KEGG   Vibrio kanaloae: BTD91_04705
Entry
BTD91_04705       CDS       T07086                                 
Name
(GenBank) hypothetical protein
  KO
K12287  MSHA biogenesis protein MshQ
Organism
vka  Vibrio kanaloae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:vka00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02044 Secretion system [BR:vka02044]
    BTD91_04705
Secretion system [BR:vka02044]
 Type II secretion system
  MSHA pilus biogenesis protein
   BTD91_04705
SSDB
Motif
Pfam: DUF6701 Bactofilin Mago_nashi
Other DBs
NCBI-ProteinID: QPK05657
LinkDB
Position
1:complement(1106209..1110906)
AA seq 1565 aa
MNNNATLWASGGFKLINSDITHNNNKVFLEGGANGSSYFENSDLRADIVVNNKVTIKNSI
IRGLVSNVSNHEIVLESDSWVTENVDGGTKITISDSQVNGRVTNRTNNEIEIKDESVVWG
RVDAGSKITIDDSTVNSDVSNRTLNEIEVKNDSTVQGDVDGGSKVTIDDSEVAGDVSNRS
NNEIIITDESRIGGSVVAIGQLSISESEIIGNIDSTNHNINLDDDTVIRGNATAANNNWA
TIYFKDNDSVVHGTCLYRTDPVDACSGTPPVNQNPQFEFGTLTDNNCTISSPGPENKQVV
TCTLNFNNTYDIAKPKPLVFVMPTIDASLSVRSNGTTELPSTAFVINTTWQSATIVQEIA
PNAKKKTNNIAYLDAPMSGQGNPLKSSNYIDYFVIEEGVISLNNGESQIVAGLVDTNTAA
SQTSGERNNADIIRYEDYGLDSFNSKPGVLVQPQTKNNTSAWFTGMARGVEVESFSLALE
KSEVIKKNSISSKENVAFVAGEGSGFIQGARFFLGNAETRVTTTLSERVISPIEIGCKEF
TSIADARFDAPPILVANKNSRDGNNGGWIRRCDITKDKVYFIVEEDMDKDSERSHVAEDV
GFFMFDRPNDIGICEGFNNKSPVQTWKGSNGSLEINGSPKIVGALRDSGNRYVGFLNSNT
NDRTGSACEGQECYGLDDLLIDKEALEDVPDNLGNSLDIPYTHNVTSLPITVGGVKIYEY
DSISIGTGAVVEIESGKYKIGSLNINGTGKLHVKSGDTVTIFTKNFSVNNDGYAGIPIVR
WNGDKPVLAGDTHFRVNVLQNGGQLVSLNGSGTLVGLLYSERNVDMSGAARVYGAVSAKS
VNMSSSALIHAETSCIVPVDDYEIDISPATDLALMCGDDSPQFTINTSNNGVAESLGVTV
GIAPDADEFDISVQQGSGTGAYPNYFSNNDGELTLKIVAKETANIDFDSDYTLTATLVDD
SGKEVESQFKFVPFKFSLVDGNTPTNRLDVIAGQATPTVTKVLACDLGDSIVVAENYVGE
AEKEVTIAHELDSSWNGSDGVLTYLPEFESGSATTDLTVSESGLFNVTLKDSSFDCTGFA
GCPEDGSYDVEGSFSVYSRPWKFAICTDNNSDGDSIGGAAFVAAGEAFDVYARPIKHTNS
FDVCTDDNLLTNNYFKSTASVQVTTTLETPSTADYPGAELGDLTPEIQLTKQISSNDQTN
KGYKFESLKYSEVGSFNFVATEAGSFYGSILGGFSGSKSIGRFYPKYFVQDTPEWNVANQ
GDIAYLDQPYDSAVHQVYPMASGESSVDNVLNNYRFFHPDLQAEFGVLDDTAVDNRFLLD
TGSGTWSTDRKHWLLNDSAAVLERVTDSDSASRKDNPFNTSDANSTVTHFGLTVGGVDPV
SFTDSDTLTDSVEFLVQPPARYGRMTLDDIGGNSGSNLTIPLRSEFWDGSEFVVNEDDDR
STFNGANVCKQVIWHSEGATTTLASLNGSGSVDDGEEKVTANQNTPTGTDSPREQVRLWL
RMDDSEPDSDGGNNISCSGSDQDQPWLRYNWRQLGDEDPSTVVTFGIYRGNDRVIYRGES
GLTGQ
NT seq 4698 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaacaacaatgcaacattgtgggcgagtggtggatttaaactgatcaacagtgatatc
acacacaataacaataaagttttcttagaaggtggtgccaacggctctagttattttgaa
aactcagacctgcgtgctgatatcgttgtaaacaataaggtgacaattaaaaattcgata
attagaggtttagtatccaacgttagtaatcatgagattgttttagagtcggattcatgg
gttacagaaaacgttgatggtggtactaaaattactatctctgattctcaagttaatggc
agggttactaatagaacaaataatgagatagaaataaaagatgaatctgttgtttggggg
cgtgtcgatgcgggctcaaaaattactattgatgattccaccgttaatagtgatgtatcg
aatcgaactttaaatgaaatagaagtaaaaaatgactctacagttcaaggagatgtcgac
ggaggatcaaaagttactattgatgattctgaagtggcgggtgacgtctcaaataggagt
aataacgagataataattactgatgaatctcgcatcggtgggagcgttgttgcaattgga
cagttaagtatttccgagtcagagattattggtaatattgatagtacaaatcataatatt
aacttagatgatgacactgttattcgcggaaatgcgactgccgctaataataattgggca
acgatatactttaaagataatgacagtgtggttcatggcacttgcctgtatagaacagat
ccagttgatgcatgttcaggaactccccctgttaatcaaaaccctcaattcgagtttggt
actcttacggataacaattgtacgatttcatctccagggcctgagaacaagcaagtcgtg
acttgtacgctgaattttaataatacctatgacatagcgaaacctaagccgcttgtgttt
gttatgccaaccattgatgcaagcttatccgttagaagtaatgggacaacagagcttcct
tctacagcgtttgtaatcaatacaacttggcaatctgcgacaatagtccaggaaatagca
ccgaatgctaagaaaaagacaaacaacattgcatatctagatgctcctatgagtgggcaa
gggaatcctttaaaaagtagtaattatattgattattttgttatcgaagaaggcgttatc
tctttaaataatggtgaaagtcaaattgttgctggtcttgtagatacaaacaccgccgcg
tctcaaacttctggagaaagaaacaatgcagatattattcgctatgaggattatggttta
gactcttttaattctaagccaggagttttagttcaacctcaaacaaaaaataacacatcg
gcgtggtttaccggaatggctcgcggtgtggaagttgaaagcttttccttggcattagag
aaatctgaagtcatcaaaaagaactctatatcatctaaagagaatgtagcttttgtggct
ggtgaaggttcaggatttattcaaggtgctcgttttttccttggcaatgctgaaacaaga
gttacgactacattgagtgaaagagtcatttctccaatagaaatcggttgtaaagagttt
acttcgatagctgatgcaaggtttgatgctcctccgatcttagttgctaataagaactct
cgtgacggtaataatggtggctggattcgtcgttgtgatatcacgaaagataaagtttac
tttattgttgaagaggatatggataaggacagtgaaaggtctcacgttgctgaagatgta
ggcttttttatgtttgatcggcctaatgacatcggtatttgtgagggcttcaataataaa
agtccagtacaaacatggaaaggttcgaatgggagtttggaaatcaatggctctcccaaa
atagtaggggcgctcagagatagcgggaatcgttacgtaggctttttaaattcgaatacc
aatgacagaactggttccgcttgtgaaggccaggaatgttacggcttggatgacttactt
atcgataaagaagcattagaagatgttccagacaacttaggtaactcattagatatccct
tacacccacaatgtcacttccttacctatcactgttggtggtgtgaagatttacgaatat
gacagcatctcaattggtactggtgcagtggttgaaatagagtctggtaaatataaaatt
ggctcacttaatatcaatggtacaggtaaattacacgtaaagagtggtgatacggttacg
atctttactaaaaacttttctgttaacaatgatggttatgctggaattccaattgttcgt
tggaatggtgataaacccgtgcttgcgggtgacacacattttagggtgaacgtattacaa
aatggtggccaacttgtcagcctaaatggaagtggcacgctggtcggtttactttacagt
gaaagaaatgttgatatgagcggagcagctagagtatatggtgcggtatctgctaaatca
gtgaatatgtcatcaagcgctttaattcatgctgagaccagttgtattgtgcctgttgat
gactatgaaattgatatttcccccgcaaccgatttagctttaatgtgtggcgacgattcc
cctcaatttaccattaatacctctaataatggtgtggcggaaagtctaggtgttaccgta
ggtattgcgccagacgctgatgagttcgacatttctgtacagcaaggttcaggtacaggt
gcatacccgaattatttttctaataacgatggtgaattaactttaaaaattgtcgctaaa
gagactgccaatattgattttgactctgattacacactcactgcaacattagtggatgac
tctggcaaagaggttgaaagtcagttcaagttcgtgccgtttaaattctcattagtggat
ggcaatactccaaccaatcgtcttgacgttattgctgggcaggctacacctacggtaact
aaagttttagcctgtgacctaggtgattctattgtggttgccgaaaactatgtaggtgaa
gccgagaaggaagttaccattgctcatgagctggatagttcgtggaatggctctgatggg
gtgttaacttacttgcctgaatttgaaagtggtagtgctacaactgacttaactgtttct
gaatcaggtcttttcaacgtcactttaaaagacagtagttttgattgtactggttttgct
ggttgtcccgaagatgggagttacgatgtagagggaagtttctctgtgtattctcgccct
tggaaatttgcgatttgtactgataataactctgatggtgatagcattggtggggctgca
tttgttgccgctggtgaggcgtttgatgtgtatgctcgtccaatcaagcataccaactca
tttgatgtttgtactgatgataatttattgacgaataattactttaagtcgacagcaagc
gtgcaagtgacaacgactttagagacaccttcaactgcggattacccaggcgctgagtta
ggtgatttaacccctgagattcaactaactaagcaaatttcatcgaatgatcagactaat
aaaggctataaattcgagagtttaaaatactcagaagtgggtagctttaactttgttgcg
acagaggctggtagtttttatggttcaattttaggtggcttttctggtagtaaatcgata
gggcgtttttaccctaaatactttgtccaagatactcctgagtggaatgttgcaaatcaa
ggtgatattgcatacttagaccaaccttatgattctgcagttcaccaagtgtatccaatg
gcttctggtgaaagcagtgttgacaacgtgcttaacaattatcgtttcttccatccagac
ttacaggcagaatttggtgttctagatgatactgctgtcgataatagattcttgctagat
actggatcaggtacttggtctactgatcgtaagcattggttgttgaacgatagtgccgct
gttcttgagcgagttacggattcagatagtgctagccgcaaggataatccttttaataca
tcggatgctaattctactgttacccatttcggtttgacggtaggcggtgttgaccctgtg
tcatttactgattcagatactttgacagactctgtagagtttctggttcagccccctgct
cgatatggccgaatgacgttagatgatattggcggaaactcaggcagtaatttaactatt
ccattacgatctgagttctgggatggtagcgagtttgttgtgaatgaagatgatgaccgc
agtaccttcaatggtgcaaatgtctgtaagcaagtcatttggcacagtgagggagcgaca
accacattagcttcacttaacggcagtggtagcgtcgatgatggtgaggaaaaggttacc
gcgaatcaaaatacaccaacaggtacagattcgccacgtgaacaagtccgtctgtggcta
agaatggatgattctgagcctgatagtgatggtggaaataacatctcatgtagtggcagt
gatcaagatcaaccatggttgcgctacaactggcgccagctaggtgatgaagatccctcc
accgtcgtcacatttggtatctaccgcggtaacgatcgtgtgatttaccgaggtgaaagt
ggtttaacaggtcagtaa

DBGET integrated database retrieval system