atgcatgcagagggaggggatggtgatgatgatatcttaggcttgttgaagcgaggtgca
gcccagatgaaagggatggtggcgggacatcttcggccagttctgaatgaggcggcggga
gcggctgaacgcgtgatgaccggttgggcaaaacagaaggctggtacgttaaagcaagcg
gtgacgaacgcgatggctggggtgttattggacacgaagagggaggcccaggcggaagct
aatgtgtacgggagcatggttggtggtcggcatgttttggctcttccccctacggatcat
ttgcaaaaattggcgcctttagtcccaccaggtgctgctgacacggttattgatgatgtg
aaacgggttggtcaccatgtcggattggctatcatggagagaggggagccagtgagagag
ccggttgtcgagaatcatgtggtgcatgagatggtaaacaggacaaagactggagtcggc
cagattggcgaggttaggagggagttagcaaagtgttctgaagttatgaaggatgtatca
gtggagaagatggtagctagaccggatgaggtgcggggaacatcatttccgatacacact
cgggggtatcatgtatctttagttgatgggtgtgacaagcatgcgatgaaggacccgacg
aataatctcgctgcaggggcgactttctcttgtcaaggattagtgacggggaaacttaaa
acatgtttttcagtgacgttagcaaaagctcatcataacagagaaacatctccgactacg
ttgcatgtcatttcagggggtttcttctcctatgacccggcagctgttcacataggaggg
caagatggtgggggaccagatcatgatatgaatattaacgttgtagtgacagcggcagtg
aagaagtccacatcggagacggcatgtaaggtgtacgttggtgctattgctaagtctccg
aatacgactcatcacacaaccaacaatggggttggatttgttccagcgattgacgacaag
gggcagacatattttacgacatcgggagtgtttgtggggagactttctttcaatatttcc
gcactgctgaggggtggattaacaggtgtgacctcttgtccctgggatggtacctttgct
ttcgttgtagcttgtggatgttcgaattatgggagcagtggttgtacgcatgttgaactc
gtgcaattaggtgttgagtttggggagtgcattattgtgccgagggggctggatcgatat
tacatatttaatcgggttcggtactatgacaagaccatttttgatttcataggtcgggtt
gatgcaactgtcgctgtttcagaatctcctttagatgtagtgagtgcgtggtcggagtta
atcagtcccttggtggtgtatcttccattgatggtgcacgaattgaagagcgctaacact
ttagccctcgtgaagactcggtatcgtgcatggctgaagaaggttggtttgaaaatgggt
gaaaacaatccttttagaactgatgaagactgtgatggctgggtgtgtgcagcaattttg
gcgatgcctatgtggatgcgttacgcaggtggcaatcctttaattattatgactcaagat
gatcgaaaggcgtcggcgataatgttgttgtctactgctaaggccatgcttcctcttagt
gcatttcagttggtggatggatccttgtctcgtgctgcagccaaaggacttaagtgggcg
gctgatcgtgagattatggggtag
DBGET
integrated database retrieval system