Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633: VP1456
Help
Entry
VP1456 CDS
T00120
Name
(GenBank) transporter, BCCT family
KO
K03451
betaine/carnitine transporter, BCCT family
Organism
vpa
Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vpa00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09193 Unclassified: signaling and cellular processes
99977 Transport
VP1456
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
BCCT
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAC59719
UniProt:
Q87PP5
LinkDB
All DBs
Position
1:1567854..1569542
Genome browser
AA seq
562 aa
AA seq
DB search
MIKFASFLKFRVQINGGRYWSSSPLRSVSNYVKFVFMDNAFKKYSIDTTDYQVGQDNVQK
WGFDIHNPVFGISAGLVVFCLISLLLVEPVTARDALNGIKNGIIEQFDAFFMWSTNFFLL
FAVGLLFSPLGKIRLGGKEATPDHSTVSWLSMLFAAGMGIGLLFWSVAEPTAYFTDWWGT
PLNAEAYSADAKSLAMGATMFHWGVHGWSIYALVALALAFFAFNKGLPLSLRAAFYPIFG
DRAWGWLGHVIDILAVLSTLFGLATSLGLGAQQATSGINHVFGLNGGIGTQMVVIAFVTF
IAVLSVVRGIDGGVKLLSNVNMIVAFALLIFITFITFDTAMGSLVDTTMAYIQNIIPLSN
PHGREDETWMHGWTVFYWAWWVSWSPFVGMFIARVSKGRTVREFLFAVIVIPTLVTLVWM
SVFGGIALDQVVNKVGELGANGLTDISLTLFHVYDVLPYSSVISILSIVLILVFFITSSD
SGSLVIDSITAGGKIDAPVPQRIFWACIEGSIAAVMLWVGGKEALQALQSGVVATGLPFT
FVLLLMCVSLVKGLRTELSAYR
NT seq
1689 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgataaaattcgcttcgtttttaaagtttagagttcaaattaatggagggcggtattgg
agttcttctcccctgagaagcgtttcaaattacgttaaatttgtatttatggataatgca
tttaaaaaatatagtatcgacacaacagactatcaggttggccaagacaacgttcaaaaa
tggggattcgatatacataatcccgtattcggcatcagcgctggtctcgttgttttctgt
cttatttcacttcttcttgtcgagccagtcaccgcacgtgacgcattaaacgggatcaaa
aacggaattattgaacagtttgatgcattctttatgtggtctaccaatttcttcttattg
ttcgctgttggtctgcttttctcgccattaggtaagattcgtttaggcggtaaagaggcg
acgccggatcattcaaccgtttcatggctgtcaatgctgtttgctgcaggtatgggtatt
ggtcttctcttttggagtgtggctgaaccaacggcctatttcacggattggtggggtacg
ccgctaaacgcagaagcgtattcagccgatgccaaatcactcgcgatgggcgcgaccatg
tttcactggggtgttcacggttggagtatttacgcccttgttgcgttggcgcttgctttt
ttcgcctttaataaaggtttaccactttcattgcgtgcggcgttttacccaatttttggt
gaccgtgcatggggctggttaggccacgttatcgatatccttgctgtactttcgacgttg
ttcggtcttgcgacttctcttggtttgggtgctcagcaggcaaccagtggtattaaccat
gtatttggtttaaacggcggcatcggtacacaaatggtggtgattgcgtttgtaaccttt
attgctgtgctttctgttgttcgtggtattgacggcggtgtcaaactcctaagtaacgtc
aatatgatcgttgcgttcgctctgcttatttttattacgttcattacctttgatactgcg
atgggttcattagtcgacacgacaatggcatacatccaaaacatcattccgttgagtaac
ccgcatggtcgtgaagacgaaacgtggatgcacggttggacagtgttctactgggcttgg
tgggtatcttggtctccgtttgtgggtatgtttatcgctcgcgtatcgaaaggccgtacc
gttcgagaatttttgttcgcagtcatcgtgattccgacgttggtaacattggtttggatg
tcagtatttggtggtattgcgcttgatcaggtcgtgaacaaagttggtgaattgggtgcg
aatggtttaacggatatttcactgacactattccatgtttacgatgtattaccatacagc
tcagtgatttctattctgtcgattgttttgattttggtgttctttatcacctcatcggac
tctggttcattggttatcgacagtatcactgcgggtggtaagattgatgctcccgttcca
cagcgaattttctgggcgtgtatcgagggttcaattgccgccgttatgctctgggttggc
ggtaaagaagccttgcaagcgctacagtctggtgtggttgcgaccggcttgccatttacc
tttgttctgctgttgatgtgtgtgagtttggtgaaaggtttacgtaccgaactttccgct
taccgctaa
DBGET
integrated database retrieval system
