Vibrio sp. HB236076: AB0763_01425
Help
Entry
AB0763_01425 CDS
T10847
Name
(GenBank) translocation/assembly module TamB domain-containing protein
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
vih Vibrio sp. HB236076
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vih00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
vih02000
]
AB0763_01425
Transporters [BR:
vih02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
AB0763_01425
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
Calycin_like
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XDK25336
UniProt:
A0AB39HGU6
LinkDB
All DBs
Position
1:283570..287358
Genome browser
AA seq
1262 aa
AA seq
DB search
MSIKLWKWSKWFALSMVLLLVITASLITILLFSQPGLGLIAWGAQQALPNLKIDNMQGSL
LGKLTVKGVSYQDSTLSLEANVDELIIDNSLSCLMSSQLCINQAKLSGLDLTLASTAQES
DESSESNQPMSRITTPIPVQIQSLVLDDINIKVDGQKVQWQHFSTSLSMRSDQLNIGDTQ
WKKVDVTLANTPKNEQGQSGAATRNASAQSSEPISLPEVKLPLSLRLKSFDLQDFVLHQQ
TPIQVQKLAFALEAQGQRVSLKSLSLLMPQVAMTGQAEVSLKQQYPLSAQFNAQAREAQY
AQQAVALSASGSLGELALNAQFDGPVKGTFKGDVKPLESDPAFEVALSDVSGQWPLTDKG
QYQWLQTQLTAKGRVSDFQFDLASALTGEEVPATQVQLKGQGSPTAVDLSQLVVETLGGQ
LTGQAKADWQSGVDWQASLTFKDIQPGRQWPQAEGKIGGQLEGSGKVSEQGQWQVALEKL
NLDGVLRQYPLTVRGDAKAQGDNSGLTKVVTKSLSLAHGKNRVTASGELNKQWAMDLNVN
LPDLNHSLADAKGLVSGDIRIRGQQKNPKISLGLIAQHLAWQDQVSLNKLTIDGNVMPLA
NDPSFDLNLSANQANYQQQTVDNVTTVLNGTLSQHRLSLAVSAPQASTELTVAGGITLKP
DVMWQGQLSSMWVESEQGRWTLNQATRLALNSAKSSLQMGAHCWLQDGSSVCLDQDININ
PQQGQVALSINDFDFEQIKKFVPEDLSLDGQVQASAQASWRNGQDLSANVQLSLPEGKVT
RAAETEEQQPLVVAWQSVVVNGQFADDTLDANWQLDIKDNGEMRGQAKINGFNQQSPQID
GQLILSQLNLDFLAPLLDEYNTLGANINSQLAFKGDWLHPQVEGDFKVSDIQFQGDLSPV
DITKGDLALVFNGYQATLTSKLTTSDGELTLEGDGDWQDLQSWQTNLRVFSEQLNVKYAP
MVDIIAQPDLKLQVTPSLASITGEINLPSGLIKVEQLPQSAISVSDDQVIVDDDTQSLVE
QSQSLPFAVESNVTIRIGENLKVEAFGLESNLKGDLKVSQKDKGPQITGEINLIDGTYTS
FGQDLEISEGKITMNGPVDQPYVSITAIRNPDNTEDDVTAGIKVTGSAKDPTITIFSDPS
MAQANALSYLLRGQNLNSESDSNAMTTTLIGLSLAQSGKVVSNIGEAFGVQDLKLDTSGS
GDDSQVTVSGYVLPGLKVQYGVGIFSALGEFSVRYRLVRDLYIEATSGVDSAVDLLYQFE
FD
NT seq
3789 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtattaaactgtggaaatggagcaagtggtttgctctctctatggtgttgctattg
gtgatcacggcgagtttgatcacgatactattgtttagtcagcccggtctgggattgatc
gcttggggggctcaacaggccttgcctaacttaaaaattgacaatatgcagggcagctta
ctcggcaagctaaccgtaaagggggtatcttatcaagactccacgctttcccttgaggca
aacgttgatgagctgattatcgataattcactgtcttgtttgatgtcgagccaactttgt
attaaccaagctaagctaagcggtctagatttaactctagcaagcaccgcgcaagaaagt
gatgagagcagtgaaagcaatcagccgatgtcacgtattaccactcccataccggttcaa
attcaatcgctggtgttagacgatatcaacattaaagtcgacggtcaaaaagtgcaatgg
caacatttttcgacctcgttatccatgcgctcagaccaactcaatatcggggatacacaa
tggaaaaaggttgacgtcactcttgctaacaccccaaaaaatgagcaaggtcagagcggc
gctgcaactcgtaatgcctcagctcaatcctccgagcctatctcactgcctgaggttaag
ctgcctttatcgctgcgcctcaaatcgtttgatttacaagactttgttttacatcagcaa
acgccgattcaagttcaaaagttggcctttgctttggaggctcaaggtcaacgcgtatca
cttaagtcgctttcattattgatgcctcaagtggcgatgacaggtcaagccgaagtgagc
ttaaaacaacaatacccactcagtgcccaattcaatgctcaagcacgagaagcgcagtac
gctcagcaggctgtggcgctttcggcgagtggcagtttaggagagttggcgctcaatgcg
cagtttgatggtcctgtaaaaggcacgttcaagggcgatgtgaagcctctggaaagcgat
cccgcttttgaggtggctctgtctgatgtttctggtcaatggccactgacggacaagggg
caatatcaatggttacaaacccagttaacggctaaggggcgagtcagtgattttcaattt
gatcttgccagtgcgttgaccggtgaagaagtaccggcgacccaagtgcaactcaaaggg
caaggatctcccactgcggtggatttatctcaactcgtggttgagacactcggtggtcaa
ctgacgggccaagccaaagcggattggcaatctggggtagattggcaagcgagcttaacg
tttaaggatattcaaccagggcgacaatggccacaagcggaaggtaaaattggtggtcaa
ttagaagggagtggtaaggttagtgagcaggggcagtggcaagtcgcattagaaaaactc
aacctcgatggtgtgttacgtcaatatcctttaacggtacgcggtgatgcgaaagcacaa
ggggataattcggggctcactaaggttgtgactaagtcattgtctttggctcatgggaaa
aaccgtgtgacagcgagtggtgagctcaataagcaatgggcgatggatctcaacgtcaat
ttaccagatttaaatcactccctcgccgatgccaaagggctggtgagtggggatattagg
atccgaggtcaacaaaagaaccccaaaattagtcttggtctcattgcacaacatctcgct
tggcaagatcaagtgagcctcaacaagttgaccattgacggcaatgtcatgcctttggcc
aacgatcctagctttgaccttaacctaagtgccaatcaggccaattaccaacagcaaacc
gtcgataatgttacgactgtgctcaatggcactttgtctcaacaccgactgtcattggcc
gtcagtgccccacaagcaagtactgagctcactgtcgcgggaggaataacgctaaagcct
gatgtgatgtggcaagggcaactttcttctatgtgggttgaaagtgaacaagggcgttgg
acacttaatcaggccactcgtttggctctaaacagcgcaaaatcgtcgttacaaatgggg
gcgcactgctggttacaagatggctcaagtgtctgtctagatcaagatattaatatcaac
cctcaacaaggccaggtggctttgagcattaacgactttgattttgaacagattaaaaag
tttgtacccgaagaccttagtcttgatggacaagtacaggccagtgcccaagccagttgg
cgcaacggacaggatctcagtgccaatgttcaattgagtttacctgaagggaaagtgact
cgcgcggcagagacagaagaacagcaaccccttgttgtggcttggcaatcggtggttgtg
aatgggcagtttgctgatgatacgttagacgccaactggcaactcgacattaaagacaat
ggtgaaatgcgaggccaggccaagataaatggcttcaaccagcagtcaccacagattgac
ggtcagctgattttgtcacagttaaatttggattttttagcgccgcttctggatgaatac
aacacacttggtgcgaatattaatagccaattggcgtttaaaggcgattggttacacccg
caagttgagggtgatttcaaggtgtcagatattcaatttcaaggtgatttgtcaccagtt
gatatcactaagggtgacctggcactggtatttaatggttaccaagctaccttgacatca
aagctcacgacttctgatggggagctcacccttgagggggatggtgattggcaagacttg
caaagctggcaaacgaacttgcgtgttttctctgagcagttaaatgtcaaatatgcgcct
atggtagatattattgctcagccggatctcaaactacaagtgacgccaagcctggcaagt
attactggtgagattaatttaccgtcgggtttaatcaaggtagagcaattgccacaaagc
gcgatcagcgtctctgatgatcaagttatcgtagacgatgacactcagagtttggttgag
caaagtcaatcactgccttttgcggttgaatctaacgtgaccattcgcatcggtgaaaat
ttaaaagtagaagcgtttggcttagagtctaacctaaaaggtgatctgaaagtgtcacaa
aaagacaaagggccacaaattaccggtgagataaacctcattgatggtacctacacgtcg
tttggccaagacttagagatcagcgaagggaaaattactatgaatggccccgtcgatcag
ccttatgtctcaattaccgcgataagaaaccctgataatacagaggatgatgtcaccgct
ggtattaaagtgacgggctcggcgaaagacccgacgatcacgattttctctgatccgagt
atggcacaggccaatgcgttgtcgtatttgttgcgtgggcaaaacttaaacagcgaatca
gacagtaatgccatgacgacgaccttaattggtttgagtttagcccaaagcggtaaggtg
gtcagtaatataggtgaggcttttggtgtacaagatttgaaactcgacacttcagggtca
ggggatgactcgcaagtgacggtcagtggttacgtgttaccgggtctaaaagtgcaatat
ggggtgggtatttttagtgccttaggtgagttttcggtgcgttatcgcttagtgcgcgac
ttgtatatcgaagcgacatccggagttgatagtgcggtggatttactgtatcaatttgag
tttgattaa
DBGET
integrated database retrieval system