Viridibacillus arvi: JNUCC6_19225
Help
Entry
JNUCC6_19225 CDS
T06874
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
Organism
vij
Viridibacillus arvi
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
SecD_SecF_C
RPW8
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QOV10681
UniProt:
A0A7M2QSP8
LinkDB
All DBs
Position
3930112..3933201
Genome browser
AA seq
1029 aa
AA seq
DB search
MHSTIKFMLKNKLAVWLLTIIVAVAGVYAGLKMKLESIPDISIPIVTVTTVYPGATPEQV
TDDISIPFEKAVNNLKSIKSVYSNSYQNASSLQIEFKYGADMKEAVDNVKEAIEKINLPE
TAQVPTIDRVNINAFPVVALSVSDKEETIEELTKTVEDYFVPKMEAIDGVASVSVTGQQV
EKVQLTYDQKKLAQYGLDEAKVKQYIQAMDIKVPLGMFQFKDAEQSVVVDGKLTTLKELK
NLDIPVQPQAGAGLTQQQPLAEPFVKLGKLAKIELIGDVESVSRTNGESAIAVQIVKSQE
ANTVEVVNDVKEASKQFEKDNKGMKIDITMDQGEPIEKSVSTMLDKALFGAIFAVIIIML
FLRNIRSTIISIISIPLSLLISVLILKQMDITLNMMTLAAMTVAIGRVIDDSIVVVENIY
RRIYLEGEKLHGRALIREATIEMFKPILSSTLVTVAVFLPLGLVGGMVGELFMPFALTMA
FALGASLIVAITVVPVLAHSLFKKELYGKKQSKKEEHGKLSQSYKKLLSWVLDHKLVTSI
GTIVILVASLFLAPFVGFSFMPEDEQKMVYLTYTPEPGETRDSVIKDVEEVEKMVMDKKD
VQTVQVSIGGANPMMPGASNGALMYIIYNPDTKDFSNVKTKLVEEVVAVNQTGTWKNQDF
SMSGSSSELNYSVYGNTMEDIKPVVKNIEKIMNKRDDLKDVKASLSEVYDEHTLVIDQDK
VKKLGLTTGQIAMAINPNVQSEVLTSIDKDGKKIEVSVHKETASPDDFNDVLKQKIKSPL
GMEVKLSEVVDVKEGTTLSQINRSKGKLFASVTATVTSKDITKASSAVQKDIDKLDLPNN
VEVNSGGVAEDMAEAFTQLGLAMVAAIAIVYFILVVTFGEGLAPLSILFSLPFTVIGALV
ALWITGETISVSSMIGLLMLIGIVVTNAIVLIDRVIHMEHEGMTMREAILEAGATRLRPI
LMTALATVGALIPLAIGAEGSGLISKGLGVTVIGGLISSTVLTLIIVPLVYELLSKMLKK
NRATENFDD
NT seq
3090 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgcattctacaattaaatttatgctaaaaaacaagctagcggtatggttattaacaatt
atcgtagcagtggcgggggtttatgcaggcttgaaaatgaagcttgaatcaattcctgat
atttcaattccaatagttacagtaacaacagtttatcctggtgctacaccagagcaagta
acagatgatatttcaattccctttgagaaggcagttaataatttaaaatcaataaaatct
gtttactcaaattcatatcaaaacgcctcaagtcttcaaattgaatttaaatatggtgca
gatatgaaggaagcagttgacaatgtaaaggaagcaattgaaaaaattaatcttcctgaa
actgcgcaagtaccaaccattgatcgagttaacattaatgccttcccggtagtagcgtta
agtgtttctgataaagaagaaacaatcgaagagttaacaaaaacagtagaagattacttc
gttcctaaaatggaagcaatcgacggtgttgcttcagtatcagtaactggtcaacaagtt
gaaaaagttcaattaacatatgaccaaaagaaattagcacaatatggtctagatgaagcg
aaggttaagcaatatattcaagcaatggatattaaagtccctcttggcatgttccaattt
aaggatgcggagcaatcggtcgtagttgacggtaaattaacaactttaaaagagctgaaa
aacttagatattcctgttcaacctcaagcaggggctggattaactcagcaacaacctcta
gctgaaccgtttgtgaaattaggtaaactcgctaaaatcgaactgatcggtgacgtagaa
tcggtttctcgtacaaatggtgaatcggcaattgcggttcaaatagtaaaatcgcaagaa
gccaatacggttgaggttgtaaatgacgtaaaagaagcttcaaaacaatttgaaaaagat
aataaaggcatgaaaattgatatcacgatggaccaaggtgaacctattgagaagtctgta
tcaacaatgttagataaagcattattcggtgctatttttgccgttattattatcatgcta
tttttacgtaacattcgttctacaatcatatcaattatatcaattccattatcactacta
atctctgtattaattttgaaacaaatggatattacattaaatatgatgacgcttgctgct
atgacggtcgcgattggtcgtgtaattgatgactctattgtagtagttgaaaatatttat
agaagaatatatttagaaggtgagaaattacatggtcgtgctttaattcgtgaagcaacg
attgaaatgttcaagccaattctatcttcaacactagttacagtagctgtattcttacca
ctaggattagtaggaggaatggttggcgaattgtttatgccgtttgcattaacaatggca
tttgctctaggggcatcgttaatcgtcgcaattactgttgtaccagttttagcacattct
ctatttaaaaaagagctgtatggtaaaaaacaatcgaaaaaagaagaacatggtaagtta
tcacaaagctataagaaattacttagttgggtacttgaccataaactagtaacttcaatt
ggtacaattgttattttagtagcaagtctattcttggctccgtttgtaggatttagtttc
atgccagaagatgaacagaaaatggtctacttaacgtatactccagaaccaggagaaaca
cgtgatagcgttattaaagacgttgaagaagtagagaagatggtaatggacaaaaaagat
gttcaaacagttcaagtatcaataggtggagctaatcctatgatgccaggtgcttcgaat
ggtgctttaatgtacattatctataatccagatacaaaagattttagtaatgtaaaaact
aaattagtagaagaagtcgttgcagttaaccaaacaggaacttggaaaaaccaagatttc
tctatgtcaggttcaagcagtgagttaaattactcagtttatggtaatacgatggaagac
atcaaaccagttgtcaaaaacatcgaaaaaatcatgaataaacgcgatgatttaaaagat
gtaaaagcatctctttctgaagtttatgatgaacatacattagtaattgaccaagataaa
gtgaaaaaacttggtttaactacaggacaaattgctatggcgattaatccaaacgtccaa
tcagaagtattaacttcaattgataaggacggcaaaaaaatagaagtttctgttcataaa
gaaacagcatcacctgatgattttaatgatgtattgaaacaaaaaataaaatcaccactt
ggtatggaagttaaactttcagaagtagtagatgtcaaagagggtacaactttatctcaa
attaatcgtagtaaaggaaaactttttgcgagtgtaacagcaacagtcacttctaaagac
attacaaaagcgtctagtgctgtacaaaaagacattgataaactagatttaccaaacaat
gttgaagtgaatagtggcggtgtagcagaagatatggctgaagcattcactcaattaggt
ttagctatggtagcagcaattgcgattgtttacttcatccttgtagttacttttggtgaa
ggtttagcaccattatcaatcctgttctcactaccatttaccgtaattggtgctttagta
gcgctatggataactggcgaaacaatcagtgtatcttcaatgattggtcttttaatgtta
ataggtatcgtagtgacaaatgcgatcgtattaatcgaccgagtaattcatatggaacat
gaaggcatgacaatgcgagaagcgattttagaagccggtgcaacacgtcttcgaccaatt
ctaatgacagcactagctacagttggcgctttaattccattagcgattggtgcagaagga
agcggcttgatttcaaaaggcttaggtgtaacagtaatcggtggtttaatcagttctact
gttttaacattaatcatcgtgccacttgtttatgaactattgtctaagatgttgaagaag
aatcgtgcaacagaaaactttgacgattaa
DBGET
integrated database retrieval system
