KEGG   Vallitalea guaymasensis: HYG85_15630
Entry
HYG85_15630       CDS       T07172                                 
Symbol
addA
Name
(GenBank) helicase-exonuclease AddAB subunit AddA
  KO
K16898  ATP-dependent helicase/nuclease subunit A [EC:5.6.2.4 3.1.-.-]
Organism
vgu  Vallitalea guaymasensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:vgu00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:vgu03400]
    HYG85_15630 (addA)
Enzymes [BR:vgu01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.4  DNA 3'-5' helicase
     HYG85_15630 (addA)
DNA repair and recombination proteins [BR:vgu03400]
 Prokaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   HR (homologous recombination)
    AddAB pathway proteins
     HYG85_15630 (addA)
SSDB
Motif
Pfam: UvrD-helicase UvrD_C AAA_19 UvrD_C_2 PDDEXK_1 Viral_helicase1 DEAD ResIII AAA_12 AAA_11
Other DBs
NCBI-ProteinID: QUH30258
UniProt: A0A8J8MCA3
LinkDB
Position
3665828..3669514
AA seq 1228 aa
MSGVKWTLEQQSVIDTRNRNLLVSAAAGSGKTAVLVERIIKMIVDGEKPVDIDKLLVVTF
TNAAASEMRERISDALEKKIDENPENKYLHKQLSLLPNSNIMTIHAFCLNVIKNNFHLIN
LDPSFRVADETELTLLKSDTIKELLEEKYQLEDNGDFIDLIESYTSGKSDDRIEELILEL
HRFAMSNPWPEIWLDEMSEQLNLEGIDNIDDSQWALMIKQVLKDEIPMYIKILEECKSIC
NSDNGPIGYLDAILLDLKNLVGINDILDTSLENISQEIIKVGFGAIGRCKKGVDKVLQER
IKGIRDDVKENYNKIKSEFFFKSGDSIMDDINNTYPVIKTLCNLVKEFIEKYQDAKAEKN
IIDFNDIEHLALNILIGEDEEGKKTPSNAAIELQDKFTEILIDEYQDSNLVQETILTSVS
KVLSNEPNMFMVGDVKQSIYKFRLAKPELFMEKYKKYSIEESLYQKIDLHKNFRSRKSVI
DCTNYLFSQIMSNQYGDVIYDDTAALYLGANYEEFMDGETAGPSEVIFIDKKDIYSEENN
EGEELEAKVIAERIKELVNPSNPYYVYDKKLGKYRPAMYKDIVILMRSTSTRADGFVTEL
INYDVPAYTDATSGYFDTIEVKTVLSLLKIIDNPRQDIPLISVLRSPIVGLKADELVRIK
AALPEGEYYDAYEQYILGTINEDELSVKLNRFNELLNDWREKAVYMPLNDLILDIYDRSH
YYNYVSVMTGGRQRRANLDLLIDKAIKYESTSYKGLFNFIRYLEKIHKYSIDMGEATVFG
ESENLVRIMSIHKSKGLEFPIVFIAGIGRQFNMQDLNKHILLHQDLGLGPKYVNYELRYE
VKTLPKAIISRKIKNENISEELRILYVALTRAREKLILVGSCKDLCKKVEKLSRYLFFPD
RLLIPQVIASGHSYMDFIIPALLRHREGEIMRNLLDNPSICSPEELWEHEASWDIKIVTI
DDIISREEDVKDAKNETYENLLNWDCEKSYSEYPRDYFDCSLNWTYPHGDAVLKPIKISV
SEIKKQSMPDELIEHEEMFNDFEPYKPRFMEEKLSLTSSEKGTAFHKVMQHIDFNELHNY
DYIVDYLDSLQQGEILTEKEKRSIRIKSILRFSKSNLLQRIINAEGNGRLKREVPFVLGV
PLKDIYNDCNIDEKALVQGVIDCYFIEDDKIVLVDYKTDYIQPHEQEVLVKRYKKQMELY
SIALENIMGMKVSEKILYAFSVGKEISI
NT seq 3687 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtcaggtgtaaaatggacgttagaacagcaaagtgttattgatacaaggaatcggaat
ttattagtttctgcagcagctggttcaggaaagacagctgtacttgttgaacgtattatt
aaaatgattgttgatggggaaaagcctgttgatattgataaacttctggttgtaaccttt
actaatgcagctgcttcagagatgagggagagaatatcagatgcattggagaagaagata
gatgaaaatcctgagaataaatatttacataaacagctatcgttattacctaattccaat
ataatgactatacatgctttttgtcttaatgtaatcaagaataattttcatcttattaac
ttggacccttcctttagagtagcagatgagacagaattgacacttcttaaaagtgatact
ataaaagaattgttggaagagaaatatcaattagaggataatggggatttcattgattta
attgagagttatacttcggggaaatcagatgataggatagaggaattaatcttggagtta
catagatttgctatgagtaatccttggcctgagatatggttggatgaaatgtcagagcaa
ctcaatttagaggggatagataatattgatgattctcagtgggctttgatgattaagcag
gttctaaaagatgagatccccatgtacataaagattttggaagaatgtaagagtatatgt
aatagtgataatggaccgataggatatttggatgctatattattggatttaaagaatttg
gttggaatcaatgatatcttggatacctctttggaaaatatttcccaagaaataattaag
gttggttttggtgctattggaagatgtaaaaaaggtgtggacaaggtactacaagagaga
ataaaaggtattagagatgatgttaaggaaaattacaataaaataaaatcggagttcttt
ttcaagagtggggatagtattatggatgatataaataatacatatccagtaataaagaca
ctgtgtaatcttgtgaaagaattcatagaaaagtatcaggatgcaaaagctgaaaagaat
ataattgactttaatgatatagaacacttagcgttgaacattttgataggggaagatgaa
gaaggtaaaaaaacgccatctaatgcggcgatagaattacaagacaagtttactgagata
cttatagatgaatatcaagacagtaacttggtacaggaaaccatattgacaagtgtatca
aaagtattgagtaatgaacctaatatgtttatggtaggtgatgtgaaacaaagtatctac
aagtttcgattagctaagccagagttgtttatggaaaaatacaagaaatattctatagaa
gaaagcttatatcaaaaaattgatctgcataagaattttcgtagcaggaaaagtgtcata
gattgtactaactatctattcagtcaaatcatgtccaatcaatatggggatgtaatctat
gatgatacagctgctttgtaccttggggctaattatgaagagtttatggatggtgaaaca
gcaggaccttcagaagttatttttatagataaaaaagatatttatagtgaagaaaataat
gaaggggaagaattagaagcaaaagttattgcggaaagaataaaagagcttgttaatcca
tctaacccatattatgtatatgataaaaagctgggtaaatatagaccagctatgtataag
gatatagttatattaatgagaagtaccagtactagagcagatggatttgttactgagtta
atcaattatgatgtaccagcttatacagatgctacttctgggtattttgatactattgag
gttaagacagtactttcattattgaagataatagataatcctagacaagatattccattg
atatctgtgttaagatcacctattgttggactaaaagctgatgaattagtacgaatcaag
gcagctttaccagaaggtgagtattatgatgcatatgagcaatatatccttgggacaatt
aatgaagatgagcttagtgtaaaattaaatcgtttcaatgagttattgaatgattggagg
gaaaaagctgtctatatgcctcttaacgacttgattcttgatatttatgataggtcacat
tactataactatgtatcagtaatgactggaggaagacagagaagggctaatctggatttg
cttattgataaagccataaaatatgaatcaaccagttataaaggattattcaacttcatt
agatatttggagaaaatacataagtattcaattgacatgggagaagctactgtatttgga
gagagtgaaaacctagttaggattatgagtatacacaagagtaagggacttgagtttcct
atagtttttattgctgggataggtagacagttcaatatgcaagaccttaataaacatata
cttctacatcaagacttgggtcttggaccaaaatatgtgaattatgagttgcgatatgaa
gttaaaacattaccaaaagctataataagcaggaaaataaagaatgaaaatatatcggag
gaactgagaatattatatgttgctctaactagggcaagagaaaaattaattctagtaggt
agttgtaaggatttatgtaaaaaagtagaaaaattatctagatacttatttttcccagat
agattgttgataccacaggtaatagccagtggacattcatacatggattttattatacca
gccttattaagacatagggagggtgaaataatgagaaacttactagataatccttctata
tgttcacctgaggagttatgggagcacgaagcctcatgggacataaagatagtaacaata
gatgatatcattagtagagaagaagacgttaaagatgcaaaaaatgaaacctatgaaaat
ctattgaattgggactgtgaaaaaagttatagtgagtatcctagagactattttgattgt
agtctgaattggacataccctcatggggatgcagtattaaagccaataaaaatatctgtt
tcggaaatcaaaaaacagagtatgccagatgaattaatagaacatgaagaaatgtttaat
gattttgagccatataagccaagattcatggaagaaaaactaagccttacttccagtgaa
aagggaacagcattccataaagtaatgcagcatatagattttaatgagttacataactac
gattacatagttgattacttagacagcttgcagcaaggagaaatattaactgaaaaagaa
aagagaagtatacgtattaagtctattctaagattcagtaagagcaatcttttacagaga
attattaatgcagaaggcaatggtagattaaaaagagaggttccttttgtattgggtgta
ccattgaaagatatctataatgactgcaatatagatgaaaaagctttggtgcaaggggtt
attgattgttattttattgaagatgataaaatcgtgttagtagattataaaactgattat
atacaaccacatgaacaagaggttctagtaaaacgatataaaaaacagatggaattatat
tccatagcccttgaaaatatcatgggaatgaaagtaagtgaaaagatactatatgctttt
agtgttggaaaagagataagtatataa

DBGET integrated database retrieval system