Vallitalea guaymasensis: HYG85_04010
Help
Entry
HYG85_04010 CDS
T07172
Name
(GenBank) ABC transporter substrate-binding protein
KO
K02035
peptide/nickel transport system substrate-binding protein
Organism
vgu
Vallitalea guaymasensis
Pathway
vgu02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vgu00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
HYG85_04010
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
vgu02000
]
HYG85_04010
Transporters [BR:
vgu02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
Peptide and nickel transporters
Peptides/nickel transporter
HYG85_04010
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SBP_bac_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QUH28122
UniProt:
A0A8J8M850
LinkDB
All DBs
Position
complement(893050..894699)
Genome browser
AA seq
549 aa
AA seq
DB search
MKKRAVLVTFLVLIMMITGCKNNQDIKADQNLQEEQKSGSANVDNGAEDNTDSVKPVNEE
VLIDQSKEIVLAGTRNIAPGEKDAYYCSSALMVWEPLITKGSDYGPKPKLAASYSANEDY
TVWTFKLREDVKFHDGEVFNADAVIANFDRMKLGKKSSSFYGMDINRTYPGLLEVNKKDD
YTIELVFENPLPTLDYSMTDFGSAMFSPNNFDEEGNFNGFPMGTGPFKLTENVLDEYCVI
EKNNDYYGEKALAERIKIKVIPSPDTRFAALKAEEVMGVIDLGAIQPVMAMELIKDNRFG
ISHTPSTITHYILLNGNKEPFNDLRLRQAVSLLIDRQLIIDSFYAGLGEPTVNVLNACTP
FYKEFDIEHDVEKAKKLAKEVLGDERVKVSFVLRQGELDRYPNKEEAQLLQSQLSELGID
AEITILESSAWNDVVKAGDFDISLKIKGLSSAEPNTLFKTMMKTDNGLNKRWNFGYSNKT
VDTLITDVENETDMDKRKEIYKKIQGYSVNEFPAVPYFNDVNLIAYNKKIEGYEAMYYGV
SLEKTKWAE
NT seq
1650 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaagagcagtattagtaacttttttggttctcattatgatgattacaggatgt
aagaataatcaagacataaaggcggaccaaaatctacaagaagaacaaaaatcaggatca
gcaaatgtagataatggtgcagaagataacacagattcagtgaagccggtgaatgaagaa
gtgttaattgaccaatccaaagagattgtactagcaggaacaaggaatattgcacctgga
gaaaaagatgcctattactgtagttctgcattgatggtatgggaaccacttattacaaaa
ggttcagattatggtcctaagccaaaacttgcagcaagttattctgcaaacgaagattat
actgtatggacattcaagttaagagaagatgtcaagttccatgatggagaagtgtttaat
gcagatgctgtcattgctaattttgatagaatgaaactagggaaaaagtcttcaagtttt
tatgggatggatattaacagaacatatccagggctgcttgaagtgaataaaaaagatgat
tatacaatagaattagtctttgaaaatcctttgccaacattggattattcaatgactgat
tttggtagtgctatgttcagccctaataattttgatgaggaaggtaatttcaatggtttt
cctatgggaactggacctttcaaattaactgaaaatgttcttgatgagtattgtgtaatc
gagaaaaacaatgattattatggtgaaaaagcattagctgaaagaattaaaataaaagtt
atcccatcacctgatacacgatttgctgcattaaaagcagaagaggtaatgggtgttatc
gatcttggggctattcagcctgtgatggctatggaattaataaaagacaatcgatttggc
atatcacacacaccaagtacaattacccattacatacttttgaatggtaacaaagagcct
tttaatgatctaaggttaagacaggcagtcagtttattaattgatagacaattgattatt
gatagtttttatgcaggtttaggtgaacctacagtaaatgtacttaatgcatgtactcct
ttctataaagaatttgatattgaacatgatgttgaaaaggcaaaaaaattggcaaaagaa
gtccttggtgatgaaagagtgaaggtttctttcgttttaagacaaggtgagctggataga
tacccaaacaaagaagaagctcagttattgcagtctcaacttagtgaactgggaatagat
gctgagattacaattcttgaaagttcagcatggaatgatgtggttaaggctggtgatttt
gatatcagcttaaagataaaaggattatccagtgctgagccaaacactctgtttaaaact
atgatgaaaactgacaatggattaaataaaagatggaattttggctattccaataaaaca
gtagatacattaataactgatgttgaaaacgaaacagatatggataagcgtaaggaaata
tataaaaagattcaagggtattcagtcaatgaatttccagctgttccatattttaatgat
gtgaacttaattgcttacaacaaaaaaattgaaggctacgaagctatgtattacggcgta
tctcttgaaaagacaaaatgggctgagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
