Virgibacillus necropolis: CFK40_04360
Help
Entry
CFK40_04360 CDS
T04976
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K03491
probable licABCH operon transcriptional regulator
Organism
vne
Virgibacillus necropolis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vne00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03000 Transcription factors [BR:
vne03000
]
CFK40_04360
Transcription factors [BR:
vne03000
]
Prokaryotic type
Other transcription factors
BglG family
CFK40_04360
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PRD
PTS_EIIA_2
HTH_11
Mga
HTH_Mga
HTH_DeoR
PuR_N
Put_DNA-bind_N
PTS_IIB
DUF7637
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASN04295
UniProt:
A0A221M9H8
LinkDB
All DBs
Position
926078..928048
Genome browser
AA seq
656 aa
AA seq
DB search
MLAHLNKRMLKALKLLSKTNDYLSSIHLSQKMGVTSRTVREDIKNLNHILKEYSIFIDSS
RGNGFKLSNSSGELNTLINQFENVLSDNDFNPIMPEDRVRYMIKKLLYSPESIKIQAFVE
DLYVSESTIKNDIQRAKLILNKYNISISKDNKGLYVEGHELNKRFCISDYLIHSSAIDDR
LILSFINNNSYIISDSDLVKIKSTILYYLNEENMVISDFALKKIAVHIAIVISRIKTGQY
IDLKSEDFSNLTNEGEYRISGEIVKAIGKEFKMSFSQDETVYMTMHLVGNRISQAGGIPT
DLLNYLGEDIYKLSYKILNEVGSWIKEIDLKKEKEFVYSLGLHLKQLLHRLSFNMNIRNP
MLSIIKIKYPLAFEAGVVSAKTIMKETGFQINENEIGFLALHFGVVIEKQRLQTLSTKKK
KIALVCASGMATSELLLTKLSHILGSNYYMIGTYALHQIDELTNQQPDIILTTVPIEEEV
SIPILIVPSILDDSDIDSIKGSLTKLEGETSSISQFIKEDLFFQSLTITTKHEALQFLTE
KMIDKGYINDKIKQSILARENISSTAIGNMVAIPHPLEVEMNQSCICTAILEHEIPWNAG
EDVSIIFIIVLEEKWRPKFQEIFIGLYDIIHSSDNVLTLSKQKNFYDFIGMINSMK
NT seq
1971 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgcttgctcatttaaataagaggatgttaaaagcattgaaattactctccaaaacaaat
gattatctatcaagtattcatttatcacaaaagatgggggtgacttcacgcacagttcgg
gaagatatcaagaatcttaatcatattcttaaggaatatagcatttttattgattcaagc
aggggtaatggatttaagttaagcaattcctctggggagttaaatacattaataaatcaa
tttgaaaatgtgctttcagataatgattttaatccgataatgccagaagatagagtaagg
tatatgatcaagaaattattatattcacccgaaagcataaaaatacaagcgtttgtggag
gatttgtatgttagtgaatcaactataaaaaatgatatccaaagagcgaagttaatttta
aataagtataatatttctatttccaaagataataaaggattatatgttgaaggtcatgag
cttaataaacgcttttgtatttcggattatttaattcacagctccgcaatagacgataga
ttaatattgagttttatcaataataatagttatataatttccgatagtgacttagtaaaa
ataaaaagtacaattttgtattatttaaatgaagaaaatatggttatttcagatttcgca
ttaaaaaaaatagcggtacacattgctattgtaattagtcgcataaagacgggtcagtat
attgatttaaaatcagaggatttcagcaatttaacgaatgaaggcgaatacaggatttcg
ggtgaaattgtgaaggccataggtaaagagttcaaaatgtccttttcacaagatgaaact
gtttatatgacaatgcatttagttggtaacaggatttctcaagcaggagggattccaaca
gatttattaaattatttaggggaagacatttataaactttcatataaaattcttaatgag
gtgggttcttggataaaagaaattgatttaaaaaaagaaaaggaatttgtttatagctta
ggattacatttaaagcaattattgcatcgtttgtcttttaacatgaatattagaaatccc
atgttaagcataataaaaattaaatatcctttggcttttgaagcgggagttgtctctgca
aagactattatgaaagaaacaggttttcaaattaatgaaaatgaaatagggtttctagca
ttgcactttggagttgttattgagaagcaacgattacaaacattgagtacaaagaagaaa
aagattgcattggtttgcgcttcaggtatggctacttcagagctactattaacaaaatta
tcccatatattgggttcaaattactatatgataggaacctatgctttacaccaaatcgat
gaattaacaaatcagcaaccagatataattttaacgaccgtacctatagaagaggaagtt
agtatacctatattaatagtaccatctatcttggatgattcagatattgatagtataaaa
ggttctttgacaaaactggagggggaaacttcaagtattagtcagtttataaaagaagac
ttgttctttcaaagcttaactattacaactaaacatgaagcgttgcagtttttgacagag
aagatgatagataaagggtatattaatgacaaaattaagcaatccatactagcacgcgaa
aatatatcttcaactgcgattggaaatatggttgcaattccacatcctctagaagttgaa
atgaatcaatcatgcatatgcacagcaattctagaacatgagattccttggaatgcgggc
gaggatgtttcaataatttttataattgtgttagaggaaaaatggcggccgaaattccaa
gaaatatttataggattatatgatattatccattcaagtgataacgttcttacgttgagt
aaacaaaaaaatttttatgattttataggaatgataaattccatgaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
