Vitreoscilla sp. C1: ADP71_03800 Help Entry ADP71_03800       CDS       T05336                                  Name (GenBank) YadA-like protein   KO K21449   trimeric autotransporter adhesin Organism vit  Vitreoscilla sp. C1 Brite KEGG Orthology (KO) [BR:vit00001]  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    02000 Transporters [BR:vit02000]     ADP71_03800 Transporters [BR:vit02000]  Other transporters   Pores ion channels [TC:1]    ADP71_03800 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  YadA_stalk YadA_anchor ESPR YadA_head Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  AUZ04182 UniProt:  A0A2L0PJ50 LinkDB All DBs Position 303227..309463 Genome browser AA seq 2078 aa AA seqDB search MNKIYKVIWNESLETYVAVAEIENSHSSSSRRTRVRALLNTIVFTPVMSVMAVAVVGTLT TPQQAHAAYAADGGVNNGGTVAIGAGAVADGTRSIALGGDAKTKGTHTVKVKGVDKVYTT PDGNNQAIAIGYESYAYGSQAVGLGANVRAVGNSSIAIGGDDLNAAAGTSNNSDTAKAYK DITGDNLVRAYDGKTGATNQYFGTSAGHAAVAIGVQAGSMGDLSTAFGTRRQADGLAATA LGVGATANKDGSIALGAGSQTSTDAVKVTQAEIGGILFDNFTGTNAFAGTIYDTGRQVSI GSAGKERQIKHVAPGQLTQTSTDAINGSQLYAVAMKLSNVKDTAEKGWYVNSVFAGGALT TTGPQKMSPGDTLTFSVGENLELDQIRGTIALRVAKNVQFDSVTTGDSVLNSTGLNIASS KGNTVSITNDGINLGNQVINGVSEGLVSGQSKQAVNGSQLYAANQNIANSLGGNAGVDAT TGALTAPNYQVTNAVGDAVVYTDAAGNTLATAAGNVGDALTQMNTYVNTGFDVQQAGTTK GTVTPGDKINFVNGTLTTAKVTTEANGVTDITFDVNAQSVVDAAQLPVVYTNANGDRVYK QSNGDWNTKADGTGTVVNAGDVMASMSNADGQTTTPMVLGNVAAGEVSGSSTDAVNGSQL YAANQNIANSLGGNAGVDATTGALTAPNYQVTNAAGDAVVYTDAAGNTLATAAGNVGDAL TQMNTYVNTGFDVQQAGTTKGTVTPGDKINFVNGTLTTAKVTTEANGVTDITFDVNAQSV VDAAQLPVVYTNANGDRVYKQSNGDWNTQADGSGNVVNAGNVMASMSNADGQTTTPMVLG NVAAGEVSGSSTDAVNGSQLYAANQNIANSLGGNAGVDATTGALTAPNYQVTNAAGDAVV YTDAAGNTLATAAGNVGDALTQMNTYVNTGFDVQQAGTTKGTVTPGDKINFVNGTLTTAK VTTEANGVTDITFDVNAQSVVDAAQLPVVYTNANGDRVYKQSNGDWNTQADGSGNVVNAG NVMASMSNADGQTTTPMVLGNVAAGVISGSSTDAVNGSQLYAANQNIANSLGGNAGVDAT TGALTAPNYQVTNAAGDAVVYTDAAGNTLATAAGNVGDALTQMNTYVNTGFDVQQAGTTK GTVTPGDKINFVNGTLTTAKVTTEANGVTDITFDVNAQSVVDAAQLPVVYTNANGDRVYK QSNGDWNTKADGTGTVVNAGDVMASMSNADGQTTTPMVLGNVAAGVISGSSTDAVNGSQL YAVGNSTASSLGGGSTFNTTTGKVEASLAVNGNTYNNVQDALNDLNGQVTSGWNLSTNGG AAHNVGPNGQVDLSNTDQNMVISNNNGNVTFDLSKNIQVDSVTSGDTLSDTYSQFTQAGF EVKTAQGNTLLNQDGLSFNDAAGLPTGPVISSNGINAGNLLITNVAAGSIAADSRDAVNG SQIHDLVGAGAYQDVNGKATPNIQNIGGTGATNIHDAFQALNTQTQAAKTEVVQGDNITV TQTVGAAGQDVYTVATKKDLVLDSVKIDDGQGQALTLNKTGTTVSNGSQSAHYGADGLVA KDAATGNQTVVNQDGLSFKDGNGNQTGPVINQNGIDAGGKQVTNVAAGVNDNDAVNVYQL NQYFLQQNQQTQNVQNTIGDLEHLFDTFNVQGQAQTDQLNIIDTINAMNTTGIQYHHTNS SNAPGRLGSTNDSSAGGNNSSAIGVDAIIEAGADSTVAFGHGTTANSAATSSVVIGHDSV VGGASSIAIGHGSQALGNQSISIGTGNVVNGNNSGAIGDLSYINADNAYGIGNNNTIDAN QSFVLGNEVKIGKDAEDMSQANGATFQGSVALGHNTTVSAAVGTTGIKILATDTEERAFA GTAPVGTVSVGAAKAERTITNVAAGRINADSTDAINGSQLYQTNEALGQLANGGAGVIQY SNEATPTVANGGIASNNLTLVGGSPSTVDVNGDGVIDANDGTAPVTLSNVAAGRAPTDAV NVGQLQQMGNNLNNRINAVEKEAQAGTATAIAVANLPQVYLPGKSGVSMATGVYEGQVGY AVGYSSISDGGKWVFKASATGSPNGSVGAGAGMLYMLD NT seq 6237 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgaataaaatctacaaggttatttggaatgagtctttagagacttatgttgcagttgca gaaatcgaaaatagtcacagttcttcttcacgtcgcactcgtgttcgagcgcttttgaat acgattgtgtttacgccagtgatgagcgtgatggccgtggcggtggttgggacattgacg acaccacaacaagcacacgctgcttatgctgcggatggcggtgttaataatggtggtact gttgcgattggagcaggtgcggtagccgacggtacacgatcaattgcgttgggtggggat gccaaaaccaaaggcacacatacggttaaagtgaagggtgtagataaggtctacaccact ccagatggtaacaatcaagcgattgcgattggttatgagtcttatgcatatggttcacaa gctgtgggtttgggtgccaatgtgcgtgcggtgggtaactcatcgattgccattggcggg gatgacttgaacgcagcagcaggtactagtaataacagtgacacagccaaggcttataaa gatattactggtgataatttggtgcgtgcttatgacggtaaaactggagcgaccaatcag tattttggtacttcagcaggtcatgccgcagtggctattggtgtacaggccggttcaatg ggcgatttgtcgactgcgtttggtacacgtagacaagcggatggcttggctgcaaccgca ttgggcgttggtgcaacagcgaataaagatggctctatcgcattgggcgcaggtagtcag acctcaacagatgctgtcaaagtgacacaagccgaaattggcggcattttgtttgataac tttaccggaaccaacgcatttgccggcactatttatgatactggacgtcaagtttctata ggtagtgcaggtaaagaacgtcaaatcaaacatgtggccccaggacaactgacacaaacc agtaccgatgctattaatggcagtcaattgtatgcagtggctatgaaattgagcaatgtg aaagatacggcggaaaaaggctggtatgtgaattcagtctttgctggaggagcgctcaca accacgggtccgcaaaaaatgtcacctggagatactttgactttttcagtgggcgaaaat ctagaattggatcagattagaggcacaattgctcttcgtgttgcaaaaaatgtgcagttt gacagtgtaactactggtgacagcgtattgaacagtacgggtttgaatattgcatcaagt aaaggcaatacagtcagcattaccaatgatggtattaacctaggtaatcaagtcatcaat ggtgtgtctgaaggcttggtttctggtcaatctaagcaggcggtgaacggcagccagttg tatgcagcgaaccaaaacattgccaacagtttgggtggcaatgcgggtgtggatgcgacc acaggtgcgttgacagcaccaaactaccaagtgaccaatgctgtaggcgatgcagtggtt tacaccgatgcagcaggcaacactttggcgacggctgcgggcaatgtgggcgatgcattg acgcaaatgaacacttatgtgaatacaggctttgacgtacagcaagcaggtacgaccaaa ggcactgtgactccgggtgacaaaatcaacttcgtcaatggcacgttgaccacagccaaa gtgacaacggaagccaatggcgtgaccgatatcacttttgatgtgaatgcccaaagcgtg gtggatgcagcgcaattgccagtggtgtataccaatgccaatggcgatcgtgtgtacaaa caaagtaacggcgactggaacaccaaagcagatggcactggtacggtggtgaatgctggt gatgtcatggcatctatgagcaatgccgatggtcaaacgactacgccgatggtattgggc aatgtggcagccggtgaggtttcaggcagctctaccgatgcagtgaacggcagccagttg tatgccgcgaaccaaaacattgccaatagcttgggtggcaatgctggtgtggatgcgacc acaggtgcgttgacagcgccaaactaccaagtgaccaatgccgcaggcgatgcagtggtt tacaccgatgcagcaggcaacactttggcgacggctgcgggcaatgtgggcgatgcattg acgcaaatgaacacttatgtgaatacaggctttgacgtgcagcaagcaggtacgaccaaa ggcactgtgactccgggtgacaaaatcaacttcgtcaatggcacgttgaccacagccaaa gtgacaacggaagccaatggcgtgaccgatatcacttttgatgtgaatgcccaaagcgtg gtggatgcagcgcaattgccagtggtgtacaccaatgccaatggcgaccgtgtgtacaaa caaagcaatggcgactggaacactcaagcagacggttcaggtaatgtagtcaatgctggt aacgtgatggcttctatgagcaatgccgatggtcaaacgactacaccgatggtattgggc aatgtggctgcaggtgaagtttcaggcagctctaccgatgcggtgaacggcagccagttg tatgccgcgaaccaaaacattgccaatagcttgggtggcaatgctggtgtggatgcgacc acaggtgcgttgaccgcaccaaactaccaagtgaccaatgccgcaggcgatgcagtggtt tacaccgatgcagcaggcaacactttggcgacggctgcgggcaatgtgggcgatgcattg acgcaaatgaacacttatgtgaatacaggctttgacgtacagcaagcgggtacgactaaa ggcactgtgactccgggtgacaaaatcaacttcgtcaatggcacgttgaccacagccaaa gtgacaacggaagccaatggcgtgaccgatatcacttttgatgtgaatgcccaaagcgtg gtggatgcagcgcaattgccagtggtgtataccaatgccaatggcgatcgtgtgtacaaa caaagcaatggcgactggaacactcaagcagacggttcaggtaatgtagtcaatgctggt aacgtgatggcttctatgagcaatgccgatggtcaaacgactacgccgatggtattgggc aatgtggcagctggtgtgatttcaggcagctctaccgatgcggtgaacggcagccagttg tatgcagcgaaccaaaacattgccaatagtttgggtggcaatgccggtgtggatgcgacc acaggtgcgttgacagcaccaaactaccaagtgaccaatgccgcaggcgatgcagtggtt tataccgatgcagcaggcaatactttggcaacggcagcgggcaatgtgggcgatgcgttg acgcaaatgaacacttatgtgaatacaggctttgacgtacagcaagcgggtacgactaaa ggcactgtgactccgggtgacaaaatcaacttcgtcaatggcacgttgaccacagccaaa gtgacaacggaagccaatggcgtgaccgatatcacttttgatgtgaatgcccaaagcgtg gtggatgcagcgcaattgccagtggtgtataccaatgccaatggcgatcgtgtgtacaaa caaagtaacggcgactggaacaccaaagcagatggcactggtacggtggtgaatgctggt gatgtcatggcatctatgagcaatgccgatggtcaaacgactacgccgatggtattgggc aatgtggcagctggtgtgatttcaggcagctctaccgatgcggtgaacggcagccagttg tatgcagttggtaatagcactgccagctctttaggcggcggtagcacgtttaataccacc accggcaaagtagaagcgagcttggcggttaatggcaatacttataacaatgttcaggac gctttgaatgatttgaatggccaagtgacttcaggttggaatttgtctactaacggtggc gctgctcacaatgtgggaccgaatggtcaagttgatttgagtaataccgatcaaaacatg gtcatcagtaataataatggcaatgtgacatttgatttgagtaaaaatattcaagttgat agtgtgacttcaggtgacacattaagtgatacttatagccaattcactcaggcaggtttt gaagtgaaaacggcgcaaggtaatacattattgaatcaggatggtttgagcttcaatgat gctgcaggtttgccaacaggcccagtgattagcagtaatggtatcaatgcaggtaatttg ttaattaccaatgttgcggcaggttcgattgctgccgattcgcgtgatgcggtcaatggt agccaaattcatgatttggtaggtgcaggtgcttaccaagatgtcaatggtaaggctacg ccgaacattcaaaacattggtggtacaggtgcaaccaacattcatgatgctttccaagct ttgaatacgcaaacccaagcggctaaaaccgaagtggtgcaaggtgacaatattactgta actcaaaccgttggcgctgctggtcaagatgtttataccgttgccacgaagaaagacttg gtattggattcggtgaaaatcgatgacggccaaggtcaggctttgactttgaataaaaca ggtaccacggttagcaatggttcacaatctgcccattacggtgcggatggtttggtggct aaagatgcagcaacaggcaatcaaacggtggtgaatcaagatggtttgtcattcaaagac ggtaatggtaaccaaacaggacctgtcatcaatcaaaatggtattgatgcaggtggcaaa caagtgaccaatgttgcagctggtgtcaatgataatgatgcagtcaatgtgtatcaattg aatcaatacttcttgcaacagaatcaacaaacgcaaaatgtgcaaaacacaataggcgat ttggagcatttgtttgatacgtttaacgtacaaggtcaagctcagacggatcaattgaat attattgataccatcaatgccatgaataccactggtattcaatatcaccataccaacagc agcaatgcgccaggtcgtttaggtagcacgaacgactcaagtgcaggtggtaataactcc agtgcgattggtgtggatgcgattattgaagcgggtgctgacagcactgtggcttttggt cacggtaccactgccaatagcgcagcgaccagttcggtggtcattggtcatgattcagta gtgggcggcgcaagcagtattgcgattggtcacggttcgcaagcattgggcaatcagtct atcagtattggtacgggtaacgtggttaacggtaacaactctggtgcgatcggtgacctg tcttacatcaacgctgacaatgcttatggtattggtaataacaatacgattgatgccaac cagtcatttgttttgggtaatgaagtcaaaattggcaaagatgcggaagacatgagccaa gccaatggcgcgacattccaaggttctgtggctttaggtcataacacgacagtatctgct gccgttggtacaacaggcattaagattttggcgacggataccgaagaaagggcttttgca ggtacggctcctgtgggtacggtgagtgtgggtgctgcgaaagcggaacgtaccattacc aatgtcgctgcaggccgcattaatgcagacagtaccgatgcgattaatggtagtcagtta tatcaaaccaatgaagctttaggtcaattggctaatggtggtgctggtgtgattcaatat tctaatgaagccacgccaactgtcgctaacggtggtattgccagcaacaacttgacattg gtaggtggttcgccatcgactgtcgatgtcaatggcgatggtgtgattgatgctaacgat ggtacagcacctgttaccttgtccaacgtggcagcaggtcgcgcgccgactgatgcagtt aacgtgggtcaattgcagcaaatgggcaataatttgaacaaccgtatcaatgcggttgaa aaagaagcccaagctggtaccgccacagcaattgcagtcgctaacttgccacaagtttac ttgccaggtaagagcggtgtgtcaatggcaactggtgtttatgaaggtcaagttggttat gccgtaggttattcttctatttctgacggtggcaaatgggtattcaaggcttcggcaaca ggcagtcctaacggttctgtcggtgcgggcgcaggcatgttgtatatgcttgactaa

DBGET integrated database retrieval system