Vagococcus intermedius: OL234_03435
Help
Entry
OL234_03435 CDS
T09229
Name
(GenBank) AAA domain-containing protein
Organism
vie
Vagococcus intermedius
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_11
AAA_12
Viral_helicase1
AAA_30
NB-ARC
UvrD_C_2
AAA
AAA_19
SLFN-g3_helicase
NTPase_1
AAA_14
AAA_7
nSTAND_NTPase5
NPHP3_N
AAA_22
AAA_18
T2SSE
PIF1
MATalpha_HMGbox
TsaE
AAA_16
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WEG73975
UniProt:
A0AAF0CVV4
LinkDB
All DBs
Position
750573..753611
Genome browser
AA seq
1012 aa
AA seq
DB search
MQDNYKNIIEAWLRIEYLNTGKLKIKENTSKVSSLEGTTFSEGNFFLEDVEQYSVIYFGI
FDDNDLEKQLCTLVDNGRKPIGEKKTLNYSLSVKVSNEGAYVENSIFIPQLQYMLKKIMG
NEMDNIGEDELARLENEAVGLFEIELKNLFKEGFTLEKLLSVNEKIGNYFLTINLLREEC
YISFGVKNEIDFNSFLTSDLEKISKLDELPKQLKLYIDGHDQFKNIDENEKAIMEILNLE
NLPDGRWPSNNNFKLSLMQQVSVNLVLNEEIDIFSVNGPPGTGKTTLLKDIFANLVIKRA
CEMTKFSSPKEAYQNKGVVYSDVNNKKGYNFRSYQLDDSICGYSIVVASSNNSAVENISK
DLPKSEELIHDNDRFMSSDKGFSESIKEVNYFPEYLSYIFDKTGAKKTESPFEKYWGLFS
VNMGRSSNINQVLDPLLYGKESKTDGKLEKLNDRLKSSKTTVKEWSVVCEKFTDIKNQIE
DEKVKITNYLVHLKKENKLIIKLNELDANLTILKNEMNEKQENMKRFYVKKSYLIEQKEL
LPRLSFFTKLMVILGIKVNESEEELKKSLSELNEKIRAYEIDVDMMKEQIKKIEIEKQEN
RIKQEKLSESLKEERLYFLDDEVDTLEGEWGPECYDKRQLTTPFVTKRLNYLRGNYFIQA
MNVHKVFNEINSPLFWSALNVLKNRSKLDMASSEHKELLKQSWQIFHLLIPVVSTTFSSL
GTMYKGLEEESIDYLFIDEAGQATPQAAAGGIWRAKRVIAVGDPSQIEPVLGIDPSILGI
IKEKYQIEDHYAGEQASVQKLADYANKYGTVKPDKSRIGVPLWVHRRCLSPIFNISNEIS
YEGKMVQGVSGKEGTVRWFDIKGKATDKYVLEQSQCLLEELKKATNLSDIYIISPFKNVV
DKTKEFLRENSSYLAENEGIKIKDWINKSIGTVHTFQGKEAPIVYFICGTDIDSEGAANW
SCQTANIINVAVTRAKKEFYIIGDYSRFSGKPFYQTLAKYSENPIKNQPDEM
NT seq
3039 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaggacaactataaaaatatcatagaggcatggttaagaattgaatatttgaataca
ggaaaattaaagataaaggaaaacacatctaaagtatctagcttagaagggacaactttt
tcagaaggaaacttttttttggaagatgtcgaacaatatagtgtcatctattttgggatt
tttgatgataatgacttggaaaaacagctatgtacacttgttgataatggaagaaagccg
ataggtgaaaagaaaactttgaactattctttatctgtaaaggttagtaatgagggggca
tatgttgagaatagtatttttataccacaattacaatatatgctcaaaaaaattatgggt
aatgagatggataatataggtgaagatgagttagccagattagaaaatgaggcagtgggg
ttatttgaaatcgagttaaaaaatttatttaaagaaggatttacactagaaaaattattg
agtgttaatgaaaaaattggtaattattttctgacaattaatttacttagagaggaatgc
tatatttcttttggcgtaaagaatgagattgattttaatagtttccttacatcagattta
gaaaaaatatctaagttagatgaattaccaaaacagttgaaattatacattgatgggcac
gatcagtttaaaaatatagatgagaatgagaaggctattatggaaattttaaatttggag
aacttgccagatggtagatggccatcaaataataatttcaaactctcattgatgcagcag
gtttcggttaatctagttctaaatgaagaaatagatattttctctgttaatggcccacct
ggaacggggaaaacaacattacttaaagatatatttgctaaccttgtcattaagagagcg
tgtgaaatgacaaagttttcaagtccgaaagaagcatatcagaataaaggagtggtttat
tctgatgttaataacaagaagggatataattttagaagttatcaattggatgactcaata
tgtggttatagtattgttgtagcgtcatcaaataatagtgcggttgaaaatatttcaaag
gatttacccaaatctgaagaattaatccatgataatgatcggtttatgtcatcagataag
gggttttctgagagcataaaggaagtaaattattttcctgaatacttatcttatatattt
gataagacaggtgctaaaaaaacagagagtccttttgaaaaatattggggattattttcg
gtgaatatggggagatcatccaatataaatcaagtattagatcctttgctttatgggaaa
gaatcaaagacggatggtaaattagaaaaacttaatgatcgtttgaaatcttcaaagacc
actgtaaaagagtggtctgtagtatgtgagaaatttactgatataaaaaatcaaattgaa
gatgagaaagtaaagataacaaactatttggttcatttaaaaaaagaaaataaacttata
ataaagttaaacgaactggatgcaaatctaactatattaaaaaatgagatgaatgaaaag
caagaaaatatgaaaaggttttatgtaaagaaaagttatttgattgagcaaaaagaacta
cttccacggttatctttttttactaagttaatggtaatattaggaatcaaagtaaatgaa
tcagaagaagagttgaagaagagtcttagtgaactaaatgaaaaaattagagcgtatgaa
attgatgtcgatatgatgaaggaacagataaaaaaaattgaaattgagaaacaagaaaat
aggataaaacaagaaaaattatctgaaagtttaaaagaggaaagactttattttcttgat
gacgaagtagatactttagagggagaatggggaccagagtgttatgataaaagacaatta
acgacacctttcgtgactaagcgattaaattatttgaggggaaattattttattcaggca
atgaatgttcataaggtttttaatgaaataaactcacccttattttggtcagcactcaat
gttctaaagaatcgctctaaattagatatggcgagtagtgaacataaagaattgttaaaa
cagtcatggcagatttttcatttgttaattccagtagtaagtacaactttttcaagcttg
ggtacaatgtataaagggttagaagaagagagtatagattatttgtttattgatgaagca
ggacaagcaacaccacaagccgctgctgggggtatatggcgagctaaacgtgtgatagca
gtgggagatccttctcaaattgaaccagtattaggaatagatccatcgattttaggaatt
atcaaagaaaaatatcaaattgaagatcactatgcaggcgaacaagcttctgttcaaaaa
ttagcagattatgcgaataagtatgggacggtaaaacctgataaatcaagaatcggagtc
ccactttgggttcatagaagatgtttgagtcctatttttaacatttcaaatgaaatatca
tatgaaggtaagatggttcaaggggtatcgggtaaagaagggacagtcagatggtttgat
attaaaggtaaagcgactgataagtatgtattagaacagagccaatgtttattagaggaa
ttgaaaaaagcgacaaatctgagtgatatttacatcatttctcctttcaaaaatgttgtt
gacaaaacaaaagaatttttaagagagaatagttcttatttagctgaaaatgaggggatt
aaaataaaagattggattaataaatcaattggaaccgttcatacctttcaagggaaagaa
gcacctattgtttattttatttgtggaacagatatagactctgaaggagctgcaaattgg
tcatgtcaaacagcgaatataataaatgtagcagtaacaagagctaagaaggagttctat
atcattggtgattatagtagatttagtggcaaacctttttaccaaacgcttgcaaagtac
agtgaaaatcctattaaaaaccagccggatgaaatgtaa
DBGET
integrated database retrieval system