Vibrio owensii: A9237_25920
Help
Entry
A9237_25920 CDS
T04844
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K13735
adhesin/invasin
Organism
vow
Vibrio owensii
Pathway
vow05100
Bacterial invasion of epithelial cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vow00001
]
09160 Human Diseases
09171 Infectious disease: bacterial
05100 Bacterial invasion of epithelial cells
A9237_25920
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Invasin_D3
Big_1
Filamin
Glyco_hydro2_C5
DUF7055
FAM171A1-2-B_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AQW61448
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(2107573..2112024)
Genome browser
AA seq
1483 aa
AA seq
DB search
MGVMSLLAISGCNDSTTETTTSLTSHISHQQSLSLNVSNRVDETEMSNLELLFVFDVANQ
NETFTVRVQDVLGREVAGFHQGEAFQSNVVVVPESGIVPFTFDVDNASDVNGGVAKMTVI
VRGDGFFSNSQVFDLTQTTMSDNYWIEIVPKSEKAEEATTFAEERVGLDGHVTSSQVDVA
TVSKDDSTDGGKILDGATAKLSIPAGTGFIGEDGQPFTPLGEVSVSMMLFSADPKGLADD
ENNPLYLFPGGLSPEGFDGELPSDITSPDSVTFISAGFVAIEIGDESGNKVLSFDGEGVT
LAFEVPKSTINPQTGEPLSLDDGTIPIWSYTDSTGKWRYEGDAVIEQENENTFTVSKPIT
HLSYYNLDWYGQDRCQLDVDVVDANGDPNNQKLRLSFAKAGGGWAYKPSGWGDDPEKLNI
NRVPAFAGHFDLLDSQGNSLLASIEVDGEVIEVADGSEGLDLDDFCFGVSSDSTKSFKAT
LNIVNPPRIDIETGLSLVCPIDETKTQTVNSGYYYLYSGYSYESSGEVNGDSITFSNLVE
DGLYRLYYYGGQTWAQVEFTAKADTTTISLMSLQLCDKIDQAIKTRLVCTDDDMAVTRFK
AAPEAYFWMYNQHYSHYLWGRTDSDGNATQSDAVESIEYMGSAYSYFENRYYWGERTTAT
TSADNAITFDIQLPSSNEYCLAELPIDYLQTFVFAENTEALADGVAEIIITVQERDEFGT
ARESNSGELTLSAEPAEEVMISGVTSNGDGTYSAKVTSTKAQEVVISGKIDDNALGGSAT
VEFIPVVDFSNAVFSRDKASASADGSEQIKVTVQLKDADGNDYTSSGGDIKFGELSGLTL
KSYQDNDDGTYTGVFISETSKIFNITASIAGSALSSSIDIEFTPVLDTNSADFSVDKSSA
SADGVDVITVTLQLKDKEGDDYTSSSGAVVFDTPNGLTKFDSQDNGDGSYTVKYKSSTSG
SYTVGASLDGSKFVESITFEFTQVLDLSNTEFTPDKSSANADGSEVITVTVQLKDSEGNN
YTSSGGTLQLSMPTGVSSVTSQDNGDGTYTVSFSSSSAGNKSIGVSIGGTQLSSSISLSY
AQVLNLSAAAFSRDKDSANADGSDQITVTVQLKDTNGADYTSSAGEISFSVPNGVTEKSK
TDNGDGSYTAVFTTVNAGTYTFGASIGGTQLANDVELTFNAVIDLSQSTLQADITTIAAD
GNSTAQLTVTLKDYAGNAFVPASNSPELTITVGSANKTELVNAGDGVYTSSISASVVGEV
TVTATYDSGTIGTSNLTFEAVAPSASQSTISSDISTFGVGGAHSAVITVALKKADGSAYT
QSYGELVLSPQGTGLSYGTPVDNGDGTYTVSVTADTAGSYVVSAAVGDLSLSNSLPLTVT
QVDAAESVVTPTELNGSGNITITLKDSSGTDLGHGGHVVTVDSSSDAFIFTAGGFGSFSD
IVDNNDGTYSVSVTCLKSTNGNSFNIEVQADSTLVGSVDVTCP
NT seq
4452 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggagtgatgtctttgcttgccatctcgggctgtaatgactctaccactgaaacgacc
acctcattaacgtctcacatctctcaccaacaaagcttgtcacttaatgtctctaatcga
gttgatgagaccgaaatgtctaatctagaactgctgtttgttttcgatgttgccaatcag
aatgagacgtttaccgttcgagtacaagatgttctaggaagagaagtggctggtttccat
cagggggaagcatttcaaagtaacgttgtggtagtgcctgaatctggcattgtgccattc
acattcgatgtcgataacgccagcgatgtgaatggcggtgtggctaagatgacggtgatt
gtgagaggggatggttttttctctaactctcaagtgtttgatctgacccaaaccacgatg
tccgataactattggattgaaattgttcctaagtcagaaaaggctgaagaggcaactact
tttgcggaagaacgtgttggcttagatggtcacgtcaccagttctcaggtggatgtcgcg
acggttagcaaagatgacagcacggatggaggaaaaatccttgatggcgcaactgccaag
ttatcgattcctgccggcacggggttcatcggtgaagatgggcagccttttacgccttta
ggagaggtttctgtttcgatgatgctgttttcagcggatccaaaaggcctagctgatgat
gagaataacccgctataccttttccctggtggtttatcaccagaaggatttgatggtgag
ctcccaagcgatattacctctcctgacagcgtaacctttatttctgctggttttgttgcg
attgagattggtgatgagagtggcaacaaagtgttatcgtttgatggcgaaggggttacc
ttggcatttgaagttccaaaatccacgataaatccgcaaacaggtgaaccactatctttg
gatgacggcacgatccctatttggagctataccgactctacgggtaaatggcgctatgaa
ggtgatgccgtcatagagcaagaaaacgaaaacacctttaccgtctcgaaaccaatcact
cacctctcatactacaatctggattggtatggacaagatcgttgtcaacttgatgtcgac
gttgtggatgcgaatggcgaccccaataatcaaaagttgcgcctctcctttgctaaagct
ggtggtggttgggcttacaagccttctgggtggggcgatgaccctgaaaagttaaacatc
aatcgagtgcctgccttcgctggtcatttcgatttgctcgacagccaaggtaatagtttg
ctggcgtcgattgaagtggacggtgaggtcattgaagtagccgatggttcagagggactc
gatctcgatgacttctgttttggtgtatcgagtgactccactaaatcgttcaaggcgacc
ttaaatattgtaaaccctcctcgtattgatatcgaaacagggctgtcattagtttgccca
atcgacgaaacgaaaactcagacagttaactcaggctattactacttatattccggttat
tcttatgaaagttcgggtgaagtaaatggggatagcattacgttttccaacttggttgaa
gacgggttatatcgactctattactacggtgggcagacttgggcacaagtagaatttacc
gccaaagcagacacgaccactatttcactgatgtcacttcaactgtgtgacaaaattgac
caagccattaaaacccgcttggtatgtaccgacgacgatatggccgtcacgcgctttaag
gcagcacctgaagcgtatttttggatgtacaaccaacactattctcactatttatggggg
agaacagactctgatggtaacgccacgcaaagtgatgcggtcgaatcgattgaatacatg
ggctcagcctattcttactttgagaaccgttattactggggtgaacgtacaaccgccacg
acgagtgccgataatgcgatcacttttgatattcagttaccaagctccaatgaatattgt
cttgccgaattaccgattgattaccttcaaacgttcgtttttgctgagaacacagaagcg
ctggcagacggtgtcgcagaaatcattattaccgttcaggagcgcgatgagtttggtacg
gctcgtgaatcgaattcaggtgagcttaccttgagtgctgaacctgctgaagaggtcatg
atttctggggttacttcgaatggtgatggtacatatagcgccaaggtaacgtctacaaaa
gcgcaagaagtcgttatctccggtaagattgatgacaatgccttaggaggctctgcgaca
gtagagtttattcctgttgttgatttctcaaatgccgtctttagtcgagataaagcgtcc
gccagtgcggatggtagtgagcaaattaaggtgactgtacaactcaaagatgcggatgga
aatgactacacatcgtctggtggtgacataaagtttggcgagctttctgggttaactttg
aagtcttaccaagataatgacgatggcacttacacaggcgttttcatcagtgaaacgtca
aaaatcttcaatatcacagcatcgattgcaggtagcgcactatctagcagcatagatatc
gagtttactccagtgttagataccaacagcgctgacttctcagttgataaaagttcagca
agcgcagatggtgttgacgtcattaccgtgaccttgcagctaaaagacaaagagggggat
gattacaccagttctagcggtgcagtcgtttttgatacaccaaatgggttaactaagttc
gacagccaagataatggcgatggctcttatactgtgaagtacaagagctcgacgtcaggc
tcctacacagtgggagcttcgctagacggcagtaaatttgttgaatccattacttttgaa
tttactcaggttcttgacctcagcaacacagagtttactcctgataaaagctcggcgaac
gctgatggtagcgaagttattacggtgacggttcaactgaaagattctgaaggcaacaac
tacacaagctcaggtggcactcttcagctctctatgccaacaggcgttagttccgttact
tctcaagataatggtgatggtacttacactgtgagtttctctagctcgagtgcaggtaac
aaatcaataggagtgtcgattggtggcacccagttatccagctctatttctttgtcttat
gctcaggtcttaaatctttctgcagcagcgttcagccgtgataaagactccgctaatgca
gatggtagtgaccagatcaccgtaacggttcagctaaaagacaccaatggtgctgactat
acatcgtccgcgggggagatttcattctctgtgcctaatggggtaacggaaaaatcaaaa
acagacaacggtgatggttcgtatacagcagtctttacaacggtgaacgcaggtacttac
acctttggtgcgagcataggtggcactcagttagctaacgatgttgagcttacttttaat
gctgtcattgatttatcgcagtcgacattgcaagccgatatcaccactattgcagcagat
ggcaacagtactgctcagttgacagtcacgctaaaagactacgcaggcaatgcgtttgta
ccagcatcgaacagtcctgagctcacgattacagtaggctctgccaataagacggaatta
gtgaatgctggcgatggggtttatacaagcagtattagcgctagcgttgttggagaggtc
actgttaccgcgacctatgactctggaaccattggtacatcaaacctcacatttgaggcg
gtagcaccaagcgcttctcagtctaccatctcgagtgatatttccacctttggtgtggga
ggcgctcatagcgcagttatcacggttgctttaaagaaagctgatggcagtgcttacaca
caaagctacggagagttggtgctgagtccacaaggtacgggtttaagctatggcaccccc
gtagataatggtgatggtacatacacggtgtcagttactgcagatactgcgggcagttat
gtcgtgagtgctgctgttggggatctctcattgagtaattcgctgcctttaacggttacc
caagtcgatgctgcagaaagtgttgtaacacctacggagttaaatggttcaggtaatatc
acaatcacgcttaaagattcgagtggtaccgatttagggcatggagggcacgtagtgact
gttgactcttcttcggacgcattcatattcacagcagggggatttggctcatttagtgat
attgtggataacaatgatggaacctactcggtttcagtgacatgtctcaaatcaaccaat
ggcaatagttttaacattgaagtccaagccgatagtactttggttggtagtgtagatgta
acctgcccgtaa
DBGET
integrated database retrieval system