KEGG   Viruses: 995370
Entry
995370            CDS       T40000                                 
Symbol
p227, SPCSVs1gp1
Name
(RefSeq) Sweet potato chlorotic stunt virus; polyprotein
Virus
81931  Sweet potato chlorotic stunt virus
SSDB
Motif
Pfam: RdRP_2 Vmethyltransf Viral_helicase1 AAA_19 Chropara_Vmeth UvrD-helicase Flavi_DEAD AAA_31
Other DBs
NCBI-GeneID: 995370
NCBI-ProteinID: NP_689396
RS: NC_004123
UniProt: Q8JJW9
LinkDB
Position
NC_004123:join(90..6050,6052..7569)
AA seq 2492 aa
MANVCSTMINSGSLALNATKTGFFDPFLNQHINVFQSKTTNASPPSKTEQMAVKNNRFGR
MGPTVPKIPFKVRLALFPNNPTVEVVNSNNEVSYVNKRRVDVEDRLDVLRKLCNIPYCKF
NRLPKAVIKVLGYNFYDINKAIDNVLYGKLGHNNNTPIIPDEEISGCTKNKLGYKLKYFE
DRDRIDIFFKFGSYVSDSYDFKINMQALYSQGRTIRDFRVTAHVCKSKKVTAPFCSSFNL
NDRLNYRQFSTKVLISSVIGLFEDYVYLTNLYFGKKFRDFYPSAIKSVTENHKKYCDYVS
RLSTKGAKIGTDSTKDCLDKNKTSYKAVVNSPDLTFGSLKGVKLINNSTAVPSKPKSNIP
LVTFVVDDVGHESFIIKEKNGFTKKITNDERALVTLFNATLTDKKYNIHPKCKVGKHGRL
EDFPNDFCWIDAFACAGKKMPVDLKPYPQISVAYLFRCGLARVIQKHSCETGWRLFHFDR
RQVVNLKRLPHGAVLGVKGDMNIPNITRNIDILFDDLVGNVIEQTSLKADNLLLSNVVNR
LSDRVNRMCERTKQLTVKTTLDSNQKRKLTKLFPELTMNFEDSTYSSHPLQTAMRTCENF
LMDEKCGGREYVDVGGDVASLLTKESRDVHICCPVVDVKDAHRHITRSSIIDRMKGFNES
ITICDKLTQDCDVPYPNIVAVEVYDMSLEDMARSILSHKAKRFDLSLIIPPEICDNYCDV
MLFDDSMRVFVRDGVVNYEYGSSGECYKHNLKTLQDILRVQLFVVDGVVFKKTLECSREQ
LHFFSIVPCVNMKPGVYNLTSHYSKSRNDKLEMILPVRGFDGGLRNVRVSVDKYVTMHLI
EYAMNTTLKVEDKAAEYLIPQFRSRKSVSISGGKVVQKEFDLPDELHAGYLAVIMAEGAR
RREKVVNLARVSYFKHYAPTVIQVLFNIFFELYGNFKRICYKAFISAMSLVMSEDFLEKV
VVGERRIFDVQEVVHFEQEIVLVGKQGDMNVLRESLHKFTVENEKRADDISQIVYANRES
FADDELDVMKQLFQMGGGSKFRGFTNNLDRSTFGFYSKVWSFVNYYVKDVKRVRLVANFF
VSLCDFFRQCGMSTWEYVNSVFKEFVGFVKCGLKGSLPNMWSELKKAAKFTKEKFNKQSE
DLKSLLHDFYRRQTGLDDEGNELFWQDMTYDFGTRRMFSEEKKNRFVVELKKTYHNLVSK
KDKLISRIMTIYNYMKFIYAFIREQLKGEDLINTVDHIIKGASFFFVHALSLCAMGSFSL
TGLVAAVSTYLGLKFTGIEKKYLGSSVVSQHLISACSVSSPAALMTLPVRSAVTKCVEIG
LKRKLSKCEGLASTMQGVIAKDAIDMRWYSYVTPYRVRMTIYISLVLVFFFPRLAIALML
TTFLVAEHKKYFEKFAVVANVDLSFASVLNRTQPTKRMATLKRLLKDKFTAAKVKEQKDD
DTSTVDAEPSEVAMLGGDISLRDEEVDVEFDYDGSYVERHGKLSTSKLVVEEDLKPSAAD
GLNFYQLKISGRGNFMQFNVPFKVSAAMTQYAYRDIPTIVYTGDEKLDTLNEYYYLEKKK
TFMELGKLDNVVDLYLSQLENKSSFEKVVFHLRQRFDDSTLYVSEDGACWHKLKIGSKSL
VSLDHKCKYDCNRVLMAFDSECKDFQVTSDELAGMYSNERCLALEYLTVDKIPQLARDLT
KKVTFYNKPPGAGKTTTIVNEFSRLHNEGKRCLALTCTKAGKVEIAEKLRARGIKSVYSN
CLTYDAFLMKNTFRDVDYVFCDEIFMIHAGLWLAISCNLEFGVMGCYGDVNQIPYINRVP
NTICTKSMNHYYQYEMFHDNISYRCPVDVCKLLSTLTDAKGQLIYPKGVYPAGDNANVLR
SLQVVPIYSPEDAMDDQDVKIVTFTQPEKEEMIKATRMRNGVSSSVNTVNEVQGGTFSKV
DVYRLKPYDNPIYSDLNQFVVSVSRHTQLMRYRVVSSKMSDKIANNISSMDNVSDFILKE
FAAKRCVDVYNLQVEDFFLPQTFSRPPASTLVAVNEFMSLINPGIIDHDFLHRTMISEYS
MFELPPVGDLTIDLSKSKPYISGDFVTSGVLGKGERSRPDTWRQAIASLSHRNYSAPRVN
ERLDTFKTAELLCESLLRAFDMSKLFENYDYIIPDIYRIDQWLSDRDVSKFNRIKRDMNH
NLMYEQFSTMKMMIKGDLKPKMDLSCYTTYAPPANIIYYKHIVSMFFSPLFLEVFDRITY
CLSNKVVMYSGMNLETLSRVVKSKLPLPLDSYYTLEIDFSKFDKSQGCVFKLYEGMIYRF
LKFSEEAYLNIETTEYFCRFKSASGLTGELGAQRRTGSPNTWLSNTLVTMGMLLNVYDLD
DIDLMLVSGDDSLIFSKKQLENKTNELNINFGFEAKFIENSVPYFCSKFIVDDRGSIKVV
PDPVRFFEKLSVPVRLSDFLAETTLRERFTSYKDLMSEYDNDSVCILVDSLISKRYSLPL
MTSYAALCFIHCLCANFSSFRKIFDEFFVVDI
NT seq 7479 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggcaaacgtttgctcaaccatgatcaactctggttcactcgcattgaatgcgacgaaa
accggattctttgatccgtttctaaaccaacacattaatgtgtttcaatccaaaacaact
aacgccagcccaccaagcaaaactgaacaaatggctgtgaaaaataataggttcggtaga
atgggccctaccgtcccgaaaattccgtttaaagttaggttggccttattcccaaataac
ccgaccgtagaggtcgttaatagtaataatgaagtatcttacgttaacaaacgacgtgta
gacgtcgaagataggttagatgtacttaggaagttatgtaatattccgtattgtaagttt
aataggttaccaaaagcagtcattaaggttttaggatataacttttatgatattaataaa
gctatagacaatgtactttatggtaagttaggacataacaataatacacctattatccct
gatgaagagataagtgggtgtacaaaaaataagttaggctataagcttaagtattttgaa
gaccgtgataggatagatatcttttttaaatttggaagttatgtgtctgatagttatgat
tttaaaataaatatgcaggcgctgtattctcaaggtcgtaccatacgcgactttagggtt
acagctcatgtatgcaagagcaaaaaggtgacagcacctttttgttcgtctttcaattta
aatgacaggttgaattataggcagtttagtactaaggtcctcatatcgtccgttattgga
ctgtttgaagactacgtgtaccttactaatttatattttggtaaaaagtttagagatttc
tacccatctgcaataaagtctgttactgaaaatcataagaagtattgtgattatgttagt
agactaagtactaaaggtgctaagattggtactgatagtactaaggactgtctagataag
aataagacatcttataaggctgttgtgaacagtcccgacttgactttcgggagtttgaaa
ggagttaaactcattaataattctactgctgttccctctaagccgaagtccaatattccc
ttggtgactttcgtagtcgacgatgtcggtcacgaaagtttcattattaaggagaaaaat
ggtttcaccaagaagatcactaatgatgagagagcgttagtgactttgtttaatgcgaca
cttacagataagaaatataatatccatccgaagtgtaaggtagggaaacacggtagattg
gaagattttcctaatgacttttgctggattgatgcatttgcatgtgctggtaagaagatg
ccagttgatctcaaaccgtatccccagatttcagtggcttaccttttcaggtgcggtttg
gctagagttatacaaaagcacagttgtgagaccggatggaggttattccattttgacaga
cgacaagttgtcaacctgaagagactgccccatggagcagttctcggtgtgaaaggagat
atgaatatcccgaatattactcgtaatatcgatattctttttgatgatttggttggtaac
gttattgagcagacgtcgttaaaagctgacaatttgttgttgtcgaacgttgtaaatcgt
ctatccgatagagtcaatagaatgtgtgagaggaccaaacaattgactgtcaaaacaaca
cttgacagtaatcagaaaagaaaactcaccaaacttttcccggaattgacgatgaacttt
gaagattcaacatactcttcacatcctctacaaactgcgatgaggacatgtgaaaatttt
ctaatggatgagaagtgtggaggaagagagtatgttgatgtcggtggtgatgtagctagt
ctgttaaccaaagagtctagagatgtccacatatgttgccctgttgttgatgtcaaggat
gcgcaccggcacataacccgtagtagtattatcgacaggatgaaggggtttaatgaatcc
ataacaatatgtgataaactcacacaagactgtgatgtaccatatccgaacatcgtagcg
gttgaggtttatgacatgtctctcgaagatatggccagatctatattgtcacataaagcc
aagaggtttgatttatctcttatcattccgcctgaaatatgtgacaactattgcgatgtt
atgctcttcgacgactctatgagggtgttcgttagagatggagtagttaattatgagtat
ggatcttctggggagtgttataagcacaatctgaagacgttacaagatattttgagggtg
cagttgttcgtcgtcgatggagtagtctttaagaagactcttgagtgttcaagagaacaa
cttcattttttctcaattgtcccgtgtgtcaacatgaaaccaggagtctataacttaact
tctcattattcgaagtcaaggaatgacaaacttgaaatgattcttccagttcgaggtttt
gatggtgggctcagaaatgttagggtgagtgtggacaaatatgttaccatgcatcttatt
gagtatgctatgaacaccacactcaaagtggaagataaagcagctgaatacctcatacct
caattcagatctaggaagagtgtatcaataagtggaggaaaggtagttcaaaaggaattt
gatttacccgacgaactccacgcaggttatttagctgttataatggcggaaggagcacgt
aggagggagaaagtggtcaacttggctagagttagctattttaaacattatgcccctacc
gttattcaggttttgtttaacattttcttcgagttgtatggtaattttaagagaatatgt
tataaggcatttatatctgcaatgtcgttggttatgtctgaggatttccttgagaaagtt
gtcgttggagagagacgtattttcgatgtgcaagaggttgtacatttcgaacaagaaatc
gtgcttgttggtaaacagggcgatatgaacgtattacgtgagtcgttacacaaattcacc
gtcgaaaatgagaagagagccgacgacatctctcaaattgtttatgccaacagagaaagt
ttcgctgacgacgaacttgatgtgatgaaacaactttttcagatgggaggaggttcaaaa
ttccgtggtttcaccaataatttggacaggtctacctttggattttattccaaagtgtgg
agttttgtgaattactacgtgaaagatgtaaagagggtcagattggtagcaaatttcttc
gtgtcattgtgcgatttcttccgtcaatgtggtatgtcgacgtgggaatacgttaattcg
gtgtttaaggaatttgttggctttgttaaatgtggtttgaaaggtagtcttccaaatatg
tggtctgagttgaagaaggctgctaagtttacaaaagaaaaatttaataagcaatcggaa
gacttgaaatcattactccatgatttttacaggagacagacaggattggatgatgaaggt
aatgaactgttttggcaggatatgacctatgacttcggtacacggagaatgttttcggaa
gagaagaagaacagatttgttgtagaactaaagaaaacttaccacaatttggtgagtaag
aaggataaattgatctcgagaatcatgacgatctacaattacatgaaatttatctacgct
tttattcgtgaacaacttaaaggcgaagatcttatcaatactgtagatcacattattaag
ggtgcgtctttcttctttgtccatgcattgtccctctgtgctatgggatctttttcttta
accggtcttgttgcagccgtatcgacatatttgggtttaaaattcactggtatagagaag
aagtatttgggatcttcagttgtctcccaacatttgatttctgcctgttcagtgtcctca
cccgcagccctgatgacgctgcctgtgcggtcagctgtcaccaagtgtgtcgagataggt
ctaaaacggaaactcagtaagtgtgagggattggcatcaactatgcaaggggttatagct
aaggatgctatagacatgagatggtactcttatgttacaccgtatagagtccgaatgaca
atatacatatctctggtgttagtatttttcttcccacgtcttgccatagctcttatgttg
acaactttcttagtggccgaacataagaagtattttgaaaaatttgcggtagtagctaat
gtcgacctatcgtttgcgtcagttttaaacaggacacaaccgacaaagagaatggcgaca
ttgaaaaggttattgaaggataaatttaccgctgcaaaggtcaaggagcagaaggacgat
gatacctccaccgtagacgctgaaccaagtgaagtagctatgttaggtggtgatatcagt
ttaagggacgaagaggtagatgtggagtttgattatgatggtagttatgttgagagacat
gggaagttatctacatctaagttggtcgttgaagaggatttgaagcctagtgcggccgat
ggtttaaatttttatcagttaaaaatttctggaagaggaaattttatgcagttcaatgtt
cctttcaaagttagtgctgcgatgactcagtatgcatacagagatattccgaccattgtg
tatactggagatgagaagttagacactttgaatgaatactactatttagagaagaagaag
acctttatggaactcgggaaattggacaatgtggtagatctttatctatcacaattggaa
aataagtcgagttttgagaaggtggttttccatctcagacaaagatttgacgactcaact
ttgtatgtttctgaagatggagcatgttggcataagttaaaaataggaagtaaatctctt
gtgtcacttgatcacaaatgtaaatatgactgcaacagagtcttaatggcattcgactct
gaatgcaaagatttccaagttaccagtgatgagttagccggtatgtattcaaatgagagg
tgtttagccttggaatatttgaccgttgacaaaatacctcaattggccagagatttaact
aagaaggtgaccttttacaataagcccccaggtgccggtaagacaactaccatcgtgaat
gagttttcgagacttcataatgagggtaagaggtgtttggccttgacttgtactaaggcg
ggaaaagttgagattgctgagaaattgagggctcgaggtattaaatccgtttattcaaat
tgtcttacatatgatgccttcttgatgaagaacacgtttcgagatgtcgattacgtgttt
tgtgatgaaatttttatgattcatgcaggattgtggcttgctatttcatgtaatctggaa
tttggagtaatgggttgttatggagatgttaatcagatcccatacatcaatagagttcct
aatactatttgcacgaaaagtatgaatcattattatcagtatgaaatgttccatgacaat
atctcttacagatgtccagttgacgtgtgcaagttgttgtccactctaacagacgcgaaa
ggtcaactcatctacccaaaaggagtttatcctgctggtgataatgcgaatgttcttagg
tctttgcaagtcgtccccatttacagtccagaagatgctatggatgaccaagacgttaag
attgtcacattcactcaacctgaaaaagaagaaatgattaaggccactaggatgagaaac
ggagtcagttcctccgttaatacggtgaatgaagttcaaggtggtactttttcgaaagtg
gatgtctacagattgaaaccgtatgacaacccaatctattcagatttgaatcaatttgtt
gtcagcgtttcaaggcatactcagttgatgcgatacagagtcgtgtcttctaagatgagt
gataagattgcgaataacatatcctcaatggataatgtttctgacttcatccttaaggag
tttgcggctaaacggtgcgttgacgtctataatctacaggtggaagatttcttcttaccg
cagactttcagtcgacctcctgcgtcgacgttggtggcggtaaatgagtttatgtccttg
ataaacccgggtattatcgatcatgattttcttcatcgaacgatgatatctgagtattct
atgtttgaattaccacctgtaggagacctaaccatcgacttgtcgaagagtaaaccatat
atatctggagattttgtcacatccggtgtgttgggtaaaggagagagatctagaccggac
acctggcggcaggctattgcatctctgagtcataggaactattctgcccccagagtgaat
gagagattagacactttcaagacagctgagctcttatgtgaatctctccttagagctttt
gatatgtctaagttgtttgagaactatgactacatcattccagatatctataggattgat
cagtggttgtccgacagagatgtgtcaaagttcaacagaataaagagggacatgaaccac
aacctcatgtatgaacaattcagtaccatgaagatgatgataaagggtgatcttaaaccc
aaaatggatttgagttgttatactacctatgcacccccggcaaacataatttactacaaa
cacattgttagcatgtttttctctccacttttcttagaggtgtttgatagaattacttat
tgtttgtcgaacaaggtcgtaatgtattcagggatgaatcttgagactttgagtagggtt
gttaaatcaaagctacccttacctctcgattcttattacacgttggaaattgacttctcg
aaatttgacaagtcccaaggttgtgttttcaaactttatgaaggcatgatctatagattt
ttaaaatttagtgaggaggcttatctcaacattgagacgactgagtacttttgtcgattt
aagtcggcatctggtttgacaggtgagttgggtgcacaacgtaggactgggtcaccgaat
acgtggttgtcaaatacgttggtgactatgggtatgttattgaatgtttatgatcttgat
gacattgatcttatgttggtgagtggtgatgacagtttaattttttcgaagaagcagtta
gagaacaagaccaacgaattgaacattaatttcgggtttgaagcaaagtttattgaaaat
tctgtcccgtatttctgttctaagttcattgtggatgaccgaggttcgattaaagttgtg
cctgatccggtcagattttttgagaagttgtccgtacctgtgaggctgtccgattttcta
gctgaaacaacgttgagggagaggtttacctcatataaggatttgatgtctgagtatgat
aacgatagtgtatgcatattggtcgactcacttatcagtaagagatattctcttccatta
atgacctcatatgcggcattgtgtttcatacattgtttgtgtgctaatttttcgtcgttt
cgtaagattttcgacgagttctttgttgttgatatttga

DBGET integrated database retrieval system