Veillonella nakazawae: VEIT17_10520
Help
Entry
VEIT17_10520 CDS
T06972
Name
(GenBank) 2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase
Organism
vnk
Veillonella nakazawae
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_lig_T4_1
AAA_33
Metallophos
AMP-dom_DIP2-like
Zeta_toxin
KTI12
PAPS_reduct
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBU34606
UniProt:
A0ABM7HC61
LinkDB
All DBs
Position
1172340..1174544
Genome browser
AA seq
734 aa
AA seq
DB search
MRTLLLMRGAPASGKSQWIRDNNLEAYTLEADHFRMLLRSPSLGENGWYISQEDNGPAWE
LLLDCLEKRMSNGDFVVLDATHTTSKAVNAYKELLNKYKYTVYYYEPDTSLEECLARNAT
RTDYKRVPEQVIQRMHKMIKTTTLPKFCRKINSIDEINNYFTVNLTNRYERVRVIGDIHG
CYTALQQAITPWDEKTLYIFCGDYLERGIENKEMMYEMMRLSTLPNTIMLEGNHERHIAN
FAFNSNLDHSKRFMKEVVAPIVKDMTKKDVESLQRELRLFYKSLRQCYPFSFHGKKYLVS
HAGLSYVPNMTFIATSTFINGFGAYETDIAKIYDTNYEKGMCQDFIQIHGHRGVPDGKCS
FCLEGEVEFGGELKYIDITADAFTKNGIKNDVYDKEYMRHEYQNMTQHVIFTQNEDINIL
GNSKLVKVKKCSPNLYSLNFTSRVFHKRLWNENTVQARGLFVDRMTGDVKLRSYNKFFNL
NERPETELNNLANTLSFPVEIRTKENGYLAILGVINDELVFASKSTTEGMHVDLFKNLFQ
KLPTSLQEEIKELLKRNSCSMMFEVISQEDTHIIKYDQDHLYVLDMIQNTLDVNGKHIDV
SFSRERLAELDSILKKYDTQLISIVKTIQQVNTMDELNSIINKELNSHHESEGFVLVDSN
GFMTKFKGPYYNTWKHRRNRILEPYQQNGKIPYENCKNEDDRKFADFLSTLEYDVVCKST
LLNIKEMMERKGLL
NT seq
2205 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaacactattattaatgcgtggtgctcctgctagtggtaagtctcagtggattcgt
gacaacaatcttgaggcttacaccttagaagccgatcatttccgtatgctattacgcagc
ccttcccttggtgaaaacggctggtatatttcacaagaggataatggtccggcctgggaa
ctcctattagattgcttagagaaacgaatgagcaatggcgactttgtcgttttagatgct
acccacactacatctaaagctgttaatgcatataaagaattgcttaacaaatataaatat
actgtatattactacgaaccagatacctcattagaagaatgtttagctcgtaatgctaca
cgaacagattacaaacgagtacctgagcaagttatacaacgcatgcacaagatgattaaa
acaactacattaccaaaattttgtaggaaaataaattctatcgatgaaatcaacaattac
tttactgtaaatttaacgaatcgatatgaacgagtgcgtgtcatcggtgatattcacggc
tgttacacggcattacaacaagctatcactccatgggatgaaaaaacactgtatatcttt
tgtggcgactatttggagcgcggtattgaaaataaagaaatgatgtacgaaatgatgcgt
cttagtacattgcctaatacgattatgttggaaggtaatcacgaacgacatattgcaaac
tttgcattcaattcaaacttagatcattccaaacgatttatgaaagaagtagtggcacct
atcgtaaaagatatgacgaaaaaagatgtagaatcacttcaacgagaattacgcctcttt
tataaatcacttcgtcaatgctatcctttcagctttcatggcaaaaaatatttagtatcc
catgctggtctttcctatgtacctaacatgacctttatagctacctctacctttataaat
ggttttggagcttacgaaacagatattgctaaaatatatgatacaaattatgaaaaagga
atgtgtcaggactttattcaaattcatggtcatcgcggtgttccggatggtaaatgttcc
ttctgcttagaaggagaagtagagtttggtggagaactcaaatacattgatattactgca
gatgcttttactaaaaatggtattaaaaatgatgtgtacgataaagagtacatgcgccat
gaataccaaaacatgacacaacatgtcattttcacgcaaaatgaagatattaatatttta
ggtaattctaaattagtaaaagtaaaaaaatgctcccctaacctatattccttgaacttt
acctcacgtgtattccacaaacgattatggaatgaaaatacagtacaggctcgagggtta
tttgttgatcgcatgacaggagatgtgaaattacgtagttataataaattctttaatctc
aatgaacgaccagaaactgagttaaataatttagctaatactctctccttccctgtagaa
attcgaactaaagaaaatggatacctcgctattcttggtgttattaatgatgagttagtc
tttgcttctaaatctactacagaaggtatgcacgtagatctgtttaaaaatttattccaa
aaactacctacaagcttacaagaagaaatcaaagagttattaaaacgtaatagctgttct
atgatgtttgaagtcattagtcaagaagatacacatattataaaatatgaccaagaccat
ctttatgtacttgatatgattcaaaatacgttagatgtaaatggcaagcatattgatgta
tctttctctagggagcgactagcagaactagattccatccttaaaaagtatgacactcag
ttaatatctattgtaaaaacaattcaacaagttaatacaatggacgaactgaatagcatc
ataaataaggaacttaattcacatcatgagtctgaaggatttgtactagttgatagcaat
ggctttatgacaaaatttaaaggtccttattataatacttggaagcaccgacgtaaccgg
attctagaaccatatcaacaaaatggtaaaattccttacgaaaactgtaaaaacgaagat
gatagaaaatttgcagatttcttgagtacactagaatatgatgtagtttgtaaatccacc
ttactaaatataaaagaaatgatggagcgtaaaggcttgctataa
DBGET
integrated database retrieval system