KEGG   Candidatus Vesicomyidisocius calyptogenae: COSY_0547
Entry
COSY_0547         CDS       T00530                                 
Symbol
rpsA
Name
(GenBank) 30S ribosomal protein S1
  KO
K02945  small subunit ribosomal protein S1
Organism
vok  Candidatus Vesicomyidisocius calyptogenae
Pathway
vok03010  Ribosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:vok00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09122 Translation
   03010 Ribosome
    COSY_0547 (rpsA)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03011 Ribosome [BR:vok03011]
    COSY_0547 (rpsA)
Ribosome [BR:vok03011]
 Ribosomal proteins
  Mitochondria/ Chloroplast
   Small subunit
    COSY_0547 (rpsA)
  Bacteria
    COSY_0547 (rpsA)
SSDB
Motif
Pfam: S1 S1_RRP5 Spt6_S1 S1CSD-TOTE-1 OB_RRP5_4th S1_2 CsrA RRP4_S1
Other DBs
NCBI-ProteinID: BAF61664
UniProt: A5CWL2
LinkDB
Position
complement(571665..573344)
AA seq 559 aa
MSESFAELFENSAEQQNVKVGALLVGTVVSINREKAIVNVGLKSEGFIPLDEFKNQQGEL
KVEEGDIVEVALKSIDDGLGNTLLSHADAKRIKLWHSLELAMNSKEVVTGIVTGAVKGGL
TVDIGVVKAFLPGSLVDVRPVKDFSYLTGQEIEAIVIKMDEVRNNIVISRKAVLQEANSA
DREALLEELEEGKEIEGIVKNLADYGAFVDLGGVDGLLHITDISWQRVNHPSEKLTIGDK
IIVKVLNYDKEKMRVSLGLKQLTVSPWDSISDRLPIGKKVQGTVSNLTDYGAFLSIEEGV
EGLVHVSEMDWTNANARPSKIVKLGQEVEVVVLDVQESKHRISLSMKQAQENPWESFEAT
HNKGDKIPVRVKSITDFGLFVGLLGGIDGLIHLADISWEKQSSDQLVSSYSKGQELEVVI
LNIDAEKERISLGIKQLLEDEFMRYASANKKGSIVRGMVMEVDSRGAVIRLNEDITGYLK
AGEISEDRVEDATLILKTGEEIEVAILNIDRRTRNILVSIKAKNSVEEKAAMEDYNKQSS
DIVSGSTLGDLLKEAKDNK
NT seq 1680 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtcagaatcatttgccgaactgtttgaaaatagtgcagaacaacaaaacgtaaaagtt
ggtgcactcttagtggggaccgttgttagtatcaatcgtgaaaaagcgattgttaatgtt
ggactcaaatcagagggttttattcccctagatgaatttaaaaatcaacaaggagaattg
aaggttgaagaaggtgacattgtcgaagttgcacttaaatcaattgatgatggtctgggt
aatactttgttatcacatgctgatgctaagcgtattaagctatggcattcacttgaatta
gcaatgaattctaaagaagttgtaactggtattgtaactggtgctgttaaagggggcttg
acggttgatattggtgtagttaaagcatttctacctggatcgttagttgatgtacgtcca
gtaaaagatttctcatatctaacgggtcaagaaattgaagctattgttattaagatggat
gaagttagaaataatattgtgatttctagaaaagctgtattgcaagaagctaattctgca
gatagagaggcgctacttgaagagcttgaagaaggtaaagaaattgaaggtattgttaaa
aaccttgcagattatggtgcgtttgttgatcttggaggtgttgatggtttgttacatatt
acagatatttcttggcagcgtgttaatcatccatctgaaaaattaactattggcgataaa
attattgttaaagtgcttaattatgataaagagaaaatgcgtgtatcattaggtcttaaa
caactaactgttagcccttgggatagtatttcagatcgtttacctatcggtaagaaagta
caaggcacggtttctaatttaacagattatggtgcatttttgagtattgaagagggtgtt
gaaggcttagtccatgtaagtgaaatggattggacaaatgctaatgctcgtccttctaaa
attgttaaattaggtcaagaagttgaagtggttgtattagatgttcaagaatctaagcac
cgtatttcattatctatgaaacaagctcaagaaaacccttgggaatcatttgaagcaaca
cataataagggtgataaaattcctgttagggttaagtcaatcactgactttggtttattt
gttggtcttttaggtggtattgacggtctaattcatttagctgatatttcatgggaaaaa
caatcttcagatcaattggtatctagttattctaaagggcaagagttagaggtggttatt
ttgaatattgatgctgaaaaagagcgtatttctttaggtattaaacagcttttagaagat
gaatttatgcgatatgcatctgctaataaaaagggatcaattgttcgaggtatggttatg
gaagttgattcacgtggtgcagttattcgtttgaatgaagatattacaggctatttaaaa
gcaggggaaatttcagaagatcgtgttgaagatgcgactttaatattaaaaactggcgaa
gaaatagaagttgcaattttgaatattgacagaagaactcgtaatattttagttagtatt
aaagcaaaaaactcagtggaagaaaaagcagcaatggaagattataataagcagtcttct
gatatagtatctggttctacattaggtgatttgttaaaagaagcaaaagataataagtaa

DBGET integrated database retrieval system