Vibrio gigantis: MID13_18920
Help
Entry
MID13_18920 CDS
T08202
Name
(GenBank) calcium-binding protein
Organism
vgi
Vibrio gigantis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HemolysinCabind
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ULN67184
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(775757..780511)
Genome browser
AA seq
1584 aa
AA seq
DB search
MEGTKHDDLIVGTDQDDAVNSRAGNDQISTLAGDDFVAAGEGSDTILAGEGADTVLGDVE
YDTGETAEAPISTDDSWGESQTVYTYDNNTNGQQSSHTIRLDSFAVNQAVNTSTTVAGLE
SNSSITVQLTDENGTVIASQIAQVDANGLVSIDTDIPESSLGDSGEVTFTFLDDNNQPIT
QIDDMNIDVRNIYNDTIDGGAGDDILKGQQGDDTIYGGTGNDFLDGDINDDTLYGEDGND
VLVGGNGDDYLDGGSGDDTLLGSDGDDILHGGDGNDLLMGEMGDDTIHGGKGNDDLIGDD
GADTLYGGEGHDKLFGGKGNDYLSGDDGNDEIHGEDGVDNIIAGAGDDFVLGGSGDDLIS
GGQGSDLLLAGDGDDVVTGDEGDDTLVGELGNDNLSGGDGQDTLYGDAGDDTLSGGAGND
QLYGGLGDDTIDGGDGDDVIHANEGADTITTGSGDDLVFAGSGDDIIDTGEGSDTVFGET
GDNQITSGSGDDTIYTDSGKDNIDSGDGADTIFAGAGDNVINSGSGDDLMYTDSGDDLIT
SGTGSDTIYAGDGDNIIESGTDNDTVFTGSGVDTINLGEGDDKAFAGGGNDSIVAGTGDD
QIFAGEGDDTLQGIQGNNQLFGEGGDDTLIAGLNASELYGGSGADTLLGSGESDSLHGGQ
GNDDITANAGNDIVEGNGGDDTLTLGTGNDVGLGGEGNDTISGGEGNDTLVGDAGHDTLT
GGSGDDVLVGGEGNDLLDGGTGRSEIYGGSGNDTIISSTEDDLLSGGSGDDTISSGIGDD
TVFAGSGTDSITTGEGDDTVYGESGSNTIDTGTGDDIVYGGVNSDNVTLGEGNDQVYSGD
GNDTIDAGSGDDHIDAGAGADYIQGGSGNDAIFGGSGNDELVGGEGYDFLAGGDGDDIIT
DDGQDTILGEKGNDTLTAAATGSHSIYGGDGNDTLIGSNASDTLYGGADDDTITGADGDD
TLFAGDGADTVDAGSGNDTVYGESGSNQVNLGTGDDTLFGGTGADTAFGGEGNDNLYGGS
GNDDLSGGVGEDFVDAGEGNDTVSGGDDNDLIFGGDGNDTLMGDAGNDLLYSGAGNDQLH
GGDGEDKLTAESGTNTLSGDSGDDILLGGSGADTLLGGTGDDYIEDSSDNNTVEGGEGSD
TIKLTGANNTVAGGAGADTISSTGGGIVSIAGGDGNDSITATGDVNTIDGGEGSDTISIT
AGSSTVTGGEGNDSITSASGSDTLHGDAGADTLSSGSGNDNLYGGSDNDKLYAGDGDDLL
EGGDGNDTMYGQNDQDSLVGGLGNDYLSGGSGNDSLKGGEGNDTLRGDSGEDTLWGGTGN
DNLSGGGSADLLFGEEGNDTLSGNGGNDIMYGESGDDKLSGGSGDDYLSGGDGNDTLSGN
NNSDTLDGGVGDDNLSGDSGNDTLFGQVGNDILDGGDGIDQLYGGAGNDQLIFDSNELES
GEVGVVHFSGGSDFDVLVVGNDNQSQMIDMSNNTFQEIEGVKISSSDTELALALDKIAAN
NTAGDTAGQFVCTGASSIDVSGWGWQLTESHLEMSESLQDIYRESNIDTGSLYGYRFESE
AGQEVVIWSDLNSGDINFPDTNEV
NT seq
4755 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaggaactaaacacgatgatctcattgtaggtacagaccaagacgacgcagtaaac
agtcgagctggcaacgaccaaattagcacactggcgggtgatgacttcgttgctgcgggt
gaaggcagcgacacaattttagctggtgaaggcgcagacaccgtattaggtgatgttgaa
tacgatacaggagaaacggctgaagccccaatcagtactgacgactcatggggtgaatct
caaaccgtttatacctacgacaacaatacaaacggccagcaatcatcacacacaattcga
cttgatagttttgctgttaaccaagctgtcaacacatcaacaacagtcgctggacttgaa
agcaacagctcaattaccgttcaactcacagacgaaaatggtactgtgatcgcctcacaa
atcgctcaagtcgatgctaacggtcttgtcagcatcgataccgatattccagagtcctca
ctcggcgactctggtgaagtcacgtttaccttccttgatgacaacaatcaacccatcacc
caaattgatgatatgaacattgacgttcgtaacatctataacgacacaattgatggcggg
gccggtgatgacattcttaaaggccaacaaggtgacgacacgatctacggtggtaccgga
aacgattttctagacggcgacatcaatgacgatacgctttatggcgaagatggaaacgat
gtattagtcggggggaacggtgatgactacctcgatggcggttctggcgatgatactcta
ctcggatctgatggcgacgacattcttcatggtggcgatggtaacgatctactcatgggt
gagatgggtgacgatacgatccatggggggaaaggcaacgatgacctgattggcgacgat
ggtgctgacaccctgtatggcggtgaaggtcacgataaattgtttggtggtaaaggtaac
gattacctatccggtgatgacggtaatgatgagattcatggtgaagacggtgttgataac
attatcgcaggcgccggcgatgacttcgtgttaggaggatctggtgatgacttaatctca
ggcggccaaggcagtgaccttttacttgccggtgatggcgatgatgttgttactggtgat
gaaggtgacgacacattagttggcgaactcggtaatgataacttatcaggcggcgacggc
caagataccctatatggtgatgccggcgatgacacgttgtcagggggcgctgggaacgac
caactgtatggtggcttaggtgatgacacaatagacggcggcgatggcgatgatgtcatt
cacgcaaatgaaggtgccgacaccatcacaaccggtagcggcgatgacctcgttttcgca
ggttccggtgacgatattatcgatacaggtgaaggctctgacacggtatttggtgaaacc
ggcgataaccaaattacgtctggttctggggacgacacgatttacaccgactcaggtaaa
gacaacattgattccggtgacggtgccgacacgattttcgcaggtgctggtgataatgta
ataaattctggatctggtgacgacttgatgtacacagattctggggacgatctcatcacc
tctggaacaggaagtgacaccatctatgccggagacggcgacaacattatagagtctggt
actgacaacgatacagtctttactggaagcggcgtggacaccatcaatcttggtgaaggc
gacgacaaagcatttgctggtgggggcaacgattcaattgttgctggtactggtgatgac
caaatctttgccggtgaaggtgacgatacccttcaagggatacaaggtaataaccaactc
tttggtgaaggcggtgacgacacattaattgcaggtcttaatgcaagtgagctatacggt
ggtagcggtgcggataccctcctgggttcgggcgaatctgacagtctgcatggtggtcaa
ggaaacgatgatatcactgcgaatgccggtaacgacatagttgaaggtaatggcggagat
gatacattaactcttggaaccggtaatgacgtcggcctaggcggtgaaggtaacgatacg
atatctggcggcgaaggtaacgacactctcgttggagatgcaggacacgatactctcact
ggcggcagtggagacgatgtccttgtcggaggcgaaggtaacgatctactcgacggtggc
acagggcgcagtgagatatatggcggtagcgggaatgatacgataattagttctactgaa
gatgacctactctccggaggctcgggagacgacactatttcatcaggaattggtgacgat
accgtatttgcaggctcggggaccgacagcataacaaccggcgaaggtgacgataccgtt
tatggagagtctggcagcaatacgattgataccggtactggtgacgatatcgtttatggt
ggtgtaaatagtgacaatgtcacccttggtgaaggcaacgaccaagtatactctggtgat
ggtaacgacaccattgatgctggctcaggtgatgaccatatagatgctggtgctggcgca
gattacatccaaggtggcagcggaaacgatgctatttttggtggttccggaaatgatgaa
ctcgtcggtggtgaaggatacgatttcctagctggcggagacggtgatgacattatcacc
gatgacggtcaagatacgatcctaggtgaaaaagggaatgacaccctcacagcagcagct
acgggaagccacagcatctacggtggtgacggtaatgatactctgataggaagtaacgct
agtgacaccctctatggtggtgccgatgatgacaccatcactggagccgatggtgatgac
acattatttgctggtgatggcgcggataccgtcgacgctggttcaggcaatgataccgtg
tatggcgaatccggcagtaaccaagtcaatttaggtactggtgatgacaccctatttggc
ggaacaggcgctgacaccgcttttggtggtgaaggtaacgataacttgtacggtggttca
ggtaacgatgatttatctggcggcgtaggagaagatttcgttgatgcaggagaaggtaat
gataccgtttccggtggcgacgataacgatcttatttttggcggtgacggtaacgacaca
ttgatgggtgatgccggaaacgacctactctactccggtgcaggtaacgatcaactgcac
ggtggcgatggcgaagataagttgaccgcagaaagtggcaccaataccctttccggtgat
tcgggagatgatattctgcttggtggttccggtgcagataccttactcggcggtactggt
gacgattatattgaagactcatcagacaacaatactgtcgaaggtggcgaaggctcggat
accataaaactaaccggtgcgaataacaccgtagccggcggtgcaggtgctgacactatc
agctctacaggtggtggtattgttagtatcgcaggtggagacggtaacgactcaattaca
gctactggtgatgtaaatactatagatggtggtgaaggcagtgacactatcagcattact
gcgggtagcagtacggttactggcggtgaaggtaacgactcgatcacgtcagccagtgga
agtgatacccttcacggtgatgccggagcagatactctatcctctgggtctggaaacgat
aacctttatggcggttccgataacgacaaactgtatgcaggggacggcgacgatctcctc
gaaggtggtgacggcaatgacaccatgtacggacaaaacgaccaagattctctcgttggc
ggattaggtaacgattacctttcaggaggttccggtaacgactcccttaaaggtggagaa
ggaaacgatacgttacgtggtgattctggcgaagacaccctttggggcggcacaggcaac
gataatctctccggtggcggctctgccgatctcctattcggagaagaagggaacgataca
ttgtctggaaacggaggcaacgatattatgtatggcgaaagtggcgatgataaactgtcc
ggaggctctggcgatgattacctttctggaggtgacggcaacgacaccctaagcggtaac
aacaattcagacacccttgacggtggcgttggcgacgacaacctatctggtgattccgga
aacgacaccctatttggtcaagttggtaatgacattctcgacggcggtgatggtattgac
caactctatggtggtgcgggtaacgaccaactcatatttgattcaaacgaactcgaatcc
ggtgaggttggtgtcgttcactttagtggtggttcagacttcgatgttttagtcgtcggc
aacgacaaccaaagccaaatgattgatatgtcgaacaatacattccaagagattgaaggg
gtaaaaatcagctccagtgatacagagctcgccctcgccttggataaaattgctgctaat
aatacggctggtgatactgcgggacaattcgtatgtaccggagcgagtagcattgatgta
tctggttggggttggcagctcactgagagccacttagaaatgagcgaatcacttcaagac
atctatcgcgaaagcaatatcgatacaggctctctgtatggctaccgatttgaaagtgaa
gctgggcaagaagtcgtcatttggagcgatctaaatagtggtgacattaatttccctgac
accaatgaagtataa
DBGET
integrated database retrieval system