Vibrio navarrensis: IF132_00545
Help
Entry
IF132_00545 CDS
T07785
Name
(GenBank) diguanylate cyclase
Organism
vnv
Vibrio navarrensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
GGDEF
PAS_3
PAS_9
PAS
PAS_8
PAS_4
PAS_11
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QOD68015
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(113431..115446)
Genome browser
AA seq
671 aa
AA seq
DB search
MDKWAVQRGRSLALSLVVMVILTTSLVIASYAFYTYQHRTEMLEEEILSQALESAERLSR
AIASDLQTGHLADYSLFLQTEMSTANHKALLAILLEASQLESAFEPPFSTFGLVKMPTGE
VREFISSQDDHLLASSQFFQQRDIRSAEGALLGHVKVYGSGEELGQEKRSLLLNSLLTAL
GLLLMQTVISATLIQWILTRPLQRITNTLVKRDADGLPTAKVHSSSYTELSVLTDTVNEM
LKVICKTRDTLRSQRERLENVIEGTDAGTWYWNIQTGKTEFNPRWAEIIGYQLHELEPIS
IQTWLDHLHPEDVKKSEEKLQAHFAGEHEYYQCEVRMRHRDGHWVWVMDRGKVALWDESG
KPLEMFGTHIDISEDRAREQQLALAADVYKYVREGILIANSRGLIVDVNRAFSQITGYSR
EEVIGQSPKMLKSGIHDRAFYHNIWKDLHLEGCWRGEIWNKRKNGEIYPELLTISRVSDA
VEEVRYVALFSDISALKEHEYHLEKIAHYDALTKLPNRLLLQERLNTSMLNAKKYGRAIA
LLFIDLDGFKDVNDQYGHTAGDEVLCVMAQRMKTITREEDTLARFGGDEFIVILSDIDDK
HRTTQIVTRLLSSIAKPLHVSGYEMSLSASIGISLYPENRDISADTLIQQADQAMYQAKL
AGKNGYYFYQA
NT seq
2016 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggataaatgggctgtgcaacgggggcgttctttagcgttgagtttggtggtcatggtg
atcttgaccacatcattggtcatcgccagttacgctttttatacctatcaacatcgcact
gagatgcttgaagaggagattttgagtcaagctctggagagtgcagagcggctaagccgt
gcgattgctagcgatttgcaaaccggtcatcttgctgattattcgctctttttgcaaaca
gaaatgagtaccgcgaatcataaagcgctgctcgccatcttgctggaagcttctcagtta
gaatccgcctttgaaccgcctttctcaaccttcggtttggttaaaatgccaacgggtgaa
gtgcgtgagtttatatctagccaagatgatcacttgcttgcttcttcacagtttttccag
cagcgagacattagaagcgcagagggtgctttgctcggccatgtcaaagtgtatggcagt
ggtgaagaactagggcaggaaaaaagaagcctattgttgaactcgttactcacggccctt
ggcctgctgctgatgcaaaccgtgatctcggcaaccctgatacaatggattttgacccgt
ccgctacaaagaattaccaacaccttagttaagcgagatgccgatggtttacccaccgca
aaagttcactcctcttcttataccgaactctccgtattaaccgacaccgtcaacgagatg
ctaaaagtgatctgcaaaacgcgagacacattgcgctcgcaacgtgagcggttagaaaac
gtgattgaagggaccgatgcaggcacttggtattggaatattcaaacgggtaagaccgag
tttaacccacgctgggcggaaattattggttatcagttgcatgaactagagcctatttct
atccaaacttggcttgatcatctccaccccgaggatgtcaaaaaatcagaggaaaaactg
caagcgcactttgctggtgagcatgagtactaccaatgtgaggtgcggatgcgtcaccgc
gatggacattgggtgtgggtaatggataggggcaaagtggcgctgtgggatgaaagtggt
aaaccgctagagatgtttggcactcacattgatatcagtgaagatagagcgcgagaacag
cagctcgcactcgccgccgatgtgtacaaatatgtacgcgaggggattttgattgccaat
agccgtggtttgattgtcgatgtcaaccgggcgtttagccaaatcacgggttatagccga
gaagaggtgattggtcagtcgccgaaaatgcttaaatccggtattcacgaccgggcgttt
tatcacaatatttggaaggacttacatcttgaagggtgctggcgcggcgaaatttggaac
aaacgtaaaaacggcgaaatctatcctgaactgctgaccattagtcgggtcagtgatgcg
gtagaagaagttcgctatgtcgcgctgttttccgacatttccgcgctcaaagaacacgag
taccacttagagaagattgcccattacgacgccttaaccaaacttcctaatcgtcttttg
ctgcaagagcgtctgaatacatcgatgctgaatgcgaaaaaatatggccgtgccattgct
ctgctgttcattgatttagatggctttaaagatgtgaacgatcaatatgggcatacagcg
ggtgatgaagtgctgtgcgtgatggcgcagcggatgaaaaccattactcgagaagaagat
actttagcgcgctttggtggcgatgagtttattgtgattctgtcggatattgatgataaa
caccgcacgactcagattgtaacccgtttactcagctctatcgcgaagccgctgcatgtc
tcagggtatgaaatgagcttgtcggccagtattggtatcagtctctatccagaaaatcgt
gatatcagcgcagacacactcatacagcaagccgatcaagccatgtatcaagctaaactg
gcggggaaaaatggttactatttttaccaagcttaa
DBGET
integrated database retrieval system