Vidua macroura (Pin-tailed whydah): 128818492
Help
Entry
128818492 CDS
T11570
Symbol
IGFN1
Name
(RefSeq) immunoglobulin-like and fibronectin type III domain-containing protein 1
Organism
vmc Vidua macroura (Pin-tailed whydah)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
I-set
fn3
Ig_3
Ig_2
FN3_DSCAM-DSCAML_C
ig
THB
Pur_ac_phosph_N
Tissue_fac
Receptor_2B4
C2-set_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
128818492
NCBI-ProteinID:
XP_053853864
LinkDB
All DBs
Position
24:1490892..1531915
Genome browser
AA seq
2586 aa
AA seq
DB search
MHKGRCLAVEGQANSPVTGGPARGDTAPGQRREGGGTDGEAEEAPAGPGAEGPALTPALP
WLQLRLPQHSAGEDTGLRAAVKIFKKSSIPGVVITQFVNDVPEGCSTPDFEKKPLSLTLQ
EGKNAIFRAVVKGVPAPEVKWSRTRKGMDDPAKYEMSFNSATNEFILQIKSLVLDDSDLY
RCCAVNAYGEASCSAGLRIIQVGFKRKAKYVPVHAADELKKTLLDSKKLLRKRVAAPKPK
PLDKEAVWQLLLHADRRDYEKICMKYGIVDFRGMLRKLQEMRKDTESEQDKLIHSLKNFE
HIKVDKEGNATFSLEMELKNSNSNVYLLKDGERLRYGTGDEYRKHCLRRVGRRYYFTVND
VQPEDAGVYQVRVEDVPVFSTELDAQAIPARFRQPLSDVRCAEAGDAEFQCVLCMPCHQP
LWLHKSHPLQASDKHQISVTPDGLTHKLIVRNVGPSDSGLYTLDAGQGSSSAWLLVEYAK
GKRRQDEGEKIGRETSEWLKETMADNERARKLRRQEQAAAEDRPSFSTSSGVEKSGWYRT
GQGSSQGRGQGHSIDSDDGSQRFLGKEGLRKTHMNGEMGSGQFSGAGLVGDSAANDGSIF
GLKGFGGRSGLKAVHGMDSVSGRAGPGGAVGGAGEWNSVDGRGEGLLGAANIDMDDGEGL
GSQHDKDGNLGDASYRAGFGGAGRFSGGSFVPDGLDPDSAGVGARGMRFHHGKDGHATVG
DMNGAGINREGQTGTPYGKAGLTPHASGQLGQTGRSGSLYGPGGLPGGDGATSGTGGNSI
GEMEALYGPDGQALGLAGGAGGAGAGGFGSPYGKDGLPAGGGFGGVGAGGLGAPYGKDGL
PIGAGSGGAGGAGEHGYLYGKDGLPAGAGGAGAGFGEALYGPDGRPLGAGVGGGAGAVGF
GAPYGKDGLPVGADVGGVGVAGVGGFGAPYGKDGLPAGAGAGGAGGFGEALYDGRPLRAG
VGAGGGGSGAGGFGSPYGKDGLPAGAGGAGLGGLGETLYGPDGRPLGAGIGGSGGTGGLG
SPYGKEGLPAGAGGAGAGESGEALYGPDGRPLGAGVGGAGSASARGIGAPYGKDGVPAGT
GAGVGGAVGVGGPYGKDGLPAGAGAGVGGAGGVGGPYGKDGLPAGAGAGVGGAVGVGGSH
GKDGLPVGVGAGRAGGEGGAGVPYGKDGLPIGAGVDGGVGAGGLGSPYGKDGLPAGAGFG
VGGAGRPGAPYGKDGLPAGAGAGVSGAGGVGGSYGMDGVPVGAGAGGAGAGAFGSPYGKD
GLPAGAGVSGAGEALYGPDGQPLGTGGGGADSVSARGTGAPYGKDGVPAGAGVGDAGGVG
GPYGENGVPVGAGVGGAVGVGGPYGKDGVPAGAGAGVGGAGGVGGPYGKDGLPAGAGAGV
GGAVGVGGPYGKDGLPVGAGVGGAGGVGGPYGKDGVPAGAGAGVGGAGGVGGPYGKDGLP
VGAGVGGVGGVECPYGKDGVPIGAGVGGAGGVGGPYGKDGLPVGAGAGVGGAVGVGGPYG
KDGLPAGAGAGVGGAGGVGGPYGKDGLPVEAGAGVGGAGGVGGPYGKDGLLAGAVAGAAH
FSLGGEEAMGSGHGTDAALSRALGYAGGAGGEGFSREGSALWGAGSPYCEDRGSAVATAG
AGGVGRLGGDEWDSVHGKGGVGAAGGPGGEYGLNAHLGRSSRGETGKGTASDVRGPGNKG
SAGDRGSLPGPGGARGEGRDFRQLGSLYGTNSAFGEAGSKSHDRSVDGSSSGGFGQGPLS
YGQMSGPFGGPPSANQRNQEPDMDLKANDSLNTESTAQKRRSVLDDLKVPRCYLNKQLAT
VRVLKGDPAELSCTVSKDNVTGTWFKDGLKLTSMDGVVFEKKGLVHKLIINKAEDIHAGK
YRFEGGDVKTEASIFVEDPPQVDKVLLKNLTSVPTVAKAGEGVKLRIPFEGRGPIRAAWL
KDRMELGDDTRIRVDKTDTCTTLSISSCDRRDCGDYKVRLKNDSGVLEINLKLMVIDKPQ
PPAGPIKIVESSANNITIQWKPPKDDGGKPIQRYLVERQQVGRNDWETLGETPRSCTSFT
MSKVEEEMSYYFRVRAMNAEGVSDALESGEVKAAGKASPGAPDPPEIISASRDTITISWK
APCKTGTSQIMGYIVQKRKKGTVTWLPVTNVPVKDKKLKVTSLKKGVQYEFRVAAVNAAG
TGQPSDPSEPAFARDPTKSPGQVQDLKVSSSDSTSVTLTWNKPEVQDGNDVKGYEVEMRP
CNSLSWTKCFTLPAESTSCRVQGLQAREKLFLRVRALGDGGPGEASELEACAGASAALVS
PRLLIDDTVKSFLVIKAGNPIRVKIPFEGSPEPLVTWLKDGLPLPSRAAVSTEDGSSQLL
LRAAELSDSGTYTVELGDGLGKRETFSFQVQITDIPQPPGAIRLEENVPNTVTVTWDPSA
SEQWEKNLYYTVLKRESQKGLWHVLGDLIYNNKFTFTRVVPGRDYYFRVVAKNDLGASDP
SETVQPWRIWKKKAEFRVKAQKYRAVNQNQHPRFLVPLKSHVVVTGSECHMSCAVGGHPP
PKITWYKDSRDLSRDPNYFCTNDFGVCSLVVLGVTKHDEGEYMVEASNEVGRAFSKAFLA
IKDSSL
NT seq
7761 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcataaaggaagatgtttagctgtggaggggcaagctaacagccctgtgacaggcggc
cccgcccgcggcgacaccgcgccgggacagcggcgggagggaggcggcacggacggagag
gctgaggaggctccagccgggcccggagcggagggacccgcactgaccccggccctgccc
tggctgcagctgcggctgccacagcactcggctggggaggacaccgggctgagagccgca
gtaaaaatcttcaagaaatcttctatcccaggagttgttatcactcagtttgtgaatgat
gttccagaaggatgcagtacacctgattttgagaagaaaccactcagtctgacattgcaa
gaaggcaaaaatgccattttcagagctgtggtcaaaggtgtcccagctcctgaggtgaaa
tggtcgcgtacacggaaaggaatggatgatcctgccaaatatgaaatgtccttcaatagt
gctacaaatgaattcattctgcagatcaagagcctggttctggatgacagtgatttgtat
cgctgctgtgctgttaatgcctatggagaggcctcgtgctctgctggcctcaggatcatc
caagttggctttaagaggaaggcaaaatatgttcctgttcatgctgctgatgagctcaag
aagacactcctggactccaagaagctgctgaggaagagggttgcagcaccaaaaccgaag
cccctggacaaagaagctgtgtggcagctgttgctgcatgcagataggagagattatgag
aaaatctgtatgaaatatggaattgttgacttccgtgggatgctgaggaagctgcaggag
atgaggaaggacacagagagtgaacaagacaagttaattcacagtctcaaaaactttgaa
cacatcaaagttgacaaggagggaaatgctactttcagcctggagatggagctgaaaaac
agcaacagcaacgtttacctgctcaaggacggcgagcggctccggtacgggacaggggat
gagtacaggaagcactgcctgcggagagtggggaggaggtactacttcactgtcaatgat
gtgcagccagaggacgcaggggtgtaccaggtcagggtggaggacgtccctgtcttctca
actgaactggatgctcaagccatcccggcgcggttccggcagccgctctccgacgtgcgc
tgtgccgaggccggggacgccgagttccagtgtgtgctgtgcatgccctgccaccaaccc
ctgtggctgcacaaaagccaccctctccaggccagtgacaagcaccagatctctgtgaca
cctgatggcctgacccacaagctgattgtcaggaacgtggggccctcggacagcggcctg
tacacgctcgacgcgggacagggctcctccagcgcctggctcctcgtggagtatgccaaa
ggaaagaggagacaggatgaaggagaaaagattggaagggagacatctgagtggctgaaa
gaaacaatggcagacaatgaaagggcgaggaagcttcgtcgccaagaacaagctgctgct
gaagatcgtccttccttttccacatcctctggtgtggagaaaagtggctggtacagaaca
ggtcaaggcagcagtcaaggcaggggccaaggacactccattgattctgatgatggaagc
caaagatttttgggaaaagaagggctacgcaaaacccacatgaatggagagatggggtct
gggcagttttctggagcaggtctagttggagactcggcagccaatgacggcagcatcttt
ggactaaaaggcttcgggggcagaagtgggttaaaggctgtccatggcatggactctgtg
tcaggcagagcaggtcctggtggtgcagtaggaggggcaggtgaatggaattctgtggat
ggcagaggtgaaggtttgctgggtgctgctaacattgacatggatgatggagaaggtttg
ggctctcagcatgacaaggatgggaatttaggtgatgccagttacagagcgggttttggg
ggtgctgggaggttcagtggtggaagttttgtgccagatgggcttgatcctgattcagct
ggagtgggagccagaggaatgagattccaccatggcaaggatgggcatgccactgtgggt
gatatgaatggagcaggtataaacagagagggacaaacagggactccctatggcaaggct
ggcctgacacctcatgccagtggtcagttagggcagacaggaagatctggctcattgtat
gggccaggaggccttccaggtggagatggggctacatctggtacaggtggcaattccata
ggagaaatggaggctttgtatggtccagatggtcaggcactgggactggctggtggtgct
ggtggagctggtgcagggggatttgggtctccctatggaaaggatggtctcccagctggg
ggtggttttggtggtgttggtgcagggggacttggagctccctatgggaaagatggtctt
ccaattggagcaggttctggtggggctggtggtgcaggggaacatggatatctctatgga
aaggatggtctcccagctggggctggtggagctggtgcaggatttggagaggctttgtat
ggtccagatggtcggccacttggagcaggtgttggtggtggtgctggtgcagtggggttt
ggagctccctatggaaaggatggtctcccagttggagctgatgttggtggagttggtgta
gctggtgtagggggatttggagctccctatggaaaggatggtctcccagctggagcaggt
gctggtggtgcaggaggatttggggaggctttgtatgacggtcggccacttagagctggt
gttggtgctggtgggggtggttctggtgcagggggatttggatctccctatgggaaggat
ggtctcccagctggagctggtggagctggtctaggaggacttggagagactttgtatggt
ccagatggtcggccacttggagcaggtattggtgggtctggtggtacagggggacttgga
tctccctatggaaaagaaggcctcccagctggagctggtggagctggtgcaggagaatct
ggagaggctttgtatggtccagatggtcggccacttggagcaggtgttggtggtgctggt
tctgcaagtgccaggggaattggagctccctatggaaaggatggtgtcccagctggaaca
ggtgctggtgttggtggtgcagtgggagttgggggtccctatggaaaggatggtctccca
gctggagcaggtgctggtgttggtggtgcagggggagttgggggtccctatggaaaggat
ggtctcccagctggagcaggtgctggtgttggtggtgcagtgggagttgggggttcccat
ggaaaggatggtctcccagttggagtaggtgctggtagggctggtggtgaagggggagct
ggagttccctatggaaaggatggtctgccaattggagcaggtgttgatggtggtgttggt
gcagggggacttggatctccctatggaaaggatggtctcccagctggagctggttttggt
gttggtggtgcagggagacctggagctccctatggaaaggatggtctcccagctggagca
ggtgctggtgttagtggtgcagggggagttgggggttcctatgggatggatggtgtccca
gttggagcaggtgctggtggggctggtgcaggggcatttgggtctccctatggaaaggat
ggtctcccagctggagctggtgttagtggtgcaggagaggctttgtatggtccagatggt
cagccacttggaacaggtggtggtggtgctgattctgtgagtgccagaggaactggagct
ccctatggaaaggatggtgtcccagctggagcaggtgttggtgatgcagggggagttgga
ggtccctatggagagaatggtgtcccagttggagctggtgttggtggtgcagtgggagtt
gggggtccctatggaaaggatggtgtcccagctggagcaggtgctggtgttggtggtgca
gggggagttgggggtccctatggaaaggatggtctcccagctggagcaggtgctggtgtt
ggtggtgcagtgggagttgggggtccctatggaaaggatggtctcccagttggtgcaggt
gttggtggtgcagggggagttgggggtccctatggaaaggatggtgtcccagctggagca
ggtgctggtgttggtggtgcagggggagttgggggtccctatggaaaggatggtctccca
gttggagctggtgttggtggtgtagggggtgttgagtgtccctatggaaaggatggtgtc
ccaattggagctggtgttggtggtgcagggggagttgggggtccctatggaaaggatggt
ctcccagttggagcaggtgctggtgttggtggtgcagtgggagttgggggtccctatgga
aaggatggtctcccagctggagcaggtgctggtgttggtggtgcagggggagttgggggt
ccctatggaaaggatggtctcccagttgaagcaggtgctggtgttggtggtgcaggggga
gttgggggtccctatggaaaggatggtctcctagctggggcggtggcaggagctgctcat
ttttctcttggaggtgaggaagcaatgggatctggccatggcacagatgccgcactgagc
agagctctgggatatgcaggtggagcaggaggagagggcttttccagggagggctctgca
ctgtggggtgcagggtctccttattgtgaggacagagggtcagctgtagccacagctggt
gcaggtggagttgggaggttgggaggggatgaatgggattcagtccatggtaaaggaggt
gtgggagctgctggtggaccaggtggtgaatatgggctgaacgcacatcttggcagatct
tcgagaggtgaaactggaaagggcactgccagtgatgtcagagggccagggaacaaaggt
tcagctggtgacagagggtccctgcctggtccaggaggagccaggggagagggcagagat
ttcagacagttgggctctctctatggcacaaattctgcctttggagaggcagggagtaaa
tcccatgacagatctgttgatgggagtagttcaggagggtttggtcaaggtccactgagt
tatggccagatgtcaggtccttttggtggacctccttcagcaaaccagagaaaccaggaa
cctgacatggatcttaaagcaaatgattccctgaacacagaaagcacagcacaaaagaga
cggagtgtcctggatgatctcaaagtcccacgctgttacctcaacaagcagctggcgacc
gtgcgagtgctgaagggggacccagctgagctgtcctgcactgtcagcaaggacaatgtg
acaggaacctggtttaaggatggcctaaagttaacaagcatggatggagttgtctttgaa
aagaaaggtcttgtccacaaactgatcattaacaaggctgaagatattcatgctgggaaa
tacaggtttgaaggtggagatgtaaaaactgaagcttcaatttttgttgaagatcctccc
caggtggacaaagttctcctcaagaacttgaccagtgtccccacagtggccaaggctggg
gagggggtgaagctgcggatcccattcgagggtcgggggcccatcagggcggcgtggctg
aaggacaggatggagctgggggatgacaccaggatccgtgtggacaagacagacacctgc
accacgctgtccatctccagctgcgacaggagggactgtggggattacaaagtcaggctc
aagaacgacagtggtgtcctggagatcaacctaaagctcatggtgatagacaagccacag
cctccagcaggacccatcaaaattgtagaaagctccgccaacaacatcacaatccagtgg
aagcccccaaaggatgatgggggcaaaccaatacaaaggtacctcgtggagaggcagcag
gtgggcaggaacgactgggagacactgggagaaacccccaggagctgcaccagcttcacc
atgagcaaagtggaggaagagatgagctactacttcagggtgagagccatgaatgccgag
ggagtgagcgatgcgctggagtcaggggaagtgaaggctgctggtaaagcttcccctggt
gcccccgatcctcctgagatcatcagtgccagcagagacaccatcaccatatcctggaaa
gctccttgtaaaaccggcacttcccaaattatgggatacattgttcagaaacgcaagaag
ggcactgtgacctggctgccagtcaccaatgtgcctgtcaaagacaagaaactgaaggtg
accagcctcaagaagggtgtgcagtatgagttccgtgtggcagctgtcaatgctgctggc
acaggacagcccagtgacccctcagagcctgcctttgcccgggaccccaccaaatctcca
ggccaagtgcaggaccttaaagtgagcagcagtgacagcaccagcgtcaccttgacgtgg
aacaaacctgaagtacaagacgggaatgatgtaaaaggctatgaggtggagatgaggccc
tgtaacagcctcagctggaccaagtgcttcaccctccctgcagagagcacctcgtgcagg
gtgcagggcctgcaggcccgggagaagctgttcctgcgcgtcagggccctcggcgacggc
ggccccggggaggcctcggagctcgaggcgtgtgctggagcttctgctgccctggtctct
cccaggttactgatagatgacacagtgaaaagcttcctggttataaaagcagggaatccc
atccgggtgaagattccctttgagggatctcccgagccgctggtgacctggttaaaggat
gggctcccccttcccagccgggctgccgtgagcaccgaggatgggagcagccagctgctg
ctcagggcagccgagctcagtgacagcggcacctacactgtggagcttggggatgggctg
gggaaaagggaaaccttcagcttccaggttcaaattacagatatccctcagccccctgga
gccatccggctggaggagaacgtgcccaacacggtgacagtgacctgggacccctcagca
tctgagcagtgggagaagaacctgtattacactgtcctgaaacgggaatcccagaagggc
ctgtggcatgtgctgggggatctgatctacaacaacaagttcaccttcaccagggtggtc
ccaggcagagattattacttcagggttgtggcaaaaaatgacctgggagccagtgatcca
tcagagactgtgcagccctggaggatctggaaaaaaaaagctgaatttcgagtgaaagca
cagaaatacagagcagtcaaccagaaccagcacccgaggttcctggtgccacttaagtca
cacgtggtggtgacaggcagcgagtgtcacatgagctgtgctgttggaggccatcctcca
ccaaaaatcacatggtacaaggacagcagagacctctccagagatcccaactacttctgc
accaacgactttggagtgtgctccctggtggtgctgggggtcaccaagcacgatgagggg
gagtacatggtggaagccagcaatgaagtgggccgtgccttcagcaaagccttcctcgcc
atcaaagactcctccctgtag
DBGET
integrated database retrieval system
