KEGG   Vibrio campbellii ATCC BAA-1116: VIBHAR_03686
Entry
VIBHAR_03686      CDS       T00589                                 
Name
(GenBank) hypothetical protein
  KO
K12287  MSHA biogenesis protein MshQ
Organism
vha  Vibrio campbellii ATCC BAA-1116
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:vha00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02044 Secretion system [BR:vha02044]
    VIBHAR_03686
Secretion system [BR:vha02044]
 Type II secretion system
  MSHA pilus biogenesis protein
   VIBHAR_03686
SSDB
Motif
Pfam: DUF6701 DUF7305 Bactofilin
Other DBs
NCBI-ProteinID: ABU72600
UniProt: A7MSA4
LinkDB
Position
I:complement(3721061..3725695)
AA seq 1544 aa
MNKKTLFSSLFLFAAFTVQAEAIFPLPDGVCVETSAQTWKGSSEQEVKLAKSNAIIDGPS
DRIIGYTKIDENRSKSCGSGGKCKASKSNGIDRRLPTSPNFSLSGVHFDHTYNETQLSGS
QSMTLSSGTYRVKKLLKLDDNSTLRINGAVTLYVEKMEVLANAKIEVSSGHPDDFIIISR
DGENDSEVILKGYNEFAAHIFAQEEVELSEHVTLIGTITAPELEIKDHAQLKAMVPESCS
PIDPEGPINRSPQFEFGTVDGATCSGSGNTYTCRISFENDYDEDKPIPLVFVMPTIDKTL
SSKKPRVTEYPSSVSVISVDRNTATIVQEFPPHNAADRNVQFLNKNDPGVRKEMAKVDYF
VIEPGVLELNNGAKIVAGTIDTKVAASQYKNDNKQINEQNNGVKVDFSDFGLSSFDGKPG
VLVQPQTKRNNGTNNWFTGMARDGTKTSFKLALEKSEVYGKNNRGQETFNIIDDEETVAF
VAGEGFGYVNGKRFWLGQGVTEYTLNQQDPVIDPIYEGCKVYTPFPDSAGFKEPPILVAN
KNSRRGNNGGWLRRCDVTKDSVAFIVEEDMKKDKERGHMDEDVGWFMFEKANQNPMCDAF
NAPVQTWRRELANDGVDGTLVLSNQSKIIGTPVLTVGGERKRVVGFMPGTVSGQNKSNAC
DGYECHGDEGLLIGKEALENFPVTSSWNNRTIGADDKVTFYEGTNVKHLNVDGELTLEAG
KYWFDSVKINTGGKLLVKEGTEVIINTKALALANHSYMGVDVDAKNNPVFNGNMRVNVYG
LTPAAGSKLHDRVDIANYSEVVGLIYSEDKVYLSNHSVIYGAVTAIDIDMNESAEVHAAT
SCLPPLDDYELTVSPKAQYALMCGVEKPTFTIETKNQGELESTWVNVEVLPADSANSFTV
SVANNIGSGTYPRFRTSMNEGSKGQLELSIAVKNTAKVDLDQTYSLKVTLEEDGNQSQAA
TFKYVPFKFHVDDQSVIAGQVKPVTAQVLACSGGEQTIVKSYVGTPDVSLKLETPNGGRD
DASLLSYEPKFVKNENSSSTEYFKLMESGEYTVTLTDQNFVCDPQYADDCPIAPEEDDES
QQETVMLNGSFNVKSRPWKIAICDVKSKEGDVINPGTQATGNGFIPSATSFNVTYKPVVH
SESRDSATDICDYPLTQNYFSSDNTNAPLEIEFSVAYPAGGELANLSEENGFIGSSTFTK
AEALSGKEGEYVWNEVGSLDLTTNASYLGMSLDEDSKVIGRFYPKFFNVIGDEWDYPGSQ
DFAYMNQPFDGLAFDVEALNASKSAVTNYVKFTTKAAFNIKELGSYSTRLLSPSFGAGEW
KNASDNSVGTFLTGSNNLCTGSVCWIKDLGGNYPDGPFNMGGGKASQIGIDYTNNADPVE
YLNSEDGNASRLLSQPDIRFGRIDLDDVGGNQGAVLRVPLRAEYWTGTRFMSNPDDDQTY
VRGITFKQSHIWPTDGSAVAVNLGSEGQVVDGFSRSLTATEITGHRQQTRVWLDLESSNV
LPWLKYNWDNSQTGEENPSSVVTFGIHRGNDRVIYRGEPGLTGQ
NT seq 4635 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaataaaaaaacactattttcaagcttgtttctatttgctgcctttactgtgcaagct
gaagctatcttcccacttcccgatggtgtttgtgttgaaacgtcagcacaaacgtggaaa
gggagcagtgaacaagaagttaaacttgcaaaatcaaatgcgataatagatggtccaagt
gatcgcattattggttacaccaagattgatgaaaaccgcagtaaatcttgtggtagcggt
ggtaagtgtaaggcctctaaatctaatggtattgatcgtcggctacctacatcaccaaat
ttttctctaagcggtgtgcactttgatcatacatataatgagacgcaattgagtggcagc
caaagtatgactttaagtagtggtacttatcgcgttaagaaactgctcaaattagatgat
aactctacattaagaatcaatggtgcggtaacactttacgtagaaaaaatggaagtattg
gcgaatgccaaaattgaagtttcttcaggtcaccctgatgattttattattatctcgcgt
gatggagaaaatgattccgaagttattctgaaaggttataacgaatttgccgctcatatt
tttgctcaagaagaggtagagctttcggagcatgtcacactaatcggaacgattaccgca
ccggagctagagattaaagaccacgcccagttgaaagctatggttcctgaaagctgttca
cctatcgatcctgagggaccaattaaccgttctccacaatttgaatttggtaccgtagat
ggggccacttgtagcggcagtggtaatacatatacatgtcgaatcagtttcgagaacgat
tacgacgaagacaaaccaattcctttggttttcgttatgcctaccattgataaaacactt
tcttctaagaagcctagagtcacggaatacccttctagtgtctcggttatcagtgttgat
agaaataccgcaacgattgttcaagagtttcctcctcacaatgctgcagatcgcaacgtt
cagttcttgaataaaaacgatcccggagtccgcaaagagatggctaaagtggattacttt
gttatcgaaccgggtgtacttgaactgaataatggtgcgaagattgttgcaggtacgatt
gatactaaagttgctgcttcacaatacaagaacgataacaagcagatcaacgaacaaaac
aacggtgtaaaagtcgacttcagtgattttggcttgagctcatttgatggtaaacctggt
gtgcttgtccagcctcaaacgaaacgaaacaatggcactaataactggtttacgggtatg
gcccgtgacgggactaaaacttcatttaagctagctctggagaagtctgaggtatacggc
aagaacaaccgagggcaagaaaccttcaacataattgatgatgaagagacggttgccttt
gttgctggtgagggttttggttacgttaatggtaagcgcttttggttagggcaaggtgtg
acagaatacacgctaaatcaacaggacccagttattgatccaatctacgaaggttgtaag
gtttatactcctttccctgatagcgctggcttcaaagagccacccattcttgtcgctaac
aaaaactctcgtcgcggtaacaatggtggttggttgcgtcgatgtgatgtgacaaaagat
tctgttgcattcattgttgaagaagacatgaaaaaggacaaagaacgcggtcacatggat
gaagatgtgggctggtttatgtttgaaaaagccaaccagaacccaatgtgtgatgccttt
aatgcgccagttcagacatggcgcagagagcttgccaatgatggggttgatggcacgtta
gttctatcaaaccagtcaaagatcataggaacacccgtgcttacggttggtggtgaacgc
aaacgtgtcgttggcttcatgccaggtactgtttctgggcagaataaatcaaatgcatgt
gatggatatgaatgtcatggtgatgaagggctattaattggtaaagaggcgttggaaaac
tttcctgtaacctcaagttggaacaaccgtactatcggtgcagatgataaagtgaccttt
tacgaaggtactaacgttaagcacctcaatgtcgatggtgagctaacgctagaggccgga
aaatactggtttgattcagttaaaatcaatactggaggtaagcttcttgtaaaagaaggg
actgaagtcattataaacacgaaggctttggctttagccaaccattcttatatgggggtg
gatgttgatgctaagaataaccctgtcttcaacggaaacatgcgtgtgaatgtttatggt
ttgactcctgcggcaggaagtaaacttcatgatagggttgatatcgctaactactcagaa
gttgtcggtttgatttatagcgaagacaaagtttatttgagtaaccatagcgtgatatat
ggtgcggtaacagccattgatattgacatgaatgagagcgccgaagtacatgctgcgaca
tcgtgtttgccgccgttagatgattatgagctgacagtatcaccaaaagcacaatatgca
ttgatgtgtggtgttgaaaagcctacttttactatcgaaaccaaaaaccaaggtgagctt
gaaagtacatgggtcaatgttgaagtacttcccgcggacagcgcgaatagctttacggtc
tctgtagcaaataatattggttctggtacttaccctcgttttcgtaccagcatgaatgaa
gggagtaaaggtcaacttgaattatctatcgctgttaaaaatactgcgaaagtcgatctt
gaccaaacatactcattaaaggtcacgttagaggaggatgggaaccaatctcaagcggca
acatttaagtatgtcccattcaaattccacgtcgatgaccagagtgttattgctgggcag
gttaaacctgttactgcgcaagtcttggcatgtagtggtggcgagcaaactatagtcaaa
agttatgttggtacaccagatgtttctctcaagctggaaacaccaaatggtggtcgtgat
gatgctagtttattgagttacgaacctaagttcgtaaagaatgagaatagcagttcgacg
gaatacttcaagttgatggagtcaggtgaatatacagttacgcttacagatcagaacttt
gtttgtgacccacaatatgccgatgattgcccaatcgcgcctgaagaagacgatgaatct
caacaagaaactgtcatgttaaatggctcgtttaatgttaaatctcgcccttggaaaatt
gctatctgtgacgttaagtctaaagagggcgatgtgatcaacccgggcacgcaagctaca
gggaatggctttattccttccgctacaagttttaatgtgacatacaagcctgttgttcat
agcgaatcacgtgatagcgcaacggatatctgtgactacccgctgactcagaactacttc
tcgagcgataacaccaatgcgcctttagaaattgagtttagtgttgcttacccagcaggt
ggtgagctagcgaacttgtctgaagagaatggttttattggttcttcgacttttactaag
gctgaagccttatcaggtaaagaaggggaatacgtttggaatgaagtaggttcgctggac
ttaacgaccaatgcttcttatttaggcatgtctcttgatgaagatagtaaggtgattgga
cgcttctatcctaagttctttaatgttatcggtgacgaatgggattaccctggttcacaa
gattttgcgtacatgaaccagccattcgatggtttagcatttgatgttgaagcgttaaat
gcgagtaagtctgcggttacaaactacgttaagtttacaactaaggctgctttcaatatt
aaagagttaggtagttactctactcgtctgctttctcctagttttggtgcgggtgagtgg
aagaatgcatcagacaacagtgtgggtactttcctgacgggaagtaacaatctatgtact
gggagtgtgtgctggattaaagatttgggcggtaattatccggacggacccttcaatatg
ggcggcggaaaagcgtctcaaattgggatcgattataccaataatgcggatcctgttgag
taccttaactcagaagatggcaacgcttcgcgattgctctctcaaccggacattcgcttt
ggtcgtattgatcttgatgatgtaggcggtaatcaaggtgcagtccttcgagttccttta
agggctgaatattggacaggtactcgttttatgtcgaacccagatgatgatcaaacttat
gttcgagggattacgtttaagcaatcacatatctggccaaccgacggtagtgctgttgct
gtcaatcttggcagtgaaggtcaagttgtcgatggtttctctcgatctttgacggcaaca
gaaatcaccggccatcgtcagcaaacacgtgtttggctcgatctggagtcgtcgaacgtg
ctcccttggctcaaatataattgggacaacagccaaactggtgaagaaaacccatcatcg
gttgtcacgtttggtattcatcgtggcaatgaccgagtgatttatcgtggtgaaccgggg
ttaaccggacagtaa

DBGET integrated database retrieval system