Vagococcus penaei: BW732_11290
Help
Entry
BW732_11290 CDS
T04715
Name
(GenBank) phenylalanine--tRNA ligase subunit beta
KO
K01890
phenylalanyl-tRNA synthetase beta chain [EC:
6.1.1.20
]
Organism
vpi
Vagococcus penaei
Pathway
vpi00970
Aminoacyl-tRNA biosynthesis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vpi00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
00970 Aminoacyl-tRNA biosynthesis
BW732_11290
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01007 Amino acid related enzymes [BR:
vpi01007
]
BW732_11290
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
vpi03016
]
BW732_11290
Enzymes [BR:
vpi01000
]
6. Ligases
6.1 Forming carbon-oxygen bonds
6.1.1 Ligases forming aminoacyl-tRNA and related compounds
6.1.1.20 phenylalanine---tRNA ligase
BW732_11290
Amino acid related enzymes [BR:
vpi01007
]
Aminoacyl-tRNA synthetase
Class II (U)
BW732_11290
Transfer RNA biogenesis [BR:
vpi03016
]
Eukaryotic type
Aminoacyl-tRNA synthetases (AARSs)
Other AARSs
BW732_11290
Prokaryotic type
BW732_11290
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
tRNA_synthFbeta
B3_4
FDX-ACB
B5
tRNA_bind
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AQP54732
UniProt:
A0A1Q2D8M5
LinkDB
All DBs
Position
2352178..2354595
Genome browser
AA seq
805 aa
AA seq
DB search
MLVSYKWLNELVDLSDIRVDELADKMSRSGIEVEDVTIPEEGLKKIVVGDVKECQPHPDS
DHLSICQIDVGEDELYQIVCGAPNITAGKKVIVALPNSRITGNVKIKKGKMRGEVSLGMV
CSLQELGYSDSVVPKAYAEGIYFLPDHAVAGEAVFPYLDMDDAIIELSVTPNRADALSLR
GVAYEVAALYNKRVTFPSQEVLEDDSDSVENYVKVTVDHAEDTPTYLMRVIKNVTVKESP
LWLQTRLMNEGIRPVNNVVDATNYVLLLFGQPQHAFDYNRLNSQNIHVRRAVAGEMLTTL
DGVERELSSDNLVITDGKTPVALAGVMGGEATEITSNTVTVALETALFEPTLIRRTARSF
GLSSESSKRFERGINTATIMEASDFAAALIAELSGGQVVQGTVVSTPYQAQSVTVSITLD
KINQSLGTSLTAQEVTAIFERLGFEVAENSHHFTVTIPPRRWDITIEADLIEEVARIYGY
DNLPSTLPSGSSLPGQLTPKQQLIRDIRRNLEGNGLTEAISYALTTPELATKFVKEPKAV
VELDWPMSQDHSVLRQNLTTSLLIDTAYNLARKNNQIAFYEIGNIFESLSKTELPVETQH
LALAIAGNWEEKDWSHPAATVDFYTLKGIVEDLMSILGVSERVRYVASTEYVELHPGRAA
EIMIDDLTVGFIGQVHPKMAKEMDLIETYVAELDLEKLCELSVQQVAIQEVGKYPSIKRD
MALLVNQTITNQEIVDVITAKGGRFLRSVHLFDVYQGEKLGNDKKSLAYSLTFQDDEGTL
VDEDITKAIEKITEALIAELNCEIR
NT seq
2418 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttagtttcatataaatggttaaacgaattagttgatttatcggacattagagttgat
gaattagcagataaaatgtcacgctcaggaattgaagtcgaagatgtcacaattcctgaa
gaagggttaaagaaaatcgttgtcggtgacgtgaaagaatgtcaaccacatccagacagt
gatcatttatcaatttgtcaaattgatgttggtgaagatgagttatatcaaattgtgtgt
ggtgcaccgaatatcacagcaggtaaaaaagtaattgttgctttacctaactcacgtatc
actggtaatgttaaaattaaaaagggtaaaatgcgtggagaagtatctttaggaatggtc
tgttcattacaagagttaggttactctgacagtgtggttccaaaagcttatgcagaagga
atttattttttaccagatcatgcagtagcaggtgaagctgtttttccatatttagatatg
gacgatgctatcatcgagttatcagtcacaccaaaccgggcagatgcactaagtttacgc
ggagttgcatatgaagtagctgcactttataacaagcgagttacttttccaagccaagaa
gttttagaagatgatagtgattcagtcgaaaattatgttaaagtaacggttgatcacgca
gaggatacaccaacttatttaatgcgcgtcattaaaaatgttaccgttaaagagagccct
ctttggttacaaacacgtttaatgaatgaagggattcgcccagttaataatgtagtagat
gcaacaaactatgttttattattattcggtcaacctcaacatgcgttcgattacaatcgt
ttaaatagtcagaatatccatgtccgtcgtgcagtagctggtgaaatgttaacgacactt
gatggtgttgaacgtgaattaagttcggataacttagtgattactgatggtaaaacacca
gttgctttagccggtgtaatgggcggtgaagcgactgaaattacctctaatacagtcact
gtcgcgttagaaacagccctatttgagccaacattgattcgccgaacagcgcgttcattt
ggcctatctagcgagtctagtaaacgatttgaacgtggtatcaatacagcaaccatcatg
gaagccagtgatttcgcagcagcattaattgctgagttatctggcgggcaagttgtacaa
ggtacagttgttagtacaccctatcaagctcaatctgttacggtttctattacattagat
aaaattaatcagtcattaggtacaagtttaacggctcaggaagtcactgcgatttttgag
cgtttaggttttgaagtggctgaaaatagtcatcattttacagttacaattccaccacgt
cgttgggatataacgattgaggcagatttaattgaagaagttgcacggatttatgggtat
gataatttgccctcgactttaccaagtggtagttcattaccaggtcaactgacgccaaaa
caacaactcattcgggatattcgtcgtaatttagaaggtaacggtttgactgaagcaatc
agttatgcactaactacgccagaactagctactaagtttgttaaggaacctaaagcagtt
gttgaattagattggccaatgagtcaagaccattctgttttacgtcaaaatttaacaact
agcttacttattgatacggcttataatttagcacgtaaaaataatcaaattgctttctac
gaaattggaaatatttttgaatcattatcaaaaactgagttaccagttgaaacacagcat
cttgcgttagctattgcgggtaattgggaagaaaaagattggtcacatccagcagcaacc
gttgatttttatacattaaaagggattgttgaagatttgatgtctatccttggtgtgagt
gaacgtgtacgctatgtagcatcaactgaatatgtagagttacatccaggtcgagctgct
gaaataatgattgatgatttaacagttggttttattggtcaagttcatccgaaaatggca
aaagagatggatttaattgagacctacgtggctgaattagatttagaaaaattatgtgaa
ttaagtgtacaacaagttgccattcaagaagttgggaaatacccatcaattaagcgtgac
atggcacttttggttaatcaaacaattactaatcaagaaattgttgatgtcattacagca
aaaggtggtcgcttcctacgttcagtccatttatttgatgtgtatcaaggtgagaagtta
ggaaacgataaaaaatcgttagcttattcattaacattccaagatgacgaaggaacattg
gtcgatgaagacataacaaaggctatcgaaaaaattactgaagcattaatcgcagagtta
aactgtgaaattagataa
DBGET
integrated database retrieval system
