KEGG   Vibrio pelagius: LZI70_05315
Entry
LZI70_05315       CDS       T08558                                 
Name
(GenBank) hypothetical protein
  KO
K12287  MSHA biogenesis protein MshQ
Organism
vpg  Vibrio pelagius
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:vpg00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02044 Secretion system [BR:vpg02044]
    LZI70_05315
Secretion system [BR:vpg02044]
 Type II secretion system
  MSHA pilus biogenesis protein
   LZI70_05315
SSDB
Motif
Pfam: DUF6701 DUF7305 Bactofilin Ice_binding
Other DBs
NCBI-ProteinID: UTT85695
LinkDB
Position
1:complement(1251992..1255909)
AA seq 1305 aa
MIKQFFVLFMVLFLSALAQANVNTNPQFEFGTIPADKCIVQGPAVTCDIEFENFYSSPPL
VFVMPTINASRSNFATKTTEYPSGLRVWSVSNSKAVIKQRIAPHAKACVRLKYKQNNKGE
WLWQCVKNTSGELVNYIDAPMENIDYLVIEPGVFEFDNGAKIVAGSFSTKKTISGRDNKG
SGTTIDFNSYGLSSNFGSAPGVLVQLQSRENSVNGDPIWLTATAKNPSSSNVTIMLDRSE
VTNNADLAKPEDVAFVAGLGEGFVQGRKFWLGQGSTQNTLTLDDKVIKPVTEGCKQFVHF
SGVNFNKAPTLIASKSARNGPNGGWLRRCSVTKNGVSFIVEEDMNKDTERSHTLEPFSYF
LFDKPPTSGTCALFPSPAQTWTSNNQASITIENTANISGAPISGGKRYIGFQSNEILDRK
NQGCDGGQCFGDKGLKVEKQQLESFQSPDPGLSAVVVERNQTRTFQNDESIGTLTIDKKA
KVIFKTGKYWVDSINIIGSIEIPPGNVVEIHTKGFSLSNGSHFSALDSGELTVFVHDLSY
NGGVIHNLVNLSNNSTFVGLLYSEKSVVLSNNATVEGAVTAKTVTLHNGSKIVATNKCFD
PADDYDITMTPESDYSLMCGTDQPVFTINTTNNSESESLPVTASILPANEADNFTVTVHD
GVGSGAYPNFNSSGFSGTIGELQLKITVNSISRVDLSQTYTLVITMDDDPAKSDSSTIKY
VPFKFAVDDQSVIAGKGYDVTAKVLACNNSGTTVVTGYTGTPTITHTLNQPTGGVDGALG
YSPVFSGDEKGITQDTFSISESGLFTVKLTDSSFDCTGISGCPIDGNGQLTGSFDVASRP
WKFAICTDSDSSGTSSSGNGFAAAGEEFDVYAKPIRYTDDATICNDALVTENYLKSNASV
AITHTLDTPTDDGSVPGSLNPNSELTKNANSIVEANKGYKFENLKYSEVGSFNFIATETG
SFYGNILDGFSGSKAIGRFYPKYFRVTDQNWNYAGAQSFNYMNQNFEQVSFAVEALSKEV
PINGQTEAPQPVHNYQYFDPKLQTSFSLYESELAKRFISPSFGKGVWSGENQSIGRFSVN
LSGKCGANTSFCVTKAETKAGYEDGPYNLNEGVSGDITDIRLAIEDNIDPVEFWIDGDQF
LKEPDIRFGRMVLESAGGVAGKSVPVPLRIEFWDSGLNHFVINNADSYTNFIGIKAQQRF
IWPDDGNDADVNLGLRVGNNGTGEVTSGLSGDLVASQAAAYSQQSQVWLDLGSPNNLPWL
RYAWEDDRATNYDGEQNPSSVVTFGVYRGNDRVIYRGESGLTGQR
NT seq 3918 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
gtgataaagcaatttttcgtattgttcatggtgctttttttatctgcgctagctcaagct
aatgttaatactaatcctcaatttgaatttggcacaattccagcagataaatgtatcgtt
caaggcccagccgttacgtgtgatattgagtttgagaacttttacagttcacctcctctg
gtttttgttatgcctacgattaatgccagtcgttcaaactttgcaacaaaaacgacggag
tatccatcgggactgagagtgtggtctgtttcaaactccaaagctgtcattaagcaacgt
atagcgcctcatgctaaagcttgtgttcgactgaagtataagcagaacaataaaggcgag
tggctttggcaatgtgttaagaatacaagcggtgagcttgttaattacattgatgcaccg
atggagaatattgactatttagtgattgagcctggagtgtttgagtttgacaatggtgcg
aagattgtagcgggcagtttttcaaccaaaaaaacaatttcagggagagataataaaggg
tctggcactactattgacttcaactcctatggcttgagttctaactttggttctgcgcct
ggggtgcttgttcaactgcaatcgagagagaacagcgtaaatggagatcctatatggttg
actgcaacagctaaaaatccatctagtagtaatgtaacgatcatgctcgatcgttctgag
gtcaccaataacgctgacctcgctaaacccgaggatgtagcttttgttgccggtcttggt
gaaggctttgttcaagggagaaagttctggttaggccaaggctcgacccagaatacatta
accttggacgataaagttattaagccagtcacagaggggtgtaagcagtttgtccacttt
tccggtgttaactttaacaaagcgcccaccttgattgcttcgaaaagtgcaaggaatggc
ccaaatggcggatggctaagacgatgttctgtgacaaaaaacggtgtgtcttttatcgtt
gaagaagatatgaataaagatacggagagaagtcacacgttggagccattttcctatttt
ttgtttgataaacctccaaccagtggcacttgtgcactgtttccgtccccagcacaaaca
tggacaagcaataatcaagcatccatcactattgaaaacactgccaatatatcgggcgct
cctatttcagggggcaaacgatatattggtttccaatccaatgagattttagatcgaaag
aaccagggttgtgatggcggacagtgcttcggtgataaggggttaaaggttgaaaaacaa
caattggaaagttttcaaagcccagatcccggacttagtgccgttgttgtcgagcgcaat
cagacaagaacgtttcaaaatgacgagtctattggcactttaactatagataaaaaggcc
aaggttatttttaaaacaggtaagtactgggttgatagtattaatattatcgggagcata
gagattcctcccggtaatgttgtggaaattcataccaaaggtttttctttgagtaatggg
tctcacttttctgctctggatagcggtgaattaacggtttttgtccatgacctgagttac
aacggcggtgtgattcataatctcgttaacttatctaacaactcgacgtttgtaggcctg
ttgtatagtgaaaaaagtgttgtattaagtaataacgccaccgttgaaggcgctgtcacg
gctaaaacggttactttgcacaatggctctaaaattgtggcgaccaacaagtgctttgac
ccagcagacgattacgatattacaatgactcccgagtccgactactcattgatgtgtggt
acagatcagcctgtgtttactatcaatacgaccaataacagtgagtcagaaagcctacct
gttactgcgagtattttacctgcaaatgaagcagataactttactgttaccgttcatgat
ggggttggttccggtgcttatccaaactttaattctagtggtttctccgggactattggc
gagttacagctgaaaattacggtcaacagtatttcaagggttgacttgagtcagacttat
actctagtcattacgatggatgatgatcctgcaaagagtgactcaagtaccattaaatac
gtaccttttaagtttgcggttgatgaccaaagtgtgattgctggaaaagggtatgatgtt
acggctaaagtcttggcttgtaacaatagcggtactaccgtcgtgactggctacaccggt
actcctacaatcacgcatacgcttaaccaaccgacaggtggagttgacggagctttaggt
tactccccagtgttttctggcgatgagaaggggataactcaagacactttctctatatca
gagtcgggcttgtttacggttaaattaactgacagctcttttgactgtactgggattagt
ggctgccctatcgatggtaatggccaacttacaggctcttttgatgtagcgtcacgacca
tggaagtttgctatatgtactgatagtgactctagtggaacgagtagctctgggaacggg
ttcgcagcagccggagaagagtttgatgtctacgcgaagccgattcgttataccgacgat
gcgactatttgtaacgacgctttggtgacagaaaactatctgaaatccaatgcaagcgta
gccattacacatactttggacacaccaacagatgatggttctgttcccggtagccttaat
ccgaatagtgaactgacaaaaaacgcgaacagcattgttgaagccaacaaaggctacaag
ttcgagaacctaaaatactcagaagtgggtagcttcaactttatagctacggaaacgggt
agtttttatgggaacattttagatggcttctccggtagcaaggcgattggccgtttctat
cctaagtatttccgagttactgatcaaaattggaattatgctggtgctcaatcattcaat
tatatgaaccagaactttgagcaagtaagttttgctgtagaggcattatctaaagaagta
cccattaatggtcaaactgaagcgcctcaaccagtacacaactaccaatattttgatcca
aagttacaaacgagcttttccttatatgaaagcgagttggcaaaacgttttatctcacca
agttttggaaaaggggtttggagtggagaaaatcagagtattggccgattttcagttaat
ttgtcaggaaaatgcggagcaaatactagcttctgtgtaactaaagcagagactaaagct
ggttatgaagatgggccatataatcttaatgaaggagtctctggagatatcacagacatt
agattggcgattgaagacaacattgaccctgtggagttttggatagatggtgaccagttt
ttaaaagaacccgatatccgctttggtcgtatggtgttagagagtgctgggggagttgcg
ggaaagtctgtcccagtgcctctaagaatcgagttttgggacagtggcttgaatcatttt
gttattaataatgctgatagttatactaatttcatcggtattaaagcgcagcaacgtttc
atttggcctgatgatggtaatgatgccgatgtgaacctaggcctaagagtaggtaacaac
ggaaccggtgaggtgacgagtggattgtctggtgatttagtcgcaagccaagccgcagcg
tacagccagcaaagccaagtgtggttagatctaggctcacccaataacttaccttggctt
cgttatgcttgggaagatgacagagcaactaactatgatggtgagcagaatccttcatca
gtggtgacctttggcgtttaccgcggcaacgatcgcgtgatctaccgaggggagagtggc
cttacaggtcagcgttaa

DBGET integrated database retrieval system