Candidatus Vesicomyidisocius calyptogenae: COSY_0799
Help
Entry
COSY_0799 CDS
T00530
Symbol
carB
Name
(GenBank) carbamoyl-phosphate synthase large subunit
KO
K01955
carbamoyl-phosphate synthase large subunit [EC:
6.3.5.5
]
Organism
vok
Candidatus Vesicomyidisocius calyptogenae
Pathway
vok00220
Arginine biosynthesis
vok00240
Pyrimidine metabolism
vok00250
Alanine, aspartate and glutamate metabolism
vok01100
Metabolic pathways
vok01110
Biosynthesis of secondary metabolites
vok01240
Biosynthesis of cofactors
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vok00001
]
09100 Metabolism
09104 Nucleotide metabolism
00240 Pyrimidine metabolism
COSY_0799 (carB)
09105 Amino acid metabolism
00250 Alanine, aspartate and glutamate metabolism
COSY_0799 (carB)
00220 Arginine biosynthesis
COSY_0799 (carB)
Enzymes [BR:
vok01000
]
6. Ligases
6.3 Forming carbon-nitrogen bonds
6.3.5 Carbon-nitrogen ligases with glutamine as amido-N-donor
6.3.5.5 carbamoyl-phosphate synthase (glutamine-hydrolysing)
COSY_0799 (carB)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CPSase_L_D2
CPSase_L_D3
MGS
ATP-grasp
Dala_Dala_lig_C
RimK
ATP-grasp_3
ATPgrasp_Ter
ATP-grasp_4
ATP-grasp_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAF61905
UniProt:
A5CVX0
LinkDB
All DBs
Position
complement(832414..835620)
Genome browser
AA seq
1068 aa
AA seq
DB search
MPKRQDLSSILIIGAGPIVIGQACEFDYSGAQACSALREEGYRVILVNSNPATIMTDPTM
ADSTYIEPIEWRIVEKIIEVEKPDALLPTMGGQTALNCALDLERHGVLDKHCVEMIGAKK
EAINKAEDRDLFREAMLKIGLDMPKAAVAHNMEEAFTIQETVGFPTVIRPSFTMGGSGGG
IAYNKDEFVKICECGLDLSPINELLVEESILGWKEFELEVIRDRKDNCIIICSIENFDPI
GIHTGDSITVAPAQTLTDKEYQAMRDASLAVLREIGVDTGGSNVQFALNPENGRLTIIEM
NPRVSRSSALASKATGFPIAKVAAKLAIGYTLDELNNDITNGKTPASFEPSIDYVVTKIP
RFAFEKFPGANDRLTTQMKSVGEVMAIGSTFQESLQKALRGLETDKVGLDPIVDLNADDA
RNKIRSECISARSDRIFYLADAFRLGMSLKEVFDLSKVDSWFLAQIQDIIATELQINSTN
VTDIDADKMFSLKRKGFSDARLAQLFCCNESSVRERRHALNVKSVFKRVDSCAAEFDTQT
AYLYSTYQLECEANPTDKKKIMILGGGPNRIGQGIEFDYCCVHASLALREDGFETIMVNC
NPETVSTDYDISDRLYFEPLTLEDVLAIIDIENPDGIIVHYGGQTPLKLAKALEKSGANI
IGTTPDAIDLAEDRERFSKMLQDLKLKQPLNGTARSLEQAQDIANAIGFPLVVRPSYVLG
GRAMKIVYDKDSLEHYMYTAVKVSNDSPILLDSFLDHAIEVDIDAICDGENVVIGGIMQH
IEQAGIHSGDSACSLPPYSLTNKVLDEMRAQVILMAKKLNVVGLMNTQLAYQNGEIYIIE
VNPRASRTVPFVSKAIGVPLANIAARVMSGVSLKAQNFTKEIIPEHFSVKEAVFPFNKFL
GVDPILGPEMRSTGEVMGVGKDFASAFDKAQLAAGSRVPENGKVFVSLRKLDRNELINLG
NKLLIQGFSLVSTRSNRDMLNAAGLKCEVINKVSEGSPHIIDMIKNDGVDLIINSTEDTQ
GVEDAAEIRCQALTHKIPFTTTVEAAFAMLDGLKVIDKFTITKLQSLY
NT seq
3207 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccaaaaagacaagatcttagtagtattttaattatcggtgctggccctattgttatt
ggtcaggcttgtgagtttgattattctggcgcgcaagcttgtagtgcattgcgtgaagaa
gggtatcgtgttattttagttaattctaatccagctactattatgactgacccaacaatg
gcagatagcacctatattgaaccgattgagtggcgtatagttgaaaagattattgaagta
gaaaaaccagatgctttgttgccaaccatgggtgggcaaactgctcttaattgtgctcta
gatttagaacgtcatggtgtgcttgataagcattgtgtagagatgattggtgctaaaaaa
gaggcaattaacaaagctgaggatcgtgatttattccgtgaagcaatgttaaaaattggt
cttgatatgcctaaagcagcggttgctcataatatggaagaagcatttaccatacaagaa
acagtaggttttccaacagttattcgtccttcatttacgatgggtggttcaggtggtggt
attgcttataacaaagatgaatttgttaaaatttgtgaatgtggcttggatttatcacca
ataaacgaattattagttgaagagtctattcttggatggaaagagtttgagttggaagta
attcgtgacagaaaggataattgtattattatttgttcaattgaaaattttgatcctata
ggtatccatacaggtgattcgattactgtagcacctgcacaaactttaactgataaggaa
taccaagcaatgcgtgatgcttcattagcagtacttcgtgaaattggggttgatacaggt
ggttcaaatgtacaatttgcgcttaatccagaaaatggtcgtttaactattattgagatg
aatccacgcgtttctcgttcatcggcattggcatcaaaagcaacaggttttcctattgct
aaagtagctgcaaagttagctataggttatactttagatgagcttaataatgatattaca
aatggtaaaacacctgcttcttttgagccaagtattgattatgtggtaactaaaatacca
agatttgcctttgaaaaatttcctggagcaaatgatcgtttaaccacgcaaatgaagtct
gttggtgaagtaatggcaataggttcaacttttcaagagtctttgcaaaaagcattaaga
ggactagaaactgacaaggttggattagaccctattgttgatttgaatgctgatgatgca
cgtaacaagatacgttctgaatgtatttcagctcgaagtgatcgtattttctatttggct
gatgcttttagattgggtatgagtttgaaagaagtatttgatttatctaaagttgactct
tggtttctagcacaaatacaagatattattgcaaccgaattacaaattaacagtacaaat
gtaactgatattgatgctgataagatgttttctttgaaacgtaaaggtttttctgatgcg
cgtttggcacaattattctgttgtaacgaatcatcagtgcgtgaacgtcgtcatgcgcta
aatgttaagtctgtgtttaagagagtagatagttgtgcggcagagtttgacactcaaact
gcttatttatactcaacttatcagcttgagtgtgaagctaacccgactgataagaaaaag
attatgattttaggtggtggacctaaccgtattggacaaggtattgaattcgactattgt
tgtgtgcatgcgtcattagcattacgtgaagatggattcgagacgattatggtcaattgt
aatcctgaaacagtttcaactgattatgatatttcagatcgtttatattttgaaccattg
accttagaagatgttttagctattattgatattgaaaacccagatggtattattgtacat
tatggcggtcagacaccacttaaattggctaaagctttagagaaaagtggtgcaaatatt
attggcacaactccagatgctattgatttggctgaagatagagagcgtttttctaaaatg
ttacaagatctgaaacttaagcaaccgttaaatggtacggcacgttcattagaacaggca
caagatattgccaatgcgattggttttccattagtagttagaccatcctatgtgcttggt
ggtcgagcaatgaagattgtttatgataaagacagtcttgagcactacatgtacacagca
gtgaaagtttcaaatgattctcctattttattagattcatttttagatcatgctattgaa
gttgatattgatgcgatttgtgatggtgaaaatgtggtgattggcggtattatgcaacat
attgaacaagctggtattcattcaggtgactctgcttgttcattacccccttattcattg
accaataaagtgttagatgaaatgcgtgctcaagttattctcatggctaaaaaattaaac
gtggttggtttgatgaatacccaactagcttaccaaaatggtgaaatttatattattgag
gttaatccacgtgcctcacgcactgtgccttttgtttctaaagcgattggcgtgccactt
gctaatattgctgcacgtgtgatgtctggtgtatcacttaaagctcagaatttcaccaaa
gagattatacccgaacactttagcgttaaagaggctgtatttccatttaataaattttta
ggtgtagatccaattttaggtccagaaatgcgttcaacaggtgaagtaatgggtgttggc
aaagattttgcttcagcctttgataaggctcaattagcagcaggtagtcgtgtaccagaa
aatggtaaggtgtttgtaagtttgcgtaaacttgatcgtaatgagttgattaatttaggt
aacaaattattaatacaaggttttagtttggtttcaacacgtagtaatagggatatgcta
aatgcagctggacttaagtgtgaagtaattaataaagtatcagaaggatcacctcatatt
attgatatgattaaaaatgatggtgttgatttaattattaactcaactgaagatactcaa
ggtgtggaagatgctgcagaaattcgttgccaagcattgacacataaaataccgtttact
accacagtggaagctgcatttgctatgttagatggtttaaaagtcattgataaatttact
ataactaaacttcaatcactatattaa
DBGET
integrated database retrieval system
