Vanderwaltozyma polyspora: Kpol_1025p11
Help
Entry
Kpol_1025p11 CDS
T01049
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K12882
nuclear cap-binding protein subunit 1
Organism
vpo
Vanderwaltozyma polyspora
Pathway
vpo03013
Nucleocytoplasmic transport
vpo03015
mRNA surveillance pathway
vpo03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vpo00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
Kpol_1025p11
09122 Translation
03013 Nucleocytoplasmic transport
Kpol_1025p11
03015 mRNA surveillance pathway
Kpol_1025p11
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
vpo03019
]
Kpol_1025p11
03041 Spliceosome [BR:
vpo03041
]
Kpol_1025p11
Messenger RNA biogenesis [BR:
vpo03019
]
Eukaryotic type
mRNA processing factors
5' end processing
Cap binding complex
Kpol_1025p11
Spliceosome [BR:
vpo03041
]
Common components
Common spliceosomal components
Cap binding complex
Kpol_1025p11
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
MIF4G_like_2
MIF4G_like
MIF4G
HDOD
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5545283
NCBI-ProteinID:
XP_001644950
UniProt:
A7TKT7
LinkDB
All DBs
AA seq
875 aa
AA seq
DB search
MFARKRRGDFDDDDGYRDFRPRMQKRQRVPPVVQLCKEMMPDIRTIGESIKSFDEDIQFL
SEAIINEYGHEEYFNTALLNTFNSIVMEQPQKQPAIALLTLVVNNKNPIAGKSIVNFFYN
ELQKWCNESYNENFNVTSNETGPWNRVKLILRFLSLMSPILIIDDLINIYKSLIDFSIEL
NNIDPSKRNPLSEAIYTNTLMNIPYLFYFNRSNELLKNKVEEFIIMVESSYNLKIIKIDL
LNEYTKSFAPYEPIELVQIVLNNVKKSLSNDMEQLNQLFINWPHLLPEKIDNNDDSDGNA
DTNEHGFNDPLILPTIEQVTPFMGLDRGFGSVDGMWKTPRYDFHVYLPNSVGEFETVLPI
TTFAGQLFNDIIIDIVQSMEFNRKEVARQVVTLDLFFKNGIFAEPGIPIAQLVDKFEEDP
LTSTYKLEDIAIETILSLMFKLPTVSQPFAYFYTLLVEICQNSPKAIAPVFGRAFRFFYN
NLDNIDFELRSRYLDWFSIQMSNFSFSWKWNEWENDSIKFGKLFYSPKMSFAKNLIRKEL
RLTSNTLDVEESLPEEFKQYLDSSYISHDELVQYYQSFFNDFKVEPSDVKKHDLYFKQDS
LPFAELTRRLIDFMHKNGEEKKIEELESIVEEFKENYGTMFTNFDKFIVTIIVQCLAHSG
SRSLSHANKYINDLADDIKHIFNKLEIEDDIKQFTAIEAIVRFWNSNSQTGFLITDAFKY
AEIISSKSIFEFCFFEKDNRNYGLVDSTVIEAIFRNLSQDPLITTGNPANFEFVFEKLCV
IINDTINKLGVNAIENVVAPIITEDTIFNDEQELVKLDLIWKYQTAVGFCKSLLRKYSDE
YRLLNEKLSTGLPAAIPHEPTRDVLISWVSETNEI
NT seq
2628 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttgctagaaaaagaagaggcgacttcgatgatgatgatggctatcgtgattttaga
ccacgtatgcagaagagacaaagagtccctcctgtggtccaactatgtaaagaaatgatg
cccgatattagaactattggggaatccattaaatccttcgatgaggatatccaattcttg
agtgaagccatcattaatgaatacgggcatgaagaatattttaatactgccttattgaat
actttcaattcaattgtaatggaacaaccacaaaaacaacctgcgatagctttattaaca
ttggttgttaataataaaaatccaattgcaggtaaaagtattgtaaattttttctataat
gaattacaaaaatggtgcaatgaaagttataatgaaaactttaatgtgacttcaaatgaa
actggaccatggaatagagttaaattgattctaagattcttatctttgatgtcaccaata
ttaattatagatgatttgattaatatttataaatctttgattgattttagcatcgaatta
aataatattgatccatctaaaaggaatccattaagtgaagcaatttatactaatactttg
atgaatatcccttatttgttttattttaatagatcaaacgaattgttgaaaaataaagtt
gaagaattcattataatggtcgaaagttcttataatttaaaaattattaaaatcgatttg
ttaaatgaatatactaaatcttttgctccatacgaaccaatagaattagttcaaatcgtg
ttaaacaatgttaaaaaatctttatcaaatgatatggaacaattaaatcaattatttata
aattggccacatttattacctgaaaaaattgataataatgatgatagcgatggtaatgct
gatactaatgaacatggttttaacgatcctttaatattacctactattgaacaggttact
ccttttatgggcttagatagaggttttggttcagtggatggtatgtggaaaactccaaga
tatgatttccatgtttatttaccaaattcagtcggtgaattcgaaactgttttaccaata
acaacttttgcaggtcaattatttaatgatattataatagatatcgttcaaagtatggaa
tttaacagaaaagaagttgcaagacaagtcgttacattggatttgtttttcaaaaatggt
atctttgctgaacctggtatcccaattgctcaattggttgataagttcgaagaagatcct
ttaacttcaacttataaattggaagatatcgcaattgaaaccattttaagtttaatgttt
aaattgccaacagtttcacaaccttttgcttatttttatactttattggttgaaatttgt
caaaactctccaaaggctattgctccagtatttggtagagcttttagatttttttacaac
aatctagataatatcgatttcgaattaagatcaagatatttagattggttttcaatccaa
atgagtaactttagtttctcttggaagtggaatgaatgggaaaatgactctatcaaattt
ggtaaattgttttattctccaaagatgtcattcgctaaaaatttaattcgtaaagaatta
agactaacttcaaatacgctagatgttgaagaaagtttaccagaggaatttaaacaatat
ttagacagttcttacatcagccatgatgaactagtacaatattatcaatcatttttcaat
gatttcaaagttgagccatcagatgttaaaaaacatgatttatattttaaacaagattca
ttaccatttgctgaattgactcgtagattaattgactttatgcataagaatggagaagag
aaaaaaattgaagaattggaatctattgttgaagaatttaaggaaaattatggtacaatg
tttacaaattttgataaattcatcgtcactataatagttcaatgtttagctcattctggt
agtagatctttatctcacgctaataaatatattaacgatttagccgatgacattaagcat
atctttaacaaattggaaattgaagatgatatcaaacaattcactgccattgaagctatt
gttagattctggaattctaattcacagactggtttcttaattaccgatgccttcaaatat
gcagaaattataagttcaaaatcaatttttgaattttgtttcttcgaaaaggataacagg
aactatggtttagtagattcaacagttattgaagctattttcagaaatctatctcaagat
cctttgatcactacaggtaacccagcaaattttgaatttgtctttgaaaagttgtgtgta
ataatcaatgataccataaataaattgggagtaaatgcgattgaaaatgttgtagcccca
attataactgaagacacgatttttaacgacgaacaagagctagttaaattagatttgata
tggaaatatcaaacagctgttggattctgtaaaagtttattaagaaaatactccgatgaa
tacagattattaaatgaaaaattatctactggcttaccagcggctattccacatgaacct
acaagagatgttttgatctcttgggtatcagaaacaaatgaaatttaa
DBGET
integrated database retrieval system