Varanus komodoensis (Komodo dragon): 123023145 Help Entry 123023145         CDS       T07701                                  Symbol COL1A2 Name (RefSeq) collagen alpha-2(I) chain   KO K06236   collagen type I alpha Organism vko  Varanus komodoensis (Komodo dragon) Pathway vko04510   Focal adhesion vko04512   ECM-receptor interaction vko04518   Integrin signaling vko04820   Cytoskeleton in muscle cells Brite KEGG Orthology (KO) [BR:vko00001]  09130 Environmental Information Processing   09133 Signaling molecules and interaction    04512 ECM-receptor interaction     123023145 (COL1A2)    04518 Integrin signaling     123023145 (COL1A2)  09140 Cellular Processes   09144 Cellular community - eukaryotes    04510 Focal adhesion     123023145 (COL1A2)   09142 Cell motility    04820 Cytoskeleton in muscle cells     123023145 (COL1A2)  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:vko00536]     123023145 (COL1A2) Glycosaminoglycan binding proteins [BR:vko00536]  Heparan sulfate / Heparin   Extracellular matrix molecules    123023145 (COL1A2) BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGFIT Motif Pfam:  Collagen COLFI Motif Other DBs NCBI-GeneID:  123023145 NCBI-ProteinID:  XP_044285505 LinkDB All DBs Position Unknown AA seq 1360 aa AA seqDB search MLSFVDTRILLLLAVTSCLATSQYEATVRRGPRGVKGPRGERGPPGPPGRDGEDGPPGPP GPPGPPGLGGNFAAQYDGSKAADLGPGPMGIMGPRGPPGSSGPPGSPGYQGPPGEPGEPG QTGPQGARGPPGPPGKAGEDGHPGKPGRNGERGVPGPQGARGFPGTPGLPGFKGIRGHNG LDGRKGEPGAQGTKGEPGAPGENGTPGQSGARGLPGERGRVGAPGPVGARGSDGSNGPTG PAGPIGSAGPPGFPGAPGAKGEVGPAGNAGPSGPAGPRGEPGLPGAAGPVGPPGNPGANG IHGAKGAAGLPGVAGAPGLPGARGIPGPAGPAGPAGSRGLTGEPGPAGSKGETGNKGEPG SPGPAGPAGPSGEEGKKGATGEPGATGIPGPAGLRGVPGSRGLPGADGRAGVIGLAGNRG ATGPAGAKGPSGDVGRPGEPGLMGARGLPGQSGSPGPAGKEGPMGLPGPDGRPGPVGPAG PRGEPGNIGFPGPKGPNGEPGKPGERGHVGLAGPRGPPGPDGNNGAQGPVGVVGAVGSKG ETGPAGPPGFQGLPGPSGPVGEAGKPGDRGLHGEFGLPGPAGVRGERGPPGPSGVAGPTG PLGSRGPSGPPGSDGSKGEPGVAGAAGAPGPGGPSGIPGERGAAGMPGGKGEKGPTGFRG DVGTTGRDGARGIPGAVGAPGPAGGSGERGEAGPAGAAGPAGPRGAPGERGEVGPAGPPG FAGPPGAAGQAGAKGERGQRGPKGDVGPQGAIGAVGNGGPAGPMGPAGPAGARGDGGPPG ATGFPGNAGRPGPPGPAGVSGPPGPPGPAGKEGIRGPRGDSGPMGRAGETGIVGPPGFSG EKGPTGESGAAGPPGSPGPQGILGAPGILGLPGSRGERGLPGVAGAPGDFGPVGIAGPPG ARGPSGPIGAPGVNGAQGEAGRDGNPGSDGAPGRDGAAGYKGERGAPGNTGPHGALGAPG PHGSVGPAGKPGNRGEPGPVGVTGPAGPAGARGPSGPQGARGEKGVTGDKGPRGMPGFKG HNGLQGLPGIAGHHGEQGPTGASGPAGPRGPAGPSGPPGKDGRNGLPGPVGPAGVRGSPG NQGPSGPPGPPGLPGPPGANGGGYEIGYDAEYYRADQPSLRPKDYEVDATLKTLNNQIET LLTPEGSKKNPARTCRDLRLSHPKWSSGFYWIDPNQGCTMDAIRVFCDFSTGETCIHANP RSIPAKNWYISKNPNEKKHVWYGETINGGTQFEYNEDGVSSKDMATQLAFMRLLANHASQ NITYHCKNSIAYMDEETGNLKKALLLLASNDVELRPEGNSRFTFTVLEDGCSKKNNQWGK TIIEYRTNKPSRLPILDIAPLDIGGANQEFGADIGPVCFK NT seq 4083 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgctcagctttgtggatacacggattttgttgctgctcgcagtaacttcatgcctagca accagtcaatatgaggcaacggtacgaaggggtccccgaggagtaaaagggccacgagga gagaggggtccaccaggtccaccaggcagagatggtgaagatggtccaccaggcccccca gggccccctggtcctcctggtcttggcggaaactttgctgctcagtacgacggttccaaa gcagctgatcttggccctggaccaatgggtataatgggacccagaggcccacccggttca agtggaccccctggttctcctggctaccaaggacctcctggtgaacctggtgaacctggt caaacaggtccccaaggtgctcgtggtccacctggtcctcctggaaaggctggtgaagat ggtcatcctggaaaacctggaagaaatggtgaaaggggtgttcctggacctcagggtgct cgtggctttcctggaactcctggtctgcctggcttcaaaggaataaggggacataatggt ttggatggtcggaaaggagaacctggtgcccaaggtactaagggtgaacctggtgcccct ggtgaaaatggaactcccggacaatctggtgctcgtggtcttcctggtgaaaggggaaga gttggtgctcctggcccagttggtgctcgtggcagtgacggaagcaatggtcccactggc cctgctggtcccattggttctgctggacccccaggattccccggtgctcctggagccaag ggtgaagtaggacctgctggtaatgctggtccatctggccctgcaggtcctcgtggtgag cctggtctccctggtgctgctggtcccgttggcccaccaggtaaccctggtgccaatggt attcatggtgctaaaggtgcagctggtcttcctggtgtagctggtgctcctggcctccca ggtgctcgtggcatccccggcccagctggccctgctggccctgctggttctagaggactt actggtgagcctggccctgctggatccaagggagaaactggtaacaagggtgaacctggt tcacctggcccagctggtcctgctggtccaagtggtgaggaaggcaagaagggtgccact ggtgagcctggtgctactggtatacctggacctgcaggtttaagaggtgttcctggatct cgtggtctccctggagctgatggcagagctggtgttataggtcttgctggtaatcgtggt gctactggccctgctggtgctaaaggtcccagtggagatgtgggccgccctggtgaacct ggtctcatgggtgcaaggggtctccccggtcaatctggaagcccaggccctgctggcaaa gaaggtcctatgggtctccctggtcctgatggtcgtcctggcccagttggtccagctggt ccaagaggtgaacctggcaacattggattcccaggaccaaaaggtcccaatggcgagcct ggcaaacctggtgaaagaggtcatgttggtcttgctggcccacggggtcctcctggtcca gatggaaacaatggggctcaaggaccagttggtgttgttggtgctgttggttccaaaggt gaaaccggtccagctggccctcctggattccaaggccttccaggtccctctggcccagtt ggtgaagctggcaaaccaggtgataggggtcttcatggtgaatttggtctccctggtcct gctggtgtaagaggtgagcgtggccctccaggcccaagtggtgttgctggtcctaccggt ccccttggaagccgtggcccatctggtccaccaggatctgatggtagcaagggtgaacct ggtgttgctggagcagctggtgctcccggcccaggtggccctagtggaatccctggcgag agaggtgcagctggtatgccaggaggcaaaggtgaaaagggaccaacaggcttcagagga gatgttggaacaactggaagagatggtgcccggggcattcctggtgctgttggtgctcct ggacctgctggaggttctggagagaggggtgaagctggtcccgctggtgcagctggtccc gctggacctcgtggagcacctggtgaacgtggtgaagttggtcctgctggccctcccgga ttcgctggacctcctggtgcagctggtcaggctggtgctaaaggcgaaagaggtcaaaga ggacctaaaggcgatgtaggcccacaaggtgccattggtgctgttggtaatggtggccct gctggtcccatgggccctgcaggtcctgctggagcccgtggtgatggcggtccacctggt gctactggtttccctggtaatgctggaagacctggacctcctggccctgctggtgtctct ggtccccctggaccccctggcccagctggcaaagagggtattagaggcccacgtggtgac tctggaccaatgggccgtgctggtgagactggtattgttggaccacctggtttcagcgga gagaaaggcccaactggagagagtggtgctgccggacctcctggttccccaggtcctcaa ggtatccttggagctcctggtatccttggtcttcctggctctagaggagaacgtggtctc ccaggcgttgctggagcacctggtgattttggccccgttggtattgctggtcccccaggt gctcgtggcccatctggtcccattggtgcccctggtgtgaatggtgcccaaggcgaagcc gggcgggatggaaatccaggtagtgatggtgctcctggtcgtgatggtgctgctggttac aagggggaacgtggtgctcccggcaacactggtccccatggtgctcttggtgctcctggc ccccatggttctgttggtcctgctggcaaaccaggaaatcgtggtgaacctggtcctgtt ggtgttactggtcctgctggccctgctggtgcaagaggtccttctggcccacaaggagca cgtggtgagaaaggtgttactggtgataagggacccagaggcatgcctggtttcaaagga cacaatggacttcagggactgcctggcattgccggacatcatggagaacaaggtccaact ggtgcttctggtcctgctggcccaaggggacctgctggtccttctggtcctcctggcaaa gatggtcgcaatggtctgcctggacctgttggtcctgctggtgtgcgtggatcccctggt aaccaaggaccttctggtcccccaggcccacctggtcttcctggcccacctggtgccaac ggtggtggatatgaaattgggtatgatgcagaatattaccgggcagatcagccttctctt agacccaaggactatgaagttgatgccaccctgaaaacactgaacaaccagattgagacc ctcctgaccccagaaggctccaagaagaacccagctcgcacctgccgtgacttgagactc agccatcccaaatggagcagtggtttctactggatcgatcccaaccaaggctgcaccatg gatgccattagagtattttgtgacttctccaccggtgagacttgcatccatgccaatccc agaagcatcccagccaagaactggtacattagcaagaaccctaatgaaaagaaacatgtc tggtatggagaaactatcaatggtggcactcagtttgaatacaatgaggatggtgtgagt agcaaggacatggccacccaacttgctttcatgcgactcctggccaaccatgcttcccag aacatcacttaccattgcaagaacagcattgcttacatggacgaggaaacaggcaacctt aaaaaggcactcttgctgttggcatccaatgatgttgaactacgacctgaaggcaacagc aggttcactttcaccgttcttgaagatggctgctctaaaaagaacaaccaatggggcaaa actatcattgaatacagaacaaataagccatctcgtttgcccatccttgacattgcacct ttggacattggtggcgctaaccaagaattcggtgcggacattggcccagtctgtttcaaa tga

DBGET integrated database retrieval system