| Entry |
|
|---|
| Symbol |
kdtA
|
|---|
| Name |
(GenBank) 3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase
|
|---|
| KO |
|
|---|
| Organism |
vok Candidatus Vesicomyidisocius calyptogenae
|
|---|
| Pathway |
| vok00540 | Lipopolysaccharide biosynthesis |
|
|---|
| Brite |
KEGG Orthology (KO) [BR:vok00001]
09100 Metabolism
09107 Glycan biosynthesis and metabolism
00540 Lipopolysaccharide biosynthesis
COSY_0380 (kdtA)
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01005 Lipopolysaccharide biosynthesis proteins [BR:vok01005]
COSY_0380 (kdtA)
Enzymes [BR:vok01000]
2. Transferases
2.4 Glycosyltransferases
2.4.99 Transferring other glycosyl groups
2.4.99.12 lipid IVA 3-deoxy-D-manno-octulosonic acid transferase
COSY_0380 (kdtA)
2.4.99.13 (Kdo)-lipid IVA 3-deoxy-D-manno-octulosonic acid transferase
COSY_0380 (kdtA)
2.4.99.14 (Kdo)2-lipid IVA (2-8) 3-deoxy-D-manno-octulosonic acid transferase
COSY_0380 (kdtA)
2.4.99.15 (Kdo)3-lipid IVA (2-4) 3-deoxy-D-manno-octulosonic acid transferase
COSY_0380 (kdtA)
Lipopolysaccharide biosynthesis proteins [BR:vok01005]
Lipid A
COSY_0380 (kdtA)
|
|---|
| SSDB |
|
|---|
| Motif |
|
|---|
| Other DBs |
|
|---|
| LinkDB |
|
|---|
| Position |
complement(389195..390445)
|
|---|
| AA seq |
416 aa
MDQSLYNIIGYILLPFIILRLIIKGIKTPKFKQRINERLGLITRIQEPIIWVHCVSIGEF
KAAIVIIDQLIKQHPNHKLLVTTTTPTGSDAVISYYRDKVVNLYFPYDLPLIIKHYIKQI
NPKICLILETEIWPNLIHELNKRNIPILLINARLSQQSKEKYQKFTSNLVKQTLNKISLI
AAQNQNSANNFIELGARNDYVVITNNIKFDQNTTPDKIISNALQKIIGKRKTVIFASTHK
NEEVQIINEYSKNKYAINALLVIIPRHPERFDVVYKLAKNANLNIARRSENQPARDVQIL
LGDSMGEMMSYFDIANIVFMGGSLSNTGGHNMLEPAAFAKPIIFGSNTFNFTEISLDLLE
QNAAILIQNVSDLFKIIIMLLNDEKQCKVLGYNAQQYLYSKQGAVKNTLQLINKFI |
|---|
| NT seq |
1251 nt +upstreamnt +downstreamnt
atggaccaaagtctctacaatataataggatatattttgttaccatttataatcctaagg
ttaataattaaaggcataaaaacacctaaatttaaacaaagaattaatgaacgactcggc
ttaattactagaatacaagaacctattatttgggtgcattgtgtttctataggtgaattt
aaagcagctattgttattattgatcaacttattaaacaacaccctaatcataaattatta
gttaccacaactacacctacaggttctgatgcagttatcagttattatagagataaggta
gttaatctttattttccttatgatttaccattgattattaagcattatattaagcaaatt
aatccaaaaatatgcctaatattagaaacagaaatttggcctaatttaatccacgaactc
aacaaaagaaacatcccaatactacttatcaacgccagattatcacaacaatcaaaagaa
aaataccaaaaatttacctctaatttagttaaacaaaccttaaataagatcagcttaatc
gctgctcaaaatcaaaattctgctaacaattttattgaattaggtgctagaaatgattat
gtcgtaataactaataatattaaatttgatcaaaacacaacacctgacaaaataataagc
aatgcattacaaaaaataattggcaaacgtaaaactgttatttttgccagcacccataag
aatgaagaagtacaaattattaacgaatactcaaaaaataaatacgctattaatgcctta
cttgttatcattccaagacatccagaacgttttgatgtagtctataaattagctaaaaat
gctaatttaaatattgctcgtcgttcagaaaaccaacctgcccgagatgttcaaattctt
ttaggcgattctatgggtgaaatgatgtcctactttgatattgctaatattgttttcatg
ggaggtagtttaagcaatactggtggacataatatgcttgaacctgctgcttttgctaaa
cctattatatttggttctaacacatttaactttactgaaatatcattagatttactagaa
caaaatgctgctattctaattcaaaatgtgagtgatttatttaaaataattataatgcta
ctaaatgatgaaaaacaatgcaaagtattaggatataacgcccaacaatacttgtatagt
aaacaaggtgcagtaaaaaatacattacaattaatcaataaatttatataa |
|---|
