Vibrio sp. NTOU-M3: AB2S62_07000
Help
Entry
AB2S62_07000 CDS
T10494
Symbol
pulA
Name
(GenBank) pullulanase-type alpha-1,6-glucosidase
KO
K01200
pullulanase [EC:
3.2.1.41
]
Organism
vio Vibrio sp. NTOU-M3
Pathway
vio00500
Starch and sucrose metabolism
vio01100
Metabolic pathways
vio01110
Biosynthesis of secondary metabolites
Module
vio_M00855
Glycogen degradation, glycogen => glucose-6P
Brite
Enzymes [BR:
vio01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.1 Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
3.2.1.41 pullulanase
AB2S62_07000 (pulA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XDE87813
LinkDB
All DBs
Position
I:1562726..1568770
Genome browser
AA seq
2014 aa
AA seq
DB search
MNSKLTKLSLAMASLGLLAGCNDQLQVRVMDGYIQDAQVWLDTNKDFLQSDLEPKAVTDK
YGRATLTLSGSQSSDKKQIVVAKVQRGISIDSDIPGVTSTRDYLMMAPSNYEHITPFSTY
ITLQMNEGLSARKALKKLRKQLNLPKLSLRKDYIKEKQMVVARSAKALAQLLPSGLKHED
LSELRQTFELGAIAIGNELKHNRSDMLGKTLMFDELGKPVISDDSDGDGVADLVDRFPND
VQESADADNDGVGDHADLDDDNDGFNDVVEFKLGTDPYDAASHPSDLDGDKIPDALDSDI
DGDGWSNIDEERLGTDPYADDDVPADYDNDGTADIEDSDIDGDGITNDQDLFPTNRFESL
DTNGDGLSDFASSDDDGDGIPDSIDPNPTSPDNSSTEPAPSYSEAVIYYKRDDGNYTDWG
LHLWNNATCDAIDANTLEGVDWGNPFAWSEIDPEHGAKFVVPLKSEHGACMNFIVHKGND
KALGGDDLKAEFVKGNTLYTNHGSSTLKYSPDEQVVVALTGAAAHWLNLNSIAWFDHSEA
ASYQIWSRQQGNGDITKPQQFEKYDLSFAGLNDNSEFPHLKGRTEFFLDVDAATAKSLLK
TQLIAVALDAEGEPLVATRIQIPGIVDDLYTQGSNDADEAKLGSWLEAGQAKFALWAPTA
QEVELYLYQEDKSLFPESPITMTLDPTTGIWRYQGDASLENVFYRYRVKAYHPKTDHVEW
MMTTDPYSLSLSTSSLHSQLVDLDSQQSKPFGWDSHTVPEIDNPEDNIIYELHIRDFSIS
DDNGSNQTSGKYLAFLEDERDSVTQLKQLKEAGLTTIHLLPSYDLASIPEDEAKTVNLTD
TVEKLCGVNLEAKLCHDGTSREATILSLLEQTDPNTGEAQALLADVRPLDGFNWGYDPFH
YNAPEGSYAVESDGISRIREYRQMVQKLHDMGFRVVQDVVYNHTYSSGLYDKSVLDKTVP
GYYHRLNPLTGAVENSTCCDNTASENRMFEKLVADSVMMWAQDYKIDGFRFDLMGHLMKS
SMLHIYDKAKQVDPDTWFYGEGWNFGEVANGQRGENATQWPMAGTGIGSYNDRLRDGVRG
GGPFDSGGALLSNPGFANAGDRFSEELKSRMDLIRYGMAGNLQNYPLETYSGATVYGRDY
QYGGQGAAYTLDPQESINYVSKHDNQTLWDFNQYKASADISPADRARMQIVGMSTVMLGQ
GVPFLHMGAELLRSKSMERDSYDSGDWYNKVDFSKQTNNWNIGLPRADKDQANWSAIQSI
ISNPNTIATAQDIEWTDDAFKALLKIRSTTPLLKLLSEEEVLKRVRFHNTGPEALPGMIV
MSVNDGVSAGADLDKAHDAIVIAINANTKAQSIAIETAENFQLHPVLLASGDEIVKQAKF
SEGRFSIPALTAAVFVQPQQGEQGSGLEVETKPVDVAPYGSTKLYLRGSMNGWSVSDELQ
YQGDGIYIFEGYLMPGVYEFKLASEDWATVNLGFGSFTTANGSVLLEDAGNGNIKVTVSN
QGVYEFVLNALDQNALQVGVVDKNLDYACYQDSNPACDLRIYQVMMESFVDGDSKHDYGV
GYGTSHHKGDLQGVIDSLDYIASLNMNAIWLTPIFDSCAGEGGDDKLDATGYFACDYFNV
DPNFGTKEKLKELVDKAHAKGLYVILDGVFGHTHINGVKTSPSGKQPSLRSEAGYPGMYV
NYPSAESEAFFAEVATYWIKEFGIDGWRLDQAYQVPLENWRNIRTAVELAAKQNQQAGKQ
WGTLGYMVGEVWNGADEITRTTYGSDQEPGLSSAFNFPLRYGVVQALAVEESGASNNARV
LDANWNSRDKSPYHAMPNLMLGNHDLVRFGDLIQRGGLGDYVQRHKAAFSFLAAYSGPIT
LYYGEEIGDEVENFAEKVSGDCVSQGLCDDHVARTSAKIEGVTDVTLTSDQQSLKTYLAK
LMQVRSEHKALYAGERRNLWLDDHVYADLKTYEDEQVLYVLNTSTSQQQLSVEQLQLNNA
NGLVDLVTGEQIVLESNQSVLKISPLTGRLLRIN
NT seq
6045 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatagcaagctaacaaaactcagtttagccatggcttcacttggacttttagccggt
tgtaacgatcagctacaagtgcgcgtgatggatggttatattcaagatgctcaggtctgg
ttagataccaacaaagactttttacaaagcgacctcgagccaaaagccgttacggataaa
tatggccgagcgactctcacactttcaggttctcagagcagcgataaaaagcagatagtg
gttgccaaagtacaacgaggaatttccatcgatagtgatatccccggcgtcacgtcgact
cgtgattacttaatgatggcaccaagcaactacgaacatattacgcctttctcgacttac
attaccttgcaaatgaacgaggggctcagtgcgagaaaggcacttaaaaagctaagaaaa
caattaaatctgcctaagctaagcctacgtaaagattacattaaagaaaaacaaatggtg
gtggcacgaagtgcaaaagcacttgcccagctattgccgtcagggctgaaacatgaagac
ctcagtgaacttcgacaaacatttgagctgggtgccattgccattggcaatgaactgaaa
cataaccgtagtgacatgctcggtaagactcttatgtttgatgagttaggtaagccagtg
atcagtgatgacagcgacggcgacggggtagcagacctagttgatcgtttccctaatgac
gttcaagaatctgcggatgcagataatgatggtgttggcgatcatgcagatttagatgat
gacaatgatggttttaatgacgtcgtggaatttaagctaggtactgatccgtatgatgca
gcgagtcatccttccgatctcgatggagataagatcccagatgcactagatagtgatata
gatggtgatggctggagtaacatcgatgaagagcgcctagggacggatccatatgcagac
gatgatgtacctgcggattacgataatgatggcactgcagatattgaagatagtgacatc
gacggagatggcattacaaatgaccaagaccttttcccaaccaaccgctttgaaagcctt
gatacaaatggcgatgggttaagtgattttgcgtcaagtgacgatgatggtgatgggatt
ccagacagcattgatccaaatccaaccagcccggacaacagctcaactgagcctgcaccg
tcttacagtgaagcagtaatttactataagcgtgatgatggaaattatacggattgggga
ttgcatctatggaacaatgcaacgtgtgacgccatcgatgctaatacgctagaaggggta
gattggggcaatccatttgcatggagtgagattgaccctgagcatggcgctaagttcgtt
gttcctttgaagtctgaacatggcgcttgcatgaacttcatcgttcataaaggtaatgat
aaagcacttggtggtgatgacctaaaagcagaatttgttaaaggcaacacgctgtatacc
aatcatggtagttcgactcttaaatactccccagatgaacaggtagtagtcgcattaacg
ggagccgctgcgcactggctgaaccttaactcaattgcgtggtttgaccatagtgaagcc
gccagctatcagatttggagtcgccaacaaggaaatggtgatattactaagccccaacag
tttgaaaaatacgatttgtcctttgctggcttaaatgacaacagcgaattcccacacctt
aaaggtcgtactgagttcttccttgatgtggatgcggcgacagccaagtctttgttaaag
acccagctgattgcggttgctttagatgctgaaggggaacctctggttgccacgcggata
caaatcccgggtattgtcgatgacctctatacccaaggtagcaacgatgcggatgaagca
aaactaggtagttggttagaagcgggacaagccaagtttgctctttgggctccgacggca
caagaggtggagttgtacctctatcaagaggacaaatcgctattcccagaatcaccgata
accatgacgctggacccgactaccggcatttggcgttatcaaggtgatgcttcgcttgaa
aacgtattctatcgttatcgagttaaagcttaccatcccaaaacagaccatgttgaatgg
atgatgacgactgacccgtattcgttatcactcagtacatcgagcttgcattcacaactg
gttgatctagattcacagcaaagcaaaccattcgggtgggattctcacaccgtcccagag
attgataatccggaagataatattatttacgagctacacattcgcgatttcagtatcagc
gatgataacggctccaaccaaaccagcggaaaatatcttgcgttcctagaagacgaacgt
gacagtgtgacgcagttgaaacaattgaaagaagcgggtttaaccacgattcatctgtta
ccgagttatgacttagcctcaattcctgaagatgaagcaaaaaccgttaacctaactgac
acggttgagaagctttgtggtgtgaacctagaggcgaagctatgtcacgatggaacgtct
cgtgaggcgacaattctttcactcttagagcaaacagatccaaataccggtgaggctcaa
gcactacttgcagatgtaagaccgcttgatgggtttaactggggatatgacccattccac
tacaatgcaccagaaggaagttatgcggttgagtcggatggtatttcgcgtattcgtgaa
taccgacaaatggtccagaaacttcacgatatgggctttagagtggttcaagatgtggtt
tacaaccacacttattcatctgggctttacgataaatccgtattggataaaaccgtgccg
ggttactaccatcgcttaaatcctctaactggcgccgttgaaaactcaacatgttgcgac
aataccgcgtcggaaaatcgcatgtttgaaaaactggtggctgatagtgtcatgatgtgg
gcacaggattacaaaatagatggtttccgtttcgatttaatgggccatttgatgaaatcc
agcatgctacacatttacgacaaagcaaaacaagtcgaccctgatacatggttctacgga
gaaggttggaactttggtgaggtggctaacgggcagcgtggtgaaaatgcaactcaatgg
ccaatggcagggacgggcattggtagctacaacgaccgtttacgtgatggtgtccgtggt
ggcgggccattcgatagtggtggagctttattgagtaacccaggctttgccaatgcgggc
gatcgtttttcagaagaactcaagtcacgtatggacttgatccggtatggcatggcaggc
aacctgcaaaactacccacttgaaacctacagtggcgcaaccgtatatggtcgtgattac
cagtacggtggtcagggagcggcttatacactcgatccgcaagaatcgattaactacgtc
tctaagcatgacaatcagactctatgggacttcaaccagtacaaggcttcggcggatatt
agtccggcagatcgtgcacggatgcaaattgttggtatgtcgacggtgatgcttggccaa
ggcgtaccattcctacacatgggggcagaactattgcgttcgaaatcgatggagcgagat
agttatgacagtggggattggtacaacaaggtcgatttcagtaagcaaaccaataattgg
aacattggcttaccgagagcagataaggatcaagcgaactggagtgcgattcagtcaatt
atcagcaatccaaacacgatagcaacggcacaagatatcgagtggacagacgatgcgttt
aaagctctgctgaaaattcgttcaacaacaccattgctgaaattactttctgaagaagag
gtgcttaaacgcgtcagattccacaacactggcccagaagcattaccgggaatgattgtg
atgtctgtgaacgatggagtttctgcgggagcagatcttgataaagctcacgatgcgatt
gtgattgcgattaacgccaatacaaaggctcagagtatcgctattgaaacggcagagaac
ttccagcttcatccagtgttattggcgtcgggtgatgagattgtcaaacaagctaagttc
tctgaaggccgctttagtattcctgctctgaccgccgccgtttttgttcagccacaacaa
ggtgagcaaggttccggattagaggtggagactaagccggttgacgttgcgccatatgga
tcaactaagctgtacctgcgaggttcaatgaatggttggtcagtttctgacgaattgcag
taccaaggtgatggcatatatatctttgaagggtacctcatgcccggagtttacgagttt
aaacttgcttcagaagattgggcgacggttaatcttggctttggttcatttaccactgca
aatggctcggtgctgttagaagatgcaggtaacggcaatattaaagttaccgtatcaaac
cagggtgtgtatgagtttgtgctcaatgcactcgatcaaaatgcactacaagttggtgtc
gtcgacaaaaatcttgattatgcatgttatcaagacagtaacccggcgtgtgatctgcgt
atttaccaagtcatgatggagtcgtttgtcgatggtgatagcaagcatgattatggtgtg
ggttatggtacatcgcatcacaaaggcgacttacaaggtgttatcgacagtttagattac
attgcaagcttaaacatgaatgcaatttggctaacgcctatctttgattcgtgtgcaggt
gaaggcggagacgacaaacttgatgcgactggatattttgcatgtgactacttcaatgtt
gatccaaactttggcaccaaagagaagttgaaagagttggtggataaagctcatgcgaaa
ggtttgtatgtcatccttgatggcgttttcggccatacacatattaacggagtgaaaacg
tcaccaagtggtaaacagccaagcttacgtagcgaagcaggttatccggggatgtatgtc
aactatccaagcgcagagagtgaggccttctttgccgaagtagcaacgtactggattaaa
gagttcggtatcgatggttggcgtttagaccaagcttaccaagtaccgcttgaaaactgg
cgaaatatccgtacggcggtcgagcttgcagcaaagcagaaccagcaggcgggcaaacaa
tggggaacgttagggtacatggttggtgaggtatggaatggtgctgatgaaattacgcgc
acaacctacggtagcgaccaagagccgggtttatcttcggcctttaacttcccgctgcgt
tatggggttgtacaagcgttggcagtcgaggagtcaggagcaagcaataatgctcgtgtg
cttgatgcgaactggaatagccgagacaaatcgccgtatcatgccatgccaaatttgatg
ttaggtaaccatgacttggtgcgctttggtgatttaattcagcgaggtggactgggtgat
tatgttcagcgtcataaagcagcattcagtttcttagccgcttattcaggtccaatcaca
ctttattatggtgaagagattggtgatgaggttgaaaactttgctgagaaagtctctggt
gattgtgtaagccaaggtttatgtgatgatcatgtggctcgcaccagtgctaaaattgaa
ggagtgacggatgtaacgctaacgtcagaccagcaatcactcaaaacataccttgctaag
ctgatgcaagttcgcagtgagcataaagcattatatgcaggggaacgtcgaaatctttgg
ttagacgatcatgtctatgcggatcttaagacctatgaagatgagcaagtgctgtatgtg
ttgaatacctcaacctcgcagcagcaattatctgttgaacagttgcaactgaacaatgcc
aatggcttggttgatctcgttacgggtgagcagatcgtgttggaatccaaccaaagtgtg
ctcaagatatcgccacttacaggacgtttattgcggattaactaa
DBGET
integrated database retrieval system
