Viridibacillus sp. JNUCC-6: JNUCC6_06670
Help
Entry
JNUCC6_06670 CDS
T06874
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
vij
Viridibacillus sp. JNUCC-6
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QOV12431
UniProt:
A0A7M2QXP3
LinkDB
All DBs
Position
complement(1338343..1347024)
Genome browser
AA seq
2893 aa
AA seq
DB search
MDSNKTRCTVCNKYQCSCNHKKRSPKTVIRDLDYIDPCEPLYIIDHCHNRGKTGPTGPTG
ATGPTGATGSTGATGATGATGATGPTGATGPTGVTGATGNTGPTGVTGVTGPTGSTGATG
ATGSTGATGPTGATGATGSTGATGETGSTGATGATGPTGSTGATGATGSTGATGLTGATG
PTGATGPTGPTGATGATGSTGLTGATGPTGATGPTGATGATGSTGSTGLTGVTGVTGPTG
ATGSTGATGSTGATGATGATGLTGVTGATGVTGVTGATGPTGPTGATGATGNTGPTGVTG
VTGPTGSIGATGSTGATGSTGATGATGLTGATGATGATGSTGETGPMGATGATGVTGATG
ATGPTGATGATGVTGATGSTGATGVTGPTGATGITGATGPTGPTGATGSTGLTGATGPTG
ATGATGATGVTGATGSTGETGPTGSTGATGATGPTGATGSTGATGLTGATGVTGPTGSIG
ATGSTGATGSTGATGATGLTGATGATGATGATGPTGLTGPTGVTGATGATGPTGSTGATG
ATGLTGVTGATGATGATGATGPTGATGLTGVTGATGNAGPTGVTGVTGPTGSIGATGSTG
ATGATGLTGATGATGSTGETGPMGATGATGVTGATGATGPTGATGATGVTGATGSTGATG
VTGPTGATGITGATGPTGPTGATGSTGLTGATGPTGATGATGLTGATGVTGATGLTGSTG
ATGATGSTGVTGPTGATGSTGATGSTGATGATGLTGATGATGATGATGPTGLTGPTGVTG
ATGPTGATGSTGSTGATGLTGVTGATGATGPTGPTGATGATGNTGPTGVTGVTGPTGATG
ATGNTGPTGVTGVTGPTGATGATGNTGPTGVTGVTGPTGATGATGNTGPTGVTGVTGPTG
SIGATGSTGATGATGLTGATGVTGATGATGATGSTGETGPMGVTGATGATGATGVTGATG
STGATGVTGPTGATGITGATGPTGPTGATGSTGLTGATGPTGATGATGATGVTGATGSTG
ETGPTGSTGATGATGPTGATGATGNTGPTGVTGVTGPTGATGSTGETGPTGSTGATGATG
ATGVTGATGNTGPTGVTGVTGATGATGPTGPTGATGPTGATGATGVTGATGSTGATGATG
VTGATGPTGPTGATGPTGPTGATGATGATGPTGATGVTGPTGLTGPTGPTGATGVTGPTG
LTGPTGVTGATGLTGATGPTGVTGVTGPTGATGSTGATGPTGATGPTGVTGATGSTGPTG
VTGVTGPTGATGSTGATGATGSTGATGATGVTGATGPTGPTGATGATGNTGPTGVTGVTG
PTGATGSTGETGSTGATGSTGPTGSIGATGSTGATGSTGATGLTGATGVTGATGLTGSTG
ATGETGATGVTGPTGETGATGLTGSTGATGATGSTGVTGPTGATGATGATGSTGPTGLTG
PTGVTGATGATGPTGATGSTGATGNTGPTGVTGVTGPTGLIGATGSTGATGATGLTGATG
VTGATGATGVTGATGATGPTGSTGATGATGVTGPTGATGVTGATGSTGETGPTGSTGATG
ATGATGVTGATGNTGPTGVTGVTGPMGATGATGPTGPTGATGPTGATGVTGPTGLTGPTG
VTGATGATGSTGATGVTGATGVTGATGVTGATGPTGNTGPTGVTGAIGATGVTGATGSTG
ATGNTGPTGVTGVTGPTGATGATGVTGPTGLTGPTGVTGATGPTGATGVTGATGPTGPTG
ATGPTGATGVTGSTGLTGPTGVTGATGPTGATGPTGVTGATGSTGATGNTGPTGVTGATG
VTGSTGPTGNTGPTGATGLTGATGPTGLTGATGPTGPTGLTGPTGVTGATGLTGATGPTG
VTGVTGPTGATGSTGATGPTGATGVTGATGVTGPTGNTGPTGVTGATGSTGPTGATGPTG
ATGATGATGATGPTGATGVTGPTGLTGPTGVTGATGPTGATGSTGATGPTGLTGATGPTG
ATGSTGATGPTGVTGVTGPTGSTGATGSTGATGLTGATGPTGATGPTGLTGVTGATGSTG
PTGVTGVTGPTGATGATGATGATGATGVTGATGPTGPTGATGPTGATGVTGPTGLTGPTG
VTGATGPTGATGSTGATGPTGPTGATGSIGATGATGATGVTGATGPTGATGVTGPTGLTG
PTGVTGATGPTGSTGATGATGATGVTGATGVTGATGVTGATGPTGNTGPTGVTGAIGATG
VTGATGSTGATGNTGPTGVTGATGVTGSTGPTGLTGVTGPTGPTGLTGPTGVTGATGLTG
ATGPTGVTGVTGPTGATGSTGATGPTGATGVTGATGVTGPTGNTGPTGVTGATGSTGPTG
ATGPTGATGATGATGATGPTGATGVTGPTGLTGPTGVTGATGSTGATGPTGLTGVTGATG
STGPTGVTGVTGPTGSTGATGSTGATGLTGATGPTGATGPTGLTGVTGATGSTGPTGVTG
VTGPTGATGATGATGATGATGATGATGPTGPTGATGPTGATGVTGPTGLTGPTGVTGATG
PTGATGATGPTGATGVTGPTGLTGPTGVTGATGSTGATGPTGVTGVTGPTGSTGATGATG
STGPTGNTGPTGATGSTGPTGNTGPTGPTGPTGVTGATGSTGSTGSTGPIGVTGATGSTG
PTGPTGATGDRGSIGPTGATGVTGTAGATGRTGSTGATGATGNTGPTGEKGATGATGPTG
STGPTGVTGPTGATGPTGAIGPTGPGGVIPFASGGTVTINSLLTGVPNTGAIIAFGNSTT
SVGIGNATVNLQNISNEAFVVPRAGAITNVAAFFNITVALSIAILGTATITAQVWKSQNA
SSNVFAPLASTLISFTPLAGAIAAFTTLNGALANLNEPVNVGDRLIMVFSVATTGLSVVT
AITGTASAGITIS
NT seq
8682 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcaaataaaacgaggtgtactgtttgtaataaatatcaatgttcttgtaaccac
aaaaaaagaagtcctaaaacagttattagagatttagattatatagatccatgtgaaccg
ctttatataatagatcattgtcataatagaggtaaaacaggtccaacggggccaaccgga
gcaacaggaccaacgggagcaacagggtcaaccggagcaacaggagcaacaggagcaacg
ggagcaacaggaccgactggagcaacaggaccgactggggtaactggggcgacaggaaac
acaggaccgacaggggtaactggtgtaaccggaccaacagggtcaaccggagcgactgga
gcaacgggatcaacaggagcaacaggaccaacaggggcaacgggagcgactggatcaacc
ggagcgactggggaaacaggatcaaccggagcaacaggagcaacaggtccaacagggtca
accggagcgactggagcaacgggatcaacaggagcaacaggattaactggggcaacggga
ccaacgggagcaacaggtccaacaggaccaactggggcaacgggagcaacaggatcaaca
ggattaactggggcaacgggaccaaccggagcaacaggaccaactggagcaacgggagca
acaggatcaactggatcaaccggattaactggtgtaactggtgtaaccggaccaactgga
gcaacgggatcgaccggagcaacaggatcaaccggagcgactggagcaactggagcaaca
ggattaactggtgtaaccggagcgactggtgtaactggtgtaaccggagcaacaggtcca
acaggaccaacgggagcaactggggcgacaggaaacacaggaccgacaggggtaactggt
gtaaccggaccaacgggatcaataggggcaacaggatcgaccggagcaacagggtcaacc
ggagcgactggagcaacgggattaactggggcaacgggagcaactggagcaacagggtcg
actggagaaacaggaccaatgggagcaactggggcaacgggagtaactggagcaacagga
gcaacaggaccaactggagcaactggggcaacgggagtaactggagcaacagggtcaacc
ggagcgaccggagtaaccggaccaactggagcaacgggaataactggagcaacaggtcca
acaggaccaactggggcaacaggttcaacaggattaactggggcaacgggaccaaccgga
gcaactggagcaactggggcaacgggagtaactggagcaacagggtcgactggagaaaca
ggaccaacagggtcaaccggagcgactggagcaaccggaccaacgggagcaacgggatca
acaggagcaacaggattaactggggcaacgggagtaaccggaccaacgggatcaataggg
gcaacaggatcgaccggagcaacagggtcaaccggagcgactggagcaacgggattaact
ggggcaacgggagcaacgggagcaactggggcaaccggaccgactgggctaactggtcca
acaggagtaactggagcaaccggagcaaccggaccaacgggatcaacgggagcaactgga
gcaacaggattaactggtgtaaccggagcaacaggagcaacaggagcaacgggagcaaca
ggaccgactggagcaacaggactgactggggtaactggggcgacaggaaacgcaggaccg
acaggggtaactggtgtaaccggaccaacgggatcaataggggcaacaggatcgaccgga
gcgactggagcaacaggattaactggggcaactggggcaacagggtcgactggagaaaca
ggaccaatgggagcaactggggcaacgggagtaactggagcaacaggagcaacaggacca
actggagcaactggggcaacgggagtaactggagcaacagggtcaaccggagcgaccgga
gtaaccggaccaactggagcaacgggaataactggagcaacaggtccaacaggaccaact
ggggcaacaggttcaacaggattaactggggcaacgggaccaaccggagcgactggagca
acgggattaactggggcaacgggagtaactggagcaacaggtctaacagggtcaaccgga
gcgactggagcaacgggatcaacaggtgtaaccggaccaactggagcaacgggatcgacc
ggagcaacagggtcaaccggagcgactggagcaacgggattaactggggcaacgggagca
actggagcaactggggcaaccggaccgactgggctaactggtccaacaggagtaactgga
gcaaccggaccaacgggagcaacgggatcaacgggatcaactggagcaacaggattaact
ggtgtaaccggagcaaccggagcaacaggtccaacaggaccaacgggagcaactggggcg
acaggaaacacaggaccgacaggggtaactggtgtaaccggaccaacgggagcaactggg
gcgacaggaaacacaggaccgacaggggtaactggtgtaaccggaccaacgggagcaact
ggggcgacaggaaacacaggaccgacaggggtaactggtgtaaccggaccaacgggagca
actggggcgacaggaaacacaggaccgacaggggtaactggtgtaaccggaccaacggga
tcaataggggcaacaggatcgaccggagcgactggagcaacaggattaactggggcaacg
ggagtaactggagcaacgggagcaactggggcaacagggtcgactggagaaacaggacca
atgggagtaactggagcaacaggagcaactggggcaacgggagtaactggagcaacaggg
tcaaccggagcgaccggagtaaccggaccaactggagcaacgggaataactggagcaaca
ggtccaacaggaccaactggggcaacaggttcaacaggattaactggggcaacgggacca
accggagcaacgggagcaactggggcaacgggagtaactggagcaacagggtcgactgga
gaaacaggaccaacagggtcaaccggagcgactggagcaaccggaccaacgggagcaact
ggggcgacaggaaacacaggaccgacaggggtaacaggtgtaaccggaccaactggagca
acagggtcgactggagaaacaggaccaacagggtcaaccggagcgactggagcaacagga
gcaactggtgtaactggggcgacaggaaacacaggaccgacaggggtaactggtgtaacc
ggagcaacgggagcaacaggtccaacaggaccaactggggcaacgggaccaaccggagca
actggggcaacgggagtaactggagcaacaggatcaactggggcaactggagcaacggga
gtaactggagcaacaggtccaacaggaccaacgggagcaacaggtccaacaggaccaacg
ggagcaactggggcaacgggagcaacaggaccaaccggagcaactggtgtaaccggaccg
actgggctaactggtccaacgggaccaaccggagcaactggtgtaaccggaccgactggg
ctaactggtccaacaggagtaactggagcaacgggattgaccggagcaacaggaccgact
ggggtaactggtgtaaccggaccaactggagcaacgggatcgaccggagcaacaggacca
actggagcaacgggaccgacaggagtaactggagcaacgggatcaacaggaccgactggg
gtaactggtgtaaccggaccaactggagcaacgggatcgacaggagcaacaggagcaaca
ggatcaactggggcaactggagcaacgggagtaactggagcaacaggtccaacaggacca
acgggagcaactggggcgacaggaaacacaggaccgacaggggtaactggtgtaaccgga
ccaacgggagcaacagggtcgactggagaaacagggtcaaccggagcgacaggatcaacc
ggaccaacgggatcaataggggcaaccggatcgactggagcaacgggatcaacaggagca
acaggattaactggggcaacgggagtaactggagcaacaggtctaacagggtcaaccgga
gcgactggagaaacgggagcaactggtgtaaccggaccaactggagaaacgggagcaaca
ggtctaacagggtcaaccggagcgactggagcaacgggatcaactggtgtaaccggacca
actggggcaacgggagcaactggagcaactgggtcaaccggaccgactgggctaactggt
ccaacaggagtaactggagcaaccggagcaaccggaccaacgggagcaacgggatcaact
ggggcgacaggaaacacaggaccgacaggggtaactggtgtaaccggaccaacgggatta
ataggggcaacaggatcgaccggagcgactggagcaacaggattaactggggcaacggga
gtaactggagcaactggggcaacgggagtaactggagcaactggagcaacaggaccaact
ggatcaactggggcaacgggagcaactggtgtaaccggaccaactggagctacgggagta
actggagcaacagggtcgactggagaaacaggaccaacagggtcaaccggagcgactgga
gcaaccggagcaactggtgtaactggggcgacaggaaacacaggaccgacaggggtaact
ggtgtaaccggaccaatgggagcaacgggagcaacaggtccaacaggaccaactggggca
acgggaccaaccggagcaactggtgtaaccggaccgactgggctaactggtccaacagga
gtaactggagcaacgggagcaacgggatcgacaggagcaaccggagtaactggagcaacc
ggagtaactggggcaacgggagtaactggagcaacaggaccaacaggaaacactgggccg
actggtgtaactggagcgatcggagcaacaggggtaactggagcaacgggatcaactgga
gcgacaggaaacactgggccgactggggtaactggtgtaaccggaccaactggagcaacg
ggagcaactggtgtaaccggaccgactgggctaactggtccaacgggagtaactggggca
acgggaccaaccggagcaacgggagtaactggagcaacaggtccaacaggaccaacggga
gcaacaggaccaaccggagcaactggtgtaaccggatcgactgggctaactggtccaacg
ggagtaactggggcaacgggaccaaccggagcaactggaccaacaggggtaactggagca
acgggatcaactggagcgacaggaaacactgggccgactggggtaactggggcgacagga
gtaactggatcaactggaccaacaggaaacacaggaccaactggagcaacgggattgacc
ggagcaactggaccgacaggattaactggggcaacgggaccaaccggaccgactgggcta
actggtccaacaggagtaactggagcaacgggattgaccggagcaacaggaccgactggg
gtaactggtgtaaccggaccaactggagcaacgggatcgaccggagcaacaggaccaact
ggggcaacgggagtaactggggcaacgggagtaactggaccaacaggaaacactgggccg
actggtgtaactggagcaacgggatcaactggtccaacaggagcaaccggaccaacggga
gcaactggggcaacgggagcaacgggagcaacaggaccaacgggagcaactggtgtaacc
ggaccgactgggctaactggtccaacgggagtaactggggcaacgggaccaaccggagca
acgggatcaactggagcaacaggaccaacaggattaactggggcaaccggaccaaccgga
gcaacaggatcaacgggagcaaccggaccgactggggtaactggtgtaaccggaccaacg
ggatcgaccggagcaacaggatcaactggagcaacaggattaactggggcaacgggacca
accggagcaactggaccaacaggattaactggggtaactggagcaacgggatcaaccgga
ccgactggggtaactggtgtaaccggaccaactggagcaacgggagcaacaggagcaact
ggggcaactggagcaacgggagtaactggagcaacaggtccaacaggaccaacgggagca
acaggaccaaccggagcaactggtgtaaccggaccgactgggctaactggtccaacggga
gtaactggggcaacgggaccaaccggagcaacgggatcaactggagcaacaggtccaaca
ggaccaacgggagcaacagggtcaatcggagcgactggagcaacgggagcaacgggagta
actggggcaacgggaccaaccggagcaactggggtaaccggaccgactgggctaactggt
ccaacaggagtaactggagcaacgggaccaacgggatcgacaggagcaacgggagcgaca
ggagcaacaggagtaactggagcaacaggagtaactggggcaacgggagtaactggagca
acaggaccaacaggaaacactgggccgactggtgtaactggagcgatcggagcaacaggg
gtaactggagcaacgggatcaactggagcgacaggaaacactgggccgactggggtaact
ggggcgacaggagtaactggatcaactggaccaacaggattaactggggtaactggacca
accggaccgactgggctaactggtccaacaggagtaactggagcaacgggattgaccgga
gcaacaggaccgactggggtaactggtgtaaccggaccaactggagcaacgggatcgacc
ggagcaacaggaccaactggggcaacgggagtaactggggcaacgggagtaactggacca
acaggaaacactgggccgactggtgtaactggagcaacgggatcaactggtccaacagga
gcaaccggaccaacgggagcaactggggcaacgggagcaacgggagcaacaggaccaacg
ggagcaactggtgtaaccggaccgactgggctaactggtccaacgggagtaactggggca
acgggatcaaccggagcaactggaccaacaggattaactggggtaactggagcaacggga
tcaaccggaccgactggggtaactggtgtaaccggaccaacgggatcgaccggagcaaca
ggatcaactggagcaacaggattaactggggcaacgggaccaaccggagcaacaggacca
acaggattaactggggtaactggagcaacgggatcaacaggaccgactggggtaactggt
gtaaccggaccaacgggagcaacgggagcaacaggagcaacaggagcaactggggcaact
ggagcaactggagcaacaggtccaacaggaccaacgggagcaacaggaccaaccggagca
actggtgtaaccggaccgactgggctaactggtccaacgggagtaactggggcaacggga
ccaaccggagcaacgggagcaacaggaccaaccggagcaactggtgtaaccggaccgact
gggctaactggtccaacgggagtaactggagcaacaggatcaactggagcaaccggaccg
actggggtaactggtgtaaccggaccaacgggatcgaccggagcgactggagcaacagga
tccactgggccgacaggaaacacaggaccaactggagcaacgggatcaactggtccaaca
ggcaacacaggaccgactgggccaacaggaccgacaggagtaactggagcaacaggatca
acaggatcaacaggatcaacaggaccgataggagtaactggagcaacaggatcaacggga
ccaacaggaccgacaggagcaactggtgatagaggaagcattggcccgacaggagcaacc
ggagtaacgggaacagctggagcaacaggaagaacgggttcaaccggggctacaggagca
acaggaaacactgggccgactggagaaaaaggagcaacaggagcaacgggaccgacagga
tcaacaggaccaaccggagtaacgggaccgacaggagcaacaggaccaacaggagcaata
ggtccgactggtccgggaggcgtaatcccatttgcatcaggaggaacagtaacaataaat
tcactattaacaggggtacctaataccggagctattattgcatttggcaatagtactact
agtgtaggaattggtaatgctacagtaaatctacaaaatattagtaacgaagcatttgtc
gttccacgtgctggagcaattacaaatgttgctgcattctttaatattacggtggctctt
agtatagctattttaggtacagctactattacggcacaagtatggaaatcacaaaatgca
tcatctaacgtatttgcacctttagcatcgactcttataagttttacaccattagctggt
gccatagctgcatttactacattaaatggtgctcttgcaaatttaaatgaaccagtaaat
gtaggggatcgtttaattatggtattctctgtggctactacagggttaagtgtagtaaca
gctattacaggtacagcaagtgcgggtattacaattagttaa
DBGET
integrated database retrieval system