KEGG   Vibrio iocasae: SNR28_11885
Entry
SNR28_11885       CDS       T11169                                 
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
  KO
K18989  multidrug efflux pump
Organism
vic  Vibrio iocasae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:vic00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:vic02000]
    SNR28_11885
Transporters [BR:vic02000]
 Other transporters
  Electrochemical potential-driven transporters [TC:2]
   SNR28_11885
SSDB
Motif
Pfam: ACR_tran MMPL
Other DBs
NCBI-ProteinID: XHF85420
LinkDB
Position
2:506415..509537
AA seq 1040 aa
MFAIIDAALSRSRTMMTLLLLILVAGALTYIAIPKESSPDITIPVIYVSVGHEGISPGDA
ERLLVRPIEQELRSIEGVKEMSSTASEGHASVTLEFNVGIDLDKAMADVRDAVDQAKPKL
PADSDEPSVHEVTLASFQPVLSVVLYGTVPERTIVQLARELRDKLEGYKQVLEVDIAGDR
EDIVEILVDPLLMESYNLDQGDIYNLISLNNRVVAAGFVDTGYGRFSVKVPSVFESLKDV
LEMPIKVDGKQVITFGDIATVRRSFRDPESYARLDGESAVVLDVKKRAGENIIETVELVR
TVIAAAQEREEWPNNLLVEYTWDESEDVKMMLNDLQNNILSAIILVVIVIIAILGVRTAL
LVGVSIPGSFLTGLLVLAIFGLTVNIIVLFALIMAVGMLVDGAIVVTEFADRRMHEGMGR
RQAYQDAAKRMAWPITASTATTLAAFAPLLFWPDTTGEFMKYLPMTLIATLSASLIMALI
FVPVLGSLIGKEQYIKPEYRAEMVALHDGDFSKATGVTKFYFLTLSFAIKHPLKIFIAAV
LLAAGVGFAYVKAGLGMEFFPEVDPPSFTIKVRSYGDLSINEKDVIMRDIESVVLGGEEF
ESVYTRTGGDDSIGQIQVTPVDWQYRRSVKEIIDELHQKLDGFAGVEIEFKKPEAGPPIE
HDLIIELSARDASKLDSAAKYVRHWADSYPAFTNLSDNSSKPGIDWQIDIKRDDAGRFGA
DATLVGNTVQFVTNGLKIGDYLPDDANEEVDILVRFPAEQRDIGRFDELRVKTPAGLVPI
TNFATIKPEPKQDTIHRIDGKRVIQVMADMKEGYNLALELPKVDEELKALGLKGIDFTLR
GKNEDQDKSSAFLGNAFIVALAVMGLILITQFNSFYQAFLILSAVLFSTVGVFAGLLIFQ
KPFGIVMSGIGVISLAGIVVNNNIVLIDTFNQLLKRGFSKEEAILRTGVQRLRPVLLTTV
TTILGLLPMVLEMNIDLMNQKIEFGAPSTQWWSQLATAVAGGLAFATMLTLVLTPCLLML
GRNKKDAKKVIAEELEQTGS
NT seq 3123 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtttgcgattattgacgctgctctttcgcgctcaagaaccatgatgacgctcttgcta
cttattttggtagcaggtgcacttacttacattgcgattcctaaagaatctagcccagat
attacgattcctgttatctatgtcagcgttggacatgaagggatctctcccggagatgct
gagcgtcttctggttcgcccgattgaacaagagttacggtctatcgaaggcgttaaggag
atgtcctctacggcttcagaaggtcatgcttctgtcactctggaattcaatgttggtatc
gacctagataaggctatggctgatgttcgggatgcagtcgatcaggcaaaacctaaacta
ccagccgatagtgatgaaccttccgttcatgaagtgacgcttgcttcattccaacccgta
ctttctgtggttttatacggtactgtaccggaaagaacaattgtacagctagccagagag
ttgagagacaaacttgaaggttacaaacaggtactggaagtcgatatcgcgggtgatagg
gaagacattgtcgagattctggttgatccgcttttgatggaaagctacaacttggatcaa
ggggatatttataatcttatatctctaaacaatcgcgtcgtcgctgcgggatttgttgat
acgggatatggacgattttccgttaaggtaccttctgtatttgaatcgctgaaagatgtg
cttgaaatgcctattaaggtagatggtaagcaagtcattactttcggtgatatcgctacg
gttagacgttcgttcagagaccctgaaagttatgcaagattagatggtgaatctgcagtc
gtgcttgatgttaagaagcgtgcaggtgaaaacatcatcgaaaccgttgaattagtcaga
acggtaattgcggcagctcaggagagagaagagtggccaaataacttgttggttgagtac
acctgggatgaatctgaagacgttaaaatgatgcttaacgatctccagaacaatatcctt
tcagcgattattctggttgttatcgtaatcatcgctatattgggtgtcaggactgcttta
ttggtcggtgtttcaatccctggctcattccttactggactgttggttttggcgatattt
ggtttaacggtcaatattatcgtcctctttgcactgatcatggctgtaggtatgctggtt
gatggtgccatcgttgttaccgagttcgcagacaggcgaatgcatgaaggtatggggaga
cgtcaggcttatcaagacgcagcaaaacgaatggcctggccaattaccgcttctaccgca
acgacgttagcggcgtttgccccgctgttgttctggccagatacgacgggtgagttcatg
aaatatcttcccatgactctgattgcgaccttaagtgcatctttgatcatggcattgata
tttgtacctgtattggggagcctgattggtaaagagcagtatataaaaccagagtacaga
gcagagatggtcgctctgcatgatggagacttttcaaaggcaacaggcgtaactaagttt
tacttcctgacactctcttttgccattaaacacccattaaagatctttattgcagctgtg
ctgctcgctgcaggtgttggatttgcttatgttaaagctggattgggaatggaattcttc
ccagaagtcgatccaccatctttcactattaaagttcgatcttacggtgatctctctatc
aatgagaaagacgtgatcatgcgtgatattgagtctgtggttttgggtggtgaggagttt
gaaagtgtttacacccgaactggtggagatgactctatcggtcaaattcaggtaacacct
gtagattggcaatatcgtcgctctgtaaaagagatcattgatgagctacatcagaagctt
gatggttttgctggcgttgaaattgagtttaagaaaccagaagctggtccaccaatagag
catgatctcatcattgagttatcggcacgagatgcgagcaagcttgatagtgcagctaaa
tatgtacgtcattgggctgacagctaccccgcattcaccaacttgagtgacaactcaagc
aaaccgggaattgactggcaaattgatattaaacgagatgatgcaggccgatttggggcc
gacgcgactcttgttggaaacaccgttcagtttgttactaatggtttgaagattggtgat
tacttaccagatgatgccaatgaagaagtagatatattggtacgattcccggcagaacaa
agggatattggtcgctttgatgagcttagagtcaagacgccagctggtttagtaccgatt
acaaactttgcgacaatcaaacctgaacctaagcaagataccatacaccgcattgatgga
aagcgtgtaattcaggtcatggcagacatgaaggagggttataacctcgcactggaactg
cctaaagttgatgaagagctaaaagctttgggtttaaaaggtatagatttcaccctaaga
ggaaaaaatgaagatcaggataaatcttcagctttccttggcaatgccttcatagttgca
ctcgcggtaatgggattaatattgattactcagtttaatagtttctatcaggctttcctg
atcctgagtgccgttctgttttctaccgtaggtgtctttgccggtttacttatattccag
aaaccatttggtattgttatgtcgggcattggtgttatctctcttgccggtattgtagtg
aataacaatattgttcttatcgatacctttaaccagctattaaaacgtggctttagcaag
gaagaagcgatattgagaacgggtgttcagcgtctgcgcccggttttacttacgacagta
acgaccattctcggattgttaccaatggtattggaaatgaatatcgacttaatgaatcag
aagattgagttcggtgctccgagtactcagtggtggtcacagctggcaacagcagtcgct
ggtggactggcatttgccactatgctgacgcttgttcttacgccgtgtttgttgatgtta
ggaagaaataaaaaggatgctaaaaaggtcatagctgaagagttggaacaaactggctca
tag

DBGET integrated database retrieval system