Vagococcus penaei: BW732_05620
Help
Entry
BW732_05620 CDS
T04715
Name
(GenBank) choline trimethylamine-lyase
KO
K20038
choline trimethylamine-lyase [EC:
4.3.99.4
]
Organism
vpi
Vagococcus penaei
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vpi00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09191 Unclassified: metabolism
99980 Enzymes with EC numbers
BW732_05620
Enzymes [BR:
vpi01000
]
4. Lyases
4.3 Carbon-nitrogen lyases
4.3.99 Other carbon-nitrogen lyases
4.3.99.4 choline trimethylamine-lyase
BW732_05620
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PFL-like
Gly_radical
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AQP53767
UniProt:
A0A1Q2D648
LinkDB
All DBs
Position
complement(1201189..1203732)
Genome browser
AA seq
847 aa
AA seq
DB search
MDLREFSDKLAEATKELSPEERATLMKMFSSVTKEIEGEEKGTISVKTSSDPVDIPDGIT
PRLKALKDIYLTHVPSITTHRARAITKIAKENPGMPKSVLRAKCFKYCCETAPLVIQDNE
LIVGAPNGAPRAGAFSPDIAWRWMVDEIDTIDSRSQDPFYISDEDKRIMREELFPYWEGK
SVDEYCEDQYREAGVWELSGESFVSDCSYHQINGGGDSNPGYDVILMKKGMLDIQNEAKE
HLKTLDYENPEDIEKIYFYKSIIDTTEGVMIYAQRLSDYAAELARKETNPKRKAELEKIS
EINARVPKHKPETFWEAIQAVWTIESLLVVEENQTGMSIGRVDQYMYPYYEADMKAGRLN
QFEAFELAGCMLIKMSEMMWITSEGGSKFFAGYQPFVNMCVGGVTRDGRDATNDLTYLLM
DAVRHVKIYQPSLACRIHNKSPREYLKKIVDVVRAGMGFPACHFDDTHIKMMLAKGVSIE
DARDYCLMGCVEPQKSGRLYQWTSTGYTQWPICIELVLNQGVPLSYGKQVCPNTGDLSSF
KTYEQFEEAVKEQIKYITKWTSVATVISQRIHRDLAPKPLMSVMYEGCMEKGRDVSAGGA
MYNFGPGVIWSGLATYADSMAAIKKLVFDDKKYTLAELNEALKADFEGYEQIRIDCLNAP
KYGNDDDYADLIAADLVNFTEAEHRKYRTLYSVLSHGTLSISNNTPFGQLTGATANGRRA
WTPLSDGISPTQGADFKGPTAIIKSVSKMSNDSMNIGMVHNFKIMSGLLDTPQGEESLIT
LLRTSCHLGNGEMQFNYLDNDTLIAAQKNPEQYRDLIVRVAGYSAFFVELCKDVQDEIIS
RTMLEQL
NT seq
2544 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatttaagagagttttcagataagttagcagaagcaacaaaggagttaagtcctgaa
gaaagagcaacattaatgaaaatgtttagctcagtaaccaaagaaattgaaggcgaagaa
aaaggcacaatcagcgttaaaacaagtagtgatccagtggacattcctgatgggattacg
ccacgtttaaaagctttgaaagatatttacttgacacatgtcccgtcaattacgactcac
cgggctcgtgcgattacgaaaattgctaaagaaaatcctggtatgccaaaaagcgtttta
cgagcaaaatgttttaaatattgctgtgagacagctccactagttattcaagacaatgaa
ttaatcgttggtgctccaaatggtgcgccacgtgcgggtgctttctctccagatattgct
tggcgttggatggttgatgaaattgatacgattgatagtcgctcacaagacccattttat
atttcagatgaagataaacggatcatgcgtgaagaattattcccttactgggaaggtaaa
tcagtagatgagtactgtgaagaccagtatcgtgaagctggtgtttgggagttatctggt
gaatcatttgtttctgactgttcatatcaccaaatcaatggtggtggtgactctaacccg
ggttatgacgttatcctaatgaaaaaagggatgcttgatattcaaaatgaagcaaaagag
catttaaaaacgttagattatgaaaacccagaagatattgaaaaaatttatttctacaaa
tcaattattgatacaacagaaggtgtcatgatttatgcgcaacgtttatctgattatgct
gccgaattagcacgtaaagaaaccaatccaaagcgcaaagcagaattagaaaaaatttct
gaaatcaatgcacgtgtaccgaaacataaaccagaaacattctgggaagcaattcaagct
gtttggacaattgaatcactattagtagtagaagaaaatcaaactggaatgtcaattgga
cgtgtcgatcaatacatgtatccatattacgaagcagacatgaaagcgggtcgcttaaat
caatttgaagcatttgaattagcgggttgtatgctgattaagatgtcagagatgatgtgg
attactagtgagggtggttcaaaattctttgcgggttatcagccatttgtcaacatgtgc
gttggtggggtaacacgtgatggacgtgatgcaacgaatgacttaacgtatttattaatg
gatgctgttcgtcatgtgaaaatttatcaaccatcattagcttgtcgaattcataataaa
tcaccacgtgaatatttgaaaaaaattgtcgatgtggttcgtgccggtatgggattccca
gcttgtcactttgatgatacacacatcaagatgatgttagctaaaggtgtatcaattgaa
gatgcacgtgactattgtttaatgggctgtgtggaaccacaaaaatcaggtcgtctatat
caatggacatccacgggttatactcaatggccaatctgtattgaacttgttttaaatcaa
ggtgttccattatcttatggaaaacaagtttgtccaaatacaggtgacttgtctagcttc
aagacctatgaacaatttgaagaagctgttaaagaacaaattaaatacattactaaatgg
acaagtgttgcgactgttatttcacaaagaattcaccgtgatttagcaccgaaaccgttg
atgtcagtaatgtacgaaggttgtatggaaaaaggtcgtgacgtttcagctggtggtgca
atgtataactttggacctggtgtcatctggtctggtttagcaacttatgctgattcaatg
gcagcaatcaaaaaattagtctttgatgataaaaaatatacattagcagaattaaatgaa
gcattaaaagctgactttgaaggctatgaacagattcgaattgactgcttaaatgcaccg
aaatatggaaatgatgacgattatgctgatttaattgctgcagatttagttaactttact
gaagcagaacatcgtaaatatcgcacattatattcagtattaagtcatggaacattatca
atttcaaacaacacaccatttggtcaattaactggagcaactgctaatggtcgtcgtgca
tggacaccgttatctgacggaatcagcccaacacaaggtgctgactttaaaggaccaaca
gcgattattaaatcggtttctaaaatgtcaaatgatagcatgaatattggtatggttcat
aactttaagattatgtcaggattattagatacaccgcaaggtgaagaaagtttaattacg
ttactacgtacatcttgccatttgggtaacggtgaaatgcaatttaactatttagataac
gatacgttgattgcggctcaaaagaatcctgagcaataccgtgatttaattgttcgggtt
gctggttatagtgcattctttgttgagttatgtaaagacgttcaagatgaaattattagt
cgaacaatgcttgagcaactgtaa
DBGET
integrated database retrieval system