Vibrio harveyi: AL538_07475 Help Entry AL538_07475       CDS       T04380                                  Name (GenBank) MSHA biogenesis protein MshQ   KO K12287   MSHA biogenesis protein MshQ Organism vhr  Vibrio harveyi Brite KEGG Orthology (KO) [BR:vhr00001]  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    02044 Secretion system [BR:vhr02044]     AL538_07475 Secretion system [BR:vhr02044]  Type II secretion system   MSHA pilus biogenesis protein    AL538_07475 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  DUF6701 DUF7305 Bactofilin Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  AUW38266 LinkDB All DBs Position 1:complement(1574289..1578227) Genome browser AA seq 1312 aa AA seqDB search MRKIITLVLTGVLLLSSFSSFAAVNNNPQFEFGTIPAEDCRVINNERGVTCNIKFKNTYD KEPLVFVMSTIDASMSNFGDKKTEYPSDLRVWSKSKTQAIVKQLFPPHSAACKYIKYNSH KNKWQCNNKGQGKAVTFFDAPMEDIDYLVIEPGVIRFDGDATIVAGTVSSDLTYSNIGGS KYQSKDVQFRNYGLNAQFASPPGVLVQLQTKNNYKNNQPLWLTSIALNPTTKGFSLILDR SEVTKNAELDTPEEVGFVAGLGQGFVSGRKFWLGNGSTRNTLGDLNDNVIKPVTEGCLQV SDFPVSGFKSAPVLLASKRTRNGNNGGWLRRCSVTKTGVALINEEDMQKDSERGHVVEPF SYFLFDKPPTSEICELFPSPVQTWTGNSNARLYMKNNALISGAPLANGKRYVGFPQSKIT LENSASCDNSGCFGNEGLMIKRLELESFHKSSKEVVVDSLEHETFSGYEALEKLEVKNNG KVTFKSGTYWIEELKVDNSAQIAIPDSQKVQIHVKKLELKNNAKFYTVGKAELIIIGHGN DKITFDNSAELTGLLYTEANVELKNNAVVYGAVTARSISMDNSASIIATDNHCFTPSDNY EVTLSPATQYALMCGTEQPKFDIQTRNDGNLESTGVTVQISPDSDKFSVDVIEGTGSGSY PKFTTSSVPSKLGKLKLGVTVKDQAGIKLDDEYTLKVTVDNDSAKTQTSTFKFVPFKFDV SGLPSGNAIVAGKGYDVETRVLACSNGQKTVVKSYTGSPSIQLELKAPNGGRSQNILTYA PEFLSSEQGTSTNDTFKLLEAGFYTIKLEDSNFTCDPEYSDSCPISPDAADNGEKTTTKL NGSFSVKSRPWKIAACDIKAKNSGTHNPATQADGSGFIAAAESFNVIYKPIVHPDSSEGR GDACEYPLTRNYFSDANTKAPLDVAFSVIYPSKGDIANLAPNDGSNLNFNSEEAKAGKLM VYTWDETGSLNLQTKATYLDEKLDEYDVTVGRFYPKYFKIVDSSWTYPDEQNFVYMGQPF DGVSYSVEALNSNEDSVKNYALSGTAVQAKFNVDELGVLGERFEAPNSNGNWSLVSDTMS IGRFSIGGNHVCGTDSVDKSIGSACFRKDFSKIDELKEYADGPYNAGGKETTKLGLTYTN NIDPVAYLNLGESQDSRLLTQPDIRFGRVDLDDVGGNQGSTLRVPLRVEYWNGSRFIANL NDSQTDVTGVKAKQEHIWPKGDNAKPKDVTLGAGGEVASGHSRSVTAKEAEPYRQQTRVW LNLEGGGNSLPWLKYDWDKDGSEENPSSVVTFGIHRGNDRVIYRGEPGLTGQ NT seq 3939 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgagaaaaataataacgttagtacttactggagtgcttttgctttcctctttttcaagc ttcgctgctgtaaataacaaccctcagtttgagtttggcactatccctgccgaagattgc cgagtaataaacaatgaacgtggtgttacatgtaatatcaagtttaaaaatacctatgac aaagagccgctggtttttgttatgtctacgattgatgcatctatgtccaactttggggat aaaaagacggaatatccttcagacttgcgagtatggtcaaagtctaaaactcaagcaata gttaaacagttattcccccctcactccgctgcatgtaagtacataaaatacaattcgcac aagaataagtggcaatgtaataataaaggacaagggaaagctgttaccttctttgatgcc ccaatggaggatattgactatttggtcattgaaccgggtgttatcaggtttgatggtgat gcaacgattgttgctggtacagttagctctgatctgacttattctaatatcggcggttca aagtatcagagcaaggacgttcagtttcgcaattatggtctgaatgctcaatttgcgtcc cctccaggtgtcttggtacaactccaaacgaaaaataactacaaaaataatcagcctttg tggctcacttctattgctttgaacccaacaacaaagggcttttctcttattctagatcgt tccgaagttacgaaaaatgctgaactcgataccccagaagaagttggatttgttgctggt ttaggtcaagggtttgttagtggtcgtaaattttggttaggcaatggatcaacaagaaat acactgggtgatttaaatgacaatgtaattaaaccagtaactgaaggttgtttacaggtt agtgattttccagtctctggatttaaatctgcaccagtattacttgcatccaagcgaact cgtaatggtaacaacggtggctggctgcgtcgttgttcggtaacaaaaacaggcgttgcg ctgatcaatgaagaagatatgcaaaaagactcagagagggggcatgttgttgagccattt tcatatttcttatttgataagcctcctacaagtgaaatttgtgagttgtttccatctcca gtccaaacttggacaggtaactccaatgctcgtctatatatgaaaaataacgctttgatt tcaggagctcctcttgcaaacggtaagcgttatgtaggcttccctcaatcgaagattacc ttagaaaatagcgcgtcatgtgacaattctggatgctttggtaatgagggtttaatgatt aaacgactagagctagaaagttttcacaaaagctctaaagaggtggttgttgatagctta gagcatgaaacattttctgggtacgaggctttagaaaaattagaggtaaaaaataatggt aaagttacttttaaaagtggtacttactggatagaagagctaaaggttgataatagcgca caaatagctatacctgattcacaaaaagtacaaattcatgtgaaaaaactggagctgaaa aataatgcgaaattttatacagttggaaaagctgagctaataattattggtcatggtaac gataaaattacgtttgataacagtgctgaattgactggtttgctctatacagaagcaaat gtagagttaaaaaataatgcagtagtttatggagcggttactgcccgaagtatttcgatg gataactcggcaagcatcattgctacagataaccattgttttacaccttcagacaattac gaagtaacactgtctccagctactcagtacgcgttgatgtgcggaactgaacaaccaaaa tttgatattcagaccagaaatgacggcaatctagaaagcactggtgtaactgttcagatc tctccggattcagataagttttctgtagatgtgatagagggcactgggtctggctcctat cctaaattcactacaagtagcgtaccttcaaaacttggtaagttgaagttaggagttact gtgaaggatcaagctggtattaaacttgatgatgaatatacgttaaaagtaacagtggac aatgattctgctaaaacacagacatcgacattcaagttcgtacctttcaagtttgatgtg agtggtctacctagtggaaatgcgattgttgccgggaaaggttatgatgtcgaaacaagg gtactagcttgcagtaatggtcagaaaacggtagttaaaagctacactggatcaccaagc atccagttagagcttaaagctccaaatggtggtcgaagtcagaacatattgacctatgca ccggaatttttgagttcagaacaagggacgtcaactaatgataccttcaagcttttagaa gcaggtttttacactatcaaactagaggactcgaattttacttgcgatcctgagtattct gatagttgcccaatctctccggatgccgccgataatggggaaaaaactacgacaaaattg aatggttcattcagcgttaagtcacgaccatggaaaattgccgcgtgtgatataaaggca aaaaatagtgggacgcacaatccagcaacgcaagcagatggtagtgggtttattgcggct gctgagagcttcaatgtcatttacaagccaattgttcatcctgactccagtgaggggaga ggtgatgcttgtgaatatccacttacacggaactatttttctgatgccaacaccaaagca ccgctcgatgtcgctttttcagttatttacccatcaaagggtgatattgctaacctagca ccaaacgacggttcaaatctaaactttaattctgaagaagctaaagctggaaaattaatg gtatatacatgggatgaaactggctcgttaaatcttcaaactaaagcaacgtatttggat gaaaaactagatgagtatgacgtaactgttggtcgcttctatccaaaatactttaagatt gtggacagttcgtggacttaccctgatgaacagaactttgtatatatggggcagcctttt gatggagtttcatattctgttgaggctctgaactccaatgaagattcagtgaaaaactac gctttgtctggaactgctgttcaagctaaattcaatgttgatgaattgggtgtccttggc gaacggtttgaagctcctaactcaaatggtaattggagcttggtaagcgatactatgagc attggtaggttttcgatcggggggaatcatgtctgtggaactgattctgtcgataaatcc ataggaagcgcttgctttaggaaagacttttcaaagattgatgagctgaaagagtatgca gatggaccttataatgcaggagggaaggaaacaacaaaattaggtctcacttatacgaat aatatcgaccctgttgcctacttaaatctaggagagagccaagactcacgattgcttacc caacctgacatccgctttggtcgtgtagacctagatgatgtcggtggcaaccaaggctcg acgctgagagtgccattacgagttgaatactggaatggtagccgctttattgctaaccta aatgacagccaaaccgatgttactggtgtgaaggctaaacaagagcatatttggcctaaa ggtgataatgcgaaacctaaggatgtcacgttaggggctggtggagaggtcgcttctggt cactctcgttctgtaacagcaaaagaagcagagccgtatcgccagcaaactcgcgtatgg cttaatcttgaaggtggtggcaattcgctcccttggctcaaatacgactgggataaagat ggctccgaagaaaacccatcatcggtagtcacgtttggtattcatcgaggcaatgaccga gtgatttatcgtggtgaaccgggcttaaccggacaataa

DBGET integrated database retrieval system