Vibrio mimicus: AL543_11215 Help Entry AL543_11215       CDS       T04381                                  Name (GenBank) MSHA biogenesis protein MshQ   KO K12287   MSHA biogenesis protein MshQ Organism vmi  Vibrio mimicus Brite KEGG Orthology (KO) [BR:vmi00001]  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    02044 Secretion system [BR:vmi02044]     AL543_11215 Secretion system [BR:vmi02044]  Type II secretion system   MSHA pilus biogenesis protein    AL543_11215 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  DUF6701 DUF7305 Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  AMG03536 LinkDB All DBs Position 2:1070099..1073797 Genome browser AA seq 1232 aa AA seqDB search MNKWLSRAVIGFFAVLSANALAFQDIDNSIYFPAVAQGHGSCNGAPKPQFVQYNSSQITG TNGSPLPFCSINDYPPSGGCDGSVCQVSGNTVPSLNLSGSNAFKTSNVSGSEIDGCSSGQ IIELSKSSMGRIELYRACTLSFSGQSEYKIKLLTMSKGATVSLSSGDYWVESLELNSDSK VIVEGDVRLFIKNNSDWNSAKINVSGSGNITIIGYNNITLNQLTQANAYVYAGGSLTLNN TSVINGRTTSRRLQMEGNTQINQNQQQGLTCFEDDFNRTSLGQNWVPFTSTGSFIPSIVS SRMRLTEALKYEATAVTYQRIFPVAGNVVTVEFDYYAWANLSRVGADGVAIIFSDATITP KTGGFGGSLGYAPLTYSTPIKPGFAGGWLGIGLDEYGNFSNPTEGRTGGPGFRAQAVALR GSESASYRYLTGTGANLSPKLDVRSTSTAGPGHRYKITIDSRSSGAVFVRVDRTYNGTQQ TLIDWYNVLNASGQSAAPEDLLLSLAGSTGSSVNNHEIDNFRVCALKSRPVEPQVDHFRF TLSQQGLTCSTSDVTIKACANENCSQLYTNPVTATLSPDSTPSATGGWVGGSHVTFTNGI VTTQLRRNTAGNVTVNVIGSTPSSKPYQVNLCSYTSSPGNYSTANCTVNFADSGFIVNVP HTYANQTVMGSIKAVRKDNASQQCLPSFQNVQKQVSFWSDYLTPNLSDAGFSVYSVSVNG TGIGQAANVATPLNLSFNQNGEANFTVAYRDAGSLALNARFTGSGNEQDLRLEGQGTFIR VPRALVLSAKNFYSSDGKCPSADLSCAVFARADEAFELNIRAVAAEPNEDNDFTNNLTAY NYQQQNITLQHSLVQPATGVAGELDAESYHHELGATTTVRQKVSEVGVFDFSLVAPSSYL GLNLAAANLPIAVVSTGSIGRFIPAYFAVSPMTVTLDAACKTNNAFTYLGQPFSYTNSPG LYLRPKSANDADTKNYLIEPWWRYTNQWDGRTYSDTVNGVSLGFTNTLAFPVSRQATSNS GIVLSGESVWYEKPLQPKAVFNSEFDLVLNASDLMDQDNVCYRQNATSDCQGFTFTQIDR TMPLYWGKLVIQDVYGPETQPLEQPIYIEHYTSNGFVRTTDDSCTSLSSINNFALQSTDY DVTTTGVPVPPQVLAGLTSSNLSQGKSAIRFSAPGAGITGYIDSILNLNTHDLMWLAEDK NGDGSFDQTTQGRAQFGLYRGSDRVIWWRESN NT seq 3699 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt gtgaataagtggttaagcagagcagttattggtttttttgcagtactgtctgctaatgct ttggcatttcaggatattgataactcaatttattttccggctgttgctcaagggcacggc agctgtaacggtgcgccaaagccacaatttgtgcaatacaatagttctcagattacgggt accaatggttctcctttgccattttgctcgatcaatgattaccctccaagtggggggtgt gatggtagtgtttgccaagtctcaggaaatacagttccatcattaaatttgtctggaagt aatgcatttaaaacatcaaatgtgagcggaagtgaaattgatgggtgttctagcgggcaa atcattgaattatcgaaatcgagtatggggagaattgaactttatagagcctgtacattg agttttagtgggcagtcagaatataaaattaaattactaactatgtcgaaaggtgcgaca gtttccctctcttcaggagactattgggttgaatctttggaattgaattcagatagtaaa gttattgtggagggggatgtccggctttttatcaaaaataattcagattggaatagtgca aagataaatgtttccggctctggaaatataacaattattggttacaacaacattacgcta aaccaactcacccaagctaatgcttacgtttatgcaggtggttctttgacgctcaataac acatcggtgatcaatgggcgtactacaagccgtagattgcagatggaaggtaacactcaa atcaatcaaaaccagcaacaaggtttaacctgttttgaggacgattttaaccgcacttct cttggacaaaactgggtaccgtttaccagtacaggaagttttattccaagcattgtgagt agccgaatgcgcttaactgaagcgctgaaatacgaggcaacggcggtgacgtatcagaga atattccctgttgctggcaacgtggtgacagtagagtttgattactacgcatgggcgaat ttaagtagggttggtgctgacggtgttgccataattttctcggatgcgacgattacccct aaaacgggaggctttggtggctctctgggctatgcaccacttacgtattctactccaata aaaccaggctttgctggtggttggctaggaattggtttagatgaatatggaaacttttca aacccaacggaagggcgtactggtggtcctggatttcgtgctcaagcggtagcgctacga ggttctgagtcggccagttaccgttacttaacgggtacaggggcgaatctttctccgaag ttggatgttcgtagtaccagcaccgctggacccggtcatcgctacaaaataacgatagat tctcgttcctctggtgccgtttttgtgagggttgatcgaacttacaatggcacccaacaa acgctaattgattggtataacgtactgaatgcttcagggcagagcgctgcacccgaagat ctgctgctgtctttagcgggctctacggggtcatcagttaataaccatgaaattgacaat ttcagagtgtgtgcactgaaatcgcgccctgttgaacctcaggtcgatcacttccgtttt actctttcgcaacaaggtcttacctgcagcacatccgatgttacgatcaaagcttgtgca aatgagaattgtagccagctttataccaatcctgtgactgcaaccctctcaccggactct acccctagtgccacaggcggatgggttggtggctcacatgttacttttaccaatggtata gtcacaactcagctacgcaggaacacagcaggcaatgtcactgtgaatgtgattggctca acgccttcgagcaaaccataccaagttaacctttgtagctatacgagttcacccggcaat tattctaccgctaactgcaccgtaaatttcgctgatagtggtttcattgtgaatgtaccc catacctatgctaatcaaactgtgatgggttcgattaaagcggtacgcaaagataacgct tcacagcagtgtttaccgagttttcagaatgtgcagaagcaagtctctttttggagtgat tatttaactccaaacctcagtgatgctggattttctgtttattcggtctctgtgaatgga acgggtattggccaagctgccaacgttgcaacgcctctcaatctaagctttaaccaaaat ggtgaggcgaatttcactgtggcgtatcgagatgcaggtagccttgccttgaatgcaaga tttacaggtagcggcaatgagcaggatttgcggttagaagggcaaggtacttttattcgt gtgcctagagccctagtgttgagtgcgaaaaacttttatagcagtgatggtaaatgtcct tcggctgatctgagttgtgcagtatttgccagagcggatgaagcttttgagctgaatata cgtgcagtggctgctgaaccgaatgaagataatgacttcaccaacaacttaacggcctac aactatcagcaacaaaatatcactctgcaacattcattagttcaaccggcgactggtgtt gcgggcgagctcgatgctgagagttatcaccacgagttaggagctacaacaaccgttagg caaaaagttagcgaagttggtgtgtttgatttctcgcttgtcgccccaagcagttatctc gggcttaatttggccgccgctaatttgcctattgccgttgtatctacaggttccattggt cgctttattcccgcttactttgcggtatcgccgatgacagtgaccttagatgcggcatgt aaaaccaataacgcgtttacctatcttggacaaccatttagctacaccaatagccccggt ttgtatttgcgccctaaatcagccaatgatgcggatacgaaaaactatctgatcgaaccg tggtggcgctacaccaatcaatgggatggccgcacctacagtgatacggtcaatggagtg agccttggttttacgaatacattggctttccctgtaagtagacaggccacttcaaatagt gggatcgtactgagcggggaaagtgtgtggtatgaaaaaccgctgcaacctaaagcggtg tttaattcagagtttgatcttgtgttgaatgcctccgacctgatggatcaagataatgtt tgttatcggcaaaacgcgacatccgattgccagggatttacctttacgcaaattgatcga accatgccactgtattggggaaaactggtgatccaagatgtgtatgggccggaaacccaa ccgctggaacagccgatttatatcgagcattacaccagtaatggctttgtacgcaccaca gatgacagctgtacctcattgtcttctatcaacaactttgcgttgcaatcgacggattac gatgtgacgaccacgggtgttccagttccaccccaagtgttggcgggtttgacttcaagc aatctcagccaaggtaagagcgcaatccgttttagtgcaccgggagccggaatcacaggg tacattgatagcattcttaatctgaatactcatgatctgatgtggcttgccgaagacaaa aatggtgacggcagctttgatcaaaccactcaaggtcgagcgcaatttggtttgtatcgc ggcagtgatcgagtgatctggtggcgcgaatctaattaa

DBGET integrated database retrieval system