Virgibacillus phasianinus: CFK37_07275
Help
Entry
CFK37_07275 CDS
T04951
Name
(GenBank) helicase SNF2
Organism
vil
Virgibacillus phasianinus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2_assoc
SNF2-rel_dom
Helicase_C
SWIM
AAA_22
USH1C_N
DUF6852
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASK64314
UniProt:
A0A220U7Q4
LinkDB
All DBs
Position
1414130..1417276
Genome browser
AA seq
1048 aa
AA seq
DB search
MQRLFPSQVYERGLEYFHQGRVTELLYDINYHVWTATVYGSESYFVEVNTKRWPHELSDA
YCDCPVFRTYNQCKHIAAVLFAIGKRHKEQGVGRQVDKYQVTKNFIQSVADIQQQKRATS
LSINRVPLEVEYICKWTYSDTLFLELKVGEKRRLVVKDVPQFLQDVFQEREHYFTKTFTY
NPEMHYFQEEDLEIFELLMSIVQNEQLYEGHSLYRYQTHISAGRSTSISPLLAKPLLKKL
VNRNFVVETEQNVFKEISIVEDELPFEFKLEKSTNKELALAISGMTDATYFANYELLFDS
GTFYFPGKDQIPMLRQVSSFARDNRSLPIPPDQADVFLSEVVPSLKKVGDVQISENVASE
IIQVPLKAKLYIDLKADWITGKLEYHYGAYQVDPFNGRKEEDVLIIRDVEKEQQIMQLIE
YANFHFNGKELYIDADEETLFEFLYDVLPMFESYVDLFLTSDIRKFFIENDPIPSTSVRL
ESSNNLLEIDFSIDGINDNEINQILSAVLEKKRYYRMDNGALLSLEGDEYTSIQELMTEL
DLKQTDIEDGSVQLPAYRGAQVDALIETKKNYDPSFRKLLHHLKSPEEQVYPIPENLQAT
LRNYQETGFQWFKSLDSYHLGGILADDMGLGKTIQSIAYLLSLEVDQPHLIVAPSSVLYN
WKNECEKFAPDLRVRVIAGSPMERIAMIDPKTTDDVWITSYATLRQDIELYQEITFHSLI
LDEAQYIKNYATKTSRAIREIKAGHRFALSGTPIENSIDELWAIFQVILPGLMPNQRNFK
QLSHAKIAMLTKPFILRRLKSDVLKELPDKIESVHVSELTKQQKELYLGYLRELQQETAQ
TLSNQDFNKNRMKILAGLTRLRQICCHPSLFIENYTGTSGKLEQLMETVNNAVKNEKRML
IFSQFTSMHDIIKKKLEEDEIDYFYLHGQTPSQERVQMSERFNNGEKSVFLISLKAGGTG
LNLTGADTVILYDLWWNPAVEDQATGRAHRFGQKNVVQVIRMVTKGTIEEKIYALQQKKR
ELIDQVIQPGEQMLSSLSESDIRELLSI
NT seq
3147 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcagcgattatttccttcccaagtgtatgaacgaggtctagaatattttcatcaggga
agagtaaccgaattattatacgatattaattatcatgtatggacagcaacggtatatggc
agtgagagctattttgtggaagttaatacaaaaagatggccgcatgaactgtcagatgct
tattgtgactgtcccgtatttcgaacctataatcaatgtaaacatattgctgctgtttta
tttgctatcggcaaaaggcataaggaacaaggtgttggcaggcaggtcgataagtaccag
gtaactaagaactttatccagtcggttgcagatatccagcagcaaaagcgtgcgaccagc
ttaagcatcaatcgtgtgccattagaagtagaatacatttgcaaatggacatatagcgac
acattgttccttgagctgaaggtcggagaaaagcgccgactggttgttaaagatgtccca
cagtttttacaggatgtgttccaggagcgggagcattactttacgaaaacatttacgtac
aatccggaaatgcattattttcaggaggaagatcttgagatatttgaattactgatgtcc
attgtacaaaatgaacagctttatgaaggacattccttgtaccgctatcaaacgcatatt
tcagcagggcgctctacttccatttctccattactcgcaaaaccattattaaaaaaattg
gttaaccgaaattttgttgtggaaaccgaacagaatgtattcaaagaaatatcgattgta
gaggatgaacttccttttgaatttaagctggaaaagagtacaaataaagaacttgcactg
gccatcagcggcatgacggatgcaacctattttgcaaactatgaactgctatttgattct
ggcaccttttatttcccaggaaaagatcaaattccgatgctgaggcaggttagtagcttt
gcaagggataatagaagtttgccaataccgccagatcaggcggatgtatttctttctgaa
gtggtcccatcattgaaaaaggtcggtgatgttcaaatttcggaaaacgttgcgtcagaa
attattcaggtgccattgaaggctaagctatatattgatttgaaagcagactggataacg
ggaaaactggaataccattatggagcataccaagttgatccatttaatggacgcaaggaa
gaggatgtcctaattattcgtgatgtggaaaaagagcagcaaattatgcaattaattgaa
tacgctaatttccactttaatggcaaagagctatatattgatgctgatgaggaaacactc
tttgagtttctatatgatgtgctgccgatgtttgaatcatacgtggatttgtttctaaca
tcggatattcgcaaattttttatagaaaatgacccaatacccagcacaagcgtacggctg
gagtcatcgaacaatctgcttgaaattgactttagcatcgatggaataaacgataatgaa
attaatcaaattttaagtgctgtgttagaaaagaaacggtactaccggatggataatggc
gcactgttatcacttgaaggtgatgagtatacgtcaatacaggagctaatgactgaacta
gacctgaaacaaacggatatcgaggatggcagtgttcagttgcctgcatacagaggtgct
caggttgatgctcttattgaaacaaagaaaaactatgatccttctttccggaaactgctg
caccatttaaagtcaccagaagagcaggtatatccgataccggagaatttgcaggctaca
ttaaggaactaccaagaaacaggatttcagtggtttaaatcgcttgacagctatcattta
ggcgggatactggcagatgatatgggactaggaaagacaatccaaagcattgcttatttg
ctttcattagaagttgatcaaccacatttaattgtggctccatcatctgttttatacaac
tggaagaacgagtgtgaaaagttcgcaccagatctgcgtgttcgggtaatcgcaggtagt
ccgatggaacggatagcgatgatcgatccaaaaacaacagatgacgtatggataacgtct
tacgcaacattacggcaggatatagagttgtatcaggaaatcacctttcattcattgata
ttggatgaagcacaatatataaaaaactatgcaactaagacatcacgtgctatccgggaa
attaaagctggacatcgtttcgccttaagcggaacaccgattgagaactccattgacgaa
ctatgggcaatctttcaggtgatcctgcctggattaatgccaaatcaacgaaactttaaa
caattgtcacatgctaagattgccatgcttacaaaaccatttattttacgcaggttgaaa
tcggatgttttaaaagaactaccggataaaattgaatcagttcatgtatcggagcttacc
aaacagcagaaagaattgtatctcggatatttacgtgaactacagcaggagacagcccaa
acgctcagcaatcaggacttcaataaaaatcgaatgaaaatcctggctggtctgacccga
ctccggcaaatctgctgtcacccttcactgtttattgaaaactatacggggacgtccggc
aagcttgaacagctaatggaaaccgtcaacaacgctgtgaagaacgagaagcggatgtta
atattttcccagtttaccagcatgcatgacatcataaagaaaaaacttgaagaagatgaa
attgattatttctatctgcatggtcaaacaccatcacaggaacgtgtgcagatgagtgag
cgcttcaacaatggcgaaaaaagtgttttcctaatttcattaaaagcaggcggcaccgga
ttgaatttaacgggcgctgacacagttattctctatgatttatggtggaatccagctgtg
gaagatcaagcaaccggccgcgcccaccgtttcggacaaaagaacgtcgttcaagtgatt
cggatggtaaccaaaggaacgattgaagaaaaaatctatgcgctgcaacaaaagaagcgt
gaattaattgaccaggtcatccagcctggagaacaaatgctatcaagtttaagcgaaagc
gatattagagaattattaagtatctag
DBGET
integrated database retrieval system