Vibrio neptunius: KW548_11925
Help
Entry
KW548_11925 CDS
T08906
Name
(GenBank) Ig-like domain-containing protein
Organism
vnp
Vibrio neptunius
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_2
PapD_N
Ig_NUP210_5th
Lcl_C
InvE_AD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QXX05865
LinkDB
All DBs
Position
1:2503296..2508377
Genome browser
AA seq
1693 aa
AA seq
DB search
MDKQFNFKGLLLLMALALMAQFTSGCDGSGGGSDSTPSSKPNQQQDEVTAELELERLTLT
PFPVKTKGTSELTLIMGHKQSFLAVAEYSNGQSQVLTKELTIDDWQSSDTEVGEFIQSGV
LQSKDAGVVTVSFTKGNLTSNSVEVAVADAAITDIVITPSVMKVAKGHVQQVTATAIYSN
GLSMNVSDSVTWTSDDTSIATITSLNDYSLVKGDGIGSTALTAFKDGVTSNTVDVEVTNA
VITAINVTPSLVNIAKGQNKTLTATAIYSDNTSSNISDSVTWAPVDSSIANVTASGLLSG
VKAGMTNLTAKKDGITSNEVGAVISDAVITSISVTPPTITLAKGQTQTLTATAIYSDNTS
ANISDSVTWKPNDTNTALVSSNGVLSGSNVGTTTLVAVKDSVTSNTIDIDVTDAVITEIS
VMPSVVNIAKGQRQTLRAIATYSDSTSSDISDSVTWVPVDAKTATVNASGVLSGSTPGTT
TLTVFKDGVTSNTVDVEVTNAVITAINVTPSLVNIAKGQNKTLTATAIYSDNTSSNISDS
VTWAPVDSSIANVTASGLLSGVKAGMTNLTAKKDGITSNEVGAVISDAVITSISVTPPTI
TLAKGQTQTLTATAIYSDNTSANISDSVTWKPNDTNTALVSSNGVLSGSNVGTTTLIAVK
DSVTSNTIDIDVTDAVITEISVMPSVVNIAKGQRQTLRAIATYSDSTSSDISDSVTWVPV
DAKTATVNASGVLSGSTPGTTTLTVFKDGVTSNTVDVEVTEAVITAINVTPSLVNIAKGQ
NKTLTATAIYSDTTSSNISDSVTWAPVDSNIANVTASGLLSGVKAGMTNLTAKKDGITSN
EVGAVVSDAVITSISVTPPTITLAKGQTQTLTATAIYSDNTSANISDSVTWKPNDTNTAL
VSSNGVLSGSNVGTTTLIAVKDSVTSNTIDIDVTDAVITEISVMPSVVNIAKGQRQTLRA
IATYSDSTSSDISDSVTWVPVDAKTATVNASGVLSGSTPGTTTLTVFKDGVTSNTVDVEV
TNAVITAINVTPSLVNIAKGQNKTLTATAIYSDTTSSNISDSVTWAPVDSSIANVTASGV
LSGAKVGMTTLTAIKDGVTSNEVGAVISDAVITSISVTPPIITLAKGRTQTLTATAIYSD
NTSANISDSVTWKPIDTNTALVTSNGVLSGSNVGTTTLIAVKDSVTSNTIDIDVTDAVIT
EISVMPSVVNIAKGQRQTLRAIATYSDSTSSDISDSVTWVPVDAKTATVNASGVLSGSTP
GTTTLTVFKDGVTSNTVDVEVTNAVITAINVTPSLVNIAKGQNKTLTATAIYSDATLSDV
SDSVTWAPVDSNIANVTASGVLSGAKVGMTTLTAIKDGVTSLTVDVKVSDAVLTSISVTP
TKISLAKGQNRALTATATYSDNTTSNISRSVNWVPVNTRVVNVDSSGKATGVGIGTTTVT
AVKDGFASNVASVKVTNAVMTKLTVNPPAVGLMPNGTQQMRATATYSDGTLIDVTNSVSW
SASQGNTISLTAGGFVTGLNSGTSSITARYKTFGQITKVNVCTSTSNRSPDGKCIYTLNV
GNNNLFTNSPSVAYLDSLGIGGSGYTSGVHRFIRMGDYYKFNHTKAVALCNKYSEFNLAG
RTNWRLPTVSEIKDIYKKNNHVKGWNNTLYYWTSSKQGPSSYYAYKYIPARPGHSWVARN
PSDMLFAACLSNP
NT seq
5082 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggacaagcaatttaactttaagggtttgttgctcctcatggcgttagccttaatggcg
caattcacctctggttgtgatggttcaggaggaggcagcgactcgacaccctcttcaaaa
ccaaaccaacaacaagatgaggttactgccgagttagagttagagcgactgactcttacc
ccctttccggtcaaaaccaagggaacgagcgaactaacccttattatgggccacaagcaa
tcttttctcgcggtggctgaatactcgaatggtcaatctcaagtgttgaccaaggaatta
actattgatgattggcaatccagtgacacagaggtgggtgagttcattcaatccggagtt
ttgcagagcaaagacgcaggcgttgtgactgtttctttcaccaaaggtaacctaaccagt
aactcagtggaagtggctgttgccgatgccgccatcacagatattgtcattacaccttca
gtgatgaaagttgccaaaggtcatgtccagcaggtaaccgccaccgcgatatacagcaac
ggtctttcgatgaacgtcagcgactctgtcacttggacatcggacgatacgtccatagcg
acaattacatcgctgaacgattacagcttagtcaaaggtgatggtatcggttctactgcc
ctcaccgcatttaaagacggggtcaccagtaatacggtcgacgtagaggtgaccaacgca
gtgatcaccgcgattaacgtgactccatcactggtcaatatcgccaaaggacaaaacaaa
accttgaccgccaccgctatctacagtgataacacctcttcaaacatcagcgattcggtc
acttgggcccctgttgattccagtatcgctaacgtcactgcaagcggattattatcaggt
gtcaaggccggcatgactaaccttacagcaaaaaaagatggcatcaccagcaacgaggtg
ggagcagtgatcagcgacgccgttatcaccagcattagcgtcaccccacccacaatcact
ctcgcaaaaggacaaacccaaaccttaaccgccaccgccatctacagtgataacacctct
gccaatatcagtgattcagtcacttggaagcctaacgataccaatactgctttggtgagt
tcaaacggggttttgtctggcagtaatgtcggtaccaccaccctcgtcgctgtaaaagat
agcgtcaccagcaataccattgatattgacgtcaccgatgctgtcatcacagagatcagc
gtgatgccctctgtcgttaatattgccaaagggcaaagacaaacattgagggccatcgcc
acctacagcgatagcacctcatcggatatcagcgattctgtcacttgggtgcctgtcgat
gccaagaccgcgacggtcaacgctagcggagtattgtctggtagcactccgggcacaact
acccttaccgtatttaaagatggggtcaccagtaacacggtcgatgtcgaagtgaccaac
gcagtgatcaccgcgattaacgtgaccccatcactggtcaatatcgccaaaggacaaaac
aaaaccttgaccgccaccgctatctacagtgataacacctcttcaaacatcagcgattcg
gtcacttgggcccctgttgattccagtatcgctaacgtcactgcaagcggattattatca
ggtgtcaaggccggcatgactaaccttacagcaaaaaaagatggcatcaccagcaacgag
gtgggcgcagtgatcagcgacgccgttatcaccagcattagcgtcaccccacccacaatc
actctcgcaaaaggacaaacccaaaccttaaccgccaccgccatctacagtgataacacc
tctgccaatatcagtgattcagtcacttggaagcctaacgataccaatactgctttggtg
agttcaaacggggttttgtctggcagtaatgtcggtaccaccaccctcatcgctgtaaaa
gatagcgtcaccagcaataccattgatattgacgtcaccgatgctgtcatcacagagatc
agcgtgatgccctctgtcgttaatattgccaaagggcaaagacaaacattgagggccatc
gccacctacagcgatagcacctcatcggatatcagcgattctgtcacttgggtgcctgtc
gatgccaagaccgcgacggtcaacgctagcggagtattgtctggtagcactccgggcaca
actacccttaccgtatttaaagatggggtcaccagtaacacggtcgacgtagaggtgacc
gaagcagtgatcaccgcgattaacgtgaccccatcactggtcaatatcgccaaaggacaa
aacaaaaccttgaccgccaccgctatctacagtgataccacctcttcaaacatcagcgat
tcggtcacttgggccccggtcgattctaatatcgccaacgtcactgcaagcggattatta
tcaggtgtcaaggccggcatgactaaccttacagcaaaaaaagatggcataaccagcaac
gaggtgggcgcagtggtcagcgacgccgttatcaccagcattagcgtcaccccacccaca
atcactctcgcaaaaggacaaacccaaaccttaaccgccaccgccatctacagtgataac
acctctgccaatatcagtgattcagtcacttggaagcctaacgataccaatactgctttg
gtgagttcaaacggggttttgtctggcagtaatgtcggtaccaccaccctcatcgctgta
aaagatagcgtcaccagcaataccattgatattgacgtcaccgatgctgtcatcacagag
atcagcgtgatgccctctgtcgttaatattgccaaagggcaaagacaaacattgagggcc
atcgccacctacagcgatagcacctcatcggatatcagcgattctgtcacttgggtgcct
gtcgatgccaagaccgcgacggtcaacgctagcggagtattgtctggtagcactccgggc
acaactacccttaccgtatttaaagacggggtcaccagtaacactgtcgatgtcgaagtg
accaacgcagtgatcaccgcgattaacgtgaccccatcactggtcaatatcgccaaagga
caaaacaaaaccttgaccgccaccgctatctacagtgataccacctcttcaaacatcagc
gattcggtcacttgggccccggtcgattccagtatcgctaacgtaaccgcgagcggagtg
ttgtcgggagccaaggttggaatgaccaccctcaccgcgataaaagatggcgttaccagc
aacgaggtgggcgcagtgatcagcgacgccgttatcaccagcattagcgtcaccccaccc
ataatcactctcgcaaaaggacgaacacaaaccttaaccgccaccgccatctacagtgat
aacacctctgccaatatcagtgattcagtcacttggaagcctatcgataccaatactgcc
ttggttacttcaaacggggttttgtctggcagtaatgtcggtaccaccaccctcatcgct
gtaaaagatagcgtcaccagcaataccattgatattgacgtcaccgatgctgtcatcaca
gagatcagcgtgatgccctctgttgttaatattgccaaaggacaaagacaaacattgagg
gccatcgccacctacagcgatagcacctcatcggatatcagcgattctgtcacttgggtg
cctgtcgatgccaagaccgcgacggtcaacgctagcggagtattgtctggtagcactccg
ggcacaactacccttaccgtatttaaagacggggtcaccagtaacacggtcgatgtcgaa
gtgaccaacgcagtgatcaccgcgattaacgtgaccccatcactggtcaatatcgccaaa
ggacaaaacaaaaccttgaccgccaccgctatctacagtgatgccaccttgtcagatgtg
agtgactccgtcacttgggccccggtcgattctaatatcgccaacgtaaccgcgagcgga
gtgttgtcgggagccaaggttggaatgaccaccctcaccgcgataaaagatggcgttacc
agcctcacagtagacgttaaggtcagtgacgcagtgctcaccagtattagtgtgacaccg
accaagatatcactcgccaaagggcaaaatcgagcattgacggccaccgccacctacagt
gataacactacctccaacatcagtcgctctgtcaattgggtgccagtcaataccagagtc
gtaaacgtagactctagtgggaaagccaccggagtgggcataggtaccaccacagtgacc
gccgtaaaagacggctttgcgagcaacgtagcctcagtgaaagtcactaacgcggtgatg
acaaagttaactgtaaacccgcccgctgtcgggttgatgcccaatggtactcagcagatg
agagccactgccacatacagtgacggcaccttgatcgatgtaactaattccgtcagttgg
tcggcatcacaagggaataccatttcattaactgccggaggcttcgtcacagggctcaat
tcagggacgagcagcattacggctagatacaaaacttttggacaaataactaaggttaac
gtatgcactagcactagtaatcgtagtccagatggtaagtgtatttacaccttgaatgtc
ggcaacaataatttgtttaccaactccccatctgtcgcttacttagacagcctaggcatc
ggtggaagtggttatacaagtggtgtgcatcgttttattcgtatgggagactattacaaa
ttcaaccacactaaggcggtagcactatgcaataaatacagcgaatttaatcttgcgggg
cgcactaactggagattaccgacagttagtgaaatcaaagatatatacaaaaaaaataat
cacgttaaagggtggaataataccctctattactggacctcaagtaaacagggcccatca
tcgtattatgcgtataagtacataccagctcgacctgggcattcatgggtagcccgtaac
ccatcagacatgctcttcgccgcctgtctttctaatccatag
DBGET
integrated database retrieval system