Vibrio neptunius: KW548_00355
Help
Entry
KW548_00355 CDS
T08906
Name
(GenBank) translocation/assembly module TamB
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
vnp
Vibrio neptunius
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vnp00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
vnp02000
]
KW548_00355
Transporters [BR:
vnp02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
KW548_00355
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
TamB_N
TamB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QXX06658
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(83170..86922)
Genome browser
AA seq
1250 aa
AA seq
DB search
MTKVVLKWSKRLSISLFSFLVVIAIALAAVLFTTPGLKIVLWGAEKFVPQLKIESYSGAI
FPRFTLNGVVFKDDSLNVDVQARSITLAVNAACLTEPSVCVDELAVDGLKFDMPELPQSS
TTPEEPVADESGPVTVPIPIKVKRVALTDMSLDILGHQIKWQSFTTGLAFQGNRLRINQT
AFDSIRVALAPSDASEPAPAARDTNAPIVLPNITLPLQIDVVRLDVNDFELQQPTPVVVN
HLGLEASAAGSQVQVDTLALDMPEIEGVLSTTVTLSDDYPLELELNAKVKQEIADGQTVK
LHATGSVAELTLKADFGGLAKAHLEAALQPLNAEFPFELTLSDGDLQWPLKGQGDYFATI
RNLHTQGSLNGYSVELDSALKGSQLPDADLTLHGKGDLNQIDLQSLSIQILGGEVSGTVM
ANWQAPINWAANLSLKDIQPGLQWQQAEGNISGKFATTGSLTEQGGWQVKLPTLDIDGVL
RDYPLNIEGALSASDKAGTGELKIDTPRLVLSHGPNHLTAKGDVEQNLNMQLAVDFPDIA
KSVPDLRGSARGQIRLTGKLDKPLVGVDLNVKAIKWQQDVQVEDVSLQGQISPLPLPSGE
LQLRVARAKYQDYLIDKVLLNFDGEQQQHALTLDLESNIASTKLAIKGALQDKPELMWKG
ALERMSLTSEQGMWNLNQPTQLEFLIDSQQAFVAAHCWLQADASICLDQDVNAGQSGEAH
LSIKQFDFDQLKALVPQTIKLEGGVNATAMAKWAPEQAPQIMIKLEMPKGSVTQHNEQPV
HLGWESLKLNAHLENNKLEADWLLDVTDNGDISGEIHIPDVLAKDKQLDGKLGLTTFHLD
FLAPLLGDYSKMKSNVSTDLTFSGPMMHPKVYGQFVVDDILLEGEITPVEIDSGKLSLSF
SGYDATLAAMINTPDGKLEAAGDANWQDLKDWQTSVRVFAEELLVDMPPMVKIKVVPDMT
ISASPKQAQIDGKISLPWGRIVVEELPPSAIGISKDQVILDDQLQPQNETTSVPFSVQTN
ININIGEDFKLSAFGLEGGLSGNLNVAQRDKGPFVTGEVNIVDGSYRSFGQDLLIKQGKV
LMNGPVDQPYVQITAVRNPDNTRDEVTAGVRVTGPVDEPTVTIFSEPAMPQANALSYLLR
GQNIDGESGSSSMTTTLIGLSLAQSGRVVGEIGQAFGVQDLQLDTSGSGDDSQVTVSGYV
LPGLQVKYGVGIFDSVGEFTVRYRLMQDLYVEAVSGLDRAVDLLYQFEFN
NT seq
3753 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaccaaggttgttttaaaatggtcaaagcggctgtctatctcattgttcagctttttg
gtggtgattgccattgccctagctgcagttctttttacaactccgggtcttaaaatagta
ctctggggagcagaaaagtttgtacctcagttgaaaatcgagtcctattcaggggcgatt
ttcccgcgctttacgcttaatggtgtcgtgtttaaagacgactcacttaacgtcgatgtg
caggctcgctcaatcacgttggcggttaatgctgcttgcctgacagagcccagtgtttgt
gtcgatgaactcgcggtagatggccttaagtttgatatgccggaattaccgcagagcagc
acgacgccagaggaacctgtggctgacgaaagtggaccagtgacagtgcctatacccatt
aaagtcaaacgcgtggccttaaccgacatgtccctggatattctaggtcatcagatcaag
tggcagtctttcacgacagggttggcctttcagggtaatcgtctacgaattaatcaaacg
gcgttcgactccattcgagtggctctggcaccaagtgatgccagtgaaccagcccctgct
gcgagggacactaacgccccgatagtcttaccaaacattaccttaccgctacaaattgat
gtagtgcgactggatgtgaatgattttgagttgcaacaacccactcctgtagtcgtaaac
catttggggttggaggcaagtgccgctggatcccaagttcaggttgatactcttgcattg
gatatgcccgaaatcgaaggtgtgcttagtacaacagtgaccttatcagatgactatccg
ttggagttggaactgaatgccaaagtgaagcaggagatagcggatggacagacagtcaaa
ctgcatgcgacgggaagtgttgctgaactgacgttaaaggcagacttcggcggtttagct
aaagctcatcttgaagctgcattgcagccactgaatgccgaatttccttttgaactgact
ttgagtgatggtgaccttcaatggccgttgaaaggccaaggtgattattttgccacaata
cgcaacttgcatactcaaggctcgctaaatggctacagtgttgaactcgattcggctctg
aaaggcagtcaattgcctgatgctgacctgactctgcatggcaaaggggatttaaaccaa
atcgatcttcagtccctctctatacaaatcttaggtggggaggtgagtggtacggtgatg
gccaattggcaagcgccgattaactgggcggctaacctttcactgaaggacattcaaccg
ggcctacagtggcagcaggcagaagggaatattagcggcaagttcgccactactggttca
ctgacggagcaaggtggttggcaggttaagttaccaacattagatattgacggcgttttg
cgagattacccgctgaacatagaaggtgcgttgtctgcttccgataaagcgggcactggt
gaactcaaaattgatacgccacgcttagtcttatctcatggaccgaatcatctgacggca
aaaggtgatgttgaacaaaacctaaatatgcagcttgccgtcgactttccggatatcgct
aaatccgtccctgatttaagaggtagcgctcgaggtcagattaggctgactggtaagttg
gataaacctttggttggtgtggatcttaatgtgaaagccattaagtggcagcaagatgtg
caggtagaggatgtttcgctgcaagggcagatctctccactgcctttaccttctggtgaa
ttgcagctcagagttgccagagccaaatatcaagattatctgattgataaagtgttatta
aattttgatggcgagcaacagcagcacgcattgactcttgatcttgagtcaaacatcgcc
tcaacgaaattggcgattaaaggtgcgttgcaagataagcctgagttgatgtggaaaggt
gcgctggagcgtatgtcgttgacctcagagcaaggtatgtggaacttgaatcaaccgact
cagttagagtttctcattgactcacagcaggcattcgttgcggcgcattgttggttacaa
gccgatgcttcgatctgtctcgatcaggatgtaaacgccggccaaagtggcgaagcgcat
ctttccatcaaacagttcgattttgatcagcttaaagcgttggtgcctcaaacgattaaa
ttagagggtggagtgaatgctactgcgatggctaagtgggcaccagaacaagcgccacag
atcatgatcaagttagaaatgcccaaaggctcggtaacgcaacataatgagcagcctgtc
catcttggctgggagtcactcaaacttaatgctcatcttgagaacaacaaacttgaggct
gactggttactggatgtgacagacaatggagacatttcaggtgagatccatatccctgat
gtgttagcgaaagacaaacagctggatggtaagcttggcttaacgactttccacttggat
tttcttgctcctcttcttggcgactatagcaagatgaaatctaatgttagtaccgattta
acattttccggccctatgatgcaccctaaagtttatggccagtttgtggtcgatgatatt
ttgcttgaaggggaaatcacacccgttgagattgattcgggtaaactgtccctcagtttc
tcgggctatgacgccacactcgcggcgatgatcaatacacctgatggtaagctggaagct
gccggagatgctaactggcaagatctcaaagattggcagacgagtgttcgggtttttgcc
gaagagctgttagtggatatgccgccgatggtgaaaatcaaggttgtgccagatatgacg
atatcggcttctcctaagcaagcccagatcgatggtaagatttctctgccttggggacgc
attgtggttgaggaactgccgccaagcgcgattggaatatcgaaggatcaggttatccta
gatgatcagcttcagccccaaaatgaaaccactagcgtaccgtttagtgttcagacaaac
attaacatcaatattggtgaggacttcaaactttcagcttttggtttagagggcggttta
tcgggaaacctcaatgttgcacagcgtgataaagggccgttcgtcactggcgaagtgaat
attgtcgatggttcctaccgctccttcggccaagatttgttaatcaaacaaggcaaagtt
ctgatgaatggtccggtggatcagccttatgtgcaaattaccgcggtgcgtaaccctgac
aacactcgagatgaggtaacggcaggtgttcgagtcactgggcctgttgatgaacctacc
gtcactattttctctgaacctgcgatgcctcaggccaatgcactatcttatttgctgcgt
ggccaaaatattgatggtgaatcaggcagtagctccatgacgacgacgttgattggtttg
agcttagctcaaagtggtcgtgtcgtcggagaaattggccaagcttttggtgttcaggat
cttcagttggatacctctgggtctggtgatgattcacaagtgaccgtgagtggttacgtt
ctaccgggtctgcaggtcaaatatggagtgggtatctttgactctgtgggcgaatttacg
gtgcgttatcgactgatgcaagatctctatgttgaagctgtatcaggtctggacagagca
gtcgatctgctgtatcaatttgaattcaattga
DBGET
integrated database retrieval system
