KEGG   Vibrio neocaledonicus: D3H41_19925
Entry
D3H41_19925       CDS       T06228                                 
Name
(GenBank) tandem-95 repeat protein
  KO
K20276  large repetitive protein
Organism
vnl  Vibrio neocaledonicus
Pathway
vnl02024  Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:vnl00001]
 09140 Cellular Processes
  09145 Cellular community - prokaryotes
   02024 Quorum sensing
    D3H41_19925
SSDB
Motif
Pfam: Big_9 Cadherin_4 Cadherin_5 Big_12 Big_13 He_PIG Cadherin_3 Big_5 Big_6 Gmad2
Other DBs
NCBI-ProteinID: QCO88281
LinkDB
Position
2:complement(699953..709579)
AA seq 3208 aa
MRLRRQVAIAITTAWVSSAFFSGEAWAAQQTINYSNGSGSSFSEVETGVTGGMPSVTLTN
AGAVSMVLDAGNSTDSTPFTGLNDLGFVAGVFFSNTMINEFNNRGFRFFERSSTNFSFDE
ITFMQGSARDSDKTYQLVLTGFSNNTQTVTETVTLPKGGEANSGLQDLFTLTRGTDFTDS
AWQDVDTVTMAFTRSPGADSRYLIKSIKIDDAAVSDSTAPTFVSASSTPTDDATNVSVSN
NIEIAFDENIELKSGNITIRNVTDSRDFEVFNVATESDGTTTSPGAGRISVTNNKVYLNP
TSDLAGNRTYAIHIEFSAVADSANNSFAGISDDATFNFTTVDTTPNAPSTPDLDASSDTG
PLNTDNITSDTTPTFSGISESGSIVTLYSDQVGGSATVIGIGTATGGNWQITTNELASGI
THAISAKASDSDDNVSSASNALSVTIDTIAPSVVSITTPIEADSIVNAAEDNDVLIVGSG
AEAGNSVTVTITDNNSSVSRTVMADNSGNWTLSGSELDVSGLNNGTLTVSATQADIAGNI
STAATQSITLDNAAPSAVTITTPIETDGIVNAAEDNDVLIAGSGAEAGNSVTVTITDNNS
SVSRTVTADNSGNWILSGRELDISGLNNGTLTVSAAQADIAGNTSTAATQSITLDNADPS
SVIITTPIETDGIVNAAEDNDVLIAGFSAEAGNSVTVTITDNNSSVSRTVTADNSGNWTL
SGNELDVSGLNNGTLIVVVTQSDTAGNTSRVTTQSITLDNAAPSAVTITTPIETDGIVNA
VEDNDVLIAGSGAEAGNSVTVTITDNNSSVSRTVTADNSGNWTLSGSELDISGLSNGTLT
VSATQADIAGNTSTAATQSITLDNAAPSVVIITTPIETDGIVNAAEDNDVLIAGSGAEAG
NSVTVTITDNNNSVSRTVTADNTGAWTTIGSEFDVSAFNNGTLTVAASQSDAAGNTSSVD
STTITLDNVRPTVSLSSSDLDLISGETASITFTLSESSSDFTESDVTVTGGSLSNFAGSG
DNYTATFTPDRDSTSTATINVAADFFTDAAGNSNTAAPQLSITVDSLVPSVTISSDKLAL
KADETATITFTLSEASSDFTEADITVSGGTLSGFAGSGSSYTATFTPTEESTTSGTIEVA
TGTFTDASGNTNSAATPLSISVDTVLPTVSITSSSAALKAGETATLTFTLSEAATDFSEA
DVTVAGGTLSNFAGSSASYTATFTPAEESTEDATIDVAAEKFSDAAGNLNTAATQLLISV
DTGIPTGHSISIDQESINKTNEQAMSFTFAAAEVNAMFTYSVTDGTTTIDGASQTISSET
MQVTGIDVTILQEGTLTVSVVVTDAAGNASDAVTDTVTKRYDVAPTVVDDSFSTEEDTAK
QFNLLANDSDVNDDMVASSTTIKTQPIKGQVSISNGVVTYTPNNNETGTDSFTYTVKDAL
LQESQEATVTVTIMAINDAPVAKALTINTDEDTASAAVSARSQAEDVEDGIPTGDLSLVS
LPQKGQVAIDQTVGTFVYTPNPNENGSDSFTYTIADSEGGVSLAATVSVNIGSVNDSPVA
EEDSFTFDEDITSTLDILSNDSDIEDGSFTPSSITLQDLGQGEGVYSFATVSVNVDGTLK
IVPTANVNGQHSFTYMLTDSGQAVSVPATVTLNITPVNDAPVAVDNSAQLLEGGSFEVNV
LGNDSDADVGDSFELTSVTVVDTPAHGSVNVTASGAIVYNPNENYFGGDSFTYTVADLAG
AVSNAATVTMTVTPVNDAPMAQAQSQTLDEDNSLVITLVGSDIDNDDDTLQYLITEQVSH
GVLEQLTNNSWRYTPEADFNGSDFFLFKVNDGDLDSTEVRVDLTVNAVNDTPTATDISAT
GEEEIPLTITLNGNDAEGSSLSYQIVKSPVNGNVTVTGNHAVYTGNSNFFGQDSFTYSVS
DGELTSGVALVTITVNNINDAPVITGTPSAQVDEDSVYQFVPAALDNDPADTLTYLIANK
PPWATFDKTTGALSGTPSNRYVGTYPGIVISVSDGTISSSLSAFSITVNNVNDAPVISGS
PATQVNEDSTYLFTPQVSDVDSQAFTFSIVNKPSWASFDASTGTLSGTPDNGDVGKYQGI
VISVSDGLTTTMLNRFSIVVNNVNDAPVISGTPALTVNEGSTYRFALQASDVDSSSLSFS
IRNKPSWATFDRATGLLSGTPENEHVGSTNNIVISVSDGELSTSLAAFSITVINVNDEPV
AVNDTYVFTESNDGSYLLDVLSNDSDVDLDTLQLEWVKPTSGTATIVGSQIQLVTTSIGT
VAVQYSVKDGNGGKATAKAIVTIKSAKLDAPTIAAPSDIEVNATSLFTKVALGSAVARDS
TGKLLPVSLVDSTTFFRPGTNTVYWRTQDSDGNVAEASQTVTVYPLISISKDAQTTEGTN
HSVSIHLNGPSPSYPVIIPYTVSGSTDSDDHTLTSGEVVIPSGTEGKLSFELLNDGQNEG
VETLVIDLDSTLNLGSKRRYTLTIFEENVAPKVTVSVSQAGEQRSQIENGVEPVTITSSV
SDANMSDIHSFRWSSDSDVLNQAIAGQMYSETLTFSPQLLSSAIYNLQLTVTDNGTPPLS
VTRNVYLEVVQTLAELGGEDSDGDLIPDDQEGHNDSDGDGIPDYLDAISDCNVIQQVVSE
KDRFLIEGQPGVCLRKGITILTNATGGALLLDEELPKDINMKSIGGIFDFVVTNLPLPGQ
SYQLVLPQRLPVPANAVYRKYNAEQGWIDFIEDAQNTVSSSAGEAGYCPPPGHSSWSQGL
TEGDWCVQLTIEDGGPNDDDGLANGSVVDPGVVAARVSNNTLPQAIDDNAFVSLNGTVTI
DVLSNDADGDGLKVSRASVDIGSVSVVDNKLSYVTQPQYYGEALITYSVTDGNGGTGSAK
VTVNVVNSQNPNAVDDNITTDDRTPVTVYVLANDTDPDNDTLKLVSVQAQYGQAVMNADQ
SVTYTPTSGFEGNDVLTYIIQDSQGLQDAGKVIVTVKLVRDVKVENTSAGSLGGIVLMLL
ILLGAMQRYGRNSALALIAVFSFSSQAGWYVDVQMGSSHADERDAVKGDNVISTDNTGLY
RSVGFGYTFSEQWSGTIRYIDMGEGSATLRSATTSPEDYHANVASIAPLLVKGMGFDIGY
KFWQYNSWSAKLSLGGLFWETDIESTYQGSKITTEVDGFDGYIGAEVGYNLSDNWEIGIQ
GARYFLHENDVDIIAVQLRYFFEPLTAY
NT seq 9627 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgagattacgtcgtcaggtagcgatcgcaattacaacagcatgggtgtcctcagcgttt
ttttccggtgaagcctgggctgcacagcaaacgattaactactctaatggttcaggttcc
agttttagtgaggtggagacaggcgtcactgggggtatgccctcggtcactcttaccaat
gcaggtgctgtgtctatggtattagatgccggcaatagcactgatagcactccgtttact
ggcctaaatgacctcgggtttgtagctggtgtttttttctcaaataccatgattaatgag
ttcaacaatcgtggcttccgcttttttgagagatcaagtactaacttcagtttcgacgaa
attacctttatgcaggggtcggcccgagactcagataaaacgtatcaacttgtgttaact
ggcttctctaataatactcaaacagtgaccgaaactgtcaccttgccaaaaggtggtgaa
gcaaactcagggttacaggatttgtttaccctgacccgtggtacagactttactgattct
gcatggcaggacgttgatacagtgactatggcgtttacccgaagtccgggtgctgactct
cgttatcttatcaaaagtatcaagattgatgacgctgcggtttcagactctaccgcgcct
acttttgtcagtgcgagctcaacccccactgatgatgcaaccaatgtttctgttagcaac
aacatcgagattgccttcgatgaaaatattgagctgaagagcggcaatattaccattcgt
aatgttaccgacagtcgcgactttgaagtatttaatgttgccaccgaaagcgatggcaca
acaacatcaccaggcgctggtcgcatcagtgttaccaacaataaagtttacttaaaccca
accagtgatctggcagggaaccggacctacgccattcatattgaattcagtgccgtggct
gacagcgcaaataatagcttcgctgggatcagcgatgatgccacatttaactttacgaca
gtcgataccacgccaaatgcgccatctacacccgatttagatgctagttcggataccggg
ccattaaatactgataatattaccagtgacactacaccaacgtttagtgggatttctgag
agtggatcgatcgttactttatacagtgatcaagtcggtggaagtgcaacggttattggc
ataggcactgctactggaggaaactggcagataacaactaatgagttggcgtctggtatt
acacatgcaataagcgctaaagcgtctgatagcgatgataatgttagctcggcatccaac
gcgttaagtgtcaccattgatacaatagcaccatccgtagtgagcattaccacgccgatt
gaggctgacagtatcgtcaacgctgcagaagacaacgatgtgctgatcgttggctccggc
gcggaagcaggcaacagcgtgaccgtgactatcacagacaataacagctctgtcagtcgt
acggtgatggccgacaactcaggcaactggacgctgagcggcagcgagctggatgtcagt
ggcttgaacaatggtaccctgacggtgtctgcaacccaagctgatatagcaggtaatatc
tccaccgcagccacacagagcattaccctggacaatgcagccccatcagcagtgaccatc
accacgccgattgaaaccgatggtattgtcaatgcggcagaagacaacgacgtactgatt
gctggttccggcgcggaagcaggcaacagcgtgaccgtgaccatcacggacaataacagc
tctgtcagtcgtacggtgacggccgacaactcaggcaactggatattgagcggcagagag
ttggatatcagtggcttgaacaatggtaccctgacggtgtctgcagcccaagctgatata
gcaggtaatacttctaccgcagccacccagagtattactctggacaatgcagacccatct
tctgtgatcatcactacgccgattgaaactgatgggatcgtcaatgcggcagaagacaac
gacgtactgatcgctggcttcagtgcggaagcaggcaatagcgtgaccgtgactatcacg
gacaataacagctctgtcagccgtacggtgacggccgacaactcaggcaactggacgttg
agcggcaatgagcttgatgtcagtggcctgaacaacggcacactcatagttgttgtgacg
caatcggatacggcgggtaatacctccagagtgaccacccagagcattaccttagataac
gccgcaccatcagctgtgaccatcactacaccgattgaaaccgatggtattgtcaatgca
gtggaagataacgatgtgttgattgctggctccggcgcggaagcaggcaacagcgtgacc
gtgactatcacggacaataacagctctgtcagtcgtacggtgacggccgacaactcaggc
aactggacgttgagcggcagcgagctggatatcagtggcctgagcaatggcaccctgact
gtgtctgcaacccaagctgatatagcaggtaatacttccaccgcagccacccagagcatt
accctagacaatgctgctccatctgttgtgatcatcactacgccgattgaaactgatggc
atcgtcaatgcggcagaagacaatgatgtgctgattgctggctctggcgcggaggctggc
aatagtgtgaccgtgaccatcacggacaataacaactcagtcagtcgtacggtgacggcc
gacaataccggggcttggacgactattggcagtgagtttgatgtaagtgcgtttaacaac
ggcaccctgacggtcgcggcgagccagagcgatgcggcgggcaacacctccagtgtagat
agcacaacaattacgttagataacgtgagaccaactgtttctttgagcagctcagacctt
gatttgatctctggcgaaacggcgagtatcacgttcaccttaagtgagtcctcaagtgac
tttactgagtcagatgtcaccgtcactggcggcagtttgtctaactttgcgggcagcggt
gacaattacacggccacctttacgccggatagagacagtacaagtacagcgacgattaac
gtggcggcagatttctttaccgatgctgccgggaatagcaacactgctgcgcctcaactg
tctataaccgttgatagtttagtgccgagtgtgactatctccagtgataaattggcgctg
aaagcggacgaaacggcgaccattacctttaccttaagtgaagcgtcgagcgattttacc
gaggcggatatcacggttagtggcggtactttgtctggttttgctggcagtggtagcagc
tacactgcgacctttacaccaacggaagagagtacgacgagcggtactattgaagttgcc
acaggcacatttaccgatgcctctggtaacaccaatagtgcagctacaccactttccatc
agcgtcgatactgtgcttccaaccgttagtatcactagctccagcgctgcgttgaaagcg
ggtgaaacggcaacactcacgtttaccttgagtgaagccgcaactgatttttccgaagcc
gatgtgaccgtggctggaggaactctttctaactttgcgggcagtagcgccagttacacg
gctacctttacacctgcagaagaaagcactgaggatgcaactattgatgttgcagccgag
aaatttagcgacgcagctggcaacctcaatacagcagcgactcagttgttgatctcagtg
gatacggggatcccgactggacatagcatcagcattgatcaggagagcattaacaaaacc
aacgaacaggcgatgagctttaccttcgcagcagctgaagtgaacgcgatgttcacttat
agcgtgaccgacggtaccacgaccattgacggcgctagtcaaacaatttcttcggagacc
atgcaagtaacgggcattgacgtcactattttgcaagaggggacgttgacagtaagcgtg
gtggtaaccgatgccgcaggcaacgcatctgatgcagtgacggatactgtgaccaaacgc
tacgatgtcgcgccaacggtagttgatgatagcttctcgactgaggaagatacggcgaaa
caatttaatctgttagccaacgattccgatgttaatgatgacatggtcgcttcttctaca
acgattaaaacgcaaccaattaaaggtcaggtgtcgatcagcaacggcgttgttacctat
acgccaaataataatgagacaggcacagatagctttacctataccgtgaaagatgccctg
ctgcaggagtcgcaagaggcgacagtgaccgtcactatcatggctataaatgatgcgcca
gtcgctaaagcgctgaccatcaacaccgacgaagataccgcaagcgcagcagtcagcgcg
cgtagtcaagcggaggatgttgaagatggcatcccaacgggtgatttatcgttagttagt
ttgcctcaaaaaggacaagtagccattgatcaaactgtaggcacttttgtatatacgccg
aatccgaatgaaaatggtagcgatagctttacttacacgatcgcagacagtgaaggcggc
gtttctcttgcggccacggtcagcgtcaatatcggttccgtcaatgactcaccagtagcg
gaggaagacagttttacttttgatgaagatatcacatcgacactcgatattttaagtaac
gacagtgatattgaagatgggtcattcaccccgagtagtattaccctgcaagatcttggt
caaggagagggggtatacagttttgccacggtcagtgtcaatgtcgatgggaccttaaag
attgtgccaacagcgaacgttaatggtcaacatagctttacctacatgctaaccgatagt
ggtcaagcagtctcagtgcctgcaaccgtcacgctcaatattacgccagtgaatgatgcc
cccgttgctgttgataacagtgcacaactactagagggaggctccttcgaggtcaatgta
ttaggcaatgatagtgatgccgatgttggagacagttttgaactcactagtgtcacagtc
gtcgatacgccagcacatggcagtgtgaacgtgacggcgtcaggagcgattgtttacaac
cccaatgagaactacttcggtggagatagcttcacctatacggtggcagacttagcaggt
gctgtatctaacgccgcaacagtgaccatgacagtaacaccagtcaacgacgcaccaatg
gcgcaagcacagtcacaaacgcttgatgaagacaatagtttggtgatcacgctggttggt
tcagatattgataacgatgatgacactctgcagtatcttatcactgagcaagtcagtcat
ggcgtgctagagcagttgaccaataatagttggcgctatacaccagaagcggacttcaat
ggctccgacttcttcttgttcaaggtcaacgacggtgatctcgactcgacagaggttcgt
gtcgatttgacggttaatgcagtcaacgatacaccaaccgcgaccgatatcagtgctacg
ggagaggaagaaataccgctgaccattactttaaatggtaacgatgcagaaggctcatct
ttgagctaccaaattgtaaaatcgccagtcaacggtaatgttaccgtcacaggcaatcac
gcggtttatacgggtaacagtaacttctttggtcaggacagtttcacttacagcgtaagt
gacggagaacttacctctggagtggcgttagtgaccatcacggtgaataacattaatgac
gcgccagtgattacgggtaccccatcggcgcaagttgatgaagatagtgtgtatcagttt
gtgcccgcggcattggacaatgacccagcggatactctgacctacttgatagctaacaag
ccaccttgggctacatttgacaagacaacaggagcgctttctggcacgccaagtaaccgt
tatgtggggacttatccaggtatcgtgattagcgtatccgatggcactatttcttcctca
ttgtcagctttttcgattactgtgaataacgttaacgatgcacccgttatctctggttca
ccagcaacacaagtgaatgaagacagcacctatctgttcacgccacaagtgtcagatgtt
gacagccaagccttcaccttcagtatcgtgaacaagccatcttgggctagctttgatgca
tcaacaggcacgcttagtggtacaccagataatggtgatgttggcaaatatcagggcatt
gttatctcggtttctgatggtctcacgaccacaatgctcaatagattcagtattgtggtt
aacaatgtcaatgacgcgccagtgatcagtggcactcctgctcttaccgtcaacgaaggc
agtacgtaccgctttgcgctgcaggcatcggatgttgatagtagtagcttgagcttttca
atccgcaataaaccatcatgggcaacctttgatagagcaactgggttgctaagtggtacg
ccggaaaatgagcatgttggcagcaccaataatattgttattagtgtctcagacggtgag
ctaagcacatctttagcagcgtttagcatcacggtaatcaacgttaatgatgagccagtg
gcggttaatgatacctatgtctttaccgagagtaacgatggtagctacttattggatgta
ctcagcaacgacagcgatgttgatctagatacattacaactggaatgggttaaacctaca
tctggaacggcaacgattgtgggcagtcaaatccaattggtaacgacctcaattggtaca
gtggcagtgcaatacagtgtgaaagatggtaacggtggaaaggccaccgcgaaagcaatc
gtgacaattaaaagtgcgaaattggacgcaccaacaatagccgcaccttcagatatcgaa
gtgaacgcaacttcgctctttactaaagttgcattaggctctgctgtggcacgagatagt
acaggcaagctattacctgtttcattggtcgacagcacgacctttttccgacctggaact
aatacggtctattggcgcactcaagactctgatggaaacgtcgctgaagctagtcaaacg
gtaacagtgtatccactgataagtatctccaaagatgcgcaaaccacggaaggcaccaat
catagcgtatcgatacaccttaacggtccttcgccgagctacccagtaatcataccttat
acggtttcaggaagcacggacagtgatgaccacacgctcacctctggtgaagtggtgata
cctagtggtaccgaaggcaaactttcgttcgaactacttaatgatggacaaaatgagggc
gttgaaaccttagtgattgatctggacagcacccttaatctaggtagtaagcgtcgttac
accttgacaatctttgaagagaatgtggctccgaaggtcacggtaagtgtatctcaggcg
ggggagcagcggagccaaattgaaaatggtgttgaaccggtcacaatcacgagcagtgtt
agtgatgccaatatgtccgatatacacagtttcagatggagtagtgatagcgatgtactt
aaccaagcgattgcggggcagatgtacagcgaaacattgactttctctccgcaattactg
agttcagcgatttacaatttgcaattgacagttactgacaatggcactccaccattatca
gtgacacggaatgtctatttagaagtggtacaaacattggcggagctcgggggtgaagac
agtgatggcgacttaatcccggatgatcaagaaggtcataatgatagtgatggtgatggt
atccctgattatcttgatgcaatttctgactgtaacgtaattcaacaggttgtgtcagaa
aaagatcgcttcctcattgaggggcagccaggtgtctgtttacgcaaaggaataaccatt
ctgactaacgcaacaggaggagctttattgctggatgaggagcttcctaaagatatcaac
atgaagagcatagggggaatctttgattttgtagtaactaatttgccgctgcccggccaa
agctatcaattagttttgcctcagcgtttacctgttccagcaaatgcagtgtaccgaaag
tataacgctgaacaggggtggatagactttattgaggatgctcaaaacacggtttcttct
agtgctggcgaggctggttattgtccgccaccagggcacagttcatggtcacagggtctg
actgaaggtgactggtgtgtacaacttaccattgaagacggtggtccgaacgatgatgac
ggattggctaatggcagtgtcgttgaccctggcgtcgttgccgctcgtgtaagcaataat
acactccctcaagcgattgacgacaatgcgtttgttagtctcaatggtacggtgacgatc
gatgtattgagcaatgatgctgatggtgatgggctgaaggtaagtcgcgcttctgtagat
attggtagtgttagtgtggttgataacaaactaagttatgtcactcaaccacagtactac
ggggaggctttgatcacttatagcgtaacggatggtaatggtggaacgggatcggcgaag
gtgacggtaaatgtggtaaacagtcagaatccgaatgcggtggacgataatattaccacc
gatgatcgtacccctgtcacggtttatgtccttgctaacgataccgatccggataacgac
acactgaagttggtttcagtccaagcgcagtatgggcaggcggtcatgaatgcagatcag
agcgtgacctatacccctacctcagggtttgaaggcaatgatgtgttgacatatatcatt
caggatagccaaggcctgcaagacgcggggaaagttatagtgaccgttaagttggtaaga
gatgtaaaggttgaaaatacttcagcaggatcattgggtggcatagtgttgatgcttttg
attttgttaggagccatgcaacgttatggaagaaacagtgctttagcactaattgctgtg
tttagttttagtagtcaagcgggttggtatgttgatgttcaaatggggtcaagccatgca
gatgagcgtgatgctgttaaaggtgataacgtaatctctactgacaacaccgggctctat
cgctctgtcgggtttggatatactttttctgagcaatggtctggaactattcgttatatt
gatatgggtgaaggtagtgctacattgcgtagtgctactacttcaccagaagactatcac
gccaatgtcgcatcgatagcaccacttcttgttaagggcatgggcttcgacatcggttat
aagttctggcaatacaattcatggtccgcaaaactgagtttggggggcttgttctgggaa
accgatattgaaagtacgtatcaaggcagcaagataacgacggaagtggatggttttgat
ggatatattggtgcagaagttggctacaacctctcagataattgggagatcggtatccaa
ggcgctcgttattttttacatgaaaatgatgttgatataattgcggtacaacttcgttat
ttttttgagccgttaacagcgtattaa

DBGET integrated database retrieval system