Vagococcus hydrophili: G7082_10730
Help
Entry
G7082_10730 CDS
T07081
Name
(GenBank) AAA family ATPase
KO
K03546
DNA repair protein SbcC/Rad50
Organism
vhy
Vagococcus hydrophili
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vhy00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
vhy03400
]
G7082_10730
DNA repair and recombination proteins [BR:
vhy03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecBC pathway proteins
G7082_10730
Archaeal homologous recombinant proteins
G7082_10730
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_23
SMC_N
AAA_21
AAA_15
AAA_29
AAA_27
SbcC_Walker_B
ABC_tran
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QIL48946
UniProt:
A0A6G8AVB9
LinkDB
All DBs
Position
2194908..2197598
Genome browser
AA seq
896 aa
AA seq
DB search
MRIERVSICNFKNIEEETIIDFQKDISILVGPNGFGKTTIFDAIELALTGTIDRISSSGI
ADGRSAFEKTYFQNNPNEDVVIKLLLSNEKNEYLTIFRFYLEKNNVKRKIASKSLAPTKS
LDNFRLIVKKNKESFSSNLDEIDYKNISSQQLIIDEFLGFKNETYKIKDIYNLFNYIQQE
NTDYYLKKNEVSRKNTLNFLLQIQDYQNKKDSILKVESQLKIVINNLKEEKKKYKDSKLL
KKINYEKLLLSTNIVHKFNEENIDFEDTLEKDRFEKYMDEVNKLIEFRENFSPNEYSKKK
QSEDFKKNIVNNNEMLKYLLFEKLIRENNQTITNNNQMIQSESNVERYLLENFIDKESYL
EKELILKDNIDELKSFINMDIEKINIEKISKIFDYIYVEILDISFLKEFVEFNCILKDYQ
NKRQQQDSTETNYSDLSEFRRKIKKYKLPDDEQHSKCVFCGYDWETEENLVKEVKKITKI
IEETMSTLDSQISDLVIKLESKIKILNKKIENITDKIIILDLELMKKINTKDVSLDYSEF
KKLVTEKTSITQFEFKNIDLDIFYRRKEELKELLKKELVMSSEIYTKYELTDQNKQNLEK
SLKKYPIIDREKVVEWMFSEEDFPINEEKYIDKKEQLKKYLTEMLTNIMKYDSIKSNDPY
GFFEKYFSNEENLFEECSKEKLILKKKYIEYKYEEKKSLKLKKIDTRLKLIKKTYEYTID
RRKELNLNITDYQQQMINMIKLPFFLYTAKILQNYQQGMGVLLTIHEDNSNIRFLTNSES
RQDAMYQLSSGQIAVISFAFTLSLNKVFNISDELKILTIDDPIQDMDAMNVHSLIDLLRH
SLPDYQIIISTHSDTTAMFIKYKFDLMSELDIDKVDFVNVREVFFEKNNAEKNILE
NT seq
2691 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaatagaaagagtatctatatgtaattttaagaatattgaagaagaaacaatcata
gattttcaaaaagatatttcaattctagttggaccaaatgggtttggaaaaacaacaatc
tttgatgctattgaattagcactgactggaacaattgataggatatcaagttcaggaata
gctgatggaagaagtgcttttgaaaaaacatattttcaaaataaccctaatgaggatgtt
gttataaaacttttgctttcaaacgaaaaaaatgaatatttaactattttcagattttat
ttagaaaaaaataatgttaaacgtaaaatagcttcaaaatcattagccccaacaaaatca
ttagataattttcgtttaattgtaaaaaagaataaagaatcgttctcaagtaatttagat
gaaatagattataaaaatattagtagccaacaactaattattgatgaatttttaggattc
aaaaatgaaacgtataagataaaagatatatataacttgtttaattatattcaacaagaa
aatacagattattatttaaaaaaaaatgaagtatcaagaaaaaatactttaaatttttta
cttcagattcaagactaccaaaataaaaaagatagtattttgaaagtagaaagtcaactt
aaaatagtcattaataatttaaaagaagagaaaaaaaaatataaagatagtaaactacta
aaaaaaataaattacgaaaaattattattatctacgaatattgtacataagtttaatgaa
gaaaatatcgattttgaggatactttagaaaaagatagatttgaaaaatatatggatgaa
gttaataagttaatagagtttagagaaaatttttcaccaaatgagtactcgaagaaaaag
caaagtgaagattttaaaaaaaatatagtgaataataatgaaatgttaaagtatttgtta
tttgagaaattaattagagaaaataatcaaactattacaaataataatcaaatgatacaa
agtgaaagtaatgtggaaagatatttattagaaaattttatagacaaagaatcttacttg
gaaaaagaattgatattaaaggataacatcgacgaattaaagagttttattaatatggat
atcgaaaaaataaatattgaaaaaatctcgaaaatatttgattatatatatgtagaaatt
ttagatattagttttctaaaagaatttgtagaatttaattgtattttaaaagactatcaa
aataaaagacaacagcaagatagcacagaaactaattactcagatttaagtgaatttcga
aggaaaataaaaaaatataaattacccgatgatgaacaacatagcaaatgtgttttttgt
ggatacgattgggaaacagaagagaatttagtaaaagaagtaaaaaaaataacgaaaatt
attgaagaaacaatgtcaactttagatagtcaaatttcagatttagtaattaaattagag
agcaaaataaaaattttaaataaaaaaatagaaaatatcactgataaaataataatttta
gatttagaattaatgaaaaaaataaatacaaaagatgtaagtttagattattcagagttc
aaaaaattggtaacggaaaagacatctataacacagtttgaatttaaaaatattgattta
gatattttttacagaagaaaagaagagctaaaagaattactaaaaaaagaattggtaatg
tcatcagaaatttacacaaaatatgaattgacagatcagaataaacaaaatttagaaaaa
agtttaaaaaaatatccaattattgatcgagaaaaagttgtagaatggatgttttcagaa
gaagattttccaattaatgaagaaaaatatattgataaaaaagaacaactgaagaaatat
ttaactgaaatgctaactaatattatgaaatacgattcaataaaaagtaatgatccgtat
ggttttttcgaaaaatattttagtaatgaagagaatttatttgaggaatgctcaaaagaa
aaactaattttaaaaaagaaatatattgaatataaatatgaagaaaaaaaatctttaaaa
ttaaaaaagatagatactagattaaaattaataaaaaaaacatatgaatatacaattgat
agaagaaaggaattaaatttaaatattacagattatcaacaacaaatgataaatatgata
aaattaccgttcttcttgtatacagcaaaaattcttcaaaattatcaacaaggaatgggt
gtattattgactatacatgaagataattctaatattaggtttttaacaaatagcgagagt
aggcaagacgcaatgtatcaattaagttctggtcaaattgcagttatatcttttgcattt
acgttgtctttaaataaagtatttaatatttcagatgagttaaaaatacttactatagat
gatcccatacaagatatggacgcaatgaacgtccattcattaatagatttattaagacac
tcactaccagattatcaaattattatatctacacatagtgacacaacagctatgtttata
aaatataaatttgatttgatgagtgaactagatattgataaagttgattttgtaaatgta
agagaggtattttttgaaaaaaataatgctgaaaaaaatattcttgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
